Почему возникает дисбактериоз кишечника и как его распознать? Медицинский центр Доктор Плюс

Дата публикации: 10.04.2020 В кишечнике постоянно живут микроорганизмы. Причем у здорового человека их «ассортимент» и количественное соотношение — более или менее постоянные параметры, определяющие так называемую нормальную микрофлору.

Дисбактериоз — это нарушение нормального соотношения микроорганизмов в кишечнике человека.

В кишечнике человека живёт около 500 видов микроорганизмов. Большую часть микрофлоры толстого кишечника составляют бифидобактерии.

Нормальная микрофлора выполняет очень важную для организма работу:

• защищает от опасных (патогенных) микробов, образуя плотную плёнку на стенке кишечника;
• участвует в выработке витаминов К, С, В1, B2, B6, B12, PP, фолиевой и пантотеновой кислот;
• участвует в обмене веществ, расщепляет белки, углеводы, пищевые волокна.
• принимает участие в обмене желчных кислот;
• вырабатывает вещества, регулирующие работу кишечника.

Микрофлора желудочно-кишечного тракта не бывает постоянной, поскольку тесным образом связана с характером принимаемой пищи, возрастом человека, перенесёнными заболеваниями.
Дисбиоз кишечника часто встречается у детей младшего возраста.

К факторам риска развития дисбактериоза относятся:

• позднее прикладывание к груди,
• искусственное вскармливание,
• неполноценное питание

Основные признаки дисбактериоза у ребенка

У детей раннего возраста наблюдается срыгивание, рвота, запах изо рта, снижение темпов нарастания массы тела, беспокойство, нарушения сна. Стул может быть обильным, жидким или кашицеобразным, пенистым, с белыми комочками, зеленоватым с кислым или гнилостным запахом.
Боль носит приступообразный характер, появляется через 2-3 часа после еды, сопровождается вздутием живота, урчанием, позывами на дефекацию.
При нарушениях кишечного всасывания в клинической картине доминирует диарея с гнилостным брожением, метеоризм, снижение массы тела, симптомы полигиповитаминоза. В патологический процесс вовлекается гепатобилиарная система и поджелудочная железа, возникает дефицит ферментов и желчных кислот. Все это замыкает порочный круг обменных процессов в организме. Накапливаются макромолекулы не полностью переваренной пищи, которые становятся аллергенами и вызывают аллергодерматоз.

У детей старшего возраста могут быть упорные запоры, неустойчивый стул, кишечные колики, гипер-и гипомоторные дискинезии кишечника. Дети жалуются на чувство распирания в желудке, отрыжку. Снижается аппетит. При длительно и стойко рецидивирующем дисбактериозе развиваются интоксикационный и астено-невротический синдромы.
Во всех случаях дисбактериоза у грудничков и детей старшего возраста обязательным является микроскопическое и бактериологическое исследование фекалий-копрограмма и бактериологический посев. Необходимым является полное обследование ребенка, включающее в себя проведение анализов крови и обследование органов пищеварения.

При дисбактериозе у грудничков, находящихся на грудном вскармливании, обследуют не только ребенка но, и маму. Особенно актуальным это становится при развитии вторичных инфекционных процессов. Кроме того, детально выясняют пищевой режим кормящей матери, прием медикаментов и БАДов.

Основой лечения дисбактериоза у грудничков и старших детей является использование препаратов, создающих оптимальные условия для роста молочнокислых бактерий (пребиотики) и средств, содержащих живые микроорганизмы (пробиотиков). Назначить которые может только врач, с подбором индивидуальных особенностей организма.

При наличии вторичной инфекции назначают антибиотики или бактериофаги.Одновременно проводят лечение основного заболевания (если таковое имеется), симптоматическое лечение возникших нарушений.Обязательным элементом является нормализация питания малыша.

При дисбактериозе у грудничков следует пересмотреть пищевой режим кормящей матери.

Детский врач-гастроэнтеролог Федотова Г.В.

Дисбактериоз кишечника у детей: симптомы, признаки, лечение

Появление на свет нового человечка — самая главная страница в жизни каждой женщины. И конечно, маме необходимо быть во всеоружии при обнаружении любых возможных недомоганий у малыша. Зачастую детские слезы вызваны болями в животике, а причиной дискомфорта в кишечнике является дисбиоз.

Чтобы не запутать читателя терминами, отметим, что дисбактериоз представляет собой дисбаланс только бактериальной составной микрофлоры. Дисбиоз же — более широкое понятие, под которым подразумевается нарушение баланса всей микрофлоры: и бактерий, и вирусов, и грибов, и простейших. И во многих случаях врачи под привычным нам термином «дисбактериоз» подразумевают именно дисбиоз.

Причины дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у ребенка

Простыми словами, дисбиоз — это состояние микрофлоры, при котором количество полезных микроорганизмов меньше, чем патогенных или условно-патогенных. Давайте разберемся, почему появляется дисбиоз и каким он бывает.

Различают два вида дисбиоза:

• транзиторный (от нуля до семи дней после рождения). Это нормальное состояние, ведь малыш только знакомится с нашим миром. Микрофлора начинает формироваться буквально после первого прикладывания к груди — в кишечник с молоком попадают питательные вещества, полезные бактерии, гормоны.
• истинный (с седьмого дня). Малыш растет, растут и крошечные колонии микроорганизмов в его желудочно-кишечном тракте. Теперь мама должна учитывать все аспекты повседневной жизни, влияющие на физиологическое развитие малыша.

Вот ряд факторов, способствующих развитию дисбиоза у ребенка:

• недоношенность,
• длительное пребывание малыша отдельно от матери,
• искусственное вскармливание,
• прием антибиотиков,
• инфекционные заболевания,
• снижение иммунитета по различным причинам.

Конечно, на некоторые из этих факторов мы повлиять никак не можем. Поэтому так важно проводить профилактику дисбиоза. Не стоит менять рацион грудничков без рекомендации педиатра, кормить нужно каждые три-четыре часа, не чаще. Необходимо, чтобы пища была теплой и нежирной. Добавьте в рацион малыша молочнокислые продукты, например кефир. Кроме того, если ребенку выписали антибиотик, можно и даже нужно параллельно давать пробиотики (подробнее об их пользе для здоровья кишечника мы расскажем ниже). Очень велика ценность грудного вскармливания: оно положительно влияет на развитие нормальной микрофлоры кишечника грудничка и на его иммунитет, ведь с грудным молоком в организм ребенка поступают иммуноглобулины IgA, IgМ и IgG, интерферон, а также макрофаги и лимфоциты.

