Дисбактериоз как проявляется: Страница не найдена

Содержание

Дисбактериоз кишечника у грудничка: симптомы и лечение

Причины заболевания

Этиологический факторы патологии разнообразны. Причинами дисбактериоза у новорожденных являются:

  • осложненное течение беременности;
  • трудные роды;
  • позднее прикладывание к груди;
  • переход с гв на ив;
  • рождение раньше запланированного срока;
  • бактериальный вагиноз у мамы;
  • плохое питание матери на грудном вскармливании;
  • мастит;
  • частые ОРВИ;
  • диатез.

У детей старшего возраста патология возникает в результате:

  • нерациональное питание;
  • избыток в рационе углеводов, жиров;
  • длительная терапия гормональными, антибактериальными препаратами;
  • антибиотикотерапия;
  • кишечные инфекции;
  • патологии органов пищеварительной системы;
  • глистные инвазии;
  • цирроз печени;
  • онкологические заболевания.

Меньшикова Мария Викторовна

врач акушер-гинеколог

Дисбиоз кишечника у детей не является самостоятельным заболеванием, лежит в основе многих болезней. Наши врачи на дистанционной консультации объяснят, почему появился дисбактериоз у детей, помогут сузить круг причин, ответят на любые вопросы, будут на связи в любое время суток.

Классификация дисбактериоза

Классификация патологии – условна, так как проявлений дисбактериоза, агентов микрофлоры много.

Степени дисбактериоза у детей:

Наименования

Описание

1 степень

Понижение нормофлоры

2 степень

Развитие условно-патогенной микрофлоры

3 степень

Присоединение патогенной микрофлоры

По клинико-бактериологическим критериям:

Наименование

Описание

Компенсированный

Протекает в скрытой форме 1-2 степени тяжести.

Субкомпенсированный

Локально, 2-3 степени тяжести

Декомпенсированный

Генерализованное или локальное течение, 3-4 степени тяжести

Пример 

Родители обратились к гастроэнтерологу с ребенком 7 лет. Жалобы были на частое расстройство пищеварения, выражающееся чередованием запоров и диареи. Ребенка мучает отрыжка. Ест плохо. В массе прибавляет мало. Появились кожные проблемы в виде шелушения на лице. До этого принимали длительно антибиотики при лечении пневмонии. Для постановки диагноза назначено УЗИ брюшной полости, ОАК, бактериологическое, биохимическое исследование кала, копрограмма. На основании исследований, анамнеза и осмотра поставлен диагноз: дисбактериоз кишечника на фоне приема антибиотиков 2 степени. Назначено лечение, диета.

Симптомы дисбактериоза у детей

Дисбактериоз у детей до года проявляется следующими признаками:

  • рвотой;
  • частыми срыгиваниями;
  • вздутием живота;
  • спастическими болями в области кишечника;
  • плохим сном;
  • беспокойством;
  • потерей аппетита;
  • плохим набором веса.

Стул жидкий, с пеной, присутствуют примеси слизи, комочков непереваренной пищи, запах гнилостный, кислый.

При мальабсорбции наблюдается стеаторея, диарея, гипотрофия. Интоксикация сопровождается анемией, снижением аппетита, задержкой физического развития. Из-за процессов брожения, гниения в кишечнику появляются дерматиты, крапивница, сыпь.

У детей постарше дисбактериоз кишечника проявляется:

  • запорами;
  • поносами;
  • чередованием диареи и запоров;
  • кишечными коликами;
  • неприятным запахом изо рта;
  • чувством распирания желудка;
  • заедами в углах рта;
  • стоматиты;
  • сыпь;
  • фурункулез.

Генерализованная форма болезни появляется у детей с иммунодефицитом. Для нее характерно развитие глоссита, хейлита, кандидоза, баланопостита, вульвита.

Меньшикова Мария Викторовна

врач акушер-гинеколог

На фоне дисбиоза могут развиваться и другие симптомы, характерные для различных заболеваний. Если вы сомневаетесь в наличии дисбактериоза у ребенка, свяжитесь с нашими врачами. Они на дистанционной консультации объяснят клиническую картину дисбактериоза, расскажут о возможных связанных патологиях, посоветуют клиники для обследования, дадут перечень необходимых анализов.

Диагностика патологии

Для постановки диагноза необходимо:

  • сделать копрограмму – даст понять степень переваривания еды;
  • посев кала на условно-патогенную флору – покажет процент облигатных бактерий.

Для установки причины заболевания может назначаться УЗИ-диагностика органов брюшной полости, гастроскопия, анализ кала на лямблии, яйца гельминтов.

Дифференциальная диагностика у младенцев исключает:

  • дисахаридазную первичную лактазную недостаточность;
  • глютеновую энтеропатию;
  • синдром мальабсорбции;
  • ОКИ;
  • неспецифический язвенный колит;
  • муковисцидоз.

Осложнения дисбактериоза

В кишечнике нарушается всасываемость питательных веществ. В результате ребенок отстает в развитии. Так как кишечник раздражается продуктами не полностью переваренной пищи, появляется вздутие, одышка, тахикардия, колит. Часто патогенная микрофлора переходит на тонкий кишечник, в котором начинается процесс воспаления. В этом случае пищеварение и всасывание нарушается полностью.

Лечение заболевания

Лечение патологии начинается с составления диеты. Дети, находящиеся на смешанном питании получают кисломолочные продукты. Детям старшего возраста ограничиваются в рационе углеводы, сахар, животные белки. Чтобы восстановить микрофлору кишечника важно употреблять кисломолочные продукты с бифидобактериями, пищевые волокна. Врачи при дисбактериозе назначают про- и пребиотики, симбиотики, бактериофаги. В крайних случаях назначаются антибиотики. Если дисбактериоз вызван грибками рода кандида, то показаны противогрибковые препараты.

Важно! При выраженных нарушениях пищеварения необходим прием ферментов, сорбентов. При рецидивирующем дисбактериозе необходимо включать иммуномодулирующие лекарственные средства, витамины.

Профилактика дисбактериоза у детей

Профилактические меры начинаются с момента беременности:

  • будущая мама должна тщательно следить за полноценным питанием и своим рационом;
  • беременная должна своевременно выявлять заболевания и лечить их;
  • своевременное прикладывание к груди младенца;
  • грамотный подход к подбору смеси, если ребенок на искусственном вскармливании;
  • введение прикорма по правилам.

Частые вопросы

Какие анализы надо сдать на дисбактериоз у грудничка?

+

У грудничка необходимо собрать кал на анализ. Определяется наличие паразитов, примесей, патогенная и нормальная микрофлора. Анализ кала на дисбактериоз не информативен.

Что показывают микробиологические исследования кала при дисбактериозе?

+

Культуральный и бактериологический методы укажут на наличие условно-патогенных, патогенных и полезных бактерий.

С какого месяца можно принимать пребиотики в лекарственной форме младенцу?

+

Новорожденные получают все необходимые вещества через материнское молоко. Дети на искусственном вскармливании- через смеси. В возрасте 6 месяцев рацион малыша обогащается продуктами, содержащими про-, пребиотики, бифидобактерии. Лекарственные формы даются детям только по предписанию врача.

Почему возникает дисбактериоз у годовалого ребенка?

+

Сам по себе дисбактериоз не возникает. Чаще всего – следствие или осложнение болезни. Важно установить причину патологии. Часто в детском возрасте причинами могут стать стрессы, несбалансированный рацион, соматические болезни, антибиотики.

Заключение эксперта

Дисбактериоз характеризуется нарушением нормальной микрофлоры кишечника. Проявляется диспептическими расстройствами. Детей старших возрастов патология имеет клинические признаки гастрита, энтерита, энтероколита. Поэтому врачи проводят диагностические исследования, чтобы выявить причину патологии. При дисбактериозе необходимо в первую очередь соблюдать диету, назначенную врачом. прием препаратов только под контролем специалистов.

ДИСБАКТЕРИОЗ – ЧТО ЭТО?

ЧТО ТАКОЕ «ДИСБАКТЕРИОЗ»?

Важной о  неотделимой частью человеческого организма являются микроорганизмы, его населяющие. Они необходимы для поддержания полноценного здоровья. В норме микроорганизмы находятся во всех органах и системах, но более всего – в ротовой полости, желудочно-кишечном тракте, влагалище и на коже. Их количество в теле здорового человека в десятки раз превышает количество его собственных клеток. Это микроорганизмы выполняют разнообразные функции.                             

Все эти функции нарушаются при изменении количественного или качественного состава нормальной микрофлоры, которое называется ДИСБИОЗОМ (прим. Наряду с термином «дисбиоз» в медицине часто используется термин «дисбактериоз» – несколько более узкое понятие, традиционно вошедшее в практику врача как синоним). Восстановление функции организма существенно зависит от успешной коррекции дисбактериоза при разнообразных патологических процессах.

         ПРИЧИНЫ ВОЗНИКНОВЕНИЯ ДИСБИОЗА

  •  Антибактериальная терапия и длительный прием лекарств других групп (гормоны, антациды и др.) – дисбактериоз развивается практически в 100 % случаев.
  • Воздействие вредных факторов: радиация и другие техногенные излучения, лучевая терапия, изменения климатических условий. Из внешних воздействий отметим изменения пищевого рациона, психоэмоциональные расстройства, повышение нагрузки (особенно экстремальные), стресс.
  • Различные инфекции, инвазии.
  • Хронические соматические заболевания. При заболеваниях желудочно-кишечного тракта дисбиоз возникает практически всегда.
  • У детей дисбиоз развивается вследствие искусственного вскармливания или короткого грудного кормления, при неправильно ведении прикорма и т.д.
  • При наличии условно-патогенной и патогенной флоры во влагалище роженицы она попадает в желудочно-кишечный тракт ребенка в процессе родов. Профилактика дисбиоза у ребенка начинается с коррекции дисбиоза беременной женщины.

         КАКОВЫ ПОСЛЕДСТВИЯ ДИСБАКТЕРИОЗА?

         В различных органах человеческого организма дисбиоз проявляется различными заболеваниями.

  • Дисбактериоз желудочно-кишечного тракта чаще всего имеет следствием: хронические энтероколиты, язвенный колит, синдром раздраженной толстой кишки, болезнь Крона, синдром избыточного бактериального роста, диарею путешественников, хронический гастрит, хронический гепатит
  • Дисбактериоз влагалища практически всегда сопровождается бактериальным или грибковым вагинозом. Частым последствием бактериального вагиноза являются патологии беременности или инфекционные заболевания новорожденных.
  • Дисбактериоз кожи обостряет течение дерматоза, угревой сыпи, нейродермита и других патологий кожи и слизистых
  • Дисбактериоз ротовой полости сопровождается стоматитами бактериальной и аллергической природы, гингивитами, глосситами, тонзиллитами, фарингитами

  

Важной особенностью дисбиоза в организме человека является его системный характер, т.е. процесс не ограничивается одним местом локализации. Так, дисбактериоз влагалища часто сочетается с дисбактериозом желудочно-кишечного тракта. Нарушения в желудочно-кишечном тракте сопровождаются аутоиммунными заболеваниями, авитаминозами, аллергозами, атеросклерозом сосудов и опухолями различной локализации

Таким образом, коррекция «местного» дисбактериоза, например, желудочно-кишечного тракта, что более привычно врачам, запускает целый ряд уникальных восстановительных механизмов во всем организме и должна применяться очень широко как для профилактики, так и в лечебных целях.

 

СРЕДСТВА ПРОФИЛАКТИКИ И КОРРЕКЦИИ ДИСБАКТЕРИОЗА

 

  1. ПРОБИОТИКИ – бактериосодержащие препараты и продукты
  1. ПРЕБИОТИКИ – препараты и продукты, селективно стимулирующие рост и активность бактерий толстого кишечника. Важным свойством пребиотиков является способность благотворно влить на свойства кишечного эпителия за счет улучшения кровотока в ворсиночных венах и пассивного транспорта кальция.
  1. СИНБИОТИКИ – комплексы про- и пребиотиков. В последнее время именно эта группа признана наиболее эффективной.

В настоящее время в медицинской практике применяется достаточно много пробиотиков и синбиотиков. По своей консистенции пробиотики производятся или в виде жидких заквасок, или в сухой форме (порошки, капсулы, таблетки).

Жидкие закваски имеют очень короткий срок годности (7-20 дней), но активность бактерий в них вышею Изготовление препаратов – синбиотиков в жидкой форме затруднено и мало используется.

Сухие формы традиционно изготавливаются на основе низкотемпературной вакуумной сушки (лиофильная сушка) культур полезных бактерий. Они имеют длительный срок хранения (1-2 года), но бактерии, высушенные путем лиофилизации, мало активны и даже при защите с помощью капсул плохо оживают в кишечнике.

Дисбактериоз – признаки, причины, симптомы, лечение и профилактика

Диагностика

Для определения нарушения микрофлоры используются следующие исследования:

  • анализ кала, в том числе биохимическое исследование;
  • бактериологическое изучение состава кишечного содержимого и желчи;
  • эзофагогастроскопия с последующим бактериологическим изучением соскоба со слизистой оболочки. Одним из часто встречающихся у детей заболеваний является дисбактериоз кишечника. При этом состоянии нарушается нормальный баланс микрофлоры, которая необходима для жизнедеятельности организма. Снижается количество «полезных» бактерий и увеличивается содержание патогенных микроорганизмов.

Лечение

Лечение дисбактериоза начинается с устранения причины, которая способствовала его развитию. Для нормализации состава микрофлоры применяются пребиотики и пробиотики. В целом лечение похоже на лечение дисбактериоза у взрослых.

Диета при дисбактериозе у детей зависит от особенностей клинической картины у каждого пациента: показателей кислотности желудочного сока, степени нарушения пищеварения, локализации патологического процесса. Питание ребенка при дисбактериозе должно быть сбалансированным и легкоусвояемым.

Опасность заключается в нарушении водно-электролитного баланса, истощения малыша вследствие длительного поноса.

В группу риска входят малыши, которые перенесли:

  • родовые травмы;
  • глистные инвазии;
  • искусственное вскармливание;
  • колит, энтерит;
  • инфекционные заболевания (дизентерия, тиф).

Профилактика

Профилактика заключается в соблюдении режима питания малыша и проведении рациональной антибиотикотерапии.

  • двенадцатиперстной кишки;
  • колоноскопия с бактериологическим исследованием соскоба слизистой оболочки толстой и прямой кишки.

Список литературы и источников

  • Знаменский В.А., Деггяр Н.В. Микробиологическая диагностика кишечного и кожного дисбактериоза: Учебное пособие. М., 1989.
  • Минушкин О. Н., Ардатская М. Д., «Дисбактериоз кишечника: современное представление, диагностика и лечебная коррекция»], 2006.
  • Видео по теме

    Дисбактериоз

    Дисбактериоз – это нарушение свойств и состава микрофлоры кишечника, которое оказывает негативное влияние на организм в целом. Заболевание встречается часто, болеют как дети, так и взрослые.

    Симптомы болезни

    Для дисбактериоза характерен большой диапазон тяжести симптоматики. У некоторых людей он протекает без жалоб, у других вызывает тяжелые расстройства здоровья. Дисбактериоз проявляется нарушениями в работе желудочно-кишечного тракта, кожными проявлениями и симптомами отравления организма.

    Наиболее частыми симптомами дисбактериоза является:

    • Нарушение стула в виде запоров и поносов. Понос кашицеобразный,

    пенящийся, зловонный.

    • Дискомфорт и боль в животе.
    • Метеоризм.
    • Снижение аппетита.
    • Тошнота.
    • Изжога и отрыжка.
    • Неприятный запах изо рта.

    Общие симптомы:

    • Головные боли
    • Слабость, недомогание
    • Повышенная утомляемость
    • Нарушение сна
    • Похудение.

    Кожные симптомы:

    • Зуд кожных покровов
    • Аллергические высыпания
    • Сухость кожи.

    Причины болезни

    Наиболее частой причиной дисбактериоза является длительный и бесконтрольный прием антибиотиков. Антибактериальные препараты подавляют рост как «плохих микробов», так и «хороших». Кроме антибиотиков, дисбактериоз могут вызвать любые препараты, подавляющие иммунную систему: кортикостероиды, химио- и лучевая терапия.

    Провоцирующим фактором в развитии дисбактериоза являются воспалительные заболевания органов пищеварения, а именно: хронические гастриты, панкреатит, холецистит, гепатит, цирроз печени, язвенная болезнь, дискинезия желчевыводящих путей.

    Еще одной причиной является несбалансированное, однообразное питание, злоупотребление жирным и сладким, монодиеты, авитаминоз.

    У детей до года, наиболее распространенными причинами дисбактериоза являются: раннее введение прикорма, инфекционные инфекции (особенно кишечные), глистные инвазии.

    Диагностика

    Диагностика дисбактериоза начинается с кабинета врача-гастроэнтеролога. Подтверждается (или опровергается) диагноз лабораторными методами исследования. Для определения возможных нарушений функций ЖКТ назначается копрограмма– общий анализ кала. Исследование показывает: нарушения ферментативной и кислотообразующей функции желудка, патологию ферментативной функции кишечника и поджелудочной железы, нарушения функций печени и желчного пузыря, а также воспалительные явления желудочно-кишечного тракта.

    Осложнения

    При отсутствии лечения дисбактериоза, возможен переход заболевания в более тяжелую форму. Не исключен риск развития осложнений, а именно:

    • Развитие патогенной флоры
    • Нарушение всасывания витаминов, минералов и микроэлементов
    • Образование токсических веществ в кишечнике, которые, проникая в кровь, отравляют весь организм
    • Нарушения местного иммунитета, снижение защитных свойств организма.

    Кроме того, при отсутствии лечения, дисбактериоз может провоцировать развитие различных заболеваний – сахарного диабета, панкреатита, дискинезии желчного пузыря, желчекаменной болезни, иммунодефицита, псориаза, экземы и атопического дерматита.

    Лечение болезни

     Важнейшей частью терапии является лечение основного заболевания, послужившего провоцирующим фактором для развития дисбактериоза. Только в этом случае положительный эффект лечения не заставит ждать.

    Следующим этапом в лечении является прием препаратов, восстанавливающих нормальную микрофлору – пробиотиков и пребиотиков. Наиболее правильно подбирать препарат, чувствительный к высеянной флоре.

    Во время лечения следует избегать приема препаратов, отрицательно действующих на желудочно-кишечный тракт.

    Врач-терапевт (заведующий)

    ГУЗ «Городская поликлиника № 5 г. Гродно»

    Мандик А. Н.

    Дисбактериоз – это нарушение свойств и состава микрофлоры кишечника, которое оказывает негативное влияние на организм в целом. Заболевание встречается часто, болеют как дети, так и взрослые.

    Симптомы болезни

    Для дисбактериоза характерен большой диапазон тяжести симптоматики. У некоторых людей он протекает без жалоб, у других вызывает тяжелые расстройства здоровья. Дисбактериоз проявляется нарушениями в работе желудочно-кишечного тракта, кожными проявлениями и симптомами отравления организма.

    Наиболее частыми симптомами дисбактериоза является:

    • Нарушение стула в виде запоров и поносов. Понос кашицеобразный,

    пенящийся, зловонный.

    • Дискомфорт и боль в животе.
    • Метеоризм.
    • Снижение аппетита.
    • Тошнота.
    • Изжога и отрыжка.
    • Неприятный запах изо рта.

