Алекс Лунный
Введение
Р’ настоящее время сфера молекулярно-биологических исследований расширяется РЅР° те области, Рѕ которых раньше Рё подумать было нельзя, что РѕРЅРё РјРѕРіСѓС‚ быть предметом молекулярной биологии. Р’ частности, Р·Р° последние 15–20 лет накоплены данные РІ такой РЅРѕРІРѕР№ дисциплине, как молекулярная палеонтология. Оказывается, РІ останках динозавров, мастодонтов Рё моллюсков, для которых общепринятый возраст составляет вплоть РґРѕ сотен миллионов лет, можно обнаружить РЅРµ распавшиеся фрагменты белков Рё ДНК. Рти сведения подвергают сильному сомнению общепринятую датировку ископаемых останков, Р°, значит, Рё эволюционные РґРѕРіРјС‹. Р’ то же время, несмотря РЅР° ощутимый массив накопленных данных, РѕРЅРё РЅРµ приобрели широкую известность.
Целью настоящего обзора является критический анализ таких данных. Хотелось бы надеяться, что высказанные соображения и углубленный разбор конкретной информации, сделанный в профессиональном аспекте, послужат прояснению, во-первых, вопроса о так называемой "научности" эволюционных представлений и, во-вторых, о субъективизме и некорректности, к которым с неизбежностью приходит исследователь, когда он начинает "подгонять" свои объективные научные данных под эволюционные построения.
1. Молекулярная палеонтология — "молодая" научная дисциплина
Как и молекулярная биология, молекулярная палеонтология, но применительно к ископаемым остаткам, в первую очередь пытается исследовать основную молекулу, в которой закодирована информация об организме, т.е. ДНК. Однако некоторые важные особенности того или иного вида можно выявить путем изучения и других биологических макромолекул — белков, липидов, углеводов [1]. Вследствие крайне низкой сохранности ДНК в ископаемых образцах (см. ниже) необходимо сделать вывод, что на настоящий момент наилучшие данные получены при исследовании не ДНК, а белков. Ртак же останется в будущее время, какого бы прогресса ни достигли методы биологических исследований.
Результаты экспериментов молекулярных палеонтологов порождают РґРёСЃРєСѓСЃСЃРёРё Рё множество противоречивых суждений. Рто обусловлено следующими причинами:
• Отсутствием эмпирических данных о принципиальной возможности сохранения биологических макромолекул в течение длительных, геологических периодов времени. Условия и длительность воздействий (и даже их вероятный перечень) нельзя промоделировать в лаборатории.
• Как правило, малым количеством исходного биологического материала, что обычно не позволяет провести достаточно исчерпывающее исследование повторно.
• Уникальностью каждого образца, поскольку невероятно обнаружение даже РґРІСѓС… ископаемых остатков, для которых РІСЃРµ условиях РёС… сохранения были Р±С‹ одинаковыми. Рто РїСЂРёРІРѕРґРёС‚ Рє тому, что нет возможности корректно воспроизвести полученные теми или иными авторами аналитические опыты.
• Большой степенью загрязненности ископаемых образцов посторонними высокомолекулярными примесями (белками и нуклеиновыми кислотами от сопутствующих бактерий, грибков и др.), что затрудняет идентификацию истинно эндогенного (т.е. присущего самому образцу) материала. Например, обнаружение в древних образцах только аминокислот не предполагает с необходимостью, что их источник — оригинальные древние белки.
В связи с этим, значимость данных, полученных в рамках молекулярной палеонтологии, корректность ее подходов и методов часто подвергаются сомнениям, что отмечают ведущие специалисты в этой области [1].
Началом молекулярной палеонтологии может, по-видимому, считаться 1956 г., когда из окаменелостей были впервые выделены белки [2], а в 1974 г. путем реакции осаждения с антисывороткой показана сохранность антигенных компонентов белков возрастом "70 млн. лет" [3].
В этих старых работах вряд ли выяснено, были ли те биомолекулы действительно эндогенными для древних образцов, или же они представляли собой результаты более "молодых" посторонних загрязнений бактериями и/или грибками (артефакты): использованные методологические подходы, скорее всего, не позволили получить однозначные ответы.
Правда, данные столь же старого исследования 1976 г. [4] кажутся более адекватными: из останков моллюска ("80 млн. лет") были выделены фрагменты гликопротеинов, у которых идентифицированный участок аминокислотной последовательности оказался аналогичен показателю белка такого же, но современного моллюска [4].
Пионерами работ в области молекулярной палеонтологии должны считаться, по-видимому, польские авторы из Краковского университета под руководством доктора Р. Павлички (R. Pawlicki). Начав еще в 1960-х гг. изучать кости динозавра, возраст которого был оценен в 80 млн. лет, они в течение более 30-ти лет публиковали результаты своих исследований, причем в весьма солидных научных журналах. В образцах костей динозавра были обнаружены под электронным микроскопом сосудистые каналы, выявлены волокна коллагена и детектированы подобные остеоцитам (клеткам костей) образования. С помощью иммуногистохимических и др. методов продемонстрировано наличие в сосудистых стенках окаменевшей кости углеводов, липидов и ДНК [5, 6] (полную библиографию работ польских авторов см. в статье креациониста Марка Армитэйджа [7]). Обнаружены даже эритроциты динозавра, содержащие железо [5]. Вопрос о них, оказавшийся одним из камней преткновения в дискуссии между эволюционистами и креационистами, мы рассмотрим ниже.
Однако. Несмотря на то, что совокупность данных, полученных польскими авторами, оставляет впечатление высокой достоверности, все-таки каждый исследованный показатель по-отдельности является только косвенным. Таковы использованные методы. Хотя углеводы, липиды и ДНК находятся в районе сосудистой стенки, нет однозначных доказательств их эндогенного (присущего самому образцу) происхождения. Вполне вероятно, что там биомолекулы микробов или грибков. Про видимые под микроскопом структуры, очень похожие на остеоциты и эритроциты, могут сказать, что это артефакты, обусловленные внешними воздействиями на кость в течение длительного времени. Даже то, что в районе эритроцитов обнаружено намного бульшее содержание железа [5], не является окончательным доказательством: всегда можно предположить, что некие железосодержащие бактерии почему-то облюбовали именно эти места в какой-то момент из многих миллионов лет.
Повторим: кажется очень маловероятным, что перечисленные показатели наличия не распавшихся фрагментов макромолекул в кости динозавра в Кракове в совокупности своей обусловлены артефактами (тем более в свете полученных другими исследователями данных). Но "кажется" — это не доказательство.
С 1998 г. прекратились публикации польских авторов на указанную тему. Ведущие молекулярные палеонтологи ныне их не цитируют, что кажется не только странным, но и просто некорректным. Так, в обширном и информативном обзоре по молекулярной палеонтологии за 2003 г. доктора Мэри Швейцер (M.H. Schweitzer) из США (известной своим гемоглобином тиранозавра; ниже) нет ни одной ссылки на многочисленные статьи польских исследователей, хотя часто и разбираются гораздо менее существенные данные других авторов [1]. Нет указанных ссылок и в "программной" экспериментальной статье М. Швейцер с соавторами по биомолекулам тиранозавра за 1997 г. [8]. Можно предположить, что все дело в тех эритроцитах ископаемых ящеров, которые (эритроциты), причем вместе с самими тиранозаврами, стали "костью в горле", если не чем похуже, для доктора М. Швейцер (это будет видно ниже). Не хочет она, видимо, в 2003 г. [1] даже вспоминать о тиранозаврах с их эритроцитами и, посему, позволяет себе научную недобросовестность.
С развитием иммунохимических методов исследования в конце 1970-х — начале 1980-х гг. стало возможным получение более однозначных результатов. При использовании антител (антисывороток животных, иммунизированных исследуемыми белками), узнающих только белки позвоночных и даже только конкретные типы этих белков (например, альбумин, гемоглобин, коллаген и др.), отпал вопрос о том, что идентифицированные в ископаемых остатках макромолекулы являются результатом посторонних загрязнений бактериями или грибками. У последних не имеется белков, аналогичных по структуре альбумину, коллагену и т.п., а с биомолекулами самих микроорганизмов и грибков специфические к белкам позвоночных антитела не реагируют.
В результате, начиная с конца 1980-х гг. (особенно же — в 1990-х гг.) молекулярная палеонтология получила относительно большое развитие. Справедливости ради надо отметить, что достижения в иммунохимических методах определения биомолекул позволяли получать адекватные результаты уже с середины 1970-х гг., но по каким-то причинам (по-видимому, субъективного и финансового характера) молекулярные палеонтологи начали свои углубленные изыскания только в 1990-х гг. Р— молекулярную палеонтологию относят ныне к "молодой науке" [1].