Признаки дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у детей: маме на заметку

Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника выражается у малышей следующими симптомами:

• пенистый кал с неприятным кислым запахом,
• колики,
• беспокойство и постоянный плач, ребенок подтягивает ножки к животу,
• обильное срыгивание,
• рвота,
• вздутие живота,
• запоры,
• диарея,
• аллергические реакции, дерматит.

Если вы заметили такие симптомы у вашего малыша, важно вовремя обратиться к педиатру. Дисбактериоз (дисбиоз) кишечника у детей до года — это распространенная проблема, которую довольно просто решить при правильном подходе. Однако необходимо исключить вероятность болезней желудочно-кишечного тракта — у них могут быть похожие симптомы.

Меры по устранению дисбактериоза (дисбиоза)

Хоть термин «дисбиоз» и звучит как название болезни, это все-таки не болезнь. И все мероприятия по нормализации микрофлоры — скорее, не лечение, а коррекция, устранение патогенных бактерий из организма и восстановление (или создание) нормальной микрофлоры.

В начале коррекции нужно провести специальное микробиологическое исследование кала. Оно позволит определить количество потенциально-патогенных микроорганизмов. Если их количество превышает допустимый уровень, назначают специальные средства — бактериофаги. Это предшественники антибиотиков, вирусы, выборочно угнетающие рост «вредных» микроорганизмов. Бактериофагами в нашей стране лечили еще до появления антибиотиков, и их лечебная эффективность доказана на практике многих поколений.

Это важно

Давать антибактериальные средства малышу необходимо строго по рекомендации лечащего врача — самостоятельное назначение может только усугубить ситуацию. Впрочем, любое самолечение в принципе недопустимо.

Как еще можно лечить дисбактериоз (дисбиоз) кишечника у ребенка?

1. Для уменьшения агрессивности содержимого кишечника применяют сорбенты (Энтеросгель®, Смекта®). Это средства, связывающие и выводящие из организма малыша токсины.
2. Нормализовать моторную функцию кишечника можно с помощью пребиотиков (лактулоза, клетчатка). Эти вещества активизируют содержащиеся в кишечнике полезные бактерии и способствуют оздоровлению микрофлоры.
3. Для улучшения переваривания пищи назначают ферменты, расщепляющие белки, жиры и углеводы для их полноценного усвоения.
4. Рациональное и полноценное питание — одно из важнейших условий поддержания здоровья ребенка. При дисбиозе исключают из меню сырые овощи и фрукты, кислые соки. В первые два дня лечения малышам до года дают овощные пюре, каши и слизистые супы, компот и запеченные яблоки. На третий день разрешается добавлять в рацион бульоны из нежирных сортов рыбы и мяса.
5. Восстановить микрофлору помогает и прием пробиотиков. Это культуры лактобацилл и бифидобактерий, которые участвуют в выработке собственного витамина B5 (пантотеновой кислоты), стимулируют местный иммунитет, выводят токсины, поддерживают пристеночное пищеварение, участвуют в процессе всасывания и усвоения питательных веществ, улучшают перистальтику кишечника и нормализуют процесс эвакуации непереваренных остатков.

Лакто- и бифидобактерии «по умолчанию» содержатся в кишечнике с первых дней жизни. Однако их количественная пропорция в организме малыша варьируется в зависимости от ряда индивидуальных показателей: характера питания, наличия заболеваний, особенностей метаболизма и других. Понять, в каком именно виде полезных микроорганизмов нуждается детский организм, непросто, поэтому оптимален прием комплексного пробиотика, в котором содержатся и бифидо-, и лактобактерии. Такой состав предпочтителен и потому, что лактобациллы синтезируют молочную кислоту, которая обеспечивает благоприятную для полезных бифидобактерий кислую среду.

При выборе пробиотика стоит обратить внимание не только на состав, но и на форму выпуска средства. Для коррекции дисбактериоза (дисбиоза) кишечника у детей до трех лет оптимальная форма — это капли. Как правило, их можно смешивать с теплым молоком или добавлять в пищу, что обеспечивает комфортное применение у малыша. К тому же капли часто оснащают удобным дозатором, позволяющим отмерить необходимое количество средства.

В настоящее время много споров о том, является ли дисбиоз отклонением от нормы и стоит ли его лечить. Тем не менее дисбиоз имеет вполне конкретные причины и симптомы, своевременная корректировка которых крайне важна для растущего детского организма.

Дисбактериоз у детей, симптомы и лечение

Каждая вторая мама знакома с таким недугом, как дисбактериоз кишечника у детей. Особенно активно он прогрессирует при ослаблении иммунной системы малыша.

Дисбактериоз представляет собой сбой в работе кишечника из-за нарушения баланса полезных и «вредных» бактерий в желудочно-кишечном тракте. Устранение дисбактериоза кишечника у детей значительно повышает качество жизни как малыша, так и мамы.

Дисбактериоз – нарушение соотношения нормальной микрофлоры кишечника. Состояние редко имеет идиопатический характер, не является самостоятельным заболеванием. Развивается в любом возрасте, более уязвимы грудные дети. Чтобы противостоять дисбактериозу, стоит ознакомиться с провоцирующими его факторами и знать, что делать при дисбактериозе кишечника у ребенка

Причины дисбактериоза и кишечный иммунитет

Перед рождением ребенок находится в стерильных условиях, его кишечник также стерилен. После первого сосания груди и приема молозива поступают питательные вещества, иммунные комплексы, гормоны, полезные бактерии. В течение последующих 5–7 дней бактериальные клетки колонизируются, подавляется рост патогенных микроорганизмов. У ослабленных и недоношенных малышей дисбаланс кишечной микрофлоры может развиваться самостоятельно, без фонового заболевания

Причины дисбактериоза у детей до года:

• неправильное питание кормящей женщины,
• резкая отмена грудного вскармливания,
• снижение иммунного ответа,
• кормление искусственными смесями,
• заражение золотистым стафилококком,
• прием антибактериальных средств.