    Общие симптомы:

    • Головные боли
    • Слабость, недомогание
    • Повышенная утомляемость
    • Нарушение сна
    • Похудение.

    Кожные симптомы:

    • Зуд кожных покровов
    • Аллергические высыпания
    • Сухость кожи.

    Причины болезни

    Наиболее частой причиной дисбактериоза является длительный и бесконтрольный прием антибиотиков. Антибактериальные препараты подавляют рост как «плохих микробов», так и «хороших». Кроме антибиотиков, дисбактериоз могут вызвать любые препараты, подавляющие иммунную систему: кортикостероиды, химио- и лучевая терапия.

    Провоцирующим фактором в развитии дисбактериоза являются воспалительные заболевания органов пищеварения, а именно: хронические гастриты, панкреатит, холецистит, гепатит, цирроз печени, язвенная болезнь, дискинезия желчевыводящих путей.

    Еще одной причиной является несбалансированное, однообразное питание, злоупотребление жирным и сладким, монодиеты, авитаминоз.

    У детей до года, наиболее распространенными причинами дисбактериоза являются: раннее введение прикорма, инфекционные инфекции (особенно кишечные), глистные инвазии.

    Диагностика

    Диагностика дисбактериоза начинается с кабинета врача-гастроэнтеролога. Подтверждается (или опровергается) диагноз лабораторными методами исследования. Для определения возможных нарушений функций ЖКТ назначается копрограмма– общий анализ кала. Исследование показывает: нарушения ферментативной и кислотообразующей функции желудка, патологию ферментативной функции кишечника и поджелудочной железы, нарушения функций печени и желчного пузыря, а также воспалительные явления желудочно-кишечного тракта.

    Осложнения

    При отсутствии лечения дисбактериоза, возможен переход заболевания в более тяжелую форму. Не исключен риск развития осложнений, а именно:

    • Развитие патогенной флоры
    • Нарушение всасывания витаминов, минералов и микроэлементов
    • Образование токсических веществ в кишечнике, которые, проникая в кровь, отравляют весь организм
    • Нарушения местного иммунитета, снижение защитных свойств организма.

    Кроме того, при отсутствии лечения, дисбактериоз может провоцировать развитие различных заболеваний – сахарного диабета, панкреатита, дискинезии желчного пузыря, желчекаменной болезни, иммунодефицита, псориаза, экземы и атопического дерматита.

    Лечение болезни

     Важнейшей частью терапии является лечение основного заболевания, послужившего провоцирующим фактором для развития дисбактериоза. Только в этом случае положительный эффект лечения не заставит ждать.

    Следующим этапом в лечении является прием препаратов, восстанавливающих нормальную микрофлору – пробиотиков и пребиотиков. Наиболее правильно подбирать препарат, чувствительный к высеянной флоре.

    Во время лечения следует избегать приема препаратов, отрицательно действующих на желудочно-кишечный тракт.

    Врач-терапевт (заведующий)

    ГУЗ «Городская поликлиника № 5 г. Гродно»

    Мандик А. Н.

    Дисбактериоз причины, лечение, профилактика

    У здорового человека толстый и тонкий кишечник заселен микроорганизмами. Около 500 видов различных бактерий ферментируют пищу, упрощая процесс пищеварения. От качественного и количественного состава микрофлоры зависит иммунитет, усвоение полезных веществ (жиров, белков, углеводов, микро- и макроэлементов, витаминов). В среднем общий вес бактерий в кишечнике – около 2 кг.

    Дисбактериозом называется дисбаланс кишечной флоры. При нарушении качественного и количественного состава симбиозных бактерий кишечник заселяется патогенными микроорганизмами, вызывающими процессы гниения. В результате возникает хроническое воспаление стенок кишечника. Если дисбактериоз не лечить, возможны и другие клинические проявления.

    В норме соблюдается баланс бифидо- и лактобактерий. Бифидобактерии составляют от 85 до 95% всех микроорганизмов. В состав кишечной микрофлоры обязательно входит кишечная палочка (эшерихии), энтерококки, пептострептококки и другие вредные бактерии, всевозможные грибки. Полезные культуры подавляют размножение патогенов.

    Причины возникновения дисбактериоза

    К гибели лакто- и бифидобактерий приводит несколько факторов:

    • Прием некоторых лекарственных препаратов. При бесконтрольном и длительном применении антибиотиков усиливается развитие грибков, подавляющих деление полезную микрофлоры. Аналогично действуют гормональные средства, химиотерапия.
    • Микрофлора также разрушается при лучевом воздействии, заболевания желудочно-кишечного тракта. Происходит ослабление иммунитета, снижается метаболизм (обмен веществ) и регенерация (воспроизведение) клеток.
    • Дисбактериоз развивается при неправильном питании, когда в рационе мало клетчатки, кисломолочных продуктов, преобладают быстрые углеводы, животные белки. Возникает брожение, вздутие. Микрофлора также не справляется с ферментацией большого количества пищи при переедании.
    • Острые и хронические инфекции, вызывающие диарею, вытесняют полезные бактерии. Флора активно заселяется патогенами.
    • Состояния, сопровождающиеся ослаблением иммунитета, серьезные патологии эндокринной системы, сахарный диабет, ВИЧ и СПИД, онкология тоже вызывают дисбаланс в кишечнике.

    Дисбактериоз также возникает при частых стрессах, психоэмоциональных перегрузках, чаще диагностируется у курильщиков и пьющих пациентов.

    Симптомы и признаки дисбаланса кишечной флоры

    На первых двух стадия развития клинической картины явной симптоматики не существует. Симптомы характерны для 3 и 4 стадии развития заболевания. Основные проявления:

    • Нарушения стула (диспепсический синдром), появления неприятного запаха от испражнений. Чаще возникает диарея, связанная с усилением образования желчных кислот. Усиливается перистальтика, затормаживается всасывание жидкости. У возрастных пациентов нередко случаются запоры из-за низко заселенности флоры ферментирующими бактериями.
    • Вздутие живота связано с усиленным образованием газов при углеводном брожении. Появляется урчание в животе, локальная схваткообразная боль. Нередко вздутие сопровождается снижением аппетита, тошнотой, отрыжкой после каждого приема пищи.
    • Возможны аллергические реакции на привычный рацион: кожный зуд, высыпания.
    • Наблюдаются симптомы интоксикации, которые сопровождаются незначительным повышением температуры. Нередко возникает головная боль.
    • Проявляется авитаминоз: возникает сухость кожи, ухудшается состояние волос и ногтей. Возможно образование заед, развитие стоматита.

    Из-за не явной симптоматики дисбактериоз часто путают с другими заболеваниями. Начинают самостоятельное лечение препаратами, усугубляющими плохое состояние организма.

    Диагностика и лечение заболевания

    Для определения дисбаланса в кишечнике назначается бакпосев кала, проводятся другие исследования: копрограмма, биохимический и газо-жидкостный анализы каловых масс.

    Лечение заболевания направлено на устранение причины разбаланса, иначе болезнь будет возвращаться снова и снова.

    В терапевтической практике эффективным средством считаются препараты, содержащие полезные симбиозные бактерии, недостаток которых испытывает пациент. Также назначаются пребиотики – компоненты, способствующие активизации размножения полезных микроорганизмов. Симбиотики одновременно с пребиотиками содержат нужные бактериальные культуры.

    Антибиотики применяют при острых формах инфицирования, они необходимы для уничтожения патогенов. После этого обязательно проводится микробное заселение кишечника. Когда активизируются грибки, необходимы противогрибковые препараты, уничтожающие кандиды. Ферменты назначаются при сбоях пищеварения, сорбенты – при отравлении и сильном вздутии.

    При лечении заболевания важно придерживаться диеты, рекомендованной лечащим врачом, сократить количество рафинированных углеводов, исключить продукты, раздражающие слизистую кишечника.

    Профилактика дисбактериоза кишечника

    При приеме антибиотиков желательно употреблять продукты, способствующие развитию бифидо- и лактобактерий. Необходимо соблюдать режим питания, балансировать рацион, включать больше овощей и фруктов, кисломолочные продукты. При своевременном лечение острых и хронических заболеваний ЖКТ снижается риск дисбаланса. Для грудничков, особенно недоношенных, рекомендуется грудное вскармливание, материнское молоко содержит пребиотики, необходимые для здорового развития микрофлоры.

    Дизбактериоз кишечника

    Дисбактериоз кишечника – довольно распространенное нарушение пищеварительной системы, которое вызвано изменением микрофлоры из полезной на патологическую. Количество полезных кишечных микроорганизмов уменьшается, а вот число болезнетворных стремительно увеличивается, вызывая у больного соответствующую симптоматику. Дисбактериоз не является самостоятельной болезнью. В основном он возникает на фоне других серьезных функциональных нарушений, таких, как язвенная болезнь, холецистит, панкреатит, поражение печени, в том числе и цирроз. Нередко заболевание возникает на фоне нарушений питания, когда в рационе преобладают продукты, пагубно влияющие на работу органов ЖКТ. В клинике «Медлайн-Сервис» лечение дисбактериоза кишечника проводится опытными специалистами, которые в первую очередь выяснят причины нарушения, после чего составят индивидуальный план терапии.

    Симптомы дисбактериоза кишечника

    На начальной стадии развития симптомы дисбактериоза невыраженные. Но по мере прогрессирования болезнь развивается более яркая клиническая картина:

    • Нарушение стула. Один из самых распространенных признаков, который чаще проявляется в виде не проходящей диареи. У пожилых людей при дисбактериозе развивается запор, который обусловлен возрастными изменениями, влияющими на активность кишечной перистальтики.
    • Усиленное газообразование. Из-за неконтролируемого размножения болезнетворной микрофлоры кишечник перестает полноценно выполнять свои функции, в результате чего пища неполноценно переваривается и всасывается, что приводит к развитию бродильных процессов и обильному образованию кишечных газов.
    • Диспепсические расстройства. Выражены такими симптомами, как обильная отрыжка, потеря аппетита, тошнота.
    • Неприятный привкус во рту, особенно после сна.
    • Вздутие живота. Может усугубляться всегда или после приема некоторых продуктов.
    • Неполное опорожнение кишечника и постоянное чувство тяжести.

    Лечение дисбактериоза кишечника

    Симптомы дисбактериоза кишечника можно спутать с другими заболеваниями системы пищеварения, такими как колит, энтероколит, гастрит, синдром раздраженного кишечника. Главная задача врача – определить точный диагноз, исключив вышеперечисленные заболевания. Поэтому после детального сбора анамнеза, специалист дает направление на комплексную диагностику. Подтвердить диагноз помогут такие процедуры:

    • анализ кала на дисбактериоз;
    • общий анализ крови;
    • колоноскопия;
    • УЗИ;
    • фиброэзофагогастродуоденоскопия.

    Медикаментозное лечение дисбактериоза предполагает применение таких групп препаратов:

    • антибиотики для уничтожения болезнетворной микрофлоры;
    • пробиотики для заселения кишечника полезными бактериями;
    • ферменты для нормализации ферментивной функции;
    • сорбенты для устранения симптомов интоксикации.

    Также необходимо соблюдать назначенную врачом диету, стараться сбалансированно питаться и не употреблять вредных продуктов.

    Дисбактериоз кишечника часто встречается при системной склеродермии и связан с гастроинтестинальными и внекишечными особенностями заболевания | Arthritis Research & Therapy

    В этом поперечном исследовании, охватывающем 98 пациентов с ССД, мы показываем, что дисбактериоз кишечника часто встречается при ССД и связан с желудочно-кишечными проявлениями заболевания. Также мы показываем, что дисбактериоз связан с некоторыми внекишечными особенностями ССД воспалительного, сосудистого и фиброзного типа. Мы представляем данные, показывающие, что дисбиоз кишечника уже присутствует на ранних стадиях течения ССД, что указывает на то, что дисбактериоз может предшествовать начальным признакам фиброза.

    Несколько IMID были связаны с изменениями микробного состава в кишечнике, включая РА, системную красную волчанку, синдром Шегрена и ВЗК [7, 8, 11, 28]. Среди IMID человека дисбактериоз наиболее широко изучен при ВЗК. У этих пациентов наблюдается снижение разнообразия микробиоты кишечника, увеличение количества бактерий, вызывающих воспалительную активность, и снижение количества бактерий с иммунорегуляторными эффектами [28]. Важный вопрос заключается в том, является ли дисбактериоз, связанный с ВЗК, первичным или вторичным явлением.На животных моделях ВЗК было показано, что как потеря иммунорегуляторных, так и добавление болезнетворных бактерий способствуют активности заболевания, поддерживая первичную роль дисбиоза в развитии болезни [29]. У пациентов с ВЗК различные стратегии воздействия на микробиоту кишечника, включая исключительно энтеральное питание, пребиотики, пробиотики, постбиотики и трансплантацию фекальной микробиоты, показали смешанные, но в целом многообещающие результаты [30].

    Молекулярный анализ выявил некоторое сходство между процессами фиброза кишечника, связанного с ВЗК, и фиброза кожи, связанного с ССД, включая трансформирующий фактор роста бета (TGF-β) и пути, зависящие от рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, что приводит к продукции коллагена I фиброцитами и фибробласты [31, 32].Кроме того, хотя воспаление можно лечить с помощью иммуносупрессивной терапии, эти фиброзные процессы также устойчивы к современным методам лечения обоих заболеваний. При ВЗК, а также при ССД часто встречаются повышенные уровни F-кальпротектина, что указывает на воспаление кишечника. Подобно данным, представленным в этом исследовании, повышенные уровни F-кальпротектина также связаны с дисбактериозом при ВЗК [33].

    Фолькманн и др. недавно сообщили об изменении микробного состава слизистой оболочки толстой кишки у 17 пациентов с ССД [16].Наше исследование, включающее 98 пациентов с ССД, подтверждает этот вывод, поскольку мы показываем высокую частоту дисбактериоза у наших пациентов. Мы также сообщаем о низком уровне иммунорегуляторных бактерий Faecalibacterium prausnitzii, , что согласуется с исследованиями ВЗК [34]. Согласно Volkmann et al. [4]. Как предполагалось ранее, это открытие может поднять новые вопросы, касающиеся использования Lactobacilli-, содержащих пробиотики, при СС.

    Наш отчет основан на анализе кала, а не на анализе лаважа толстой кишки или биопсии кишечника. Следовательно, слабостью нашего подхода является неспособность специально сосредоточиться на бактериях, распространенных на границе между слизистой оболочкой толстой кишки и просветом кишечника. Примечательно, что, несмотря на то, что использовались разные методологии, наш основной вывод согласуется с отчетом Фолькмана.

    Объективная оценка заболевания ЖКТ при ССД является сложной задачей. ССД может влиять на желудочно-кишечный тракт несколькими различными способами, включая нарушение моторики, недоедание, воспаление и фиброз.В нашем исследовании мы оценивали желудочно-кишечный тракт путем оценки моторики пищевода с помощью бариевой рентгенографии, которая ранее была предложена в качестве золотого стандарта в объективной оценке этого заболевания [17]. Мы исследовали недоедание по лабораторным маркерам, включая Р-транстиретин, и антропометрическим данным с помощью MUST [19, 20]. Хотя предполагалось, что недостаточность питания при СС вызвана нарушением всасывания [35], вероятно, задействованы дополнительные механизмы, включая кахексию, вызванную хроническим воспалительным процессом [36].

    Большинству наших пациентов были назначены ИПП, и использование этого лекарства было достаточно интересно связано с дисбактериозом. Однако в предыдущих исследованиях не удалось показать, что использование ИПП само по себе вызывает значительные отклонения в составе микробиоты толстой кишки [37]. В соответствии с предыдущим исследованием и интерпретацией Krause et al. [36], мы предполагаем, что регулярное использование ИПП в первую очередь является неспецифическим маркером симптоматического ССД желудочно-кишечного тракта. В этом исследовании все пациенты были опрошены о желудочно-кишечных симптомах, и действительно, дисбиоз чаще встречался у пациентов с желудочно-кишечными симптомами, что указывает на то, что утвержденный опросник, такой как UCLA SCTC GIT 2.0 следует включить в будущие исследования [38].

    Основной целью данного исследования было изучение распространенности дисбактериоза при ССД. В отличие от исследований полногеномного секвенирования, у нас есть лишь ограниченные данные о конкретных родах бактерий. Кроме того, у нас нет данных о метаболических путях кишечника, используемых различными микробиомами наших пациентов. Необходимы дальнейшие исследования, включающие такие анализы, для дальнейшего выяснения сложной взаимосвязи между хозяином и микробиомом при СС [39].

    Мы можем только догадываться о механизмах связи между дисбактериозом и желудочно-кишечными или внекишечными проявлениями ССД. Можно предположить, что некоторые из этих проявлений являются косвенными маркерами тяжелого течения заболевания. Однако нам не удалось выявить связь между mRSS, подтипом заболевания, профилем аутоантител и иммуносупрессивной терапией. Принимая это во внимание, мы поэтому склонны предполагать, что связь между кишечным микробиомом и СС является многофакторной и связана с факторами, не зависящими от тяжести заболевания или статуса аутоантител.Мы отмечаем, что дисбактериоз связан с повышенным уровнем маркеров воспаления в сыворотке, и мы предполагаем, что необходимы дальнейшие исследования для выяснения влияния дисбактериоза ЖКТ на иммунную систему при ССД.

    Дисбиоз кишечной микробиоты способствует развитию колоректального рака – Полный текст – Пищеварение 2021, Vol. 102, № 4

    История вопроса: Микробиота кишечника представляет собой разнообразное сообщество микробов, поддерживающих стабильность кишечной среды.Дисбиоз кишечной микробиоты связывают с желудочно-кишечными заболеваниями, такими как колоректальный рак (КРР) — основной причиной смерти онкологических больных. Резюме: Кандидаты в патогены были идентифицированы с использованием бактериальной культуры и методов высокопроизводительного секвенирования. В настоящее время имеются данные, свидетельствующие о том, что определенные кишечные микробы вызывают развитие и прогрессирование КРР, однако их патогенетические механизмы до сих пор неясны. Ключевые сообщения: В этом обзоре мы описываем известную микробиоту здорового кишечника и ее изменения при КРР.Особое внимание мы уделяем изучению патогенных механизмов дисбактериоза кишечной микробиоты при КРР. Это имеет решающее значение для объяснения того, как дисбактериоз кишечной микробиоты управляет процессом колоректального канцерогенеза и прогрессирования опухоли. Оценка изменений микробиоты кишечника при развитии и прогрессировании КРР предлагает новую стратегию диагностики и лечения этого заболевания.

    © 2020 S. Karger AG, Базель

    Введение

    Микробиота кишечника человека представляет собой совокупность различных микробов, населяющих нормальный кишечный тракт.Общее количество микробных клеток по всему кишечному тракту достигает от 10 13 до 10 14 [1], включая бактерии, вирусы, грибы и археи, среди которых преобладают бактерии. На сегодняшний день в кишечнике человека идентифицировано примерно 1000–1150 видов бактерий, а основная микробиота, общая для разных людей, включает около 160 видов [2]. Микробиота кишечника в основном состоит из 4 типов: Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Proteobacteria [3].Различные микробные виды сосуществуют в определенных пропорциях, взаимозависимы и конкурируют друг с другом, что поддерживает относительно стабильную экологию [1].