Основная цель дисциплины — это, конечно, попытки найти эволюционные связки на молекулярном уровне между теми или иными классами и семействами животных. Подкрепить, так сказать, "научные эволюционные построения", причем желательно — на неодарвинистском, молекулярно-генетическом уровне, путем исследования ископаемых ДНК [1]. Забегая вперед, позволим себе сразу сказать: все это, исходя из плохой сохранности древних макромолекул и наличия множества артефактов — дело безнадежное (в особенности для ДНК), но, безусловно, имеющее большой рекламный отклик (вспомним хотя бы роман и фильм "Парк Юрского периода").
2. В каком виде сохраняются ископаемые остатки
Сама идея, лежащая в основе молекулярной палеонтологии, поначалу должна казаться любому биохимику и молекулярному биологу абсурдной. В самом деле: общепринято, что биологические макромолекулы, внутримолекулярные связи в которых имеют значительную свободную энергию, не могут быть устойчивыми в течение длительных периодов времени просто по определению. Базовое, "кухонно-научное" понятие (не значит — неверное) — что органические соединения не способны сохраняться в течение миллионов лет просто вследствие термодинамических процессов распада. Тление мира греховного, как пишут Святые Отцы [9]. Да и микроорганизмы быстро разрушают органические субстраты.
Рдействительно, для обнаруживаемых ископаемых остатков было постулировано РёС… окаменение СЃ постепенным замещением органических структур неорганическими веществами (СЃ РЅРёР·РєРѕР№ СЃРІРѕР±РѕРґРЅРѕР№ энергией связей, Р° потому — стабильными). Только так, полагали ранее, РјРѕРіСѓС‚ сохраняться останки животных возрастом десятки миллионов лет. Рсключительно РІ РІРёРґРµ окаменелостей Рё отпечатков (Р° также хитина насекомых Рё весьма сходных панцирей черепах), причем РІ окаменелости переходят РЅРµ только скелеты, РЅРѕ Рё РјСЏРіРєРёРµ ткани.
Механизм последнего процесса обусловлен проникновением минеральных веществ, находящиеся в водных растворах, в ткани погибшего организма с последующим замещением ими соединений, первоначально составлявших органические остатки. Процессу окаменения (fossilize; фоссилизации) кроме останков животных могут подвергаться также останки растений, когда их ткани, в частности древесина, замещаются кремнеземом. При недостатке же кислорода стволы и стебли растений превращаются в уголь, а листья — в углистые пленки. Аналогичным процессам фоссилизации иногда подвергаются микроорганизмы, но это происходит в исключительных условиях, когда их останки захоронятся и консервируются в тонкодисперсных осадках либо в коллоидных отложениях кремнезема [10]. Единственным, что кажется более или менее похожим на ископаемые органические соединениям, являются углеводороды нефти и газа, но это не биомолекулы.
Даже очень редко встречающуюся мумификацию палеонтологических образцов связывают, все-таки, с замещением неорганическими соединениями исходных тканей в условиях сухого и жаркого климата, подобного климату пустынь. Например, в 1908 г. Ч. Штернбергом были найдены в Вайоминге нескольких мумий динозавров-траходонтов, образованные мелкозернистым песчаником. Полагают, что животные погибли во время песчаной бури и их трупы были занесены сухим песком. После мумификации высохшие ткани оказались замещенными песчаником, образовав так называемые псевдоморфозы (т.е. имитации настоящих мумий) [11].
Процесс окаменения не обязательно связан с очень длительными периодами времени: при некоторых условиях возможен достаточно быстрый переход органических соединений в окаменевший образец. С данным фактом соглашаются и палеонтологи-эволюционисты в своих работах (в качестве обзора см., например, [7]). А не соглашаться никак нельзя, поскольку есть ряд примеров: окаменевшее водяное колесо, погребенное в монолите скалы (фото см. в [12]), какие-то окаменевшие мешки с мукой и т.п. [7]. Словом, нельзя однозначно утверждать, что для получения окаменевшего биологического образца обязательно необходимы сотни тысяч и миллионы лет.
3. Бывают ли не окаменевшие кости возрастом в "десятки миллионов лет"?
Окаменение окаменением, однако, оказывается, что некоторые кости даже динозавров почему-то "РЅРµ совсем" окаменевшие. Рменно РІ таких костях (или РІ подобных участках костей) наиболее успешны РїРѕРёСЃРєРё сохранившихся биомолекул. РЈ молекулярных палеонтологов РёРЅРѕР№ раз встречаются термины " unmineralized" [13] Рё "nonpermineralized" [8], что, как кажется сначала, РЅРµ может означать ничего РґСЂСѓРіРѕРіРѕ, РєСЂРѕРјРµ как "РЅРµ окаменевшая" Рё недоокаменевшая". Рсследования [8, 13] доктора РњСЌСЂРё Швейцер СЃ соавторами были посвящены выделению Рё идентификации фрагментов белков РёР· кости тиранозавра возрастом РІ "65 млн. лет". Р РІРѕРєСЂСѓРі того, была ли та кость или же ее исследованные участки окаменевшими, возникла критика СЃРѕ стороны эволюциониста, доктора наук (Ph.D.) Дж. РЎ. Харда (G.S. Hurd) [14]. Критикует же РѕРЅ статьи известного креациониста доктора Карла Виланда (C. Wieland) [15, 16], РІ том числе Р·Р° то, что тот постоянно называет ту "недоокаменевшую" кость тиранозавра совсем "РЅРµ окаменевшей". Глобальный это РІРѕРїСЂРѕСЃ, оказывается (СЃРј. РІ [14]).
Дело в том, что термин " unmineralized" — это не окаменевшая, а "nonpermineralized" — действительно, как бы частично недоокаменевшая. Перминерализация же — это проникновение минералов в район сосудистых участков кости, заполнение минералами ее открытых частей [14, 17]. Две большие разницы, как говорится: вовсе не окаменевшая, это, де, быть не может — иначе как бы она сохранилась миллионы лет... А вот частично — пожалуйста, бывает такое.
Крепко ополчился на своем сайте доктор Дж. С. Хард на креационистов по этому поводу, обвиняя их в научной недобросовестности, натяжках и подтасовке фактов. Однако исследование первоисточников показало, что все может оказаться с точностью наоборот.
В своей первой статье в научном журнале ("Journal of Vertebrate Paleontology") доктор М. Швейцер прямо в заголовке указала: "...biomolecules in unmineralized bone from Tyrannosaurus". Было это в самом начале, в 1994 г. [13]. Позже появилась публикация-интервью в недоступном нам научно-популярном американском журнале "Earth" [18], где, судя по [14] и [15, 16], она снова назвала ту кость "не окаменевшей".
Доктор К. Виланд поверил М. Швейцер и всюду в своих работах повторяет исходные слова основной исследовательницы. Но, начиная с 1997 г. в научных статьях доктора М. Швейцер по тиранозавру, мы более не встречаем термин "unmineralized", зато в программной статье [8] имеется уже "nonpermineralized", "недоокаменевшая частично", значит.
Доктор Дж. С. Хард, отчитывая доктора К. Виланда, с жаром не раз пеняет ему на то, что тот в своих выводах о "неокаменевшей кости" опирается на рекламную публикацию М. Швейцер с соавтором под характерным названием "Реальный Парк Юрского периода" в жалком научно-популярном журнале "Earth" в 1997 г. [18] (да и журнал тот, дескать, "приказал долго жить" после выхода третьего номера [14]).
Однако ни доктор Дж. С. Хард, ни доктор К. Виланд почему-то вовсе не упоминают на своих сайтах о работе в журнале по палеонтологии позвоночных, посвященной белкам в кости тиранозавра и опубликованной в 1994 г. [13]. Там эта кость, как указано нами выше, прямо названа "не окаменевшей" в заголовке статьи. Такое впечатление, что о работе [13] оба вышеуказанных доктора не ведают (иначе бы К. Виланд мог ей оправдаться). Получается, что о той работе знают только сама М. Швейцер со своим шефом и еще двумя соавторами (и помалкивают [14]), а также ваш покорный слуга. Либо — что в 1994 г. были кости другого тиранозавра. Последнее весьма сомнительно (да и сам факт "не окаменения" кости возрастом в десятки миллионов лет не изменится от того, какому тиранозавру она принадлежит). Рмалопонятно, почему в 1994 г., когда приступили к исследованию той кости, она была "не окаменевшей", а к моменту главной публикации в 1997 г. стала "частично недоокаменевшей". "Фоссилизировалась" она местами за три года, что ли?
Как ошиблись с окаменением в начале исследования, сказать трудно. Можно предположить, что все дело в конъюнктуре: спохватились, когда несколько неосторожно назвали не окаменевшую кость своим именем (как же тогда с десятками миллионов лет?), и решили лучше подчеркнуть, что имелись некоторые "недоокаменевшие" места в участках сосудистых структур, а вовсе не то, о чем подумали в 1994 г.