Этиология дисбактериоза у детей после 1 года связана с глистной инвазией, частыми простудными болезнями, ослаблением моторики и ферментативной недостаточностью кишечника, подверженностью стрессовому воздействию. Все перечисленные состояния ведут к снижению иммунной реакции.

Местный иммунитет в кишечнике играет колоссальную роль в борьбе с патогенной микрофлорой, вирусными и бактериальными агентами. Клеточные макрофаги расщепляют и поглощают поступившие антигены.

Последствия ослабления иммунитета и возникновения дисбактериоза

Первым признаком дисбактериоза кишечника у детей является нарушение отхождения кашицеобразного стула. Он становится жидким, с резким кислым запахом, цвет от бледно-желтого до болотно-зеленого или отмечаются стойкие запоры с болезненным актом дефекации.

Другие последствия:

• урчание в животике;
• повышенное газообразование;
• появление колик у малыша, сопровождающееся болями;
• аллергические высыпания на фоне интоксикации;
• отставание в физическом развитии – недостаток витаминов группы В, витаминов Е, Д.

При выявлении подобных признаков рекомендовано обращение в клинику к педиатру. Только специалист сможет объективно оценить состояние здоровья малыша.

Первый сигнал о дисбактериозе – появление сыпи разной локализации на теле, которая чешется и для которой характерен полиморфизм высыпания. Так проявляются аллергические реакции на коже.

Что делать при дисбактериозе у малышей?

Коррекция дисбактериоза кишечника у детей направлена на устранение причины и симптомов нарушения. Женщинам, желающим узнать, как помочь малышу при коликах и газах, желательно ознакомиться с советами доктора. Зачастую специалист назначает:

• бактериофаги;
• пероральные сорбенты;
• ферментативные средства;
• ветрогонные препараты;
• назначают пробиотики для малышей, чтобы заселить микрофлору, или пребиотики для стимуляции роста собственных колоний;
• иногда антибиотик;
• прием интерферонов.

Для коррекции дисбиоза также показаны прогулки на свежем воздухе, дополнение рациона питания пробиотическими продуктами и нормализация режима сна и отдыха детей

Как поддержать естественную микрофлору

Поддерживать естественную микрофлору кишечника могут помочь капли для приема внутрь – Аципол® Малыш, капли. Они относятся к биологически активным добавкам, в состав которых входит необходимое количество колониеобразующих организмов – лактобактерии, бифидобактерии.

Способ дозирования средства очень прост – есть насадка-дозатор. Разводить вещество не нужно, оно выпускается в суспензии. Согласно инструкции по применению, Аципол® Малыш, капли дают ребенку 1 раз в день по 5 капель, допускается добавление в смесь, воду.

Действие компонентов Аципол® Малыш, капли

Действие Аципол® Малыш, капли сходно с аналогичными средствами, относящимися к группе пробиотиков. Лактобактерии и бифидобактерии заселяют желудочно-кишечный тракт и оказывают благотворное влияние на организм.

Образующиеся колонии полезных бактерий вытесняет патогенную микрофлору. Результатом использования такого средства служит нормализация стула малыша, уменьшение болей в животике, снижение интоксикации.

Стоит отметить, что применение только Аципол® Малыш, капли при дисбактериозе кишечника у детей нецелесообразно, обязательна комплексная терапия с применением лекарственных препаратов, которые вам назначит специалист вместе с Аципол® Малыш, капли

При выявлении первых признаков дисбактериоза у ребенка следует обратиться за медицинской помощью к профилирующему специалисту. Причин развития патологического состояния много, только специалист может определить этиологию недуга и назначить адекватное лечение с учетом возраста ребенка и степени тяжести патологии.

Дисбактериоз у ребенка | Официальный сайт Huggies®

Содержание:

1. Что такое дисбактериоз
2. Дисбактериоз у детей: причины возникновения
3. Дисбактериоз у ребенка: симптомы
4. Лечение дисбактериоза у детей
5. Немедикаментозное лечение дисбактериоза

Если у ребенка болит живот или плохо переваривается пища, врач часто ставит диагноз «дисбактериоз». Отечественные педиатры давно и успешно лечат детей от дисбактериоза, в то время как на западе такого слова не знают вовсе. Что же это за заболевание, как диагностировать и чем лечить дисбактериоз у ребенка?

Что такое дисбактериоз

Современные педиатры все чаще говорят, что дисбактериоз — это не болезнь, а состояние любых слизистых оболочек, при котором нарушен баланс микрофлоры. Чаще всего встречается дисбактериоз кишечника у детей — уменьшение полезной микрофлоры и размножение патогенных организмов.

Дисбактериоз у детей до года — очень распространенное явление. В норме в кишечнике человека присутствуют бифидо- и лактобактерии, они защищают кишечник от патологической флоры и токсинов, участвуют в пищеварении, позволяют полноценно усваивать белки, жиры, углеводы, витамины, различные кислоты.

Помимо полезных бактерий в кишечнике ребенка живут и условно-патогенные организмы (стафилококк, энтерококк и другие), которые в незначительном количестве не опасны, но размножаясь, могут вызывать признаки дисбактериоза у детей: тошноту, вздутие и боль в животе и так далее.

Дисбактериоз у детей: причины возникновения

Незрелость желудочно-кишечного тракта

Дисбактериоз у месячного ребенка чаще всего обусловлен несформированностью микрофлоры слизистых оболочек желудка и кишечника. Работа ЖКТ новорожденного еще только налаживается, и полезных бактерий для стабильной работы кишечника может не хватать.

Неправильное питание

Несоответствующее возрасту питание (частая смена смесей или слишком ранний ввод прикорма), а также употребление в пищу аллергенов (например, молочных продуктов при непереносимости лактозы) может способствовать развитию дисбактериоза.

Дисбактериоз после антибиотиков у ребенка

Если ребенок принимал антибиотики, естественная микрофлора его кишечника нарушается, так как антибиотики убивают любые бактерии, не разбирая, болезнетворные они или полезные.