    Микробиоту кишечника можно разделить на 3 кластера в зависимости от их влияния на организм человека: полезные, нейтральные и патогенные. Полезные микробы, такие как Bifidobacterium и Lactobacillus , могут защищать кишечный тракт, производить полезные метаболиты и детоксицировать кишечник человека [4]. Нейтральные микробы, такие как Enterococcus , имеют двойные признаки; они полезны для здоровья человека в нормальных условиях роста и могут вызывать заболевания разной степени тяжести при превышении определенной нормы роста или переносе на другие части тела [5].Патогенные микробы, такие как Salmonella и Helicobacter pylori , выделяют токсины в кишечном тракте и тем самым наносят вред здоровью человека [6]. Кроме того, микробиоту кишечника можно разделить на 3 группы в зависимости от потребности в кислороде: облигатно-анаэробные, факультативно-анаэробные и аэробные, среди которых преобладают анаэробные бактерии [7].

    В нормальных условиях микробиота кишечника играет ключевую роль в функциях организма, таких как содействие пищеварению и всасыванию питательных веществ, поддержание нормальной физиологической функции желудочно-кишечного тракта и модулирование иммунитета.Когда на микробиоту кишечника влияют многие факторы, включая диету, окружающую среду и гены хозяина, ее дисбактериоз проявляется в виде изменения состава микробиоты, бактериальной биоактивности и локализации в различных частях тела человека [8]. Такие изменения могут вызывать такие заболевания, как воспалительные заболевания кишечника, колоректальный рак (КРР), сердечно-сосудистые заболевания, сахарный диабет и психические заболевания [9, 10]. Однако причинно-следственная связь между кишечной микробиотой и этими заболеваниями до сих пор не выяснена.

    CRC является третьим наиболее распространенным злокачественным новообразованием, которое серьезно угрожает здоровью человека. Он стал основной причиной смерти онкологических больных во всем мире [11] и является причиной почти 500 000 смертей в год, что представляет собой серьезную глобальную проблему для здравоохранения. В Китае в период с 2009 по 2011 год в среднем ежегодно регистрировалось 376 000 новых случаев и 191 000 смертей [12], что делает CRC пятой по значимости причиной смерти от рака. Эта заболеваемость может быть еще выше в экономически развитых городах [13].CRC является злокачественным заболеванием с участием многих факторов. Большое количество работ показало, что этиология CRC включает генетический фон и факторы риска окружающей среды, такие как сахарный диабет, холецистэктомия, ожирение, диета с высоким содержанием жиров, обработанные пищевые продукты и красное мясо [14-17]. За последнее десятилетие исследователи предоставили массивную важную информацию о роли кишечных микробов в развитии и прогрессировании CRC. Также была подтверждена причинно-следственная связь между присутствием специфических микробов и развитием КРР.

    Обсуждение

    Конкретные микробы, связанные с CRC

    С появлением многочисленных новых методов были проведены широкомасштабные генетические и метаболические анализы кишечной микробиоты, которые позволяют понять роль кишечной микробиоты человека. Взаимосвязь между дисбиозом кишечной микробиоты и CRC рассматривается во все большем количестве исследований [18-23]. Основными характеристиками дисбактериоза микробиоты являются изменение видов бактерий и увеличение количества патогенных бактерий.Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что дисбактериоз микробиоты может вызывать изменение физиологических функций хозяина и тем самым приводить к патогенезу различных заболеваний [24, 25]. В тканях КРР и прилежащей слизистой оболочке часто возникает выраженный дисбактериоз микробов [26]. Однако из-за различных стандартов классификации и методов, использованных в прошлых исследованиях, ключевые виды, вовлеченные в прогрессирование CRC, до сих пор неясны. Это создает трудности при суммировании специфических характеристик кишечных микробов, связанных с CRC.Здесь мы приводим сводку кишечных бактерий, связанных с CRC, о которых часто сообщалось на сегодняшний день.

    Fusobacterium nucleatum

    Fusobacterium nucleatum ( Fn ) является грамотрицательной анаэробной бактерией [27]. Как член микробиоты полости рта, Fn обычно обнаруживается при заболеваниях пародонта и редко выявляется в нормальном кишечном тракте человека [28]. На основании количественной ПЦР, секвенирования 16S рРНК и анализа FISH было обнаружено, что уровень Fn повышается при аденомах и CRC по сравнению со здоровым контролем, а высокий уровень Fn связан с метастазированием CRC в лимфатические узлы [18].Чен и др. [19] обнаружили, что Fn может стимулировать прогрессирование CRC благодаря его способности ингибировать противоопухолевый иммунный ответ за счет уменьшения количества CD4 + T-клеток и подавления экспрессии белка TOX. Однако Fn сам по себе не может колонизировать толстую кишку, так как для образования колоний требуется взаимодействие с несколькими другими видами. Fn секретирует адгезин Fad A, который связывается с внеклеточной областью E-кадгерина в эпителиальных клетках, чтобы стимулировать катениновый путь, что приводит к активации воспалительного ответа и канцерогенеза [29].Кроме того, E-кадгерин увеличивает экспрессию факторов транскрипции, генов Wnt и воспалительных генов путем активации пути Wnt, что, в свою очередь, стимулирует рост клеток CRC [30]. Кроме того, Fn секретирует белок Fap 2, который нацелен на ингибирующий рецептор TIGIT (домен ингибирующего мотива на основе Т-клеточного иммуноглобулина и иммунорецепторного тирозина), который затем действует на Т-клетки и естественные клетки-киллеры; это действие ингибирует активацию Т-клеток и уничтожение опухолевых клеток, опосредованное естественными клетками-киллерами, способствует пролиферации опухолевых клеток и, таким образом, приводит к развитию CRC [31].

    Энтеротоксигенные Bacteroides fragilis

    Энтеротоксигенные Bacteroides fragilis ( ETBF ) являются грамотрицательными анаэробными бактериями [20]. Он продуцирует токсин B. fragilis (BFT) для участия в диарее, связанной с воспалением, или в образовании опухоли, вызванной воспалением [20]. BFT представляет собой цинкзависимый металлопротеиназный токсин, который связывается с рецепторами эпителиальных клеток толстой кишки, тем самым повышая проницаемость слизистой оболочки и секрецию цитокинов; затем он участвует в передаче различных сигналов в эпителиальных клетках толстой кишки, таких как активация пути Wnt и провоспалительных сигналов MAPK, управляя развитием структуры эпителиальной слизистой оболочки кишечника по пути воспаление-аденома-аденокарцинома [32].Эксперимент на мышах, проведенный Boleij et al. [33] показали, что BFT может усугубить воспалительную реакцию кишечника и прогрессирование опухоли; также было продемонстрировано, что BFT и Th27/IL-17 играют существенную роль в процессе канцерогенеза, индуцированного ETBF . Более того, BFT усиливает дифференцировку клеток костного мозга в супрессорные клетки миелоидного происхождения, а затем индуцирует развитие CRC через патогенные воспалительные пути [34].

    Escherichia coli

    Е.coli — кишечный комменсал человека, принадлежащий к грамотрицательным анаэробным бактериям [35]. Свидсински и др. [36] показали, что E. coli способны колонизировать слизистую оболочку толстой кишки; он увеличивает проницаемость слизистой оболочки за счет активации митогенной передачи сигналов Wnt, повреждения ДНК и вмешательства в процесс репарации ДНК, а также дисфункции E-кадгеринов, тем самым индуцируя развитие CRC [7, 37, 38]. E. coli можно разделить как минимум на 5 подтипов: A, B1, B2, D и E [39]. Согласно исследованию с использованием ксенотрансплантатов и моделей опухолей животных, связанных с воспалением [21], подтип B2 E.coli содержит консервативный генный остров — «поликетидсинтазу ( pks )», который продуцирует поликетидный пептид колибактин. Этот генотоксин может проникать через клеточные мембраны толстой кишки и мигрировать к ядру, где он вызывает двухцепочечные разрывы ДНК, остановку клеточного цикла и неполную репарацию ДНК, вызывая хромосомные аберрации, а затем канцерогенез [9-11]. pks могут индуцировать канцерогенез, повреждая ДНК [40-42]. В другом эксперименте на мышах удаление генных островков pks уменьшало повреждение ДНК и уменьшало количество бактериальных инфекций и образование опухолей без какой-либо воспалительной реакции; это еще раз подтверждает, что островок генов pks может индуцировать развитие CRC [22].Роль E. coli в CRC была также подтверждена патологическим анализом во французской популяции 50 пациентов с аденокарциномой и 33 с дивертикулезом [43].

    Salmonella

    Salmonella представляет собой группу грамотрицательных факультативно анаэробных бактерий, которые являются распространенными патогенами, обнаруживаемыми у людей и животных [44]. Распространенными источниками инфекции Salmonella являются зараженные пищевые продукты, такие как мясо, яйца и сельскохозяйственные продукты [45]. После инфекции Salmonella могут проявляться некоторые хронические осложнения, включая реактивный артрит, синдром раздраженного кишечника, воспалительное заболевание кишечника или канцерогенез [46, 47].Исследование, проведенное в популяциях американцев и голландцев Kato et al. [23] показали, что уровни экспрессии антител к жгутикам Salmonella были значительно выше у пациентов с колоректальным раком и предраковыми поражениями, чем у здоровых людей, при этом одним из опосредующих факторов было потребление пищи; это наводит на мысль о потенциальной связи между Salmonella и CRC [23]. Salmonella может секретировать эффекторный белок AvrA, чтобы способствовать ацетилированию и убиквитинированию белков-мишеней.AvrA ингибирует деградацию β-катенина, поддерживает стабильность β-катенина и способствует пролиферации эпителиальных клеток кишечника, тем самым способствуя онкогенезу. Кроме того, AvrA увеличивает разнообразие опухолей и стимулирует их прогрессирование [48, 49].

    Другие бактерии

    Desulfovibrio desulfuricans [50] и Enterococcus faecalis [51] представляют собой грамотрицательные и грамположительные анаэробные бактерии соответственно. Эти бактерии могут быть связаны с CRC, потому что их метаболиты (анион-радикалы сероводорода и супероксида) потенциально вредны для слизистой оболочки толстой кишки [52].Более того, Хан и др. [53] сообщили о случае анаэробной бактериемии с повышенным уровнем Parvimonas micra , который при раннем обследовании оказался локальным раком правой половины толстой кишки. Ю и др. [54] наблюдали обогащение Solobacterium moorei и генов, связанных с CRC, на ранней стадии CRC. Вместе эти исследования показывают, что P. micra и S. moorei , вероятно, связаны с развитием CRC.

    Микробные метаболиты, связанные с CRC

    Короткоцепочечные жирные кислоты

    Кишечные бактерии (e.g., Clostridium кластер IV и Fecalibacterium ) продуцируют короткоцепочечные жирные кислоты (SCFAs) посредством ферментации пищевых волокон, а продукты, включая бутират, ацетат, пропионат и валерат, действуют как регуляторы иммунного ответа [55]. ]. SCFAs могут поддерживать здоровье кишечной микробиоты и увеличивать микробное разнообразие. Кроме того, SCFAs играют положительную роль в барьерной функции кишечника, способствуя выработке слизи и экспрессии коннексина. Кроме того, SCFAs могут снизить концентрацию кислорода в полости кишечника и помочь поддерживать здоровую иммунную систему.Благодаря этим функциям SCFAs оказывают превентивное действие на развитие CDC [56]. Было обнаружено, что SCFAs ингибируют колит и связанный с ним канцерогенез, связываясь с рецептором Gpr109a [57]. Бутират, как один из наиболее важных членов семейства SCFA, обладает противовоспалительными и противоопухолевыми свойствами посредством клеточного метаболизма, гомеостаза микробиоты, иммунной регуляции и эпигенетической модуляции генов [56]. Исследование показало, что масляная кислота управляет апоптозом в клетках CDC, ингибируя экспрессию генов, регулирующих гистондеацетилазы [58].

    Другие метаболиты

    Другие метаболиты кишечных бактерий, в том числе вторичные желчные кислоты, дезоксихолевая кислота и литохолевая кислота, также связаны с развитием CRC [59]. Анаэробные кишечные бактерии расщепляют желчные кислоты, оставшиеся в кишечнике, на дезоксихолевую кислоту и литохолевую кислоту, обе из которых могут вызывать повреждение ДНК путем образования свободных радикалов и, таким образом, увеличивать риск развития CRC [60]. Сообщается, что первичные и вторичные желчные кислоты связаны с CDC [61-63].Диета с высоким содержанием жиров может привести к увеличению синтеза желчных кислот в печени, что, в свою очередь, увеличивает накопление желчных кислот в кишечнике. Первичные желчные кислоты превращаются во вторичные желчные кислоты с помощью 7-α-дегидроксилазы, продуцируемой кишечной микробиотой. Вторичные желчные кислоты, особенно дезоксихолевая кислота, считаются генотоксичными, поскольку они могут вызывать повреждение ДНК в эпителиальных клетках слизистой оболочки кишечника [64] и способствовать развитию и прогрессированию опухолей кишечника [65]. Кроме того, кишечные бактерии производят несколько вредных соединений, которые могут играть роль в CDC и воспалительных заболеваниях кишечника.Например, аммиак, фенолы, p -крезол, некоторые амины и сероводород, вероятно, участвуют в возникновении или ухудшении состояния рака из-за хронического воспаления и повреждения ДНК [66].

    Механизмы дисбактериоза кишечной микробиоты в развитии КРР

    В последние годы, с развитием методов культивирования, высокопроизводительного секвенирования и мультиомных исследований, появляется все больше доказательств того, что дисбактериоз кишечной микробиоты тесно связан с развитием и прогрессированием КРР [7]. , 67].Возможные механизмы, с помощью которых дисбактериоз кишечной микробиоты стимулирует развитие CRC, обобщены в таблице 1. взаимодействие между комменсальными бактериями и иммунными клетками составляет тонкий баланс: провоспалительные гены и онкогены против противовоспалительных генов и антионкогенов [88].В случае дисбиоза кишечной микробиоты было обнаружено, что активация воспалительных путей, опосредованная воспалительной микросредой, стимулирует развитие и прогрессирование CRC. Иммунные клетки в микроокружении и продуцируемые ими цитокины и факторы роста активируют связанные сигнальные пути, такие как Wnt, Notch и TGF-β, которые, в свою очередь, влияют на самообновление эпителиальных клеток слизистой оболочки толстой кишки. Эти компоненты также активируют факторы транскрипции NF-KB и STAT3, тем самым влияя на восстановление тканей толстой кишки и иммунный гомеостаз.Более того, они активируют пути MAPK и Akt/PKB, что влияет на митоз и выживание клеток толстой кишки [89]. ETBF может повышать уровни хемокина L20 и простагландина E2 в эпидермальных клетках кишечника; простагландин E2 участвует в пролиферации и активации клеток Th27 и усиливает секрецию IL-17 и родственных факторов клетками Th27, что приводит к развитию CRC, связанного с воспалением [90, 91]. Микробные продукты воспринимаются Toll-подобными рецепторами, которые запускают опосредованную MyD 88 продукцию провоспалительного цитокина IL-23.IL-23 активирует продукцию IL-17a, IL-6 и IL-22 и тем самым способствует развитию CRC [92]. Более того, дисбиоз кишечной микробиоты индуцирует выработку генотоксинов и метаболитов, связанных с опухолью, что, в свою очередь, вызывает нарушения иммунного ответа, способствует и поддерживает воспалительное заболевание кишечника и приводит к развитию КРР.

    Иммунный ответ

    Тесный контакт между кишечной микробиотой и иммунной системой слизистой оболочки также стимулирует туморогенные иммунные реакции посредством эндогенных бактерий.Иммунитет Th27 обычно канцерогенен и связан с неблагоприятным прогнозом CRC; его активация обусловлена ​​микробами и их продуктами [92]. Например, Fn использует Fap2 для клеточной адгезии и напрямую взаимодействует с иммуносупрессивными рецепторами Т-клеток через TIGIT, что приводит к потере функции лимфоцитов, убивающих опухоль [31]. Во-вторых, Fn модулирует обогащение супрессорных клеток миелоидного происхождения и ассоциированных с опухолью макрофагов, которые ингибируют противоопухолевый Т-клеточный ответ [81].

    Повреждение ДНК

    Накопление повреждений ДНК может привести к нарушению стабильности генома хозяина и затем способствовать сохранению или ускорению мутаций в предраковых и раковых клетках [93]. Кишечные микробы как раз и являются потенциальным источником мутагенов ДНК. Исследования in vitro и in vivo показали, что около энтерококков spp. производят активные формы кислорода, такие как гидроксильные свободные радикалы [83]; эти вещества могут вызывать разрывы ДНК, точечные мутации и перекрестное связывание белок-ДНК, снижая стабильность генов, связанных с CRC [84].Различные животные модели CRC также продемонстрировали, что ETBF индуцирует экспрессию сперминоксидазы на эпителии толстой кишки; этот фермент может вызывать повреждение ДНК [40]. Кроме того, pks -положительные E. coli способствуют разрывам двухцепочечной ДНК, остановке клеточного цикла и делению анеуплоидных клеток in vivo [21, 22, 82]. Недавно было также обнаружено, что дифференциальная численность нескольких кишечных бактерий связана с мутациями NRAS , TP53 и RAS у хозяина, основываясь на секвенировании гена 16S рРНК фекальных бактерий у 83 пациентов с колоректальным раком и 60 здоровых. контроля из Ирана и Финляндии [94].Микробы прямо или косвенно вызывают повреждение ДНК и влияют на стабильность генома, что делает микробиом потенциальным фактором риска и терапевтической мишенью для CRC.

    Модуляция клеточной пролиферации

    Сигналы, вызывающие рост и гибель, строго модулируются в нормальных тканях для поддержания клеточной структуры и функции. Как только нарушения клеточной пролиферации и апоптотических сигналов вызывают продолжение клеточной пролиферации, в конечном итоге формируются злокачественные опухоли [95]. Мыши, инфицированные Citrobacter rodentium , могут опосредовать активацию Wnt-β-катенина через R-spondin 2, что приводит к избыточной пролиферации и плохой дифференцировке кишечных стволовых клеток [86]. ETBF высвобождает BFT для стимуляции расщепления E-кадгерина, а также способствует ядерной транслокации β-катенина, активизации транскрипции протоонкогена c-Myc и пролиферации эпителия толстой кишки [87]. По сходному механизму Fn связывается с E-кадгерином через Fad A, затем активируя нижестоящие пути и облегчая пролиферацию эпителиальных клеток [30]. Таким образом, прошлые исследования показали, что искаженная микробиота кишечника является источником сигнала, который активирует аномальную пролиферацию эпителиальных клеток и способствует раннему прогрессированию опухоли.

    Специфическая микробиота как диагностический биомаркер КРР

    Пациенты с КРР и здоровые люди имеют существенно различающиеся микробиоты кишечника в фекалиях [96]. Следовательно, микробиота кишечника может служить микробным маркером риска развития CRC, который можно использовать для скрининга CRC и предраковых поражений. В более раннем исследовании Zackylar et al. [97] использовали высокопроизводительное секвенирование для скрининга дифференциальных родов бактерий в образцах фекалий, собранных у 30 здоровых людей из контрольной группы, 30 пациентов с аденомой толстой кишки и 30 пациентов с CRC в Англии, а затем построили модель микробного прогноза.Предложенная модель в сочетании с факторами риска, связанными с КРР, существенно улучшила способность различать здоровые контроли, аденомы и КРР, достигнув 50-кратного увеличения частоты выявления КРР. Впоследствии Ли и соавт. [98] и Komiya et al. [99] протестировали 40 генов и 5 сигнальных путей в 2 группах пациентов с КРР ( Fn -высокий и Fn -низкий). Они обнаружили, что частота мутаций генов AMER1 и ATM и пути TGF-β была выше в группе Fn -high, чем в группе Fn -low, а Fn -high была связана с плохим прогнозом CRC.Совсем недавно Колов и соавт. [100] обнаружили, что высокие уровни Fn и, возможно, B. fragilis были связаны с худшим прогнозом после операции по поводу CDC. Кроме того, многофакторный анализ подтвердил, что Fn -high является независимым отрицательным прогностическим фактором для CRC.