Еще. В своем очень познавательном обзоре по молекулярной палеонтологии за 2003 г. [1] ведущий специалист в этой области, доктор Мэри Швейцер, в списке цитированной литературы представила всего одну свою работу (не про тиранозавра) из порядка десяти имеющихся. Нет там в списке ни единой статьи по идентификации белков в кости тиранозавра (не окаменевших в 1994 г. и "недоокаменевших" в 1997 г.), хотя в тексте и упоминается глухо о "возможности присутствия гемоглобина в кости динозавра", причем представлена все та же, единственная ссылка по совсем другому поводу (Schweitzer et al., 1999). Упоминание имеется, но подробного разбора данных, а также самих статей, в списке источников нет.
Такого ваш покорный слуга за четверть века не встречал ни в одном обзоре: чтобы не ссылались на свои же работы, будучи, притом, ведущим специалистом в данной области и имея основополагающие публикации. Налицо, так сказать, какой-то "тайный замысел". Ничем другим объяснить подобное нельзя. Ведь совсем безобидным кажется на первый взгляд вопрос о "неокаменении" или "недоокаменении", однако, как видим, страсти вокруг него разгорелись серьезные. Такие страсти, что доктор М. Швейцер в 2003 г., видно, опасается цитировать саму себя за 1994–1997 гг. В самом деле — прослывет "слепой пособницей креационистов", и финансирование работ по грантам весьма ужмется. А за такое профессор Дж. Хорнер (Jack Horner), шеф М. Швейцер, по головке ее, наверное, не погладит.
По-видимому, именно поэтому в вышеупомянутом обзоре 2003 г. [1] доктор М. Швейцер цитирует одну из двух своих работ последних лет, из которой следует, что она, Швейцер, стоит строго на эволюционных позициях: там развивается гипотеза о молекулярных механизмах развития внешнего покрова в эволюционной линии динозавры — птицы [19, 20]. Причем цитированная работа опубликована в узкопрофильном журнале по экспериментальной зоологии ("Journal of Experimental Zoology") [20]. Зато нецитированная, по белкам тиранозавра, — в серьезном и широко известном журнале АН США [8].
Столь подробно указанный вопрос мы разобрали здесь потому, что следует понимать степень субъективизма в представлении данных не только интерпретаторами важных экспериментальных фактов (независимо от того, эволюционисты то или креационисты), но и самих исходных исследователей. В особенности же в такой области, как "эволюционизм" или Творение. К сожалению, часто получается так, что мало какие из выходящих за рамки общепринятого научные (а также околонаучные) факты и рассуждения можно сразу принимать на веру. Необходимо убедиться не только в достоверности исходного источника, но и изучить доступные сопутствующие публикации, в особенности фундаментальные.
4. Биологические макромолекулы, фрагменты которых идентифицированы в останках организмов возрастом в "десятки и сотни миллионов" лет
Как уже упоминалось, в конце 1980-х и, особенно, в 1990-х гг. молекулярная палеонтология достигла относительно больших успехов. Белки и ДНК были выделены и идентифицированы из различных ископаемых остатков порой прямо-таки умопомрачительного оцененного возраста. Подобные работы, помимо Кракова (Польша), проведены в целом ряде лабораторий США, в Австралии, Нидерландах, Германии и, если включить сюда митохондриальную ДНК кавказского "неандертальца", даже в России [21].
Р’ табл. 1 представлены имеющиеся РЅР° настоящий момент данные РїРѕ выделению Рё/или идентификации белков Рё ДНК РёР· ископаемых остатков РІ палеонтологическом плане: С‚.Рµ. древних РІ смысле геологической хронологии. Рспользованные РІ цитированных работах методы (иммунохимический анализ либо сравнительное исследование характеристик очищенных белков) позволяют однозначно утверждать: это фрагменты (РїРѕСЂРѕР№ значительные) эндогенных макромолекул, С‚.Рµ. принадлежащих самим ископаемым организмам, Р° РЅРµ являющиеся посторонними примесями Р·Р° счет бактерий, РіСЂРёР±РєРѕРІ Рё РґСЂ.
Можно видеть, что, несмотря на оцененные периоды в десятки, а порой и в сотни миллионов лет, в образцах остались не распавшиеся фрагменты белков, которые можно определить с помощью антител. То есть фрагменты такой величины, что они способны антителами узнаваться.
Относительно бета-кератина и коллагена следует отметить, что эти белки, вследствие своей особой жесткой молекулярной структуры, являются наиболее устойчивыми как к химическим воздействиям, так и к деградации микроорганизмами [34]. В то же время, относительно сохранности даже коллагена в ископаемых остатках все не так уж и ясно.
Ранние работы были сфокусированы на идентификации именно коллагена, поскольку он может быть детектирован в костях с помощью электронной микроскопии вследствие своей уникальной фибриллярной структуры [1]. Рдействительно, в целом ряде исследований коллагеновые микроструктуры были хорошо видны под электронным микроскопом в остатках костей динозавров, мамонтов и других ископаемых животных [6, 7, 13, 36–38]. Продемонстрировано, однако, что сохранение даже высокого уровня микроструктур не указывает с необходимостью на действительное наличие белковых молекул коллагена (структуры просто сохраняют их форму). В видимых коллагеновых структурах далеко не всегда идентифицируются специфические для этого белка аминокислоты [37] и не всегда такие структуры реагируют с антителами к коллагену [39].
Отсюда вывод: обнаружение под электронным микроскопом даже хорошо сохранившихся коллагеновых структур (и сосудистых стенок) внутри ископаемых костей не указывает однозначно на присутствие в них самого белка, поэтому ни к каким "сенсационным" креационистским выводам такие структуры в костях, например, динозавра [7], приводить не должны. Наверное, даже эти уже безколлагеновые образования вряд ли способны выдержать миллионы лет, но доказательств тому нет, поскольку в них, по-видимому, часто отсутствует лабильный органический материал (как в упомянутых выше псевдоморфозах песчаных мумий динозавров).
Представленные же в табл. 1 данные, в том числе по коллагену, отражают действительную идентификацию белковых фрагментов. Во всех перечисленных случаях действительно выделили и/или детектировали части белков. Наиболее сохранными оказываются, понятно, коллаген, кератины и остеокальцин, а наименее — более лабильные и более сложные белки с глобулярной структурой, в частности альбумин.
Рмеется, однако, РѕРґРЅРѕ важное Рё фундаментальное исключение, связанное СЃ работами РІСЃРµ той же доктора РњСЌСЂРё Швейцер.
1. Кератины — белки, формирующие волосы, перья, чешую и т.п. образования. Вследствие жесткости своей молекулярной структуры очень устойчивы к внешним воздействиям. Бета-кератин для современных животных обнаружен только у рептилий и птиц (чешуя, перья) [34].
2. Представлена продолжительность периода или эпохи.
3. Коллаген. Соединительная ткань организма формирует хрящи, сухожилия, связки, остов костей и т.д. Механическая и поддерживающая функция этой ткани обеспечивается нерастворимыми нитями, образованными высокополимерными соединениями коллагена — самого распространенного белка животных. Мономеры коллагена представляют собой трехнитевые белковые "тяжи", которые связываются друг с другом поперечными молекулярными связями (сшивками), образуя коллаген. Такая жесткая структура обеспечивает механическую прочность при сопутствующей эластичности [34].
4. Остеокальцин — низкомолекулярный костный белок, содержащий много глутаминовой кислоты; специфичен для костей.
5. Результаты авторов из мормонского университета (США), по-видимому, спорны: имеется комментарий на данную работу ведущих молекулярных палеонтологов [35].
5. Фрагменты гемоглобина из кости тиранозавра (Tyrannosaurus rex)
В 1990 г. в восточной части штата Монтана выкопали останки тиранозавра. Почти сразу же (возможно, под влиянием фильма С. Спилберга), на Биологическом факультете университета штата Монтата, в г. Бозмене (Bozeman), США, началось исследование его костей в аспекте молекулярной палеонтологии. Работы проводились в группе ассистента профессора, доктора биологических наук (Ph.D.) Мэри Швейцер (Mary Higby Schweitzer). Руководителем лаборатории являлся (и является до сих пор) профессор Джек Хорнер.
Если посмотреть РІ Рнтернете страничку, посвященную сведениям Рѕ докторе Рњ. Швейцер [40], то РЅР° фото перед вами предстанет симпатичная Рё жизнерадостная РѕСЃРѕР±Р°, имеющая, несмотря РЅР° СЃРІРѕР№ РЅРµ очень-то значительный возраст, солидный послужной СЃРїРёСЃРѕРє Рё, РїРѕ-РІРёРґРёРјРѕРјСѓ, высокую профессиональную квалификацию. Рменно доктор РњСЌСЂРё может ныне считаться, полагаю, РѕРґРЅРёРј РёР· ведущих мировых исследователей РІ области молекулярной палеонтологии.