Кишечные инфекции

Если функциональное нарушение пищеварения у грудного ребенка чаще всего вызвано незрелостью ЖКТ или погрешностями в питании, то дисбактериоз у ребенка 2 лет может быть следствием вирусной инфекции (ротавируса, дизентерии, сальмонеллеза), в результате которой в кишечник попали болезнетворные микробы.

Неблагоприятная экология

На состояние желудка и кишечника влияет и окружающая среда: загрязненный промышленными выхлопами воздух, химические отравления, недостаточно чистая питьевая вода могут спровоцировать развитие дисбактериоза.

Еще до обращения к врачу родители обычно понимают, что у ребенка дисбактериоз кишечника. Симптомы у детей проявляются довольно ярко и причиняют дискомфорт, особенно новорожденным и грудным малышам.

Дисбактериоз у ребенка: симптомы

• Боли, чувство тяжести и вздутия в области живота, метеоризм;

• расстройство стула: запоры или поносы;

• остатки непереваренной пищи, слизь или крупинки в кале;

• обильные срыгивания, отрыжка, а иногда и рвота;

• шелушение и покраснение кожи, высыпания и опрелости, атопический дерматит;

• выпадение волос, ломкость ногтей, кровоточивость десен;

• неприятный запах изо рта;

• белый или серый налет на языке;

• темный налет на зубах;

• плохой аппетит.

Многие заболевания ЖКТ имеют такие же симптомы, как симптомы дисбактериоза у детей. Лечение же должно быть различным, поэтому так важно правильно поставить диагноз.

Лечение дисбактериоза у детей

Для определения качественного и количественного состава микрофлоры кишечника необходимо сдать копрологический, биохимический и бактериологический анализ кала. В зависимости от того, какая условно-патогенная флора и в каких количествах будет обнаружена, врач-гастроэнтеролог подберет лечение.

Для борьбы с дисбактериозом применяются:

• бактериофаги — препараты, уничтожающие бактерии-возбудители дисбактериоза;

• пробиотики — препараты на основе живых микроорганизмов, позволяющие искусственно заселить кишечник полезной флорой;

• пребиотики — неперевариваемые вещества (лактулоза, клетчатка), стимулирующие двигательную функцию кишечника;

• пищеварительные ферменты — вещества, помогающие расщеплять и переваривать пищу.

При выборе препаратов учитывается и причина, вызвавшая дисбактериоз. Если виной расстройству кишечника — антибиотики, лечение будет одно, если аллергическая настроенность организма — другое.

Не выбирайте препараты для лечения микрофлоры кишечника самостоятельно. В аптеках их сейчас множество («Аципол», «Линекс», «Бифидумбактерин», «Бифиформ Малыш» и др.) и фармацевт обязательно посоветует вам что-нибудь, но неправильно подобранный препарат и неверная дозировка могут еще больше нарушить микрофлору кишечника.

Немедикаментозное лечение дисбактериоза

Заселяя кишечник ребенка полезной флорой, не забывайте и об основных принципах питания:

Сохраняйте грудное вскармливание

Дисбактериоз у грудных детей бывает реже, чем у детей на искусственном вскармливании, так как грудное молоко — источник полезных лактобактерий. Если сохранение или восстановление грудного вскармливания невозможно, применяйте лечебные смеси.

Придерживайтесь диеты

Если ребенок уже не питается грудным молоком, позаботьтесь о его диете: исключите из рациона сырые овощи, фрукты, белый хлеб, бобовые, молочные и другие продукты, повышающие газообразование. Основу рациона должны составлять крупы, нежирное мясо, кисломолочные продукты, из фруктов допускаются бананы и печеные яблоки.

Соблюдайте режим дня

При лечении дисбактериоза очень важно создать для ребенка спокойные и комфортные условия, исключить стрессы и уделить внимание здоровому сну, прогулкам, физической активности на свежем воздухе.

Как победить состояние дисбактериоза у детей?

Дисбактериоз в последнее время – весьма распространённое состояние у детей, особенно у грудничков. Оно доставляет дискомфорт малышам, ухудшая их общее состояние, самочувствие, мешает нормальному набору веса ребенка  и причиняет массу беспокойств их родителям. Кроме того, микрофлора играет немаловажную роль в жизнедеятельности человека. Она регулирует перистальтику кишечника, поддерживает и стимулирует иммунную систему, синтезирует многие витамины, обеспечивает противовирусную защиту хозяина, нормализует обменные процессы, помогает усваивать многие микроэлементы и аминокислоты, помогает очищать организм от токсинов и препятствует проникновению чужеродных микробов в кровь. Всего в организме человека в кишечнике в высушенном виде находится 1,5 килограмма полезных микробов – это целый «орган». Их деятельность, значимость, можно сравнить с функцией двух органов печени и почек вместе взятых!  О причинах возникновения дисбактериоза и методах борьбы с ним рассказывает заведующий отделением детской гастроэнтерологии Челябинской областной детской клинической больницы,  врач высшей категории Вадим Земляков.