    Ю и др. [54] обнаружили, что помимо Fn и Peptostreptococcus stomatis , которые были идентифицированы ранее, P. micra , S. moorei и гены, связанные с CRC, были обогащены на ранней стадии CRC.Таким образом, эти виды можно использовать в качестве инструмента ранней диагностики CRC, чтобы точно отличить пациентов с CRC от здорового населения. Шах и др. [101] проанализировали необработанные данные о последовательности гена 16S рРНК фекального микробного сообщества из 9 исследований CRC. Они обнаружили, что специфическая микробиота, включая P. micra ATCC 33270 и Streptococcus , была значительно увеличена у пациентов с колоректальным раком, что позволяет эффективно различать пациентов с колоректальным раком и здоровых людей. Несмотря на технические различия в различных методах исследования или процессах биоинформатики, ключевые микробные маркеры имеют решающее значение для классификации случаев КРР, и их можно использовать для общей диагностики заболевания КРР [101].

    Заключение

    Микробиота кишечника систематически участвует в питании, обмене веществ и иммунных функциях организма человека. Дисбактериоз кишечной микробиоты вызывает дисбаланс в микробном гомеостазе, в то время как специфическая микробиота индуцирует развитие CRC и способствует его прогрессированию различными путями, такими как воспалительная реакция, повреждение ДНК и/или стимулирование клеточной пролиферации. Видовые различия в микробиоте кишечника во время онкогенеза могут быть использованы в качестве биомаркера и диагностического инструмента для CRC.Ожидается, что в ходе дальнейших исследований будут обнаружены конкретные виды микробов и их метаболиты, тесно связанные с развитием и прогрессированием КРР, которые обеспечат новые стратегии прогнозирования, профилактики и клинических исследований КРР.

    Заявление о конфликте интересов

    У авторов нет конфликта интересов, о котором следует заявить.

    Источники финансирования

    Нет источников финансирования для объявления.

    Вклад авторов

    X.F. и LJ задумали и разработали исследование, составили проект статьи и утвердили окончательный вариант.Г.К. и Х.М. разработал исследование, критически отредактировал статью и утвердил окончательный вариант. Л.З. задумал и разработал исследование, критически отредактировал статью и утвердил окончательный вариант.

    Авторское право: Все права защищены. Никакая часть данной публикации не может быть переведена на другие языки, воспроизведена или использована в любой форме и любыми средствами, электронными или механическими, включая фотокопирование, запись, микрокопирование или любую систему хранения и поиска информации, без письменного разрешения издателя. .
    Дозировка препарата: авторы и издатель приложили все усилия, чтобы гарантировать, что выбор препарата и дозировка, указанные в этом тексте, соответствуют текущим рекомендациям и практике на момент публикации. Тем не менее, в связи с продолжающимися исследованиями, изменениями в правительственных постановлениях и постоянным потоком информации, касающейся лекарственной терапии и реакций на лекарства, читателю настоятельно рекомендуется проверять вкладыш в упаковке для каждого лекарства на предмет любых изменений в показаниях и дозировке, а также для дополнительных предупреждений. и меры предосторожности.Это особенно важно, когда рекомендуемый агент является новым и/или редко используемым лекарственным средством.
    Отказ от ответственности: заявления, мнения и данные, содержащиеся в этой публикации, принадлежат исключительно отдельным авторам и участникам, а не издателям и редакторам. Появление рекламы и/или ссылок на продукты в публикации не является гарантией, одобрением или одобрением рекламируемых продуктов или услуг или их эффективности, качества или безопасности.Издатель и редактор(ы) отказываются от ответственности за любой ущерб людям или имуществу в результате любых идей, методов, инструкций или продуктов, упомянутых в содержании или рекламе.

    Дисбактериоз микробиоты при раке легкого: доказательства связи и потенциальные механизмы – Xu

    Введение

    Человеческое тело населено триллионами микробов (т. е. бактерий, архей, грибков, протистов и вирусов), которые все чаще считаются критически важными для здоровья человека (1,2).Симбиотические сообщества в нашем организме участвуют в деградации питательных веществ, борьбе с инвазией ксенобиотиков, уничтожении патогенов и созревании нашей иммунной системы (3). Ограниченные развитием экспериментальных методов и технологий, наши знания об этом обширном микробиоме, по-видимому, ранее были очень ограниченными. С развитием и распространением технологии секвенирования мы получили глубокое понимание микробиома человека; таким образом, наше понимание роли микробиома в здоровье и болезнях человека значительно расширилось (4,5).На основе ключевых характеристик микробиома, включая микробное разнообразие, относительную численность и богатство микробных генов, исследования консорциума проекта микробиома человека продемонстрировали, что здоровые люди имеют высокое бактериальное разнообразие и отчетливую индивидуальную изменчивость на уровне видов (6,7). Недавние исследования продемонстрировали сложное взаимодействие между микробиомом человека и различными состояниями заболеваний, включая рак (8-11). Например, Helicobacter pylori , распространенная протеобактерия , обитающая в верхних отделах желудочно-кишечного тракта, значительно увеличивает риск рака желудка и канцерогенеза поджелудочной железы (12,13).Кроме того, было показано, что Enterotoxigenic Bacteroides fragilis , как один из наиболее распространенных патобионтов, обнаруженных у пациентов с колоректальным раком, индуцирует онкогенез толстой кишки мышей путем образования мутагенов ДНК, таких как генотоксин, супероксид и перекись водорода (14). В дополнение к исследованиям, посвященным отдельным патогенным видам, все больше исследований выявляют изменения в составе микробиоты в различных анатомических участках, связанные с канцерогенезом (15). Кроме того, убедительные доказательства свидетельствуют о том, что физиологические факторы и факторы окружающей среды, включая диету, курение, употребление алкоголя и загрязнение воздуха, значительно изменяют состав микробиоты в различных анатомических участках (16).Эти факторы часто связаны с канцерогенезом. Таким образом, необходимы обширные исследования для дальнейшего выявления связи между микробиотой и развитием рака. Рак легкого, являющийся ведущей причиной смерти от рака среди мужчин и женщин во всем мире, демонстрирует рост заболеваемости в развивающихся странах (17). Он имеет мрачный прогноз, то есть более половины людей, у которых диагностирован рак легких, умирают в течение одного года после постановки диагноза, а пятилетняя выживаемость составляет менее 18% (18). Двумя основными гистологическими группами рака легкого являются мелкоклеточная карцинома легкого (МРЛ, 15% всех случаев рака легкого) и немелкоклеточная карцинома легкого (НМРЛ, 85% всех видов рака легкого).НМРЛ далее подразделяется на плоскоклеточный рак, аденокарциному и крупноклеточный рак (19). Хотя этиология, морфология и внутренний молекулярный характер хорошо охарактеризованы, мало что известно о взаимосвязи рака легких с микробиотой легких. В этом обзоре мы в основном суммируем текущий прогресс исследований микробиоты легких и роли микробиома легких при различных заболеваниях легких и других связанных с ними заболеваниях, особенно при раке легких. Кроме того, мы сосредоточимся на изменении микробиома легких и потенциальных патогенных механизмах, чтобы обеспечить теоретическую основу для лечения этого смертельного заболевания.


    Микробиота легких у здоровых людей и заболевания легких

    Хотя легкие связаны с наружным воздухом, легкие здоровых людей даже ранее долгое время считались стерильными. В последнее время большое количество исследований подтверждают наличие микробиоты легких у здоровых людей. В предыдущих исследованиях использовались независимые от культуры молекулярные методы для анализа наиболее распространенных бактериальных типов, включая Bacteroidetes , Firmicutes и Proteobacteria , а также известные роды, включая Prevotella , Veillonella и 9024cus -23).Эти роды также обнаруживаются в оральных образцах. Кроме того, легкие содержат специфические бактерии, такие как Enterobacteriaceae , Haemophilus , Methylobacterium , Ralstonia и Tropheryma видов (21,24). В здоровых легких микробная плотность низкая, содержит от 10 3 клеток/г до 10 5 клеток/г ткани (для сравнения, кишечная микробиота достигает плотности от 10 11 до 10 12 клеток/г) (25,26).Состав легочной микробиоты определяется балансом между микробной иммиграцией из верхних дыхательных путей и элиминацией микробов (например, при кашле или иммунной защите) с относительно небольшим вкладом регионального роста самих микробов (27-29). Иммиграция микробов из верхних дыхательных путей происходит в основном путем микроаспирации. Эта точка зрения может быть поддержана высоким сходством между микробиотой нижних дыхательных путей и ротоглотки, а не носоглотки.Микроаспирация — пассивный процесс с вовлечением ротовой и глоточной мускулатуры; в основном это происходит во время сна (8). Тем не менее, исследование с использованием секвенирования гена 16S рРНК показывает сходство микробиоты легких с микробиотой ротоглотки и носоглотки у детей раннего возраста (23). Это может быть связано с различной анатомической структурой верхних дыхательных путей у детей и взрослых. Баланс между микробной иммиграцией (например, посредством микроаспирации) и микробной элиминацией (например, мукоцилиарный клиренс, кашель и иммунная защита хозяина) определяет состав микробиоты легких.

    Кроме того, еще один уровень сложности добавляется влиянием условий окружающей среды (например, pH, температуры, питательных веществ, напряжения кислорода и активации воспалительных клеток хозяина) на этот процесс. Таким образом, географические, физиологические и иммунологические различия также формируют состав микробиоты легких (30,31). Недавние исследования показали, что атмосферная концентрация (мкг/м 3 ) твердых частиц диаметром 10 и 2.5 микрометров (PM10 и PM2,5) могут повлиять на микробиоту легких и дыхательные функции (32–34). Кроме того, бытовое загрязнение воздуха играет роль в составе микробиома легких (35,36). Сообщалось, что курение как фактор риска легочных заболеваний изменяет микробное разнообразие и сообщества в нижних дыхательных путях мышей и людей (37,38). Антибиотик — еще один важный фактор, влияющий на микробиоту легких; в последние годы он привлек к себе большое внимание. Однако влияние антибиотиков на микробиоту в основном сосредоточено на кишечных исследованиях; меньше известно о влиянии на состав микробиома легких (39-41).Недавнее исследование показало, что после одного года лечения азитромицином у пациентов с астмой уменьшилось бактериальное разнообразие (42). Аналогичным образом лечение азитромицином снижало альфа-разнообразие у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ), но не изменяло общую бактериальную нагрузку (43).

    У пациентов с заболеваниями легких нарушается баланс между иммиграцией и элиминацией. Таким образом, микробиота легких изменена, количество симбиотических бактерий снижено, преобладают патогенные бактерии.Это изменение приводит к уменьшению разнообразия микробиоты легких и связано с прогрессированием хронических заболеваний легких, таких как ХОБЛ (44–54), муковисцидоз (55–58), астма (59–62), идиопатический легочный фиброз. (63-65) ( Таблица 1 ).

    Таблица 1 Текущие данные о взаимосвязи между микробиотой легких и неонкологическим поражением легких
    Полная таблица

    Таким образом, гомеостаз микробиоты легких связан с балансом между иммунной защитой патогенов и иммунной толерантностью комменсалов.С одной стороны, легкие хозяина установили три основных пути защиты от вторжения патогенов. Во-первых, слизь, в основном секретируемая бокаловидными и булавовидными клетками, обеспечивает эффективную защиту от повреждения эпителия и ограничивает миграцию патогенов в эпителиальные клетки. Таким образом предотвращается систематическое распространение микробов в организме; также предотвращается воспаление и защищается гомеостаз микробиоты и хозяина (66,67). Во-вторых, альвеолярный сурфактант, содержащий sIgA, покрывает поверхность альвеолярных эпителиальных клеток легких и участвует в врожденном иммунитете легких (68).Наконец, слой эпителиальных клеток является не только структурным барьером, но и компонентом врожденной защиты хозяина. Эпителиальные клетки экспрессируют несколько рецепторов распознавания образов (PRR) и секретируют противомикробные молекулы и муцины для защиты от вторжения патогенов (69). PRR, включая толл-подобный рецептор (TLR) и рецепторы, подобные домену олигомеризации, связывающему нуклеотиды, могут предотвращать перегрузку патогенами или метаболитами путем идентификации молекулярных паттернов, связанных с патогенами, или молекулярных паттернов, связанных с повреждением клеток (70,71).Затем патогены дополнительно элиминируются путем активации нижестоящего воспалительного сигнального пути (72). С другой стороны, иммунная толерантность комменсалов регулируется противовоспалительными макрофагами в альвеолах путем ингибирования путей воспаления и адаптивных иммунных реакций (73,74).


    Связь между микробиомом кишечника и микробиомом легких

    В последнее время многие исследования начали сосредотачиваться на двухстороннем пути между кишечником и легкими, известном как «ось кишечник-легкие» (75).Эта теория основана на «кишечно-лимфатической» теории Samuelson et ​​al. (76). Согласно теории, многие макрофаги и другие иммунные клетки присутствуют в подслизистой оболочке кишечника или брыжеечных лимфатических узлах, содержащих много транслоцирующих бактерий. Если они не устраняются первой линией защиты, то выжившие бактерии, фрагменты клеточных стенок или белковые фрагменты мертвых бактерий высвобождаются вместе с цитокинами и хемокинами, вырабатываемыми в кишечнике, и перемещаются по брыжеечной лимфатической системе в цистерну хили. а затем в кровеносную систему.Одним из путей является доступ к малому кругу кровообращения, что приводит к локальной активации дендритных клеток и макрофагов, а также к инициации и дифференцировке Т-клеток. Другим путем является активация иммунных клеток, которые воздействуют на область легкого путем собственной миграции при первом контакте с антигеном в слизистой оболочке кишечника. Следовательно, кишечные микробиомы влияют на микробиом легких частично за счет вдыхания желудочно-пищеводного содержимого, заглатывания мокроты и, что наиболее важно, за счет модуляции иммунитета хозяина.

    Исследования показали, что сигаретный дым, как основной фактор риска ХОБЛ, также может изменять состав кишечной микробиоты и снижать разнообразие кишечных бактерий (77), а изменение состава микробиоты тесно связано со многими воспалительными заболеваниями, включая воспаление кишечника и воспалительное заболевание кишечника (ВЗК) (75,78,79). Многие респираторные инфекции часто сопровождаются желудочно-кишечными симптомами, учитывая двунаправленность «кишечно-легочной оси» (80).Это открытие также было продемонстрировано на животных моделях с респираторной инфекцией (81,82). Однако прямых доказательств влияния микробиоты легких и ее продуктов на их циркуляцию нет. Эксперимент на животных показал, что неабсорбируемый индикатор, попадающий в носовую полость, впоследствии может быть обнаружен в желудочно-кишечном тракте (83). Необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить и расширить эти выводы.


    Микробиом и рак легких

    Микробиом полости рта и рак легких

    Микробиом полости рта тесно связан с микробиомом легких, поскольку легкие непосредственно связаны с полостью рта.В последнее время значительное внимание уделяется связи микробиома полости рта с раком легких. Несколько проспективных когорт последовательно показали, что заболевания пародонта, которые, как известно, изменяют микробиоту полости рта, связаны с повышенным риском рака легких после контроля потенциальных искажающих факторов, включая курение (84-88). Результаты секвенирования гена 16S рРНК микробиома слюны свидетельствуют о повышенном количестве Capnocytophaga и Veillonella при сниженном количестве Neisseria (89).Другое исследование с участием некурящих женщин с раком легких показало, что представители родов Blastomonas и Sphingomonas были значительно повышены в микробиоте ротовой полости пациентов с раком легких, тогда как Acinetobacter и Streptococcus были выше в контрольной группе (90). Хотя связь между заболеванием пародонта и раком легких обычно считается сильной, причинно-следственная связь остается большой проблемой, и необходимы дальнейшие исследования для оценки потенциальных механизмов.

    Микробиом легких и рак легких

    Исследования показали, что пациенты с раком легких могут иметь сходную микроэкологию легких.Краткий обзор взаимосвязи между микробиотой легких и раком легких показан в таблице 2 (30,91-102). Хасэгава и др. собирали интраоперационную бронхиальную жидкость с помощью зонда для микропроб у девяти пациентов с карциномой легких и культивировали в анаэробных условиях на чашках с кровяным агаром. Преобладающие изоляты из интраоперационной бронхиальной жидкости обычно происходят из полости рта, а именно: Streptococcus , Veillonella , Gemella , Porphyromonas , Olsenella и Ei 9029 9.Эти данные указывают на то, что интраоперационная бронхиальная жидкость содержит бактерии, вероятно происходящие из микробиоты полости рта (93). Результаты другого исследования образцов чистящих средств дыхательных путей показали, что известные типы или роды также преобладали в образцах полости рта пациентов с раком легких (94). Саймон и др. собрали образцы мокроты от 10 пациентов с возможным РЛ, у четырех из которых в конечном итоге был диагностирован РЛ (ЛК+), а у шести не было РЛ через год (ЛК-). Среди семи видов бактерий, обнаруженных во всех образцах, Streptococcus viridans были значительно выше в LC+.Среди пяти видов, имеющих значительно более высокую численность в LC+, Granulicatella adiacens показали самый высокий уровень изменения численности. Тем более, G . Обилие adiacens коррелировало с шестью другими видами бактерий только в образцах LC+, а именно с Enterococcus sp . 130 , Streptococcus intermedius , Escherichia coli , S . viridans , Acinetobacter junii и Streptococcus sp . 6 , которые могут быть связаны со стадией ЖК. Результаты этого исследования показали, что спонтанная мокрота может быть жизнеспособным источником бактериальных биомаркеров для статуса и стадии РЛ (91). Другое исследование образцов мокроты некурящей пациентки с РЛ показало обогащение Granulicatella , Abiotrophia и Streptococcus (92). Ли и др. изучал бронхоальвеолярную жидкость из 28 пациентов и обнаружил, что актероиды , 70294, и протебактерии , и протеабактерии были наиболее распространенные Phyla, и Prevotella , STREPTOCOCCUS , и Neisseria были наиболее распространенными родами в обеих группах. .Относительная численность двух типов ( Firmicutes и TM7 ) и четырех родов ( Veillonella , Megasphaera , Atopobium и Selenomonas ) была значительно увеличена у пациентов с раком легких. Кроме того, комбинация двух родов ( Veillonella и Megasphaera ) показала более высокое значение рабочих характеристик приемника, чем отдельный род, в прогнозировании рака легких. Таким образом, эту комбинацию можно использовать в качестве биомаркера рака легкого.Другим примечательным открытием было то, что у курящих пациентов с раком легкого соотношение Firmicutes к Bacteroidetes было значительно выше, чем у некурящих пациентов (92). Подобный результат также показан при исследовании образцов легочной ткани при ХОБЛ (47). Кроме того, при ХОБЛ сообщалось об увеличении числа филумов TM7 (48). Эти результаты еще раз подтверждают мнение о тесной взаимосвязи между ХОБЛ и раком легких, как указано в других исследованиях (103,104).