Программная экспериментальная работа, посвященная изучению макромолекул РІ кости тиранозавра, опубликована РІ трудах РђРќ РЎРЁРђ Рё, как РІСЃРµ статьи этого издания, полностью помещена РІ Рнтернете (Schweitzer M.H. et al., 1997) [8]. Последнее позволяет углубленно ознакомиться СЃРѕ всеми методическими тонкостями Рё выводами авторов без посещения специальной библиотеки. Специалисту РІРёРґРЅР° тщательность РїСЂРё выполнении экспериментов, адекватность методов Рё достоверность полученных результатов.
Хотя нашей задачей РЅРµ является рассмотрение СѓР·РєРёС… специальных РІРѕРїСЂРѕСЃРѕРІ Р±РёРѕС…РёРјРёРё Рё РёРјРјСѓРЅРѕС…РёРјРёРё, РІСЃРµ же придется разъяснить, что сделано Рё как. Рначе будет непонятно, РґР° Рё слишком важна проблема.
РР· участка кости СЃ видимыми РїРѕРґ РјРёРєСЂРѕСЃРєРѕРїРѕРј сосудистыми стенками провели экстракцию белкового материала. Такового было получено, СЃ позиций Р±РёРѕС…РёРјРёРєР°-аналитика, ощутимое количество — РїРѕСЂСЏРґРєР° 1 РјРі. Фрагменты распавшихся белков (полипептиды Рё пептиды) СЏРІРЅРѕ имели небольшой размер, поскольку, как указывают авторы, РѕРЅРё РЅРµ идентифицировались РїСЂРё электрофорезе РІ денатурирующих условиях [8]. Последний метод — это стандартный РїРѕРґС…РѕРґ РїСЂРё разделении белковых смесей РІ соответствии СЃ РёС… молекулярной массой, Рё белки хорошо РІРёРґРЅС‹ РЅР° электрофореграмме (РїСЂРё стандартных условиях опыта), только РєРѕРіРґР° РѕРЅРё имеют молекулярную массу РЅРµ менее 6.000–10.000 "углеродных единиц" (РІСЃРїРѕРјРЅРёРј школьную С…РёРјРёСЋ: углеродная единица — это 1/12 РѕС‚ массы обычного нам изотопа углерода 12C). Масса средней аминокислоты (всего РёС… 22) составляет 140 Сѓ.Рµ. (РѕС‚ 89 РґРѕ 240 Сѓ.Рµ.; большинство 120–150 Сѓ.Рµ.). Следовательно, чтобы белок был хорошо "виден" РїСЂРё электрофорезе, РѕРЅ должен состоять РёР· 40–70 аминокислот. РќРѕ РІ белковом экстракте РёР· кости тиранозавра такие полипептиды РЅРµ обнаруживались, следовательно, фрагменты оказались меньшими.
Априори было ясно, что основную часть должны составлять фрагменты именно гемоглобина — наиболее "обильного" белка крови (сравним только альбумин) — ведь экстрагировали те участки кости, где локализовались видимые под микроскопом стенки сосудов.
Далее авторы иммунизировали белковым экстрактом крыс. Обычно иммунизируют кроликов или морских свинок (у последних иммунный ответ сильнее, а от кроликов — больше материала), но в данном случае, в связи с малым количеством белкового экстракта, пришлось, наверное, выбрать крыс, которые меньше кроликов и свинок.
Рммуноген (экстракт) вместе СЃ адъювантом Фрейнда (стандартный СЃРїРѕСЃРѕР± усилить иммунный ответ) вводили РґРІСѓРј крысам, Рё Сѓ обеих выработались антитела (последнее указывает, что иммуногенность была достаточно стабильна; значит, фрагменты РЅРµ являлись совсем СѓР¶ ничтожными). Хорошо известно, что степень иммуногенности (С‚.Рµ. способность вызывать выработку антител Сѓ животных) очень зависит РѕС‚ размера белковой или пептидной молекулы. Невозможно выработать антитела против фрагмента белка СЃ молекулярной массой менее 1000, С‚.Рµ. состоящего РёР· РїРѕСЂСЏРґРєР° 7–8 аминокислот (СЃРј., например, [41]).
Однако авторы не просто получили "какой-то" иммунный ответ. Не это было их задачей. Они использовали антисыворотку крови крыс для дальнейших иммунохимических методов определения. Отсюда следует, что уровень антител в сыворотке был достаточно высок (иначе методы бы не сработали), а такое может быть обеспечено, только если фрагменты белка имели молекулярную массу значительно более 1000.
Думаю, что ни один специалист (даже иммунохимик) не скажет, какие точно минимальные размеры фрагментов белка при иммунизации необходимы, чтобы антисыворотка имела "рабочий вид". Он скажет, что иммуногенность зависит от конкретного типа белка, от конкретного типа фрагментов (она связана и с аминокислотным составом), от конкретных животных и т.п. Здесь просто голая эмпирика, можно сказать, почти ремесло: кто дольше работал и с бульшим количеством белков, тот и способен дать более правдоподобный ответ. Тем более, что на практике редко получают антисыворотку к столь малым молекулам, поскольку таких белков в живом организме просто мало.
Ваш покорный слуга, хотя и получал антисыворотку и делал аналогичные вещи в области определения белков иммунохимическими методами, все-таки не является конкретно иммунохимиком. Ртем не менее позволю себе сделать следующий вывод. Чтобы антисыворотка к каким-то белковым фрагментам, выделенным из той кости тиранозавра, "работала" так, как это наблюдалось у авторов [8], она все-таки должна была иметь ощутимый титр (концентрацию) антител. Поэтому и иммуногенность вводимых крысам полипептидов была достаточно ощутима, а, значит, и их молекулярная масса (длина молекулы) — тоже. Полагаю, что величина последней составляла никак не менее 2000–3000 у.е., что соответствует цепочке из порядка 15–20 аминокислотных остатков.
Указанный вывод косвенно следует в том числе и из руководств по иммунохимическим методам анализа (например [42]).
Далее авторы [8], использовав полученную антисыворотку, с помощью двух иммунохимических методов определили, реагирует ли она с препаратами гемоглобинов (коммерческих, выпускаемых химическими фирмами) из различных источников. При иммуноферментном анализе в растворе (ELISA) было обнаружено, что антисыворотка отчетливо "узнает" гемоглобин индюка, а с помощью иммуноблоттинга (это на специальной мембране) получены еще более исчерпывающие данные.
Р’ [8] проделаны РІСЃРµ стандартные контроли Рё представлен почти весь первичный экспериментальный иллюстративный материал. Перед иммуноблоттингом авторы убедились, что имеющиеся Сѓ РЅРёС… стандартные препараты гемоглобинов кролика, РёРЅРґСЋРєР° Рё змеи вполне качественные. Действительно, хотя Рё закупленные, наверное, РЅР° крупных химических фирмах (РІ статье РЅРµ указано, РЅРѕ РІСЂСЏРґ ли сами очищали), такие препараты РјРѕРіСѓС‚ портиться РїСЂРё хранении даже РІ холодильнике (РјРёРєСЂРѕР±С‹ съедят, РІРѕРґР° попадет). Рто вам РЅРµ доказывать, что выделенным РЅРµ распавшимся фрагментам белка тиранозавра миллионы лет. РџРѕРїСЂРѕР±СѓР№ РЅРµ убедись, что твои стандартные препараты современных белков РЅРµ развалились Сѓ тебя (частично, конечно) РїСЂРё хранении РІ течение нескольких лет, или же РїСЂРё неаккуратной транспортировке СЃ фирмы (РєРѕРіРґР° лед положить забыли), Рё коллеги-Р±РёРѕС…РёРјРёРєРё РјРѕРіСѓС‚ указать РЅР° возможность некорректности Рё артефактов, посмотрев полученные тобой данные.
Рто только Сѓ тиранозавра его полипептиды десятки миллионов лет нераспадаться СЃРїРѕСЃРѕР±РЅС‹.
Как бы там ни было, перед иммуноблоттингом авторы провели электрофорез своих стандартных гемоглобинов (электрофореграмма представлена) и убедились, что все они имеют присущую гемоглобинам молекулярную массу (порядка 64.000), то есть, что препараты "не развалились".
После этого проводили их иммуноблоттинг с антисывороткой к белковому экстракту из кости тиранозавра и обнаружили отчетливую (во всяком случае, на фото) реакцию с гемоглобинами кролика и индюка. А вот с гемоглобином змеи антитела не реагировали, и это послужило контролем того, что антитела связываются не с любым белком. Если бы антитела "узнали" еще и гемоглобин змеи, то авторам пришлось бы для контроля исследовать реакцию с еще каким-нибудь белком, не гемоглобином (с альбумином, к примеру). Чтобы сказать: да, реакция характерна не просто для белков как таковых, а именно и только для гемоглобинов.