– Вадим Леонидович, дисбактериоз некоторые врачи считают болезнью. Каково Ваше мнение по этому поводу?
– Дисбактериоз – это состояние, которое может развиваться при различных заболеваниях или неблагоприятных окружающих условиях человека. Приведу простой пример: вы сидите на лекции или в кино, в зале душно нарастает количество углекислого газа в воздухе. В этой ситуации  постепенно начинает развиваться состояние дисбактериоза. На работе отругал начальник, человек получил новую порцию стресса, усилилась моторика кишечника, положено начало к развитию состояния дисбактериоза. На нормальную кишечную флору, и не только кишечную, но и на флору всех полостных органов влияет: неправильное питание, плохая экология, изменение климата,  различные ионизирующие излучения, которые окружают человека в повседневной жизни, воспалительные заболевания, прием лекарственных средств. Но это  не болезнь – это изменение флоры (состояние временное) в зависимости от внешних условий воздействия.
– Дисбактериоз может быть только в кишечнике или этому подвержены все слизистые оболочки организма?
– Нарушенная кишечная флора будет отрицательно действовать на слизистую всех полостных органов в которых она имеется (полость рта, пищевод, желудок, кишечник, влагалище и др.). Здесь появляется цепочка взаимосвязей: болезнь слизистой кишки влияет на состояние микрофлоры, нарушенная микрофлора – на слизистую.
– По каким признакам родители могут определить, что у ребенка имеется состояние дисбактериоза?
– Родителям стоит задуматься, если у ребенка снижается аппетит, ребенок бледный с синюшными кругами под глазами и под носом. Если у ребенка периодически отмечается подташнивание, бурчание  и боли в животе, меняется стул, в кале присутствует зелень или кусочки непереваренной пищи. Ребенок плохо прибавляет в весе, срыгивает, начинает часто болеть простудными заболеваниями. Возможно, вечером, а именно в семь часов, отмечается субфебрильная температура – 37,1-37,2.  При условии, что держат ртутный стеклянный (а не электронный) градусник именно 10 минут – это очень важно. Данные признаки могут говорить о болезнях органов пищеварения и в частности о состоянии дисбактериоз.
– Насколько состояние кишечной флоры влияет на иммунитет ребенка?
– При изменении кишечной микрофлоры ребенка в худшую сторону происходит снижение иммунитета. Когда у ребенка появляются частые простудные заболевания, это тоже говорит о том, что органы пищеварения не позволяют иметь 100%-ный иммунитет. Ведь у человека иммунитет на 98% зависит от состояния микрофлоры толстой кишки. И когда она нарушается, иммунитет падает, а, значит, появляются частые простуды.
– То есть, если у родителей часто болеет ребенок, они должны задуматься о посещении гастроэнтеролога?
– Как один из моментов. Мы знаем, что многие болезни: кожи, зубов, слизистых, вплоть до бронхиальной астмы, – это порой осложнение болезней органов пищеварения. Когда мне задают подобные вопросы, я сразу вспоминаю один случай: выходит конферансье на сцену и говорит: «У меня сегодня что-то болит голова». Его напарник отвечает: «Наверное, ты что-то не то съел». Зрители в зале смеются, но ведь он сказал все правильно. Головная боль может быть прямым следствием проблем желудочно-кишечного тракта.
– Как врач определяет наличие у ребенка состояния дисбактериоза?
– Существуют различные методы исследования микробной флоры у человека. Очень важно при оценке анализа кала на дисбактериоз учитывать возраст пациента, принципы его питания, период посева: как его собирали, и когда был сдан кал. И без учета данных факторов нельзя правильно оценить полученный результат. Потому что цифры в конечном итоге будут разные. Приведу простой пример: если пациент употребляет больше кисломолочных продуктов, то у него бактерий coli будет значительно меньше, но это не значит, что это болезнь. Если он ест больше мяса, у него бактерий coliбудет больше, а бифидум меньше и так далее. Поэтому сам анализ нужно интерпретировать с учетом этих всех моментов.
– Когда ребенок сдает анализ, все эти факторы обследуются досконально?
– Нет, конечно.
– Тогда получается нельзя с точностью определить у ребенка наличие дисбактериоза?
– Без учета данных факторов нельзя. Поэтому многие родители, когда обращаются к нам за помощью, часто удивляются, почему мы спрашиваем все тонкости и подробности питания, которые в принципе никто никогда не спрашивает. Поэтому мы положительно отличаемся и в плане лечения, и в плане диагностики, и в плане результата. И поэтому к нам  всегда огромная очередь.
– Какие методы лечения состояния дисбактериоза существуют и надо ли его вообще лечить?
– Лечить обязательно надо! Начинать лечение необходимо с основного заболевания, приведшего к этому состоянию или с той причины, которая привела к нему. Естественно, первично назначаются лекарственные препараты, которые воздействуют непосредственно на устранение основной причины. Предположим, у ребенка имеется гастрит, проводится его лечение и плюс назначаются препараты улучшающие микрофлору кишечника ребенка. Если ребенок находится в помещениях, где имеются различные домашние «приборы-излучатели» (телевизор, компьютер, микроволновая печь, радиотелефон, и другие, то, соответственно, их необходимо использовать, как можно реже. Если фактором, приводящим к болезни, являются лекарственные препараты (антибиотики и др.), то их по возможности надо заменить или исключить совсем. То есть, сначала необходимо убрать факторы, отрицательно влияющие на нормальную кишечную флору ребенка. И только после этого, появляется возможность ее восстанавливать.
– Врач сможет точно определить, отчего именно развился дисбактериоз?
– Чаще всего, мы видим причину.
– Существует ли профилактика  дисбактериоза?
– В  первую очередь необходимо следить за состоянием здоровья ребенка. Обязательно нужно придерживаться принципов здорового питания. В ежедневном рационе ребенка должна содержаться растительная клетчатка (овощи, фрукты, зерновые каши), которая способствует восстановлению кишечной микрофлоры. Естественно, набор должен быть полный: микроэлементы, витамины, ферменты. В рационе должна преобладать растительная пища, обязательно ребенку необходимо употреблять кисломолочные продукты и белки, в виде яиц, мяса, курицы, рыбы. Это будет способствовать восстановлению нормальной кишечной флоры.