    Таблица 2 Текущие данные о взаимосвязи между микробиотой легких и раком легких
    Полная таблица

    В большинстве предыдущих исследований микробиоты легких использовались образцы перорального приема, мокроты или бронхоскопии.Общая проблема с этими образцами заключается в том, что они могут быть загрязнены микробиотой верхних дыхательных путей или ротовой полости. Некоторые исследования предполагают, что бактерии в канцерогенезе легких могут быть связаны с аспирацией бактерий полости рта или глотки. Однако исследование 165 доброкачественных образцов легочной ткани онкологических больных показало, что микробиота легких имеет определенные особенности, которые отличаются от микробиоты ротовой полости и других участков тела. На самом деле в нем преобладают протеобактерии .Аналогичные результаты других исследований показывают преобладание Proteobacteria в образцах легочной ткани при раке легкого (97,98,102). Кроме того, род Thermus более распространен в тканях пациентов с поздней стадией, а Legionella высок у пациентов с метастазами (30). Кроме того, на микробиоту легких влияет загрязнение воздуха и курение табака.

    Таким образом, у пациентов с раком легкого наблюдаются изменения в относительной распространенности нескольких родов.Последовательные выводы из всех недавних исследований ограничены из-за небольшого размера выборки в большинстве исследований и гетерогенности рака легких. Однако большинство исследований показывают, что Streptococcus и Proteobacteria могут быть ключевыми бактериями рака легких. Тем не менее, необходимы дальнейшие крупномасштабные исследования для проверки определенных микробных биомаркеров у пациентов с раком легких.

    Возможные механизмы, опосредующие микробиоту легких и рак легких

    Дисбиоз микробиома в основном проявляется уменьшением количества симбиотических бактерий и увеличением количества патогенных бактерий, а затем вызывает канцерогенез на нескольких уровнях, включая изменение метаболизма, воспаление и иммунный ответ (105,106).Нынешние исследования механизмов микробиоты и рака в основном сосредоточены на кишечной флоре и раке толстой кишки (107-109). При нарушении регуляции кишечная микробиота может способствовать развитию колоректального рака за счет модуляции иммунной функции и продукции метаболитов микробного происхождения (110). Увеличение количества патогенных бактерий может привести к хроническому воспалению из-за постоянного образования медиаторов воспаления, тем самым влияя на клеточный апоптоз и усиливая мутации.Более того, метаболиты бактерий, такие как реактивный кислород и азот, посредством прямого повреждения ДНК или модификации клеточной передачи сигналов создают проканцерогенную среду. Бактерии влияют на клеточную сигнализацию и/или индуцируют воспаление слизистой оболочки, чтобы инициировать или способствовать онкогенезу толстой кишки за счет продукции различных онкогенных токсинов, непосредственно повреждающих ДНК (111).

    Однако исследований механизма микробиоты легких и рака легких немного. Прилагаются большие усилия, чтобы выявить и охарактеризовать возможную причинно-следственную связь между раком легких и взаимодействием легочных микробов.

    Большое когортное исследование Boursi et ​​al. продемонстрировали, что повторное воздействие некоторых антибиотиков (пенициллинов, цефалоспоринов или макролидов) может повышать риск развития рака легких (112). Вызванный антибиотиками дисбиоз не только изменяет численность, состав и разнообразие бактерий в моделях на животных, но также ускоряет LC Льюиса, который прогрессирует на стороне хозяина (113). Дисбактериоз легочной микробиоты может способствовать развитию рака легкого за счет высвобождения бактериальных метаболитов, способствующих развитию рака, и индукции воспалительных путей хозяина (114).Возможные механизмы, опосредующие микробиоту легких и рак легких, проиллюстрированы на рис. 1 .

    Рисунок 1 Возможные механизмы, опосредующие микробиоту легких и рак легких. Комменсальная микробиота способствует иммунной толерантности за счет уменьшения воспаления легких и рекрутирования дендритных клеток. Макрофаги и Т-клетки реагируют на микробную колонизацию и предотвращают перегрузку патогенами или метаболитами (левая панель).Когда баланс нарушен, патогены или метаболиты усиливают экспрессию медиаторов воспаления и цитокинов (например, IL-1, IL-23, TNF и IL-17), воздействуя на MAMP. Эти медиаторы воспаления или цитокины запускают нижестоящие критические сигнальные пути (например, пути STAT3 и NF-kB и пути ERK и PI3K), которые способствуют канцерогенезу клеток-хозяев.

    Метаболизм

    Недавние исследования показали, что метаболиты бактерий могут быть вовлечены в развитие рака легких.Цитолетальный токсин растяжения (CDT) как бактериальный генотоксин, продуцируемый различными грамотрицательными бактериями, такими как Actinobacillus , может индуцировать апоптоз в клеточной линии аденокарциномы легкого человека A549 (115). Г . Было обнаружено, что adiacens связаны с раком легких. Кроме того, исследование функциональных возможностей показало, что G . adiacens участвовал в метаболизме полиамина (91). Интересно, что повышенные уровни полиаминов, таких как путресцин и гамма-аминомасляная кислота, связаны с целым рядом видов рака, включая злокачественные новообразования легких (116).Апопа и др. обнаружили, что количество Cyanobacteria было значительно увеличено при аденокарциноме легкого, и функциональный анализ показал, что токсин Cyanobacteria (т. е. микроцистин) может быть связан с увеличением проциклического кислого повторяющегося белка 1 (PARP1), тем самым воспаления и приводит к раку. Результат был дополнительно подтвержден на клеточных линиях аденокарциномы легкого (A427), зараженных микроцистином (98).

    Кроме того, некоторые бактерии кишечного микробиома могут повышать биодоступность противоопухолевых препаратов.Ниу предположил, что Bacteroidaceae и Prevotellaceae содержат виды, способные гидролизовать гинсенозиды, присутствующие в экстракте красного женьшеня (RGE), усиливая эффект RGE в профилактике и лечении рака легких (117). Это открытие указывает на то, что уменьшение количества симбиотических бактерий может ускорить прогрессирование LC.

    Пути воспаления и иммунный ответ

    В последние годы обширные исследования показали, что хроническое воспаление играет важную роль в развитии нескольких форм рака, включая рак легких.Дисбиоз микробиоты может активировать воспалительный путь, чтобы вызвать пролиферацию и выживание эпителиальных клеток при определенных условиях, способствуя развитию опухолей. TLR4, как член рецептора распознавания образов, инициирует естественный иммунитет на ранней стадии инвазии патогенов. Все больше данных показывают, что он играет решающую роль в развитии микроокружения опухоли, и все больше его исследуют. TLR способствуют канцерогенным эффектам, активируя путь ядерного фактора κB (NF-κB), высвобождая воспалительный фактор и активируя транскрипцию 3 (STAT3) (118).TLR4 более сильно экспрессируется в ткани рака легкого, чем в ткани парарака (119).

    Очоа и др. обнаружили, что воздействие на дыхательные пути частиц дыма и нетипируемого штамма Haemophilus influenzae (NTHi) способствует пролиферации клеток рака легкого за счет высвобождения IL-6 и TNF, которые дополнительно активируют пути STAT3 и NF-kB в эпителии дыхательных путей (120). Другое исследование показало, что блокада IL-6 значительно ингибирует развитие рака легкого, внутреннюю активацию STAT3 опухолевых клеток, пролиферацию опухолевых клеток и маркеры ангиогенеза (121).

    Кроме того, было установлено, что воспаление, опосредованное клетками Th27, играет критическую роль в онкогенезе легких (122). Юнгникель и др. указали, что эпителиальный цитокин IL-17C опосредует опухолевый эффект бактерий, таких как NTHi, посредством нейтрофильного воспаления (123). В последнее время наблюдается растущее осознание важности NTHi в патофизиологии ХОБЛ, и ХОБЛ-подобное воспаление дыхательных путей, вызванное NTHi, обеспечивает микроокружение опухоли, которое способствует продвижению и прогрессированию опухоли легких (124-126).Таким образом, NTHi может действовать как мост между ХОБЛ и раком легких.

    Кроме того, накопленные данные показали, что активация пути PI3K играет центральную роль в пролиферации клеток, выживании и инвазии тканей при раннем раке легкого (127). Цай и др. сообщили, что оральные таксоны ( Streptococcus и Veillonella ), обогащенные нижними дыхательными путями пациентов с раком легких, были связаны с активацией сигнальных путей ERK и PI3K, и те же самые сигнальные пути активировались in vitro воздействием эпителиальные клетки дыхательных путей к Veillonella , Prevotella и Streptococcus (128).Эти исследования предварительно показали, что легочные бактерии усиливают экспрессию медиаторов воспаления и цитокинов, воздействуя на ассоциированные с микробами рецепторы распознавания молекулярных образов (MAMP), тем самым влияя на развитие рака легких.


    Применение микробиома легких в клинических испытаниях

    Большинство экспериментальных исследований, анализирующих применение микробиоты легких в клинической терапии, в основном были сосредоточены на животных моделях.Соответствующая тема контента была освещена в нескольких обзорах (11 129 130). Наиболее часто изучаемыми микроорганизмами в контексте заболевания легких являются известные пробиотики, такие как Lactobacillus и Bifidobacterium . Их благоприятная роль в моделях заболеваний легких на животных была хорошо продемонстрирована (130). Например, было показано, что перорально или интраназально вводимые Lactobacillus и Bifidobacterium защищают мышей от легочной инфекции за счет увеличения продукции антител, повышения активности естественных клеток-киллеров и продукции IFN-γ, а также увеличения секреции IL-10.Кроме того, было показано, что Lactobacillus и Bifidobacterium оказывают благотворное влияние на аллергическое воспаление дыхательных путей, индуцируя клетки T reg и клетки T H 1. В настоящее время экспериментальные исследования по применению легочного микробиома при раке легкого относительно ограничены. Было показано, что пероральное введение Lactobacillus acidophilus на модели рака легких у мышей уменьшает размер опухоли и увеличивает выживаемость после лечения цисплатином (131).Кроме того, введение Enterococcus hirae и Barnesiella intestinihominis в сочетании с химиоиммунотерапией может значительно улучшить эффективность у пациентов с распространенным раком легкого (132).


    Выводы

    Таким образом, накапливаются данные о том, что специфические бактерии являются биомаркерами присутствия рака легких. Однако точный механизм влияния легочной микробиоты на регуляцию рака легких до сих пор частично неясен.Будущие исследования причинной роли этих бактерий в канцерогенезе легких будут полезны для нашего понимания взаимодействий между микробиотой легких и функцией легких, что также ценно для определения терапевтических целей для профилактики и лечения рака легких.


    Благодарности

    Финансирование: Это исследование было поддержано Национальным фондом естественных наук Китая (81871734, 81471994, 81700463, 81700389), Медицинским талантом провинции Цзянсу (ZDRCA2016053), Проектом шести талантов провинции Цзянсу (WSN-135), Advanced Health талант шести-один проект провинции Цзянсу (LGY2016042).


    Конфликты интересов: Все авторы заполнили единую форму раскрытия информации ICMJE (доступна по адресу http://dx.doi.org/10.21037/tlcr-20-156). У авторов нет конфликта интересов, о котором следует заявить.

    Заявление об этике: Авторы несут ответственность за все аспекты работы, обеспечивая надлежащее расследование и решение вопросов, связанных с точностью или целостностью любой части работы.

    Заявление об открытом доступе: Это статья открытого доступа, распространяемая в соответствии с международной лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 (CC BY-NC-ND 4.0), которая разрешает некоммерческое копирование и распространение статьи. со строгим условием, что никакие изменения или правки не вносятся, а оригинальная работа правильно цитируется (включая ссылки как на официальную публикацию через соответствующий DOI, так и на лицензию).См.: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/.