Но в молекуле гемоглобина змеи не оказалось того участка аминокислотной последовательности, который соответствовал фрагментам гемоглобина тиранозавра, в то время как в гемоглобинах индюка и кролика он имелся. Антитела не среагировали с гемоглобином змеи, и, поэтому, авторам повезло: не пришлось проводить дополнительное исследование реакции с каким-нибудь другим, неспецифическим белком. В качестве его случайно выступил гемоглобин змеи.
С первого взгляда кажется странным: антитела к белку тиранозавра, а реагируют с гемоглобином кролика, но не змеи. Но это и не важно: просто такой участок полипептидной последовательности во фрагментах весьма распавшегося гемоглобина тиранозавра попался, которого нет в белке змеи. Тем более, что он имеется в гемоглобине птицы (индюка), а именно к птицам ящеры типа тиранозавра и близки [10, 11].
Авторы [8] проделали также иммуноблоттинг с экстрактами из бактерий и даже из окружавшего кость песчаника, но антитела со всем этим, конечно, не среагировали. Таким образом, почти все мыслимые контроли были соблюдены.
Однако идентификацией белковой части фрагментов гемоглобина тиранозавра Рњ. Швейцер СЃ соавторами похвально РЅРµ ограничились. Р’ состав молекулы гемоглобина РІС…РѕРґРёС‚ специфичное молекулярное образование — гем: железо РІ РѕСЃРѕР±РѕР№ координационной форме РІ СЃРІСЏР·Рё СЃ порфирином (это кольцевая структура; РіСЂСѓР±Рѕ РіРѕРІРѕСЂСЏ, что-то типа нескольких бензолов). Авторы [8] для идентификации специфической структуры гема РІ экстрактах РёР· костей динозавра применили целый комплекс РёР· пяти физико-химических методов: РЇРњР , спектроскопию РІ ультрафиолете, РРџР , HPLC Рё РґСЂ. (РЅРµ станем РїРѕРґСЂРѕР±РЅРѕ рассматривать суть этих известных методов). Было обнаружено, что РІРѕ всех случаях полученные показатели характерны для гема.
Кроме того, в местах локализации структур, соответствующих сосудам внутри костей, окраска была характерной для остатков крови (красно-коричневая). Такую же окраску имел и белковый экстракт [8, 16].
Рто РІСЃРµ, РЅРѕ этого вполне хватает, чтобы сделать следующие выводы:
1) Работа проведена корректно; использованные подходы адекватны, а полученные данные убедительны.
2) Найдены остатки специфичной структуры гема в участках сосудистой стенки кости тиранозавра.
3) Строго идентифицированы белковые фрагменты молекулы именно гемоглобина тиранозавра возрастом "65 млн. лет".
4) Рти фрагменты, хотя Рё малы, РІСЂСЏРґ ли состоят РёР· менее чем 15–20 аминокислотных остатков, что составляет 3–5% РѕС‚ интактной (РёСЃС…РѕРґРЅРѕР№) молекулы гемоглобина. Р’ самом теоретически "худшем" случае фрагменты РЅРµ РјРѕРіСѓС‚ включать менее 7–8 аминокислот (2% РѕС‚ интактной молекулы), РЅРѕ этот случай весьма проблематичен, РёСЃС…РѕРґСЏ РёР· РёС… ощутимой иммуногенности. Р’ наиболее же "лучшем" теоретически случае фрагменты РЅРµ РјРѕРіСѓС‚ быть длиной более 40–70 аминокислот (10–15% РѕС‚ интактного белка), поскольку РЅРµ РІРёРґРЅС‹ РїСЂРё электрофорезе.
Таким образом, гемоглобин тиранозавра за "65 млн. лет" почему-то не распался на все 100%, а только максимум на 95–98%. Что же это за такой, по-видимому, никому неизвестный сверхустойчивый полипептидный участок входит в его состав? Новое слово в науке о гемоглобине и в науке о тиранозаврах.
6. Последствия работы доктора М. Швейцер с соавторами
Мы уже знаем, как доктор Мэри поспешила со своей, по словам одного эволюциониста "рекламной" [14], статьей-интервью в научно-популярном журнале в 1997 г.
"Реальный Парк Юрского периода" [18] у нее в лаборатории, понимаешь. Ркость тиранозавра у нее почему-то то не окаменевшая [13], то "недоокаменевшая" [8, 18].
Рзвестный креационист доктор Рљ. Виланд уделил большое внимание всем этим исследованиям Рё интервью, причем немного запутался СЃ недоокаменением, Рє тому же слишком сосредоточившись, РІРёРґРёРјРѕ, РЅР° научно-популярном РІ ущерб действительно научному [15, 16]. РћРЅ получил СЃРІРѕСЋ порцию критики РѕС‚ эволюциониста [14], Рё, наверное, РЅРµ РѕС‚ РѕРґРЅРѕРіРѕ.
Однако, как мы видели выше, фундаментальная работа по фрагментам гемоглобина тиранозавра, опубликованная в журнале АН США [8], в дальнейшем явно стала замалчиваться. Ее не цитирует даже сама доктор М. Швейцер в обзоре за 2003 г. [1].
А на справедливые замечания доктора К. Виланда, что для иммуногенности фрагменты белка должны быть достаточно большими, какой-то эволюционист Джек Дебон (Jack DeBaun) небрежно ответил ему, что для иммуногенности, дескать, было достаточно гема с прикрепленными к нему 3–4 аминокислотами [16]. Спросил доктор К. Виланд своего приятеля — специалиста по моноклональным антителам, правда ли это, но тот сразу очень сильное сомнение насчет 3–4 аминокислот выразил [16]. Рмы скажем здесь: гем к иммуногенности отношения не имеет вовсе, иначе бы мы просто жить не смогли, поскольку гем един для всех видов позвоночных, а эритроциты у нас распадаются постоянно, и гем в кровь выходит. Ребенку ясно (только не Дж. Дебону [16]), что не вынесли бы мы такой постоянной аутоиммунной нагрузки собственными антителами к собственному гему. Рчтобы пептид в 3–4 аминокислоты наработку антисыворотки у крыс (причем "рабочей" антисыворотки) вызывал, того не видано и у папуасов. С чем хочешь небелковым свяжи такой пептид для иммунизации, все равно не получится.
А еще видно, как изо всех сил стараются забыть про ту "unmineralized", то есть "не окаменевшую" кость тиранозавра, какой она в 1994 г. была, заменив ее на "недоокаменевшую частично" (nonpermineralized) [14, 17] (доктор М. Швейцер, видимо обжегшись, и вовсе о ней помалкивает осторожно [1]).
Вопрос же о возрасте кости сомнению эволюционистами не подвергается: 65 млн. лет, и все тут [1, 14, 17]. Указывается, что это данные не только радиоизотопного анализа, но и основанные на определении степени рацемизации аминокислот [17].
Смысл последнего метода состоит РІ следующем. Р’СЃРµ живущие РЅР° Земле организмы имеют РІ составе белков только L-формы аминокислот (кристаллы которых вращают плоскость поляризованного света влево). Однако если синтезировать аминокислоту химически (Р° РЅРµ выделить РёР· биологического материала), то РјС‹ получим рацемат — смесь РёР· равных количеств L- Рё D-форм (оптических изомеров), С‚.Рµ. РёР· лево- Рё правовращающих. Вследствие стремления Рє состоянию химического равновесия, соединение, РёСЃС…РѕРґРЅРѕ представленное какой-то РѕРґРЅРѕР№ изомерной формой (L- или D-) СЃРѕ временем превращается РІ рацемат РёР· равных количеств обеих форм. Ресли организм умирает, то, РІ зависимости РѕС‚ времени, соотношение L/D формы становится РІСЃРµ меньше Рё меньше, РїРѕРєР° РЅРµ достигнет единицы. Рменно РЅР° определении РїРѕРґРѕР±РЅРѕРіРѕ соотношения Рё основано датирование ископаемых останков РїРѕ степени рацемизации аминокислот [1, 43, 44].
Но и тут не все оказывается столь просто: даже беглое ознакомление со специальной литературой показывает, что процесс рацемизации зависит от окружающих условий. Так, присутствие воды — фактор, влияющий на рацемизацию, а для некоторых аминокислот в процессе нагревания (105°С), выявляется обратная кинетика реакции рацемизации [44]. Конечно, 105°С немало, но ведь это в лабораторных условиях, когда время ограничено. А в течение сотен и тысяч лет, наверное, и 20–30°С роль сыграют. Логичным это кажется с химических позиций. Рвообще, скорость рацемизации постоянна только при постоянной температуре [45], чего и следовало ожидать. В результате даже использующие этот метод с осторожностью подходят к его результатам, указывают на некоторые сложности [46] и рекомендуют применять его в комплексе с радиоизотопной датировкой [1, 47].
А те, кто занимается радиоизотопной датировкой, наверное, рекомендуют использовать ее в комплексе с определением рацемизации.