  – Можно вести здоровый образ жизни, но ведь от стрессов и излучений  уберечься гораздо сложнее. Какой выход в этом случае?
– Единственный – избавиться от источника негатива. Если, допустим, у вас стресс на работе, то нужно заменить место работы.  И это абсолютно серьезно, ведь мы живем один раз. Быть в постоянном стрессе и лечиться от болезней – это не лучшее решение проблемы.  Это просто бессмысленно. Не зря считают японцы, что место работы надо менять один раз в пять лет. И на каждом предприятии у них имеется комната разгрузки, в которой стоят муляжи начальников.   Если начальник тебя обидел, заходишь в эту комнату и имеющейся там палкой лупишь по данному муляжу. Начальника, чей муляж разрушается быстрее остальных, увольняют с предприятия. Это и есть профилактика болезней у сотрудников и борьба за более высокую производительность на предприятии.
– Получается, что также не рационально жить в Челябинской области, где экология не самая лучшая?
– Безусловно, проживать у Средиземного моря или в горах Грузии гораздо полезнее,  чем в Челябинской области. Приведу простой пример: в 1991 году мы по линии «Зеленого креста» детей с гастроэнтерологической паталогией вывозили для оздоровления  в Карловы Вары. Я взял с собой  огромную коробку с лекарствами на случай обострения болезней, потому что каждый ребенок имел серьезное заболевание органов пищеварения. И прожив там 1,5 месяца, ни один из детей не пожаловался  на плохое самочувствие. Но как только мы пересекли Брест и сходили в ресторан в поезде, ровно в течение двух суток, которые мы ехали, были использованы все припасенные лекарства. У детей начались проблемы со здоровьем в связи с ухудшением качества питания, воды и воздуха.
– А какова роль наследственности в развитии болезней ЖКТ?
– Безусловно, большую роль в здоровье ребенка играет здоровье его родителей. Они передают ему предрасположенность к заболеваниям органов пищеварения. Если мама нездорова, то качество ее грудного молока будет низким, что является следующим фактором не в пользу ребенка.
– Во время грудного вскармливания мама должна соблюдать особый режим питания или  диету?
– Питание должно быть полноценным и разнообразным. При наличии заболеваний ЖКТ у матери с профилактической целью могут быть назначены лекарства, улучшающие ее состояние. На это мама сама должна обратить внимание врача-гинеколога, потому что ее состояние здоровья на момент рождения ребенка играет большую роль в формировании здоровья малыша. В частности, насколько полноценным будет состав его микрофлоры кишечника. Ведь заселение нормальных микробов в кишечник ребенка происходит в утробе матери, начиная 26-28 недели.
– Какие продукты детям не рекомендуется употреблять в пищу?
– Существует пять основных вредных продуктов – это газированные напитки, майонез, кетчуп, чипсы и жевательная резинка. Это все продукты генной инженерии. Например, длительное использование жевательной резинки приводит  к слабоумию (наличие в ней фенолов). Более того, она покрыта вредным вкусообразующим веществом. А частое ее использование ведет к нарушению пищевого рефлекса. И в следующий раз при глотании пищи желудок не будет готов к ее перевариванию.
– А какие продукты лучше не давать до трех лет?
–  Все продукты до трех лет должны быть натуральными, не консервированными! Использовать их можно в  сыром или вареном виде. Жареное и  копченое, маринованное, шоколадное, естественно, нельзя. Хотя в последнее время надо уже говорить и о вредных привычках у детей раннего возраста, когда малышам  матери начинают давать по чайной ложке водки на ночь, чтобы они лучше спали. А для аппетита детям стали давать пиво. Это встречается достаточно часто в последнее время. К нам поступают дети раннего возраста с циррозом печени, потому что мама, вскармливая ребенка грудью, употребляла алкогольные напитки и курила.
– Как вы относитесь к употреблению молока в питании детей?
– Учитывая тот факт, что идеально здоровых детей нет, употребление молока многим из них может быть не на пользу.  Молоко может способствовать излишнему росту микрофлоры, а порой, организм ребенка не способен его переварить (лактазная недостаточность). Поэтому мы, гастроэнтерологи, больше ратуем за употребление кисломолочных продуктов, сыров.
– Если ребенок вынужден принимать антибиотики, что нужно делать в профилактических целях, чтобы не развился дисбактериоз?
– Лучше всего прием антибиотиков сочетать с отваром трав, например, тысячелистника, подорожника, ромашки или душицы. Они на 80% снижают отрицательное воздействие антибиотиков на слизистую кишечника и его микрофлору.
– Как часто встречаются заболевания органов пищеварения?
– Заболевания желудочно-кишечного тракта у детей находятся на втором месте после респираторных инфекций. И это если учесть, что ребенок болеет ОРВИ 2-3 раза за год, а диагноз заболевания ЖКТ ставится однократно.
– Вы лечите детей только с области или из Челябинска тоже?
– ЧОДКБ обслуживает жителей Челябинской области вне зависимости от ее территорий, то есть сюда входит  и Челябинск. Но учитывая тот факт, что в Челябинске имеются в достаточном количестве гастроэнтерологические койки и специалисты,  диагностика тоже на высоком уровне,  мы стараемся  брать из Челябинска только самые тяжелые и сложные случаи. И последним этапом, если уже мы не можем оказать помощь, пациентами занимается институт педиатрии в Москве.
– Каким образом дети попадают к вам?
– Они приезжают по направлению врачей из территорий области на консультативный прием в детскую областную поликлинику к специалисту-гастроэнтерологу.  Осмотрев ребенка, и проведя необходимые исследования, врач решает необходимость его госпитализации или лечения в амбулаторных условиях. Вторым вариантом прибытия пациента в областную детскую поликлинику или на госпитализацию в отделение является осмотр врача-гастроэнтеролога  «выездной поликлиники». Это когда наши специалисты консультируют детей по месту их проживания.