    Ссылки

    1. Бартон В., О’Салливан О., Коттер, полицейский участок. Метаболический фенотип микробиома человека. F1000Res 2019; 8: F1000 факультета Rev-1956.
    2. Отправитель Р., Фукс С., Майло Р. Пересмотренные оценки количества клеток человека и бактерий в организме. PLoS Biol 2016;14:e1002533. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    3. Томас Р.М., Заяк-Кей М.Микробные мародеры: микробиота поджелудочной железы и ее влияние на канцерогенез. Энн Трансл Мед 2018;6:S63. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    4. Чакраворти С., Хелб Д., Бурдей М. и др. Подробный анализ сегментов гена 16S рибосомной РНК для диагностики патогенных бактерий. J Microbiol Methods 2007;69:330-9. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    5. Ван Треурен В., Додд Д. Вклад микробов в метаболизм человека: последствия для здоровья и болезней. Annu Rev Pathol 2020; 15: 345-69.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    6. Арумугам М., Раес Дж., Пеллетье Э. и др. Энтеротипы микробиома кишечника человека. Природа 2011;473:174-80. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    7. Проект микробиома человека C. Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека. Природа 2012;486:207-14. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    8. Чен Дж., Доминг Дж. К., Сирс КЛ. Дисбактериоз микробиоты при некоторых видах рака человека: доказательства связи и причинно-следственной связи.Семин Иммунол 2017;32:25-34. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    9. Конг Дж., Чжан XC. Как человеческий микробиом взаимодействует со здоровьем и болезнью. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2018;37:1595-601. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    10. Orr MR, Kocurek KM, Bakos YJ, et al. Взгляд восстановительной экологии на лечение воспалительных заболеваний кишечника. Эвол Мед Общественное здравоохранение 2019.217-20. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    11. Фаббрицци А., Амедей А., Лаворини Ф. и др.Микробиом легких: клинические и терапевтические последствия. Intern Emerg Med 2019;14:1241-50. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    12. Guo Y, Liu W, Wu J. Инфекция Helicobacter pylori и риск рака поджелудочной железы: метаанализ. J Cancer Res Ther 2016;12:C229-32. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    13. Трикуданатан Г., Филип А., Дасану С. и др. Связь между инфекцией Helicobacter pylori и раком поджелудочной железы. Мета-анализ. Am J Gastroenterol 2010;105:S48-S.
    14. Wu SG, Rhee KJ, Albesiano E, et al. Комменсал толстой кишки человека способствует онкогенезу толстой кишки посредством активации Т-клеточных ответов Т-хелперного типа 17. Nat Med 2009;15:1016-22. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    15. Schwabe RF, Джобин С. Микробиом и рак. Nat Rev Рак 2013; 13: 800-12. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    16. Кейси С.К., Ваккари М., Аль-Мулла Ф. и др. Влияние химических веществ окружающей среды на микроокружение опухоли.Канцерогенез 2015;36:S160-83. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    17. Шанкар А., Сайни Д., Дубей А. и др. Осуществимость скрининга рака легких в развивающихся странах: проблемы, возможности и дальнейшие действия. Transl Lung Cancer Res 2019;8:S106-21. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    18. Заппа С., Муса С.А. Немелкоклеточный рак легкого: современное лечение и перспективы на будущее. Transl Lung Cancer Res 2016; 5: 288-300. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    19. Йонеяма Р., Саджи Х., Като Ю. и др.Клинико-патологическая характеристика и тактика лечения молодых больных раком легкого. Энн Трансл Мед 2019;7:100. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    20. Сегал Л.Н., Алексеенко А.В., Клементе Ю.С. и др. Обогащение микробиома легких надгортанными таксонами связано с усилением воспаления легких. Микробиом 2013; 1:19. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    21. Моррис А., Бек Дж.М., Шлосс П.Д. и др. Сравнение респираторного микробиома у здоровых некурящих и курильщиков.Am J Respir Crit Care Med 2013;187:1067-75. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    22. Bassis CM, Erb-Downward JR, Dickson RP, et al. Анализ микробиоты верхних дыхательных путей как источника микробиоты легких и желудка у здоровых людей. mBio 2015;6:e00037. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    23. Марш Р.Л., Кестли М., Чанг А.Б. и др. Микробиота в бронхоальвеолярном лаваже у детей раннего возраста с хроническими заболеваниями легких включает таксоны, присутствующие как в ротоглотке, так и в носоглотке.Микробиом 2016; 4:37. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    24. Диксон Р.П., Эрб-Даунворд М.Р., Фримен К.М. и др. Пространственная изменчивость микробиома легких здорового человека и адаптированная островная модель биогеографии легких. Ann Am Thorac Soc 2015; 12:821-30. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    25. Матье Э., Эскрибано-Васкес У., Декамп Д. и др. Парадигмы функций микробиоты легких в норме и при патологии, в частности, при астме. Фронт Физиол 2018;9:1168. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    26. Мадди А., Сабхарвал А., Виоланте Т. и др.Микробиом и рак легких. J Thorac Dis 2019; 11: 280-91. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    27. Диксон Р.П., Эрб-Даунворд М.Р., Хаффнэгл Г.Б. К экологии легких: новые концептуальные модели легочной микробиологии и патогенеза пневмонии. Ланцет Респир Мед 2014;2:238-46. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    28. Диксон Р.П., Мартинес Ф.Дж., Хаффнэгл Г.Б. Роль микробиома в обострениях хронических заболеваний легких. Ланцет 2014;384:691-702. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    29. Venkataraman A, Bassis CM, Beck JM, et al.Применение модели нейтрального сообщества для оценки структуризации микробиома легких человека. mBio 2015;6:e02284-14. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    30. Ю.Г., Гейл М.Х., Консонни Д. и др. Характеристика микробиоты легочной ткани человека и ее связь с эпидемиологическими и клиническими особенностями. Геном Биол 2016;17:163. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    31. Ni L, Chuang CC, Zuo L. Мелкие твердые частицы при обострении ХОБЛ. Фронт Физиол 2015;6:294. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    32. Ван Л., Ченг Х.С., Ван Д.Б. и др.Микробиом дыхательных путей связан с респираторными функциями и реакцией на воздействие твердых частиц окружающей среды. Ecotoxicol Environ Saf 2019;167:269-77. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    33. Цинь Т., Чжан Ф.Р., Чжоу Х.Дж. и др. Воздействие высоких уровней PM2,5/PM10 связано с изменениями в составе микробиоты глотки человека. Front Microbiol 2019;10:54. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    34. Li X, Sun Y, An YH и др. Загрязнение воздуха в зимний период и микробный дисбаланс дыхательных путей у здорового молодого населения Северо-Восточного Китая.Загрязнение окружающей среды 2019; 246: 972-9. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    35. Rylance J, Kankwatira A, Nelson DE, et al. Бытовое загрязнение воздуха и микробиом легких здоровых взрослых в Малави: поперечное исследование. BMC Microbiol 2016; 16:182. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    36. Hosgood HD 3rd, Sapkota AR, Rothman N, et al. Потенциальная роль микробиоты легких в развитии рака легких, связанная с воздействием сжигания угля в домашних условиях. Environ Mol Mutagen 2014;55:643-51.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    37. Чжан Р., Чен Л., Цао Л. и др. Влияние курения на микробиом нижних дыхательных путей у мышей. Респир Рес 2018;19:253. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    38. Хуан С., Ши Г.К. Курение и микробиом полости рта, дыхательных путей, кишечника и некоторых системных заболеваний. J Transl Med 2019;17:225. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    39. Циммерманн П., Кертис Н. Влияние антибиотиков на состав кишечной микробиоты – систематический обзор.J Infect 2019; 79: 471-89. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    40. Ким С., Ковингтон А., Памер Э.Г. Кишечная микробиота: антибиотики, резистентность к колонизации и кишечные патогены. Immunol Rev 2017; 279:90-105. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    41. Hufnagl K, Pali-Scholl I, Roth-Walter F, et al. Дисбактериоз кишечника и легочного микробиома играет роль в развитии астмы. Семин Иммунопатол 2020;42:75-93. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    42. Тейлор С.Л., Леонг ЛЕКС, Мобеги FM и др.Азитромицин длительного действия уменьшает гемофильную палочку и повышает устойчивость к антибиотикам при тяжелой астме. Am J Respir Crit Care Med 2019; 200: 309-17. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    43. Сегал Л.Н., Клементе Дж.К., Ву Б.Г. и др. Рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое исследование азитромицина отбирает противовоспалительные микробные метаболиты в эмфизематозном легком. Торакс 2017; 72:13-22. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    44. Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, et al.Анализ микробиома легких у «здорового» курильщика и при ХОБЛ. PLoS One 2011;6:e16384. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    45. Хилти М., Берк С., Педро Х. и др. Нарушение микробных сообществ в астматических дыхательных путях. PLoS One 2010;5:e8578. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    46. Ким Х.Дж., Ким Ю.С., Ким К.Х. и др. Микробиом легкого и его внеклеточных везикул у некурящих, здоровых курильщиков и больных ХОБЛ. Exp Mol Med 2017;49:e316. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    47. Сзе М.А., Димитриу П.А., Хаяши С. и др.Микробиом легочной ткани при хронической обструктивной болезни легких. Am J Respir Crit Care Med 2012;185:1073-80. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    48. Прагман А.А., Ким Х.Б., Рейли С.С. и др. Микробиом легких при среднетяжелой и тяжелой хронической обструктивной болезни легких. PLoS One 2012;7:e47305. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    49. Милларес Л., Феррари Р., Гальего М. и др. Бронхиальный микробиом больных тяжелой ХОБЛ, колонизированный Pseudomonas aeruginosa. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2014;33:1101-11.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    50. Гарсия-Нуньес М., Милларес Л., Помарес Х. и др. Изменения бронхиального микробиома при хронической обструктивной болезни легких в зависимости от тяжести течения. J Clin Microbiol 2014;52:4217-23. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    51. Ли С.В., Куан С.С., Ву Л.С. и др. Метагеномное и метатранскриптомное профилирование мокроты умеренной и тяжелой ХОБЛ у тайваньских мужчин хань. PLoS One 2016;11:e0159066. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    52. Mayhew D, Devos N, Lambert C, et al.Продольное профилирование микробиома легких в исследовании AERIS демонстрирует повторяемость обострений бактериальной и эозинофильной ХОБЛ. Торакс 2018;73:422-30. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    53. Джубинвиль Э., Вейлетт М., Милот Дж. и др. Обострение вызывает сдвиг микробиоты в мокроте больных ХОБЛ. PLoS One 2018;13:e0194355. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    54. Лейтао Филью Ф.С., Алотаиби Н.М., Нган Д. и др. Микробиом мокроты связан с годовой смертностью после госпитализаций по поводу хронической обструктивной болезни легких.Am J Respir Crit Care Med 2019; 199: 1205-13. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    55. Feigelman R, Kahlert CR, Baty F, et al. Секвенирование ДНК мокроты при муковисцидозе: неинвазивный доступ к микробиому легких и сведениям о патогенах. Микробиом 2017; 5:20. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    56. Фрайман К.Б., Армстронг Д.С., Карзино Р. и др. Микробиота нижних дыхательных путей при раннем муковисцидозе легких: продольный анализ. Торакс 2017;72:1104-12. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    57. Laguna TA, Wagner BD, Williams CB, et al.Микробиота дыхательных путей в жидкости бронхоальвеолярного лаважа от клинически здоровых младенцев с кистозным фиброзом. PLoS One 2016; 11:e0167649. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    58. Кармоди Л.А., Чжао Дж., Шлосс П.Д. и др. Изменения микробиоты дыхательных путей при муковисцидозе при легочном обострении. Энн Ам Торак Сок 2013; 10: 179-87. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    59. Дурак Дж., Линч С.В., Нария С. и др. Особенности бронхиального бактериального микробиома, связанные с атопией, астмой и реакцией на лечение ингаляционными кортикостероидами.J Allergy Clin Immunol 2017;140:63-75. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    60. Тео С.М., Мок Д., Фам К. и др. Назофарингеальный микробиом младенцев влияет на тяжесть инфекции нижних дыхательных путей и риск развития астмы. Микроб-хозяин клетки 2015; 17: 704-15. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    61. Хуан Ю.Дж., Нария С., Харрис Дж.М. и др. Микробиом дыхательных путей у пациентов с тяжелой астмой: ассоциации с особенностями и тяжестью заболевания. J Allergy Clin Immunol 2015;136:874-84.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    62. Марри П.Р., Стерн Д.А., Райт А.Л. и др. Ассоциированные с бронхиальной астмой различия в микробном составе индуцированной мокроты. J Allergy Clin Immunol 2013;131:346-52.e1-3.
    63. Molyneaux PL, Cox MJ, Wells AU, et al. Изменения респираторного микробиома при обострении идиопатического легочного фиброза. Респир Рес 2017;18:29. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    64. Хань М.К., Чжоу Ю., Мюррей С. и др. Микробиом легких и прогрессирование заболевания при идиопатическом легочном фиброзе: анализ исследования COMET.Ланцет Респир Мед 2014;2:548-56. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    65. Molyneaux PL, Cox MJ, Willis-Owen SA, et al. Роль бактерий в патогенезе и прогрессировании идиопатического легочного фиброза. Am J Respir Crit Care Med 2014; 190: 906-13. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    66. Fahy JV, Dickey BF. Функция и дисфункция слизистой оболочки дыхательных путей. N Engl J Med 2010;363:2233-47. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    67. Evans CM, Raclawska DS, Ttofali F, et al.Полимерный муцин Muc5ac необходим при аллергической гиперреактивности дыхательных путей. Нац коммуна 2015;6:6281. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    68. ЛеВайн А.М., Уитсетт Дж.А., Гвоздз Дж.А. и др. Отчетливые эффекты дефицита сурфактантного белка A или D во время бактериальной инфекции на легкие. J Immunol 2000;165:3934-40. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    69. Лейва-Хуарес М.М., Коллс Дж.К., Эванс С.Е. Эпителиальные клетки легких: терапевтически индуцируемые эффекторы антимикробной защиты. Иммунол слизистых оболочек 2018;11:21-34.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    70. Меджитов Р. Распознавание микроорганизмов и активация иммунного ответа. Природа 2007;449:819-26. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    71. Мариатасан С., Монак Д.М. Адаптеры и сенсоры инфламмасомы: внутриклеточные регуляторы инфекции и воспаления. Nat Rev Immunol 2007;7:31-40. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    72. Янсен Ф.Л., Стрикленд Д.Х., Томас Дж.А. и др. Ускоренный отбор антигена и транспортировка дендритными клетками слизистой оболочки дыхательных путей после вдыхания бактериального стимула.Дж. Иммунол 2006; 177:5861-7. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    73. Вестфален К., Гусарова Г.А., Ислам М.Н., и соавт. Сидячие альвеолярные макрофаги взаимодействуют с альвеолярным эпителием для модуляции иммунитета. Природа 2014;506:503-6. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    74. Копф М., Шнайдер С., Нобс С.П. Развитие и функция резидентных в легких макрофагов и дендритных клеток. Нат Иммунол 2015;16:36-44. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    75. Budden KF, Gellatly SL, Wood DL, et al.Возникающие патогенные связи между микробиотой и осью кишечник-легкие. Nat Rev Microbiol 2017; 15:55-63. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    76. Самуэльсон Д.Р., Уэльс Д.А., Шеллито Д.Э. Регуляция иммунитета легких и защиты хозяина кишечной микробиотой. Front Microbiol 2015;6:1085. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    77. Бадден К.Ф., Шукла С.Д., Рехман С.Ф. и др. Функциональные эффекты микробиоты при хронических респираторных заболеваниях. Ланцет Респир Мед 2019;7:907-20. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    78. Kabeerdoss J, Jayakanthan P, Pugazhendhi S, et al.Изменения микробиоты слизистой оболочки толстой кишки у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника, выявленные методом полимеразной цепной реакции с амплификации 16S рибосомальной рибонуклеиновой кислоты в режиме реального времени. Indian J Med Res 2015; 142:23-32. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    79. Шваб С., Берри Д., Раух И. и др. Продольное исследование активности микробиоты мышей и взаимодействия с хозяином во время острого воспаления и выздоровления. ISME J 2014;8:1101-14. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    80. Дилантика С., Седянингсых Э.Р., Каспер М.Р. и др.Вирусная инфекция гриппа среди педиатрических пациентов, сообщающих о диарее и гриппоподобном заболевании. BMC Infect Dis 2010; 10:3. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    81. Ван Дж., Ли Ф., Вэй Х. и др. Инфекция респираторного вируса гриппа вызывает иммунное повреждение кишечника посредством опосредованного микробиотой воспаления, зависящего от клеток Th27. J Exp Med 2014; 211:2397-410. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    82. Samuelson DR, Charles TP, de la Rua NM, et al. Анализ кишечного микробного сообщества и предполагаемых функциональных возможностей во время ответа хозяина на пневмоцистную пневмонию.Exp Lung Res 2016;42:425-39. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    83. Саутам Д.С., Долович М., О’Бирн П.М. и др. Распространение интраназальных инстилляций у мышей: влияние объема, времени, положения тела и анестезии. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol 2002; 282: L833-9. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    84. Юн Х.С., Вен В., Лонг Дж. и др. Связь здоровья полости рта с риском рака легких у малообеспеченного населения афроамериканцев и американцев европейского происхождения на юго-востоке США.Рак легких 2019; 127:90-5. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    85. Zeng XT, Xia LY, Zhang YG и др. Заболевания пародонта и риск возникновения рака легких: метаанализ когортных исследований. J Периодонтол 2016;87:1158-64. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    86. Michaud DS, Lu J, Peacock-Villada AY, et al. Заболевания пародонта, оцененные с использованием клинических стоматологических измерений и риска рака в исследовании ARIC. J Natl Cancer Inst 2018; 110:843-54. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    87. Mai X, LaMonte MJ, Hovey KM и др.Тяжесть заболеваний пародонта и риск рака у женщин в постменопаузе: исследование Buffalo OsteoPerio. Рак вызывает контроль 2016; 27: 217-28. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    88. Фернандес-Плата Р., Ольмедо-Торрес Д., Мартинес-Брисено Д. и др. Распространенность тяжелых заболеваний пародонта и их связь с респираторными заболеваниями у госпитализированных взрослых пациентов в центр третичной медицинской помощи. Gac Med Mex 2015;151:608-13. [ПубМед]
    89. Ян X, Ян М, Лю Дж и др.Открытие и проверка потенциальных бактериальных биомаркеров рака легких. Am J Cancer Res 2015; 5:3111-22. [ПубМед]
    90. Yang J, Mu X, Wang Y и др. Дисбактериоз микробиома слюны ассоциирован с раком легкого у некурящих женщин и коррелирует с иммуноцитохимическими маркерами. Фронт Онкол 2018; 8:520. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    91. Cameron SJS, Lewis KE, Huws SA, et al. Пилотное исследование с использованием метагеномного секвенирования микробиома мокроты предполагает наличие потенциальных бактериальных биомаркеров рака легких.PLoS One 2017;12:e0177062. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    92. Lee SH, Sung JY, Yong D и др. Характеристика микробиома жидкости бронхоальвеолярного лаважа у пациентов с раком легкого в сравнении с доброкачественными новообразованиями. Рак легких 2016; 102:89-95. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    93. Хасэгава А., Сато Т., Хошикава Ю. и др. Выявление и идентификация оральных анаэробов в интраоперационной бронхиальной жидкости больных карциномой легкого. Microbiol Immunol 2014;58:375-81.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    94. Лю Х.С., Тао Л.Л., Чжан Дж. и др. Разница в микробиоме нижних дыхательных путей в двусторонней защищенной щетке для образцов у пациентов с раком легкого с односторонними долевыми образованиями и контрольными субъектами. Int J Рак 2018; 142: 769-78. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    95. Чжуан Х., Ченг Л., Ван Ю и др. Дисбактериоз микробиома кишечника при раке легкого. Front Cell Infect Microbiol 2019;9:112. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    96. Zhang W, Luo JW, Dong XP и др.Слюнный микробный дисбактериоз связан с маркерами системного воспаления и прогнозируемыми пероральными метаболитами у пациентов с немелкоклеточным раком легкого. J Рак 2019; 10: 1651-62. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    97. Greathouse KL, White JR, Vargas AJ и др. Взаимодействие между микробиомом и TP53 при раке легкого человека. Геном Биол 2018;19:123. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    98. Apopa PL, Alley L, Penney RB, и др. PARP1 активируется в тканях немелкоклеточного рака легкого в присутствии цианобактериального токсина микроцистина.Front Microbiol 2018;9:1757. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    99. Peters BA, Hayes RB, Goparaju C, et al. Микробиом в ткани рака легкого и безрецидивное выживание. Рак эпидемиол биомаркеры Prev 2019; 28: 731-40. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    100. Tsay JJ, Wu BG, Badri MH, et al. Микробиота дыхательных путей связана с активацией пути PI3K при раке легкого. Am J Respir Crit Care Med 2018; 198: 1188-98. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    101. Hosgood HD, Sapkota AR, Rothman N, et al.Потенциальная роль микробиоты легких в развитии рака легких, связанная с воздействием сжигания угля в домашних условиях. Environ Mol Mutagen 2014;55:643-51. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    102. Бингула Р., Филайр М., Радошевич-Робин Н. и др. Характеристика микробиоты кишечника, легких и верхних дыхательных путей у пациентов с немелкоклеточной карциномой легкого Протокол исследования для обсервационного исследования случай-контроль. Медицина (Балтимор) 2018; 97: e13676. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    103. Сейджо Л.М., Зулуэта Дж.Дж.Понимание связи между раком легких, ХОБЛ и эмфиземой: ключ к более эффективному лечению и скринингу. Онкология (Уиллистон Парк) 2017; 31:93-102. [ПубМед]
    104. Дай Дж., Ян П., Кокс А. и др. Рак легкого и хроническая обструктивная болезнь легких: с клинической точки зрения. Онкотаргет 2017; 8:18513-24. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    105. Руссо Э., Таддеи А., Рингресси М.Н. и др. Взаимодействие между микробиомом и адаптивным иммунным ответом при развитии рака.Therap Adv Gastroenterol 2016;9:594-605. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    106. Раджагопала С.В., Ваши С., Олдфилд Л.М. и др. Микробиом человека и рак. Cancer Prev Res (Phila) 2017; 10: 226-34. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    107. Держите ГЛ. Желудочно-кишечная микробиота и рак толстой кишки. Диг Дис 2016; 34:244-50. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    108. Бирт Д.Ф., Филлипс Г.Дж. Диета, гены и микробы: сложности профилактики рака толстой кишки. Токсикол Патол 2014;42:182-8.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    109. Rescigno M. Патогенная роль кишечной флоры при ВЗК и раке толстой кишки. Curr Drug Targets 2008;9:395-403. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    110. De Almeida CV, de Camargo MR, Russo E, et al. Роль диеты и кишечной микробиоты в иммуномодуляции колоректального рака. World J Gastroenterol 2019;25:151-62. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    111. Деджеа С., Вик Э., Сирс С.Л. Бактериальный онкогенез в толстой кишке. Future Microbiol 2013;8:445-60.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    112. Бурси Б., Мамтани Р., Хейнс К. и др. Периодическое воздействие антибиотиков может способствовать образованию рака — еще один шаг к пониманию роли микробиоты человека? Eur J Рак 2015; 51: 2655-64. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    113. Дженкинс С.В., Робсон М.С. 2-й, Гриффин Р.Дж. и др. Дисбактериоз желудочно-кишечного тракта усиливает дистальную прогрессию опухоли за счет подавления трафика лейкоцитов. Рак Res 2019; 79: 5999-6009. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    114. Холмс И., Харрис К., Айва К.Полиномиальные смеси Дирихле: генеративные модели микробной метагеномики. PLoS One 2012;7:e30126. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    115. Yaghoobi H, Bandehpour M, Kazemi B. Апоптотические эффекты субъединицы B бактериального цитолетального токсина растяжения на клеточной линии рака легкого A549. Asian Pac J Cancer Prev 2016; 17: 299-304. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    116. Nowotarski SL, Woster PM, Casero RA Jr. Полиамины и рак: значение для химиотерапии и химиопрофилактики.Эксперт Rev Mol Med 2013;15:e3. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    117. Ню Т., Смит Д.Л., Ян З. и др. Биоактивность и биодоступность гинсенозидов зависят от гликозидазной активности кишечного микробиома мышей A/J, определенной с помощью пиросеквенирования. Фармрез 2013;30:836-46. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    118. Herfs M, Hubert P, Delvenne P. Эпителиальная метаплазия: перепрограммирование взрослых стволовых клеток и (пред)опухолевая трансформация, опосредованная воспалением? Тенденции Mol Med 2009;15:245-53.[Перекрестная ссылка] [PubMed]
    119. Ван К., Ван Дж., Вэй Ф. и др. Экспрессия TLR4 при немелкоклеточном раке легкого связана с PD-L1 и плохим прогнозом у пациентов, перенесших пульмонэктомию. Фронт Иммунол 2017;8:456. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    120. Ochoa CE, Mirabolfathinejad SG, Ruiz VA, et al. Интерлейкин 6, но не Т-хелперные цитокины 2, способствует канцерогенезу легких. Cancer Prev Res (Phila) 2011; 4:51-64. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    121. Каэтано М.С., Чжан Х., Кампиан А.М. и др.Блокада IL6 перепрограммирует микроокружение опухоли легких, чтобы ограничить развитие и прогрессирование мутантного рака легких K-ras. Рак Res 2016; 76: 3189-99. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    122. Chang SH, Mirabolfathinejad SG, Katta H, et al. Клетки Т-хелперы 17 играют критическую патогенную роль при раке легкого. Proc Natl Acad Sci U S A 2014;111:5664-9. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    123. Jungnickel C, Schmidt LH, Bittigkoffer L, et al. IL-17C опосредует рекрутирование ассоциированных с опухолью нейтрофилов и рост опухоли легких.Онкоген 2017;36:4182-90. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    124. Кинг П.Т., Шарма Р. Иммунный ответ легких на нетипируемую гемофильную палочку (иммунитет легких к NTHi). J Immunol Res 2015; 2015:706376.
    125. Moghaddam SJ, Ochoa CE, Sethi S, et al. Нетипируемая гемофильная палочка при хронической обструктивной болезни легких и раке легкого. Int J Chron Obstruct Pulmon Dis 2011; 6: 113-23. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    126. Шрирам К.Б., Кокс А.Дж., Сивакумаран П. и др.Выявление нетипируемой гемофильной палочки в нижних дыхательных путях у больных раком легкого и хронической обструктивной болезнью легких. Multidiscip Respir Med 2018;13:11. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    127. Густафсон А.М., Солди Р., Андерлинд С. и др. Активация пути PI3K в дыхательных путях является ранним и обратимым событием в развитии рака легкого. Sci Transl Med 2010; 2:26ra25. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    128. Tsay JJ, Wu BG, Badri MH, et al. Микробиота дыхательных путей связана с активацией пути PI3K при раке легкого.Am J Respir Crit Care Med 2018; 198: 1188-98. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    129. Соммарива М., Ле Ночи В., Бьянки Ф. и др. Микробиота легких: роль в поддержании легочного иммунного гомеостаза и ее значение в развитии и терапии рака. Cell Mol Life Sci 2020. [Epub перед печатью]. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    130. Wypych TP, Wickramasinghe LC, Marsland BJ. Влияние микробиома на здоровье органов дыхания. Nat Immunol 2019;20:1279-90. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    131. Сиван А., Корралес Л., Хьюберт Н. и др.Комменсальные бифидобактерии способствуют противоопухолевому иммунитету и способствуют эффективности анти-PD-L1. Наука 2015;350:1084-9. [Перекрестная ссылка] [PubMed]
    132. Daillère R, Vetizou M, Waldschmitt N, et al. Enterococcus hirae и Barnesiella intestinihominis способствуют индуцированным циклофосфамидом терапевтическим иммуномодулирующим эффектам. Иммунитет 2016;45:931-43. [Crossref] [PubMed]