Поэтому сомнительно, что кто-то кроме любителей эволюции способен безоговорочно доверять таким датировкам, которые насчитывают 65 млн. лет для образцов сохранившихся полипептидов, обладающих к тому же иммуногенной активностью. Ведь иммуногенная активность, все-таки, — это один из видов биологической активности.
7. Как молекулярные палеонтологи-эволюционисты объясняют возможность сохранения фрагментов биомолекул в течение десятков миллионов лет
Как только молекулярная палеонтология возникла, так, РІРёРґРёРјРѕ, сразу появилась необходимость объяснить механизмы, обусловливающие сохранность достаточно высокоэнергетических биомолекул РІ течении десятков Рё сотен миллионов лет. Рто только палеонтологи прошлого РЅРµ задумывались над подобным РІРѕРїСЂРѕСЃРѕРј: считали, что РІСЃРµ, что сохранилось Р·Р° "биллиарды" лет, окаменело, отвердело, заместилось силикатами, песчаниками Рё кремнеземами. Рли РІ РІРёРґРµ угля Рё нефти представлено. Рђ иначе Р±С‹ РЅРµ сохранилось "РїРѕ определению" [10, 11]. Молекулярным же палеонтологам пришлось волей-неволей разрабатывать возможные механизмы, поскольку РІ противном случае эволюционная "наука" (РІ смысле происхождения РѕРґРЅРёС… СЂРѕРґРѕРІ Рё семейств РѕС‚ РґСЂСѓРіРёС…) могла лишиться главной РѕРїРѕСЂС‹ СЃРІРѕРёС… умозрительных построений — гигантских промежутков времени.
Ваш покорный слуга, кроме общих фраз типа адсорбции на неорганических носителях, сам в этом роде придумать что-либо неспособен. Рне остается ничего другого, как только рассмотреть соответствующие места из все того же информативного обзора доктора М. Швейцер за 2003 г. [1].
Однако и там не очень много убедительного. Сначала признается, что все белки через какое-то время распадаются вследствие воздействий протеолитических (переваривающих) ферментов, микробов, окисления, гидролиза, внутри- и межмолекулярных взаимодействий. Отмечается, что механизмы столь долгого, миллионолетнего сохранения ДНК и белков еще только предстоит выяснить. (Mechanisms for the preservation of organic compounds such as DNA or protein over the course of geological time remain to be elucidated.) [1]. Затем говорится, что, тем не менее, накапливается все больше фактов о реальности указанного сохранения. Рдействительно: если иммуногенные фрагменты белков обнаруживаются в образцах, которым приписан возраст до сотен миллионов лет (см. выше табл. 1), то, следуя логике эволюционистов, возраст таких фрагментов сотни миллионов лет и должен насчитывать.
Далее автор обзора 2003 г., опираясь на гипотезы других исследователей, рассматривает следующие возможные механизмы, обусловливающие указанные чудеса [1]:
1. Распад биомолекул и разрушение внутримолекулярных связей могут приводить к появлению продуктов, которые, реагируя между собой, формируют комплексы биополимеров, резистентных к дальнейшей деградации.
Комментарий. Рто РЅРµ совсем понятно, поскольку даже те комплексы биополимеров, РІСЃРµ-таки, биомолекулами СЃРѕ всеми высокоэнергетическими СЃРІСЏР·СЏРјРё Рё остаются.
2. Биомолекулы способны стабилизироваться через связывание с органическими продуктами распада в окружающей почве, что ингибирует активность ферментов, расщепляющих ДНК и белки. Такой феномен выявлен в лабораторных исследованиях [1, 48].
Комментарий. Вот только из этих исследований совершенно не ясно, как будут вести себя подобные комплексы в течение не только миллионов, но и просто десятков лет.
3. Раннее "цементирование" органических остатков при погребении отложений, что защищает объекты от микробов и кислорода.
Комментарий. Ртут не совсем верится, что в течение геологических эпох (миллионы лет) те "цементные пломбы" не будут нарушены какими-нибудь подвижками пластов, землетрясениями, наводнениями и извержениями вулканов. Гемоглобин тиранозавра, опять же. Допустим, "зацементирована" кость была, защищена от микробов. Почему же тогда гемоглобин все-таки распался на 95–98%? А если микробы и другие воздействия, несмотря на "цемент", место имели, почему не до конца белок распался?
4. Связывание (адсорбция) белков Рё ДНК СЃ минеральным субстратом, причем сохранность увеличена РІ биоокаменевших (biomineralized) тканях, РіРґРµ компонент белка РІ минеральном кристалле попадает РІ закрытую систему, предохраняющую РѕС‚ молекул РІРѕРґС‹. Например, сохранение белков РІ комплексе СЃ апатитом (минеральной составляющей костей) возможно РІ течение длительного времени. Рто наиболее важный механизм.
Комментарий. Может, РІСЃРµ Рё так, РЅРѕ окаменевшая кость, РІ которой Рє тому же имеются "недоокаменевшие" участки, это РЅРµ алмаз Рё даже РЅРµ янтарь. Полагаю, что те "закрытые системы" РІ кристаллах должны были РЅРµ раз становиться открытыми РІ течение геологических промежутков времени, РєРѕРіРґР° подвергались длительным воздействиям даже слабых растворов неорганических кислот, образующихся путем взаимодействия между просачивающейся РІРѕРґРѕР№ Рё минералами (даже углекислая кислота могла сыграть роль). Рли воздействиям слабых растворов щелочей. Р’РѕРґР°, как известно, РѕРЅР° Рё камень точит.
Кто-то заметит, что останки могли РёСЃС…РѕРґРЅРѕ оказаться погребенными столь глубоко, что РЅР° РёС… "белково-минеральные кристаллы" РЅРё разу РЅРµ попала никакая РІРѕРґР°. Думаю, что тогда эти останки никто Рё РЅРёРєРѕРіРґР° Р±С‹ РЅРµ обнаружил. Рђ раз эти останки, как пишут исследователи, "excavated" (откопали), то значит, что РЅРµ так СѓР¶ глубоко РѕРЅРё Рё залегали (причем часто РЅРµ РІ пустынях это было). Рзначит, что РІРѕРґР° РІСЂСЏРґ ли была так далеко, тем более РІ течение миллионов лет. Рли же надо предположить, Рє примеру, что РІ течение 64.999.999 лет останки того тиранозавра без доступа РІРѕРґС‹ РІ глубинах Земли жюль-верновских находились, Рё только РіРґРµ-РЅРёР±СѓРґСЊ РІ последний РіРѕРґ РІ верхние пласты поступили? Сомнительно это.
В результате даже автор обзора по молекулярной палеонтологии [1] заключает:
"Существует, однако, немного экспериментальных свидетельств о том пределе [промежутка] времени сохранения, который может быть обусловлен указанными механизмами". ("However, there is little experimental evidence for a temporal limit to preservation enhanced by such mechanisms".)
Отдельным является важный РІРѕРїСЂРѕСЃ Рѕ термодинамических закономерностях сохранения пептидной СЃРІСЏР·Рё (между аминокислотами РІ белках). Рта СЃРІСЏР·СЊ достаточно стабильна, несмотря РЅР° то, что ее свободная энергия гидролиза относительно велика, если сравнивать, например, СЃ неорганическими соединениями [34]. Чтобы разрушить химически РІСЃРµ пептидные СЃРІСЏР·Рё РІ препарате белка, его раствор РІ очень концентрированной соляной кислоте (6 РЅ) запаивают РІ ампулу Рё 1–3 суток выдерживают РїСЂРё 100–105В°C [49]. Р’ этом случае разрушаются РІСЃРµ внутримолекулярные СЃРІСЏР·Рё.
Другой способ — те же условия, но при 37°C. Здесь белок распадается не полностью: помимо отдельных аминокислот, получается много ди- и трипептидов (по 2–3 аминокислоты), но не более [49]. Однако пептиды в 2–3 аминокислоты не являются иммуногенными, как то было с гораздо бульшими фрагментами гемоглобина тиранозавра, поэтому для наших прикидок можно считать, что белок практически распался.
Протеолитические ферменты (например, пепсин и трипсин) проделывают почти то же самое (хотя и не до конца) при гораздо менее жестких условиях. Вернее, вовсе не жестких. Рмикроорганизмы своими переваривающими ферментами осуществляют то же, причем часто — до конца. Всякий знает, как быстро микроорганизмы деградируют белковые питательные субстраты.
Вышеуказанное химическое расщепление РІ сильной кислоте РїСЂРё температурах 37–105В°C обусловлено уже РЅРµ биохимическими (ферментами), Р° чисто химическими, термодинамическими процессами. РћРЅРё подчиняются закону, выраженному уравнением, РІ которое РІС…РѕРґСЏС‚ параметры СЃРІРѕР±РѕРґРЅРѕР№ энергии СЃРІСЏР·Рё Рё температура. РСЃС…РѕРґСЏ РёР· распада пептидных связей Р·Р° 1–3 суток РїСЂРё 37–105В° C, специалист РїРѕ химической термодинамике способен, наверное, хотя Р±С‹ прикидочно рассчитать то время, Р·Р° которое должен произойти распад, например, РїСЂРё 20В°C. Концентрация водородных РёРѕРЅРѕРІ (кислотность) также является РѕРґРЅРёРј РёР· параметров РІ исходных термодинамических уравнениях равновесия химической реакции. Рздесь, полагаю, можно оценить то время, которое понадобится для распада РїСЂРё pH 7 (нейтральные условия) РїРѕ сравнению СЃ pH сильных растворов соляной кислоты.