Ольга Мельчакова, информационное агентство «Уралпресс»

Лечение дисбактериоза у детей в Одинцово

В период внутриутробного развития желудочно-кишечный тракт (ЖКТ) плода стерилен. Там нет никаких бактерий и других микроорганизмов. После рождения ЖКТ ребенка заселяется бактериями, которые находятся в окружающей среде. В грудном молоке содержится бифидус-фактор, вещество, которое способствует росту бифидобактерий. Неудивительно, что бифидобактерии составляют 95-99% флоры кишечника детей на грудном вскармливании. Бифидобактерии, которые иногда называют еще пробиотиками, являются частью здоровой флоры кишечника. Бифидобактерии преобладают в кишечнике у грудного ребенка до тех пор, пока грудное молоко составляет бо́льшую часть питания ребенка.

Что такое дисбактериоз?

Дисбактериоз или дисбиоз – нарушение качественного или количественного баланса микроорганизмов в организме, в данном случае, в кишечнике. За рубежом дисбиоз именуется синдромом «избыточного роста бактерий». Это значит, что изменилась пропорция бактерий в кишечнике или там появились необычные для нормальной флоры микроорганизмы. Дисбактериоз часто связывают с лечением антибиотиками и кишечными инфекциями.

Диагностирование дисбактериоза проводится по симптомам или же анализом кала на дисбактериоз. Обычно, показанием к анализу на дисбактериоз является непреходящий в течение двух или трех суток понос. Среди других симптомов, которые служат поводом для лабораторных исследований на дисбактериоз могут быть зеленоватый стул, стул со слизью, запор (редкий стул у грудных детей часто ошибочно принимают за запор), пенистый стул, частички непереваренной пищи.

Когда нужно обратиться к врачу?

Обратитесь к врачу, если у ребенка наблюдается склонность к запорам или, наоборот, жидкий стул, повышенное газообразование, колики, беспокойство, низкий набор веса.

Что нужно знать и помнить кормящей маме?

Способствует возникновению дисбиоза ранний перевод на искусственное вскармливание, поэтому кормление грудью является самой настоящей страховкой здоровья желудочно-кишечного тракта ребенка в течение первых лет жизни. Грудное молоко способствует росту бифидобактерий, которые препятствуют колонизации кишечника болезнетворными бактериями, а также содержит антитела и факторы, которые защищают ребенка от болезни, даже если патогенным бактериям удалось прижиться в кишечнике. Кормление грудью помогает восстановить баланс микрофлоры кишечника ребенка после лечения антибиотиками, а также укрепляет общий иммунитет, защищает от инфекций.

Дисбактериоз кишечника. Как лечить дисбактериоз

Организм человека – очень сложная и слаженная система, для нормальной работы которой важно поддержание внутреннего баланса. Но у организма есть и помощники – полезные бактерии, живущие в кишечнике. Они помогают переваривать пищу, получать питательные вещества, более того, они необходимы для работы иммунной системы и защищают организм от распространения вредных, патогенных бактерий. Однако иногда баланс микроорганизмов нарушается, что приводит к неприятным последствиям – развивается дисбактериоз.

Дисбактериоз кишечника – это нарушение состава нормальной микрофлоры кишечника. Количество полезных бактерий снижается, а патогенные микроорганизмы начинают усиленно размножаться. Это заболевание приводит к расстройству пищеварения, дефициту некоторых микроэлементов, снижению иммунитета и плохому самочувствию.

Дисбактериоз кишечника встречается очень часто: по некоторым данным ему подвержены до 90% всех взрослых людей. Еще чаще возникает дисбактериоз кишечника у детей – 95% грудных малышей страдают от этого заболевания. Причин дисбактериоза множество: плохая экология, хронический стресс, неправильное питание. Кроме того, дисбактериоз кишечника может быть вызван бесконтрольным применением антибиотиков и иммунодепрессантов. У детей он часто возникает в связи с переходом на искусственное вскармливание. В то время как грудное молоко богато полезными микроорганизмами и помогает заселить ими кишечник ребенка, искусственные смеси могут нарушить состав микрофлоры и привести к дисбактериозу.

Как лечить дисбактериоз?

Если по тем или иным причинам баланс нормальной кишечной микрофлоры был нарушен и развился дисбактериоз кишечника, лечение лучше начинать сразу, до перехода состояния в затяжную форму и развития более серьезных симптомов. Лечение дисбактериоза должно быть комплексным, поэтому как лечить дисбактериоз в каждом конкретном случае лучше всего расскажет лечащий врач. Дело в том, что дисбактериоз не является самостоятельным заболеванием и может быть симптомом различных болезней, чтобы избавиться от дисбактериоза, необходимо вылечить в первую очередь заболевание его вызвавшее.

Тем не менее, существуют общие рекомендации по лечению дисбактериоза кишечника. Для нормализации состава микрофлоры кишечника применяют, так называемые, бактериальные препараты, например, Линекс, Бификол, Энтерол и другие. Эти препараты содержат живые культуры, характерные для нормальной микрофлоры и помогут восстановить баланс. Кроме того, при дисбактериозе полезно употребление продуктов, содержащих лактобактерии и бифидобактерии. Для нормализации работы пищеварительной системы стоит исключить из рациона продукты, раздражающие слизистую кишечника, т.е. на время отказаться от острого, соленого и маринованного. Для того, чтобы предотвратить распространение патогенных микроорганизмов при дисбактериозе кишечника иногда применяют антибактериальные препараты. Однако выбор препарата и продолжительность курса должен оценивать врач. Применение антибиотиков без рекомендации врача может привести к усугублению дисбактериоза.

Ещё статьи:

Дисбактериоз кишечника новорожденных | Журнал перинатологии

1.

Домингес-Белло М.Г., Годой-Виторино Ф., Найт Р., Блазер М.Дж. Роль микробиома в развитии человека. Кишечник. 2019; 68: 1108–14.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

2.

Генсоллен Т., Айер С.С., Каспер Д.Л., Блумберг Р.С. Как колонизация микробиотой в раннем возрасте формирует иммунную систему. Наука. 2016; 352: 539–44.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

3.

Ayres JS. Совместное поведение микробной толерантности в мутуализме микробиоты хозяина. Клетка. 2016; 165: 1323–31.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

4.

Санчес К.К., Чен Г.Й., Шибер АМП, Редфорд С.Е., Шохирев М.Н., Леблан М. и др. Совместная метаболическая адаптация хозяина может способствовать бессимптомной инфекции и способствовать снижению вирулентности кишечного патогена. Клетка. 2018; 175: 146–58.e15.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

5.

Сорбара МТ, Памер Э.Г. Межбактериальные механизмы устойчивости к колонизации и стратегии, используемые патогенами для их преодоления. Mucosal Immunol. 2019; 12: 1–9.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

6.

Ко А., Бэкхед Ф. От ассоциации к причинно-следственной связи: роль микробиоты кишечника и ее функциональных продуктов в метаболизме хозяина. Mol Cell. 2020; 78: 584–96.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

7.

Gevers D, Kugathasan S, Denson LA, Vazquez-Baeza Y, Van Treuren W., Ren B, et al. Микробиом, ранее не получавший лечения, при впервые возникшей болезни Крона. Клетка. Хост-микроб. 2014; 15: 382–92.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

8.

Клингберг Э., Магнуссон М.К., Стрид Х., Демингер А., Шталь А., Сундин Дж. И др. Различный состав микробиоты кишечника у пациентов с анкилозирующим спондилитом связан с повышенным уровнем кальпротектина в кале.Arthritis Res Ther. 2019; 21: 248.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

9.