    Цитируйте эту статью как: Xu N, Wang L, Li C, Ding C, Li C, Fan W, Cheng C, Gu B. Дисбиоз микробиоты при раке легких: доказательства связи и потенциальные механизмы.Transl Lung Cancer Res 2020;9(4):1554-1568. doi: 10.21037/tlcr-20-156

    Новый биотерапевтический агент: Akkermansia

  • Гупта В., Суд У., Кумар Р., Лал Р., Калия В.К. (2020) Микробиом: новая аренда микробиологии. Индиан Джей Микробиол 60:1. https://doi.org/10.1007/s12088-019-00852-8

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Sender R, Fuchs S, Milo R (2016) Пересмотренные оценки количества клеток человека и бактерий в организме.PLoS Биол 14:e1002533. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1002533

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Гилберт Дж. А., Блазер М. Дж., Капорасо Дж. Г. и др. (2018) Современное понимание микробиома человека. Nat Med 24: 392–400. https://doi.org/10.1038/nm.4517

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Rowland I, Gibson G, Heinken A et al (2018)Функции микробиоты кишечника: метаболизм питательных веществ и других пищевых компонентов.Евр Дж Нутр 57: 1–24. https://doi.org/10.1007/s00394-017-1445-8

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Blaser MJ (2014) Революция микробиома. J Clin Invest 124: 4162–4165. https://doi.org/10.1172/jci78366

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Кулкарни А.С., Кумбхаре С.В., Дхотре Д.П., Шоуч Ю.С. (2019) Изучение основного микробиома кишечника из выборки населения Индии.Индийский J Microbiol 59: 90–95. https://doi.org/10.1007/s12088-018-0742-0

    Статья пабмед Google ученый

  • Кумар Р., Суд У., Гупта В., Сингх М., Скария Дж., Лал Р. (2020) Последние достижения в разработке современных пробиотиков для восстановления дисбактериоза микробиома кишечника человека. Индийский J Microbiol 60: 12–25. https://doi.org/10.1007/s12088-019-00808-y

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Sood U, Gupta V, Kumar R et al (2020) Микробиом куриного кишечника и здоровье человека: прошлые сценарии, текущие перспективы и футуристические приложения.Индийский J Microbiol 60: 2–11. https://doi.org/10.1007/s12088-019-00785-2

    Статья пабмед Google ученый

  • Диас Карраско Х.М., Казанова Н.А., Фернандес Миякава М.Е. (2019) Микробиота, здоровье кишечника и продуктивность цыплят: какая связь? Микроорганизмы 7:374. https://doi.org/10.3390/microorganisms7100374

    CAS Статья ПабМед Центральный Google ученый

  • Миланович В., Кардинали Ф., Аквиланти Л. и др. (2020) Взгляд на микробиоту продаваемых готовых к употреблению сверчков ( Acheta domesticus ).Indian J Microbiol 60:115–118. https://doi.org/10.1007/s12088-019-00817-x

    Статья пабмед Google ученый

  • Kalia VC (2019) Загрязнение фармацевтических препаратов и средств личной гигиены: глобальный сценарий. В: Prasad MNV, Kapley A, Vithanage MM (eds) Фармацевтические препараты и средства личной гигиены: управление отходами и технология обработки – возникающие загрязнители и микрозагрязнители. Elsevier Inc, Нью-Йорк, стр. 27–61. https://дои.org/10.1016/B978-0-12-816189-0.00002-0

    Глава Google ученый

  • Raffa CM, Chiampo F (2021) Биоремедиация сельскохозяйственных почв, загрязненных пестицидами: обзор. Биоинженерия 8:92. https://doi.org/10.3390/bioengineering8070092

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Maji A, Misra R, Dhakan DB et al (2018)Микробиом кишечника способствует нарушению иммунитета у пациентов с туберкулезом легких путем изменения продуцентов бутирата и пропионата.Environ Microbiol 20:402–419. https://doi.org/10.1111/1462-2920.14015

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Das T, Jayasudha R, Chakravarthy S и др. (2021) Изменения в бактериальном микробиоме кишечника у людей с сахарным диабетом 2 типа и диабетической ретинопатией. Научный представитель 11:2738. https://doi.org/10.1038/s41598-021-82538-0

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Иебба В., Тотино В., Гальярди А. и др. (2016) Эубиоз и дисбактериоз: две стороны микробиоты.New Microbiol 39:1–12

    CAS пабмед Google ученый

  • Sood U, Bajaj A, Kumar R, Khurana S, Kalia VC (2018) Инфекция и микробиом: влияние туберкулеза на микробиом кишечника человека индийской когорты. Indian J Microbiol 58: 123–125. https://doi.org/10.1007/s12088-018-0706-4

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Bodkhe R, Shetty SA, Dhotre DP et al (2019) Сравнение микробиоты тонкого и цельного кишечника родственников первой степени родства со взрослыми пациентами с глютеновой болезнью и контрольной группой.Фронт микробиол 10:164. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00164

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Tuikhar N, Keisam S, Labala RK et al (2019) Сравнительный анализ микробиоты кишечника у долгожителей и молодых людей показывает общие признаки среди генотипически неродственных групп населения. Mech Aging Dev 179: 23–35. https://doi.org/10.1016/j.mad.2019.02.001

    Статья пабмед Google ученый

  • Gaike AH, Paul D, Bhute S et al (2020) Разнообразие микробов кишечника у впервые диагностированных диабетиков, но не у преддиабетиков, значительно отличается от такового у здоровых людей без диабета.mSystems 5: e00578–e00519. https://doi.org/10.1128/mSystems.00578-19

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Coetzer WG, Coetzee LM et al (2021) Предварительная оценка разнообразия микробиома кожи данио ( Danio rerio ): южноафриканская рыба из зоомагазина. Индийский J Microbiol 61: 81–84. https://doi.org/10.1007/s12088-020-00900-8

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Корник С., Тавия А., Чади К. (2015)Роль и регулирование слизистого барьера в кишечнике.Тканевые барьеры 3:e982426. https://doi.org/10.4161/21688370.2014.982426

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Нг К.М., Феррейра Дж.А., Хиггинботтом С.К. и др. (2013)Освобождаемые микробиотой сахара хозяина облегчают постантибиотическую экспансию кишечных патогенов. Природа 502: 96–99. https://doi.org/10.1038/nature12503

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Petersson J, Schreiber O, Hansson GC et al (2011) Важность и регулирование слизистого барьера толстой кишки в мышиной модели колита.Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 300:G327–G333. https://doi.org/10.1152/ajpgi.00422.2010

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Cani PD, de Vos WM (2017) Полезные микробы следующего поколения: случай Akkermansia muciniphila . Фронт Микробиол 8:1765. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01765

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Naito Y, Uchiyama K, Tkakgi T (2018) Полезный микроб нового поколения: Akkermansia muciniphila .J Clin Biochem Nutr 63:33–35. https://doi.org/10.3164/jcbn.18-57

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Дерриен М., Воан Э.Е., Плагге К.М., де Вос В.М. (2004) Akkermansia municiphila gen. ноябрь, сп. nov., бактерия, разлагающая муцин кишечника человека. Int J Syst Evol Microbiol 54:1469–1476. https://doi.org/10.1099/ijs.0.02873-0

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Belzer C, de Vos WM (2012) Микробы внутри: от разнообразия к функциям: случай Akkermansia .ИСМЕ J 6: 1449–1458. https://doi.org/10.1038/ismej.2012.6

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • O’Keefe SJ, Li JV, Lahti L et al (2015) Жир, клетчатка и риск рака у афроамериканцев и сельских жителей Африки. Нат Коммуна 6:6342. https://doi.org/10.1038/ncomms7342

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Schneeberger M, Everard A, Gómez-Valadés AG et al (2015) Akkermansia muciniphila обратно коррелирует с началом воспаления, изменением метаболизма жировой ткани и метаболическими нарушениями при ожирении у мышей.Научный отчет 5:16643. https://doi.org/10.1038/srep16643

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Han M, Wang C, Liu P, Li D, Li Y, Ma X (2017)Разрыв пищевых волокон и микробиота кишечника хозяина. Белковый пептид Lett 24: 388–396. doi: https://doi.org/10.2174/0929866524666170220113312

    CAS Статья Google ученый

  • Борда-Молина Д., Зайферт Дж., Камаринья-Сильва А. (2018) Текущие перспективы желудочно-кишечного тракта кур и его микробиома.Comput Struct Biotechnol J 16:131–139. https://doi.org/10.1016/J.CSBJ.2018.03.002

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Clavijo V, Flórez MJV (2018) Желудочно-кишечный микробиом и его связь с контролем патогенов при производстве цыплят-бройлеров: обзор. Poult Sci 97: 1006–1021. https://doi.org/10.3382/ps/pex359

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Baldwin J, Collins B, Wolf PG et al (2016) Потребление столового винограда снижает ожирение и маркеры печеночного липогенеза и изменяет микробиоту кишечника у мышей, получавших сливочное масло.J Nutr Biochem 27: 123–135. https://doi.org/10.1016/j.jnutbio.2015.08.027

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Shen W, Shen M, Zhao X et al (2017)Эффект капсаицина против ожирения у мышей, получавших диету с высоким содержанием жиров, связан с увеличением популяции кишечной бактерии Akkermansia muciniphila . Фронт Фармакол 8:272. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00272

    Статья Google ученый

  • Zhao S, Liu W, Wang J et al (2017) Akkermansia muciniphila улучшает метаболические профили за счет уменьшения воспаления у мышей, получавших чау-чау.Дж. Мол. Эндокринол 58:1–14. https://doi.org/10.1530/JME-16-0054

    Статья пабмед Google ученый

  • Anhe FF, Roy D, Pilon G et al (2015) Экстракт клюквы, богатый полифенолами, защищает от вызванного диетой ожирения, резистентности к инсулину и воспаления кишечника в связи с повышенным содержанием Akkermansia spp. популяции микробиоты кишечника мышей. Гут 64: 872–883. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2014-307142

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Roopchand DE, Carmody RN, Kuhn P et al (2015) Пищевые полифенолы способствуют росту кишечной бактерии Akkermansia muciniphila и ослабляют метаболический синдром, вызванный диетой с высоким содержанием жиров.Диабет 64: 2847–2858. doi: https://doi.org/10.2337/db14-1916

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Masumoto S, Terao A, Yamamoto Y et al (2016) Неабсорбируемые яблочные процианидины предотвращают ожирение, связанное с микробными и метаболическими изменениями в кишечнике. Научный представитель 6:31208. https://doi.org/10.1038/srep31208

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Nakanishi M, Chen Y, Qendro V et al (2016) Влияние потребления грецких орехов на канцерогенез толстой кишки и структуру микробного сообщества.Предотвращение рака, рез. 9:692–703. https://doi.org/10.1158/1940-6207CAPR-16-0026

    CAS Статья Google ученый

  • Kawabata K, Yoshioka Y, Terao J (2019)Роль микробиоты кишечника в биодоступности и физиологических функциях пищевых полифенолов. Молекулы 24:370. https://doi.org/10.3390/molecules24020370

    CAS Статья ПабМед Центральный Google ученый

  • Tu P, Bian X, Chi L et al (2018) Характеристика функциональных изменений в микробиоме кишечника мыши, связанных с увеличением популяции Akkermansia muciniphila , модулируемой употреблением в пищу черной малины.САУ Омега 3: 10927–10937. https://doi.org/10.1021/acsomega.8b00064

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Everard A, Belzer C, Geurts L et al (2013)Взаимодействие между Akkermansia muciniphila и кишечным эпителием контролирует вызванное диетой ожирение. Proc Natl Acad Sci USA 110:9066–9071. https://doi.org/10.1073/pnas.1219451110

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • de la Cuesta-Zuluaga J, Mueller NT, Corrales-Agudelo V et al (2017) Метформин связан с более высокой относительной численностью разлагающих муцин Akkermansia muciniphila и нескольких короткоцепочечных микробиот, продуцирующих жирные кислоты, в кишки.Лечение диабета 40:54–62. https://doi.org/10.2337/dc16-1324

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Wu H, Esteve E, Tremaroli V et al (2017) Метформин изменяет микробиом кишечника у людей с диабетом 2 типа, ранее не получавших лечения, способствуя терапевтическому действию препарата. Nat Med 23: 850–858. https://doi.org/10.1038/nm.4345

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Plovier H, Everard A, Druart C et al (2017) Очищенный мембранный белок из Akkermansia muciniphila или пастеризованной бактерии улучшает метаболизм у мышей с ожирением и диабетом.Nat Med 23: 107–113. doi: https://doi.org/10.1038/nm.4236

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Weir TL, Manter DK, Sheflin AM et al (2013) Различия микробиома и метаболома стула у пациентов с колоректальным раком и здоровых взрослых. PLOS ONE 8:e70803. doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0070803

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Routy B, Le Chatelier E, Derosa L et al (2018)Микробиом кишечника влияет на эффективность иммунотерапии на основе PD-1 против эпителиальных опухолей.Наука 359: 91–97. https://doi.org/10.1126/science.aan3706

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Luo ZW, Xia K, Liu YW et al (2021) Внеклеточные везикулы из Akkermansia muciniphila вызывают противоопухолевый иммунитет против рака предстательной железы посредством модуляции CD8 + Т-клеток и макрофагов. Int J Nanomed 16: 2949–2963. https://doi.org/10.2147/IJN.S304515

    Статья Google ученый

  • Grajeda-Iglesias C, Durand S, Daillère R и др. (2021) Пероральное введение Akkermansia muciniphila повышает системные антивозрастные и противораковые метаболиты.Старение 13: 6375–6405. https://doi.org/10.18632/aging.202739

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Bárcena C, Valdés-Mas R, Mayoral P et al (2019) Увеличение продолжительности жизни и здоровья за счет трансплантации фекальной микробиоты прогероидным мышам. Нат Мед 25: 1234–1242. https://doi.org/10.1038/s41591-019-0504-5

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Zhu L, Zhang D, Zhu H et al (2018) Лечение берберином увеличивает Akkermansia в кишечнике и улучшает атеросклероз, вызванный диетой с высоким содержанием жиров, у мышей Apoe-/-.Атеросклероз 268:117–126. https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2017.11.023

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Кумбхаре С.В., Кумар Х., Чоудхури С.П. и др. (2017) Поперечное сравнительное исследование бактериального сообщества кишечника индийских и финских детей. Научный отчет 7:10555. https://doi.org/10.1038/s41598-017-11215-y

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Dinh DM, Ramadass B, Kattula D et al (2016) Продольный анализ кишечной микробиоты у детей раннего возраста с постоянной задержкой роста в Южной Индии.PLoS ONE 11:e0155405. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0155405

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Vrieze A, Van Nood E, Holleman F et al (2012) Перенос кишечной микробиоты от худых доноров повышает чувствительность к инсулину у лиц с метаболическим синдромом. Гастроэнтерология 143:913–916. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2012.06.031

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Ридаура В.К., Фейт Дж.Дж., Рей Ф.Е. и др. (2013)Микробиота кишечника близнецов, несовместимая с ожирением, модулирует метаболизм у мышей.Наука 341:1241214. https://doi.org/10.1126/science.1241214

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Cox LM, Yamanishi S, Sohn J et al (2014) Изменение кишечной микробиоты во время критического окна развития имеет длительные метаболические последствия. Ячейка 158: 705–721. https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.05.052

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Лешем А., Хореш Н., Элинав Э. (2019)Трансплантация фекальных микробов и ее потенциальное применение при кардиометаболическом синдроме.Фронт Иммунол 10:1341. https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.01341

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Wang Y, Wiesnoski DH, Helmink BA et al (2018)Трансплантация фекальной микробиоты при рефрактерном колите, связанном с ингибитором контрольной точки. Nat Med 24: 1804–1808. https://doi.org/10.1038/s41591-018-0238-9

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • van Nood E, Vrieze A, Nieuwdorp M et al (2013)Дуоденальная инфузия донорского кала при рецидиве Clostridium difficile .N Engl J Med 368: 407–415. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1205037

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Weingarden AR, Chen C, Bobr A et al (2014)Трансплантация микробиоты восстанавливает нормальный состав фекальных желчных кислот при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 306:G310–G319. https://doi.org/10.1152/ajpgi.00282.2013

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Buffie CG, Bucci V, Stein RR et al (2015) Прецизионная реконструкция микробиома восстанавливает опосредованную желчными кислотами резистентность к Clostridium difficile .Природа 517: 205–208. https://doi.org/10.1038/nature13828

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Zarrinpar A, Chaix A, Xu ZZ et al (2018) Истощение микробиома, вызванное антибиотиками, изменяет метаболический гомеостаз, влияя на сигнализацию кишечника и метаболизм толстой кишки. Нат Коммуна 9:2872. https://doi.org/10.1038/s41467-018-05336-9

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Fluckiger A, Daillère R, Sassi M et al (2020) Перекрестная реактивность между опухолевыми антигенами, ограниченными MHC класса I, и энтерококковым бактериофагом.Наука 369: 936–942. https://doi.org/10.1126/science.aax0701

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Bodogai M, O’Connell J, Kim K et al (2018) Комменсальные бактерии способствуют резистентности к инсулину при старении, активируя врожденные клетки B1a. Sci Transl Med 10:eaat4271. https://doi.org/10.1126/scitranslmed.aat4271

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • de Aguiar Vallim TQ, Tarling EJ, Edwards PA (2013)Плейотропная роль желчных кислот в метаболизме.Cell Metab 17: 657–669. https://doi.org/10.1016/j.cmet.2013.03.013

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Pierre JF, Martinez KB, Ye H et al (2016) Активация передачи сигналов желчных кислот улучшает метаболические фенотипы у мышей с ожирением, вызванных диетой с высоким содержанием жиров. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 311:G286–G304. https://doi.org/10.1152/ajpgi.00202.2016

    Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Depommier C, Everard A, Druart C et al (2019) Добавление Akkermansia muciniphila к добровольцам с избыточным весом и ожирением: экспериментальное исследование, подтверждающее концепцию.Nat Med 25: 1096–1103. https://doi.org/10.1038/s41591-019-0495-2

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Де Ваддер Ф., Ковачева-Датчари П., Гонсалвес Д. и др. (2014) Метаболиты, генерируемые микробиотой, способствуют метаболическим преимуществам через нервные цепи кишечника и мозга. Ячейка 156: 84–96. https://doi.org/10.1016/j.cell.2013.12.016