К сожалению, в креационной литературе нам не встретились серьезные расчеты подобного рода (хотя они, может, и имеются). Но есть большое подозрение, что полученные в результате таких расчетов промежутки времени "самораспада" окажутся на много порядков меньше тех "десятков и сотен миллионов" лет, в течение которых полипептидные фрагменты гемоглобина и других белков (см. табл. 1) оказались не разрушенными.
Самое же главное относительно их сохранности — это, все-таки, вездесущее действие микроорганизмов. Существуют большие сомнения, что те кости на нашей Земле могли находиться в стерильных условиях миллионы — сотни миллионов лет.
8. Фактическая сохранность фрагментов макромолекул в зависимости от времени, прошедшего с момента захоронения
Кажется познавательным представить сведения из, так сказать, областей молекулярной археологии и молекулярной антропологии. А именно — сохранность иммуногенных фрагментов белков и ДНК в останках доисторических и исторических людей (табл. 2).
Рспанские исследователи вообще подвергают сомнению корректность сравнительного СЃ современным человеком расчета мутаций РІ амплифицированных ДНК тех "неандертальцев", поскольку, как РѕРЅРё пишут, никто РЅРµ учитывал вариаций РІ РЅРѕСЂРјРµ РІ определенном участке той ДНК митохондрий. Пересчитали испанцы заново эту "генетику", Рё указывают, что никакого расхождения ("дивергенции") "неандерталец" — современный человек Сѓ РЅРёС… РЅРµ получается [65].
Наконец, только что (2004 г) работы немецких исследователей ДНК неандертальца, похоже, надолго закрыли вопрос с его "расхождениями" от нас [66]. Оказалось, что экстракты из древних костей сами по себе обладают сильной способностью вызывать повреждения в ДНК (мутации — точковые замены и делеции). Когда последовательности современных митохондриальных ДНК помещали в экстракты из кости неандертальца, то наблюдались их повреждения (77% исходных копий были значительно изменены). Рчасто — именно в тех участках, что ранее столь любили сравнивать в плане "неандерталец" — Homo sapiens. Авторы делают предположение, что все дело в клеях и консервантах, которыми в прежние времена пропитывали кости, и что "последовательности древних ДНК необходимо исследовать с предосторожностями по крайней мере до тех пор, пока молекулярная основа вызываемых экстрактом мутаций не будет понята" [66].
РР· табл. 2 РІРёРґРЅРѕ, что, РІРѕ-первых, чем старше образец даже РїРѕ шкале РІ единицы тысяч лет, тем хуже сохраняются белки. Рхотя гемоглобин, например, идентифицируется РІ самых древних костях, РІ останках возрастом единицы тысяч лет его содержание уже очень мало [53].
Противоречивы данные относительно сложного и лабильного белка иммуноглобулина G. С одной стороны, он обнаружен "молекулярными археологами" в останках доисторических детей, а, с другой стороны, — не идентифицирован судебными медиками спустя всего 1,3 года после пребывания ткани с кровью в земле (см. табл. 2).
Очень иллюстративными кажутся эксперименты по идентификации в остатках костей ископаемых животных остеокальцина. Они полностью запутывают картину датирования геологических эпох.
Остеокальцин представляет собой низкомолекулярный (масса 5200–5900 "у.е.") белок позвоночных, состоящий из порядка 50-ти аминокислот и содержащий три остатка глутаминовой кислоты. Его аминокислотная последовательность, если пользоваться специальным термином, консервативна, т.е. мало отличается для различных видов животных. На взгляд биохимика, этот белок просто чудовищно термостабилен: так, после нагревания порошка из кости современной коровы при 165°C в течение 5,3 ч остеокальцин распадается только на 90% [67].
Рто кажется почище РІРёСЂСѓСЃР° гепатита, который полностью инактивировать кипячением РЅРµ удается —приходится автоклавировать РїСЂРё температурах выше 100В°C. Рхотя низкомолекулярные белки хорошо известны своей термостабильностью, должен заметить, что показатель остеокальцина выходит Р·Р° РІСЃСЏРєРёРµ мыслимые рамки.
Отсюда вывод — очень стабилен белок остеокальцин к физико-химическим воздействиям. Термодинамически стабилен, а, значит, сохраняться в костях должен долгое время (если, конечно, микроорганизмы не учитывать — они быстро справятся с любым растворимым белком). Рдействительно — еще в 1987 г нашли остеокальцин в ископаемых костях быка и зубах грызуна [26], а позже — в костях древних бизонов [67] и даже в останках динозавра [27]. Следовало бы ожидать, что в образцах от быка и бизона остеокальцин сохранится много лучше, чем, например, в костях динозавра. Однако это оказывается не так.
В работе 2002 г. [67] получены уникальные в своем роде данные. Основная часть исследования заключалась в микровыделении остеокальцина из порошка костей бизона возрастом 56–59 тыс. лет. Авторам с помощью специальных современных методов удалось его очистить, "умножить" количественно и определить аминокислотную последовательность, которая была аналогичной показателю современного остеокальцина. К сожалению, выход белка из тех костей, которым насчитали 55–56 тыс. лет, авторы не представили. (Выход белка — его количество, полученное из 1 г или из 1 кг исходного материала; в данном случае — костей.)
Зато авторы представили выход остеокальцина из костей современной коровы и бизонов возрастом по "120 и 300 тыс. лет". Определение в экстрактах из костного порошка проведено с помощью радиоиммунологического метода с антителами к остеокальцину современной коровы [67]. Чувствительность данного метода велика — достаточно просто следовых количеств белков, а полученные значения отвечают их истинной концентрации в пробах из тех или иных образцов [42].
РСЃС…РѕРґСЏ РёР· приведенных авторами [67] значений (РІ специальных единицах — пикомолях РЅР° 1 РјРі кости) путем расчета удается узнать, каково содержание остеокальцина РІ более общеизвестных единицах (например, РІ РјРі РЅР° 1 РєРі исходных костей). Нами построен соответствующий график (СЂРёСЃСѓРЅРѕРє) сохранения остеокальцина РІ костях РІ зависимости РѕС‚ времени ("сотен тысяч лет"; оценено палеонтологами РІ [67]).
РР· СЂРёСЃСѓРЅРєР° (СЃРј. материалы Рє публикации) РІРёРґРЅРѕ, что нормальный уровень остеокальцина РІ костях современной нам РєРѕСЂРѕРІС‹ (Р°, значит, Рё Сѓ Р±РёР·РѕРЅРѕРІ должно быть сравнимое значение) составляет 0,25 РјРі/РєРі кости. Рто малое содержание: РІСЃРїРѕРјРЅРёРј, что даже РёР· тиранозавра доктору Рњ. Швейцер СЃ соавторами удалось получить РїРѕСЂСЏРґРєР° 1 РјРі гемоглобина [8]. Рными словами, РІ организме, вероятно, содержится РјРЅРѕРіРѕ меньше остеокальцина, чем гемоглобина (последнего — РІСЃРїРѕРјРЅРёРј анализы РєСЂРѕРІРё — 120–140 грамм РЅР° 1 Р» РєСЂРѕРІРё).
Несмотря РЅР° РІСЃСЋ стабильность остеокальцина, спустя "оцененные" 120 тыс. лет после смерти животного уровень этого белка РІ костях Р±РёР·РѕРЅР° (СЃСѓРґСЏ РїРѕ [67] — "без вечной мерзлоты") уменьшился РІ 28 раз, Р° спустя 300 тыс. лет (РґСЂСѓРіРѕР№ Р±РёР·РѕРЅ, конечно) — РІ 2500 раз (СЃРј. СЂРёСЃСѓРЅРѕРє). Р’ последнем случае детектируются просто следовые количества белка — РѕРґРЅР° десятимиллионная грамма РЅР° 1 РєРі костных остатков. Рто указывает, как кажется вначале, что даже столь невероятно устойчивый Рє физико-химическим воздействиям остеокальцин плохо сохраняется РІ образцах возрастом "сотни тысяч лет" (РІРёРґРёРјРѕ — работа РјРёРєСЂРѕР±РѕРІ).
Но, при всем при том, известна идентификация остеокальцина в ископаемых останках различных животных возрастом до 13 млн. лет [26]. Как он может там обнаруживаться, если исходить из экстраполяции сохранности от времени согласно графику на представленном нами рисунке?
Существует еще один пример — остеокальцин в костях динозавра (и не одного) возрастом "73–75 млн. лет" (1992 г.) [27[. Конечно, там также использовали метод иммунохимического анализа, а именно: определяли уровень остеокальцина в экстрактах из костей двух динозавров, используя антитела кролика против остеокальцина современного аллигатора. Детектировали исследуемый белок динозавров и с помощью HPLC (один из типов специальной высокоразрешающей хроматографии).
Что вы думаете? Остеокальцин прекрасно определялся в костях возрастом "73–75 млн. лет" [27]. Чувствительность иммунохимического метода, использованного авторами [27], нисколько не выше, чем радиоиммунологического анализа при изучении костей бизонов в [67]. Значит, содержание остеокальцина в костях тех динозавров никак не меньше, чем у упомянутых древних бизонов, хотя возраст костей динозавров больше в 250–600 раз. Более того, поскольку авторам [27] удалось выделить остеокальцин динозавра с помощью HPLC, его содержание никак нельзя назвать тем следовым, что детектировано для бизонов в 120 и 300 тыс. лет. Скорее, оно соответствовало тому, что было характерно для костей бизона возрастом 55–56 тыс. лет в [67], для которых как раз подобное микровыделение с HPLC и проводили.
Рто уже почти 1200-кратная разница РІ возрасте ископаемых остатков.
В костях же бизонов в "120 и 300 тыс. лет", как уже отмечалось (см. рисунок), уровень остеокальцина совершенно ничтожен — 9 и 0,1 микрограмма на 1 кг (микрограмм — 0,001 мг). Чтобы выделить из таких костей белок хотя бы путем HPLC, понадобились бы тонны ископаемых останков.
РќРѕ остеокальцином РІРѕРїСЂРѕСЃ РЅРµ исчерпывается. РР· табл. 1 (СЃРј. выше) РІРёРґРЅРѕ, что детектированы Рё даже получены (выделены, очищены) фрагменты РґСЂСѓРіРёС… белки. Непонятен весьма лабильный (нестойкий) альбумин, который идентифицировали РІ костях мастодонта. Хотя известно, что последние мастодонты были современниками человека, РІСЃРµ-таки, РїРѕ оценкам, РёС… ископаемым останкам РЅРµ менее 10 тыс. лет [68], что кажется несколько многовато для сохранения даже частей молекулы альбумина.
Ркаким образом РІ старой работе 1976 Рі. [4] ухитрились выделить фрагмент гликопротеина РёР· моллюска возрастом РІ "80 млн. лет", РґР° РЅРµ просто выделить, Р° определить его аминокислотную последовательность, сравнить последнюю СЃ показателем современного нам такого же моллюска Рё сказать: "Да, аналогичны". Ведь РІ 1976 Рі., РєРѕРіРґР° проводили то исследование, никаких сверхчувствительных методов выделения РІ сверхмикроколичествах, подобных HPLC, насколько РјРЅРµ известно, РЅРµ было. Рмелись только различные РІРёРґС‹ обычной хроматографии, что Рё было использовано РІ [4]. Рђ для этих хроматографий требуется РјРЅРѕРіРѕ материала.
Р’РѕРїСЂРѕСЃС‹, РІРѕРїСЂРѕСЃС‹... Гемоглобин тиранозавра доктора Рњ. Швейцер СЃ соавторами [8], опять же. Лабильный белок. Рто вам РЅРµ крайне стабильная маленькая молекула остеокальцина. Каким образом удалось выделить отнюдь РЅРµ следовые количества фрагментов гемоглобина, которые позволили иммунизировать животных Рё получить антисыворотку?
Ответьте мне все же на вопросы: что же это за таинственные механизмы стабилизации у тиранозавра и что же это за столь различные условия захоронения, когда:
• В одном и том же источнике (костях), хотя и разных животных;
• Фрагменты значительно более лабильного белка (гемоглобина);
• Сохраняются в 200–500 раз дольше, чем стабильного (остеокальцин);
• Да еще в количествах, на много-много порядков выше.
Добавим: а бета-кератин ящеров (до "140 млн. лет" — см. табл. 1). Как с ним? Сохранился ведь.
Но почему тогда, если взглянуть на "палеоантропологическую" и "археологическую" табл. 2, мы обнаруживаем достаточно плохую детекцию гемоглобина и других белков в образцах возрастом "всего-навсего" порядка тысяч лет?
Так что, помимо остеокальцина бизонов, очень многое свидетельствует о том, что даже несоизмеримо меньшие по сравнению с геологическими промежутки времени весьма отражаются на сохранности биомолекул. Впрочем, ничего другого биохимик не может и ожидать: вспомним контрольные опыты М. Швейцер с соавторами [8], в которых они проверяли интактность коммерческих, закупленных недавно на химических фирмах препаратов гемоглобинов (то, что недавно — следует из гарантированного срока годности подобных белковых препаратов).
Рпозволим себе еще раз издать "глас вопиющего в пустыне": неужели гемоглобин, который слабо определяется уже в некоторых костях с оцененным возрастом всего в единицы тысяч лет (табл. 2), применительно к тому тиранозавру вдруг попал в столь чудесные условия, что частично сохранился за промежуток времени более чем в десятки тысяч раз продолжительный? Рдругие белки ископаемых животных тоже (см. табл. 1). Кто-то может верить в подобное, но для меня, например, все это кажется полным абсурдом, даже если прямых доказательств обратному получить нельзя (как смоделируешь те химические и физические условия за "десятки миллионов лет"?).
Рздесь следует твердо высказать свое мнение (пусть его назовут субъективным). Биохимик-эволюционист, допускающий существование нераспавшегося за десятки и сотни миллионов лет иммуногенного полипептида в кости, гораздо более далек от понимания выявленных фундаментальными естественнонаучными дисциплинами закономерностей, чем биохимик-креационист, который, хотя и не имеет непосредственного опровержения, но, опираясь на те закономерности, полагает, что фрагмент белка не может иметь столь гигантский возраст. Что те белки не могут быть захороненными не только миллионы, но даже сотни тысяч лет назад.
9. Кто первый сказал: "Рритроциты тиранозавра!"
В последние годы вокруг этого вопроса развернулась весьма оживленная, с переходом на личности, дискуссия между докторами-эволюционистами и докторами-креационистами. "Костью в горле" для первых стали те эритроциты. Рименно эволюционисты более переходят на личности.
Как уже отмечалось выше, доктор Мэри Швейцер с соавтором в 1997 г. поспешили дать рекламную статью-интервью ("Реальный Парк Юрского периода") в научно-популярный американский журнал "Earth" [18]. Журнал вскоре прекратил свое существование [14], а та статья нам, конечно, недоступна. Но основные моменты из нее широко цитируются доктором К. Виландом [15, 16, 69], а потом его высказывания, основанные на этих цитатах, критикуются эволюционистом доктором Дж. С. Хардом [14]. Сами цитаты последний сомнению не подвергает, он только ставит К. Виланду в вину увлечение "научно-популярным" и "рекламным" [14]. Поэтому мы можем смело представить те цитаты из "Парка Юрского периода" доктора Мэри с соавтором [18].
Оказывается, как только начали изучать срез кости того тиранозавра под микроскопом, то сразу обнаружили нечто, весьма похожее на эритроциты:
"Лаборатория наполнилась возгласами изумления, когда я сосредоточила [внимание] кое на чем внутри сосудов; на том, чего ни один из нас никогда не видел когда-либо ранее: крошечные круглые объекты, прозрачные, красные, с темным центром. Когда коллега бросил всего один взгляд на них, то он закричал: "Вы обнаружили эритроциты! Вы обнаружили эритроциты!" ("You’ve got red blood cells!") (цитировано по [69]).
Относительно "темного центра" надо сказать, что эритроциты лишены ядра только у млекопитающих, но у птиц, пресмыкающихся и земноводных ядра в этих клетках имеются. А не видели сотрудники доктора М. Швейцер эритроцитов под микроскопом никогда раньше наверное потому, что они палеонтологи (про то же, как проходили практику в институтах-университетах, они, видимо, давно забыли).
Рассматривая далее критику доктором Дж. Хардом доктора К. Виланда, мы можем узнать на сайте первого, что в той научно-популярной статье в "Earth" имелась еще и фотография среза кости с подписью: "Кровь из камня" [14].
Таким образом, наше исследование напоминает восстановление несохранившегося текста работы Цельса на основе трактата Оригена "Против Цельса".
За все эти "Парки Юрского периода" и "Крови из камня" доктору Мэри Швейцер, конечно, досталось от эволюциониста доктора Дж. Харда, попутно с пинками доктору К. Виланду. Уж очень любила, дескать, доктор Мэри представлять репортерам результаты своих еще незаконченных работ в преувеличенном и спекулятивном виде ("in very speculative and even grandiose terms") [14]. В результате ее шефу,