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Jayachandran M, Chung SSM, Xu B (2019) Критический обзор взаимосвязи между диетическими компонентами, кишечным микробом Akkermansia muciniphila и здоровьем человека.Crit Rev Food Sci 60: 2265–2276. https://doi.org/10.1080/10408398.2019.1632789

    Статья Google ученый

  • Азад МАК, Саркер М., Ли Т., Инь Дж. (2018) Пробиотические виды в модуляции микробиоты кишечника: обзор. Biomed Res Int 2018: 9478630. https://doi.org/10.1155/2018/9478630

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Bajagai YS, Alsemgeest J, Moore RJ, Van TTH, Stanley D (2020) Фитогенные продукты, используемые в качестве альтернативы антибиотикам-стимуляторам роста, изменяют кишечную микробиоту, полученную из ряда производственных систем: модель in vitro .Appl Microbiol Biotechnol 104:10631–10640. https://doi.org/10.1007/s00253-020-10998-x

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Lee JK, Patel SKS, Sung BH, Kalia VC (2020) Биомолекулы из бытовых отходов и отходов пищевой промышленности: обзор. Биоресурс Технол 298:122346. https://doi.org/10.1016/j.biortech.2019.122346

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Coutzac C, Jouniaux JM, Paci A et al (2020) Системные короткоцепочечные жирные кислоты ограничивают противоопухолевый эффект блокады CTLA-4 у больных раком.Нат Коммуна 11:2168. https://doi.org/10.1038/s41467-020-16079-x

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Сильва Ю.П., Бернарди А., Фрозза Р.Л. (2020)Роль короткоцепочечных жирных кислот кишечной микробиоты в коммуникации между кишечником и мозгом. Фронт Эндокринол 11:25. https://doi.org/10.3389/fendo.2020.00025

    Статья Google ученый

  • Kalia VC, Patel SKS, Cho BK, Wood TK, Lee JK (2021) Новые возможности применения бактерий в качестве противоопухолевых агентов.Сем Рак Биол. https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2021.05.012

    Статья Google ученый

  • Patel SKS, Lee JK, Kalia VC (2020) Использование биомолекул в качестве средств против COVID-19. Indian J Microbiol 60: 263–268. https://doi.org/10.1007/s12088-020-00893-4

    CAS Статья пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Риши П., Такур К., Видж С. и др. (2020) Диета, микробиота кишечника и COVID-19.Indian J Microbiol 60:420–429. https://doi.org/10.1007/s12088-020-00908-0

    CAS Статья ПабМед Центральный Google ученый

  • Сингхви Н., Гупта В., Гаур М. и др. (2020) Влияние кишечного микробиома человека на здоровье и благополучие. Индийский J Microbiol 60: 26–36. https://doi.org/10.1007/s12088-019-00825-x

    CAS Статья пабмед Google ученый

  • Роль дисбиоза кишечной микробиоты в патогенезе СПКЯ.- Полнотекстовый просмотр

    Технология метагеномного секвенирования Метагеномное секвенирование является основным методом, используемым в этом исследовании. Метагеномика, также известная как экономика, была впервые предложена Гендельманом и изучает молекулярный состав микробных популяций, их взаимодействия и функции генов.

    В медицине метагеномика сравнивает структурные и функциональные изменения микробных сообществ человека в норме и при патологии. Он может анализировать разнообразие и функциональные отличия микробных сообществ от здоровых людей и от пациентов с заболеваниями, таким образом определяя, как болезни связаны с изменениями в микробных сообществах и в их соответствующих метаболических сетях.Таким образом, метагеномика предоставляет теоретические данные для профилактики, выявления и лечения заболеваний. В настоящее время всемирно известный проект «Микробиом человека» (HMP, http://www.hmpdacc.org/) и «Метагеномика желудочно-кишечного тракта человека» (MetaHIT) являются типичными приложениями метагеномики в медицине.

    [Метагеномные виды, гены и функциональная аннотация]

    ① Контроль качества данных: секвенированные необработанные данные будут содержать определенное количество данных низкого качества, поэтому необходимо выполнить контроль качества.Только качественные данные могут правильно отразить реальное присутствие микроорганизмов в образце.

    ② Сборка метагенома: на основе чистых данных отдельные образцы сначала будут собираться отдельно, затем считывания, которые не участвуют в сборке, описанной выше, будут объединены и смешаны для сборки. Это увеличит глубину секвенирования малочисленных видов в каждой пробе и предоставит больше информации о секвенировании для каждого вида.

    ③ Предсказание генов: MetaGeneMark будет использоваться для предсказания генов на основе отдельных образцов и смешанных каркасов.Избыточность всех предсказанных генов будет уменьшена для получения набора генов Uniq. Затем чистые данные каждого образца будут сравниваться с набором генов, и для каждого образца будет определяться распространенность набора генов.

    ④ Аннотация вида: Чистые данные будут использоваться для контроля качества. Его будут сравнивать с аннотированными по эталонным базам данных геномов бактерий, архей, вирусов и грибов от NCBI. Таблица обилия видов будет получена для каждой пробы на разных уровнях классификации.

    ⑤ Функциональная аннотация: функциональная аннотация и статистика численности будут основываться на наборе генов Uniq и базе данных KEGG.

    Дисбактериоз и старение – Медицинские новости Таиланда

    Дисбактериоз характеризуется изменением микробиоты. Такой дисбаланс в естественных колониях микрофлоры в организме человека может стать причиной целого ряда заболеваний. Исследования показали, что изменения в микробиоме также могут способствовать старению.

    Микробиом включает в себя полный генетический состав микробиоты (полный набор микробов, обнаруженных в таких областях, как кожа, мочевыводящие пути, дыхательные пути и кишечник).

    Колонизация микробиоты кишечника

    Кишечная микробиота начинает населять организм, как только новорожденный подвергается воздействию микробов. Они попадают через материнский, диетический или экологический пути.

    Микробы, такие как актинобактерии, протеобактерии и фирмикуты, являются основными типами, присутствующими в раннем детстве, из которых актинобактерии преобладают.К 1-2 годам микробиота кишечника становится более стабильной.

    Ниже представлен состав микробиоты на разных этапах развития человека:

    • Младенцы
      • Младенцы, находящиеся на грудном вскармливании — бифидобактерии составляют основной микробиом кишечника
      • Младенцы на искусственном вскармливании – разнообразные микробы с большим количеством Bacteroidetes и меньшим количеством Bifidobacteria
    • Дети
      • После перехода на твердую пищу колонизируются более разнообразные микробы
    • Взрослые
      • Firmicutes, Bacteroidetes и Actinobacteria являются первичными микробами;
      • Proteobacteria и Verrucomicrobia являются менее доминирующими
    • Пожилые люди
      • Меньше Firmicutes и больше Bacteroidetes и Proteobacteria

    4 степени развития дисбактериоза.Дисбактериоз кишечника. Толстая кишка. дисбиоз толстой кишки. Изображение предоставлено: Тимонина / Shutterstock

    Изменение микробиоты кишечника у пожилых людей

    Такие факторы, как измененный образ жизни, питание, подвижность и патофизиологические изменения, могут привести к дисбактериозу в кишечнике.

    Меньшее потребление питательных веществ в результате таких факторов, как плохое состояние зубов, приводит к меньшему потреблению клетчатки и белка. Такой диетический сдвиг может быть связан с изменением микробной экосистемы кишечника.

    Исследования показывают, что различия в микробиоте наблюдались у пожилых людей, которые жили в домах престарелых, таких как дома престарелых и общинные дома престарелых. Гериатрии, жившие в общественных местах, потребляли разнообразную пищу, что приводило к колонизации разнообразной микробиоты в их кишечнике; тем самым помогая им поддерживать здоровую микробиоту кишечника.

    Снижение перистальтики кишечника, связанное со старением, также приводит к изменениям в обмене питательных веществ и влияет на общий состав микробиоты.Кроме того, снижение физической активности у пожилых людей также снижает моторику желудочно-кишечного тракта (ЖКТ). Менее подвижный желудочно-кишечный тракт приводит к различным осложнениям, таким как трудности с прохождением фекалий, растворением бактерий и выработкой определенных веществ, способствующих метаболизму, что еще больше ограничивает изгнание бактерий. Накопившиеся бактерии создают нагрузку на желудочно-кишечный тракт.
     

    Чрезмерное использование и многократные дозы различных антибиотиков приводят к разрушению разнообразной микробиоты, такой как Bifidobacterium и Faecalibacterium.В среднем 33% микробиоты нарушается из-за неправильного применения антибиотикотерапии.

    Потребление нестероидных противовоспалительных препаратов (НПВП) также может изменить микробиоту в кишечнике. Общее снижение некоторых хороших микробов, таких как Actinobacteria и Firmicutes, наблюдалось у пожилых людей, которые принимали НПВП в течение длительного периода времени. Исследования также показали, что пожилые люди, которые страдали от проблем с желудком и принимали лекарства, относящиеся к категории ингибиторов протонной помпы, также демонстрировали нарушение микробиоты кишечника.

     

     

    Последствия дисбактериоза

    Повышенный риск инфекций  – Пожилые люди более склонны к внутрибольничным инфекциям (вызванным госпитализацией) и страдают от диареи, вызванной бактерией, известной как Clostridium difficile. Было обнаружено, что передовые методы, такие как трансплантация стула, полезны при лечении диареи, вызванной Clostridium difficile. Здоровая микробиота вырабатывает короткоцепочечные жирные кислоты (КЦЖК), такие как ацетат, бутират и пропионат, которые способствуют поддержанию здоровья кишечника.Образцы фекалий пожилых людей показали снижение продукции SCFAs. Кроме того, это может быть связано с уменьшением количества некоторых бактерий, таких как Eubacterium и F. praunsnitzii, которые способствуют выработке SCFAs.

    Это связанное с возрастом истощение микробиоты у продуцентов SCFAs может привести к ухудшению эпителиального барьера. Ослабленный эпителий кишечника позволяет проникать вредным бактериям, что приводит к нарушению иммунологической защиты. Кроме того, некоторые грамотрицательные бактерии и энтеробактерии выделяют токсины, что приводит к воспалению.

    Воспаление – Иммуностарение (снижение иммунной системы) и воспаление-старение (патофизиологический процесс старения) вызывают системное воспаление.

    Эти изменения включают резкое увеличение количества бактерий, таких как Proteobacteria, и разрушение полезных бактерий, таких как бактерии, выделяющие бутират, что приводит к быстрому увеличению количества клеточных мессенджеров, таких как интерлейкин (IL)-6 и IL-8. Этот процесс приводит к возрастным изменениям, таким как воспалительное старение.

    Слабость  – Сокращение количества хороших бактерий, таких как бактерии, выделяющие бутират, приводит к дегенеративным изменениям и потере аппетита у пожилых людей.Дряхлость — это состояние, связанное со снижением физиологического запаса и увеличением возрастных состояний.

    Микробиологическое исследование образцов стула пожилых людей показало снижение количества бактерий, таких как лактобациллы. Однако количество энтеробактерий было обнаружено в большом количестве у ослабленных пожилых людей.

    Метаболизм и возрастные нарушения  – Было обнаружено, что бактерии выделяют определенные вещества, которые способствуют абсорбции и метаболизму аминокислот.

    Исследования показывают, что здоровая микробиота кишечника может способствовать поддержанию и регулированию общего обмена веществ в организме и может помочь в борьбе с возрастными расстройствами, такими как рассеянный склероз, болезнь Паркинсона и болезнь Альцгеймера.

    Здоровое старение может быть достигнуто за счет поддержания сбалансированной микробиоты кишечника путем введения диет, содержащих клетчатку/доступные для микробиоты углеводы (MAC), и пробиотиков. Употребление таких продуктов может сдерживать возрастные патофизиологические изменения.

    Ученые обнаруживают «недостающее звено» в тяжелой форме астмы, прокладывая путь к новой терапии

    LPS вызывает общие и различные реакции в тканях легких человека и мыши и управляет системными реакциями. (A) Общие зависимые от OSM, LPS-индуцированные гены с дифференциальной экспрессией (DEG) показаны в PCLS человека через 4 часа и в легких мыши через 4 часа. (B) Цитокины и хемокины в сыворотке измеряли у мышей-реципиентов C57BL/6 Osm-/- или C57BL/6 WT, которым вводили макрофаги костного мозга WT или Osm-/- (BMDM), обработанные LPS или PBS, как указано.n=5 мышей на группу с 1 из 2 показанных экспериментов. Данные представлены как среднее ± SEM. Данные анализировали с использованием тестов Манна-Уитни. *п

    Ученые идентифицировали единственную молекулу, которая может объяснить, как бактерии могут вызывать один из самых тяжелых типов астмы, открытие, которое впервые определяет «недостающее звено» между воздействием бактериальных компонентов и сильным воспалением дыхательных путей легких.

    Новое исследование не только проясняет, как тяжелая форма астмы влияет на пациентов, но и подчеркивает, как бактериальный дисбактериоз — нарушение жизнедеятельности полезных бактерий на фоне воздействия патогенных форм — влияет на уязвимые легкие.Приступая к исследованию, ученые уже знали, что бактериальные молекулы могут вызывать воспалительную активность в дыхательных путях легких, потому что у пациентов с тяжелой астмой часто происходят изменения в их бактериальных популяциях. Тем не менее, точные механизмы, с помощью которых бактерии усугубляют астму, оставались неясными.

    В поисках ответов доктор Сара Хедленд и ее коллеги из отдела иммунологии Genentech на юге Сан-Франциско сосредоточились на форме астмы, известной как нетип 2, чтобы выяснить, почему она является одной из самых тяжелых форм воспалительного респираторного заболевания. .Она и ее команда также приступили к трудной задаче по разработке индивидуальной терапии.

    В статье Science Translational Medicine команда описывает исследование, позволившее лучше понять эту форму астмы, и первые шаги к терапии, предназначенной специально для пациентов с заболеванием, отличным от типа 2. Они начали с анализа клеток и тканей пациентов с тяжелой бактериальной астмой и сравнения этих результатов с клетками и тканями людей с легкими и умеренными формами астмы, а также с теми, у кого астмы нет вообще.

    Headland и коллеги изучили биоптаты дыхательных путей 57 пациентов с тяжелой астмой, 28 пациентов с легкой или умеренной астмой и 16 здоровых людей. Ключевым открытием стала аномально высокая активность онкостатина М, белка, связанного с воспалением и агрессивным иммунным ответом, которая была уникальной для пациентов с тяжелой астмой. Кроме того, воздействие липополисахарида — ЛПС, компонента стенок бактериальных клеток — запускало активность онкостатина М.

    .

    «Бактериальный дисбактериоз и условно-патогенные бактериальные инфекции наблюдались при более тяжелой астме и могут способствовать ее развитию», — пишет Хедланд в журнале Science Translational Medicine .«Однако молекулярные механизмы, вызывающие эти обострения, остаются неясными. Здесь мы показываем, что бактериальный липополисахарид индуцирует онкостатин М и что биопсии дыхательных путей пациентов с тяжелой астмой демонстрируют транскрипционный профиль, управляемый OSM.

    «Этот профиль коррелирует с активацией воспалительных и слизеобразующих путей», — добавил Хедленд, отметив, что, используя «первичную легочную ткань человека или эпителиальные и мезенхимальные клетки человека, мы демонстрируем, что онкостатин М необходим и достаточен для управления патофизиологическими особенностями, наблюдаемыми при тяжелых астма после воздействия LPS.”

    Хотя новый анализ помог ученым лучше понять основные факторы, лежащие в основе тяжелой бактериальной астмы, в их исследованиях также высказывались предположения, что моноклональные антитела могут однажды заблокировать онкостатин М. Оба направления исследований — обнаружение недостающего звена в тяжелая бактериальная астма и выявление потенциальной формы лечения — дают луч надежды для пациентов с формой заболевания, широко известной как нетип 2.

    Когда-то считалось, что астма представляет собой отдельное заболевание, но теперь врачи понимают, что это несколько сложных, но связанных состояний с различными основными триггерами.Существует две ключевые категории тяжелой астмы: воспаление 2-го типа и воспаление не 2-го типа. Каждая из двух категорий основана на биологических механизмах, вызывающих заболевание. Воспаление типа 2, например, включает аллергическую астму и эозинофильную астму.

    Американский фонд астмы и аллергии определяет аллергическую астму как воспалительное заболевание, вызванное аллергеном, таким как воздействие тараканов, пыльцы, пылевых клещей, плесени или перхоти домашних животных и т.д.Иммунная система реагирует, вырабатывая избыток иммуноглобулина (антитела), известного как иммуноглобулин E или IgE. Чрезвычайно высокий уровень IgE может вызвать воспаление дыхательных путей легких.

    Другой формой астмы типа 2 является эозинофильная астма, которая характеризуется высоким уровнем лейкоцитов, известных как эозинофилы. Отличительной чертой этого типа астмы является генерализованный отек во всех дыхательных путях, от области носа до мельчайших дыхательных путей в легких. У людей с этой формой астмы среди прочих симптомов отмечаются свистящее дыхание, одышка, стеснение в груди и нарушения функции легких.

    Воспаление нетипа 2 при тяжелой астме определяется как отсутствие эозинофилов. Тем не менее, врачи говорят, что эта форма астмы имеет гораздо большее значение, для которой характерно множество проблем, начиная от крайнего воспалительного состояния в легких и дыхательных путях до одышки и трудностей с контролем состояния. Что касается лечения, медицинские эксперты также давно знают, что воспаление, отличное от 2-го типа, не реагирует на ингаляционные кортикостероиды, стандарт лечения, который хорошо работает при других формах астмы.Таким образом, открытие бактериального дисбактериоза, связанного с онкостатином М, открывает новое окно в понимании изнурительной формы заболевания, сообщили Хедланд и его коллеги.

    Действительно, существует явная неудовлетворенная потребность в пациентах с этой формой астмы, потому что не существует специфической терапии — чего-то целенаправленного — для устранения уникальных проявлений этой формы.

    Headland и ее сотрудники обнаружили, что онкостатин М управляет основными симптомами астмы, такими как воспалительная передача сигналов и чрезмерное выделение слизи, при воздействии либо ЛПС, либо распространенного бактериального патогена, Klebsiella pneumoniae.И из-за уникальной роли, которую играет онкостатин М, ученые Genentech разрабатывают мощное моноклональное антитело, которое может блокировать белок, предотвращая воспаление дыхательных путей.

    До сих пор многообещающие испытания проводились на мышиной модели. Надежда состоит в том, чтобы разработать лечение, которое можно будет протестировать в клинических испытаниях на людях. «Вместе эти результаты дают научное обоснование, поддерживающее клиническую разработку терапевтических средств, нацеленных на [онкостатин М] для предотвращения прогрессирования астмы», — заключили авторы.


    Исследователи открыли новую терапевтическую мишень для лечения тяжелой астмы
    Дополнительная информация: Sarah E. Headland et al, Экспрессия онкостатина М, индуцированная бактериальными триггерами, вызывает воспаление дыхательных путей и секрецию слизи при тяжелой астме, Science Translational Medicine (2022).DOI: 10.1126/scitranslmed.abf8188

    © 2022 Наука Х Сеть

    Цитата : Ученые обнаруживают «недостающее звено» в тяжелой форме астмы, прокладывая путь к новой терапии (15 апреля 2022 г.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.