Фалони Дж., Джоосенс ​​М., Виейра-Силва С., Ван Дж., Дарзи Й., Фауст К. и др. Популяционный анализ изменчивости микробиома кишечника. Наука. 2016; 352: 560–4.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

10.

Яцуненко Т.Р., Манари М.Дж., Трехан И., Домингес-Белло М.Г., Контрерас М., Магрис М. и др.Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии. Природа 2012; 486: 222–7.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

11.

Биттингер К., Чжао С., Ли И, Форд Э, Фридман Э.С., Ни Дж. И др. Бактериальная колонизация перепрограммирует метаболом кишечника новорожденных. Nat Microbiol. 2020; 5: 838–47.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

12.

Vangay P, Ward T, Gerber JS, Knights D. Антибиотики, детский дисбактериоз и болезни. Клетка. Хост-микроб. 2015; 17: 553–64.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

13.

Deshmukh HS, Liu Y, Menkiti OR, Mei J, Dai N, O’Leary CE, et al. Микробиота регулирует гомеостаз нейтрофилов и устойчивость хозяина к сепсису Escherichia coli K1 у новорожденных мышей. Nat Med. 2014; 20: 524–30.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

14.

Грачи MG, Гарретт WS. Кишечник. микробиота, метаболиты и иммунитет хозяина. Nat Rev Immunol. 2016; 16: 341–52.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

15.

Ольшак Т., Ан Д., Цейссиг С., Вера М.П., ​​Рихтер Дж., Франке А. и др. Воздействие микробов в молодом возрасте оказывает стойкое влияние на функцию естественных Т-клеток-киллеров. Наука. 2012; 336: 489–93.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

16.

Cox LM, Yamanishi S, Sohn J, Alekseyenko AV, Leung JM, Cho I, et al. Изменение кишечной микробиоты во время критического периода развития имеет долгосрочные метаболические последствия. Клетка. 2014; 158: 705–21.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

17.

Кимура И., Миямото Дж., Оуэ-Китано Р., Ватанабе К., Ямада Т., Онуки М. и др. Микробиота кишечника матери во время беременности влияет на метаболический фенотип потомства мышей.Наука. 2020; 367: eaaw8429.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

18.

Гордон Х.А., Пести Л. Животное-гнотобиотическое животное как инструмент в изучении микробных взаимоотношений хозяина. Бактериол. Ред. 1971; 35: 390–429.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

19.

Лучинский П., Маквей Нойфельд К.А., Ориач К.С., Кларк Дж., Динан Т.Г., Крайан Дж. Ф.Выращивание в пузыре: использование стерильных животных для оценки влияния микробиоты кишечника на мозг и поведение. Int J Neuropsychopharmacol. 2016; 19: pyw020.

PubMed PubMed Central Google Scholar

20.

Уилкс М. Бактерии и раннее развитие человека. Early Hum Dev. 2007; 83: 165–70.

PubMed PubMed Central Google Scholar

21.

Гериг Дж. Л., Венкатеш С., Чанг Х. В., Хибберд М. С., Кунг В. Л., Ченг Дж. И др.Влияние продуктов, содержащих микробиоту, на животных-гнотобиотов и детей с недостаточным питанием. Наука. 2019; 365: eaau4732.

PubMed PubMed Central Google Scholar

22.

Turnbaugh PJ, Ley RE, Mahowald MA, Magrini V, Mardis ER, Gordon JI. Микробиом кишечника, связанный с ожирением, с повышенной способностью собирать энергию. Природа. 2006; 444: 1027–31.

PubMed PubMed Central Google Scholar

23.

Safari Z, Джерард П. Связь между микробиомом кишечника и неалкогольной жировой болезнью печени (НАЖБП). Клетка. Mol Life Sci. 2019; 76: 1541–58.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

24.

Цзян Ц., Ли Дж., Хуанг П., Лю З., Чжао Б. Микробиота кишечника и болезнь Альцгеймера. J. Alzheimers Dis. 2017; 58: 1–15.

PubMed PubMed Central Google Scholar

25.

Ли Ю.П., Чиу С.К., Лин Т.Дж., Хунг С.В., Хуанг В.С., Чиу С.К. и др. Моноколонизация мышей без микробов с помощью Bacteroides fragilis улучшает индуцированный азоксиметаном / декстрансульфатом натрия колоректальный рак, вызванный колитом. Immunopharmacol Immunotoxicol. 2019; 41: 207–13.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

26.

Tissier H. Recherches sur la flore кишечника дез nourrissons. C R Mem Soc Biol. 1899; 51: 943.

Google Scholar

27.

Logan WR. Кишечная флора младенцев и детей раннего возраста. J Pathol. 1913; 18: 527–51.

Google Scholar

28.

Гарридо Д., Бариле Д., Миллс Д.А. Молекулярная основа обогащения бифидобактериями желудочно-кишечного тракта младенцев. Adv Nutr. 2012; 3: 415С – 21С.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

29.

Ruiz-Moyano S, Totten SM, Garrido DA, Smilowitz JT, German JB, Lebrilla CB, et al.Изменения в потреблении олигосахаридов грудного молока младенческими кишечными штаммами Bifidobacterium breve. Appl Environ Microbiol. 2013; 79: 6040–9.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

30.

Живкович AM, German JB, Lebrilla CB, Mills DA. Гликобиом грудного молока и его влияние на микробиоту желудочно-кишечного тракта младенцев. Proc Natl Acad Sci USA. 2011; 108 (Приложение 1): 4653–8.

CAS Google Scholar

31.

Хенрик Б.М., Хаттон А.А., Палумбо М.С., Касабури Дж., Митчелл Р.Д., Андервуд М.А. и др. Повышенный pH кала указывает на глубокое изменение микробиома кишечника грудного ребенка из-за сокращения бифидобактерий за последнее столетие. мСфера. 2018; 3: e00041–18.

PubMed PubMed Central Google Scholar

32.

Litvak Y, Byndloss MX, Tsolis RM, Baumler AJ. Распространение дисбиотических протеобактерий: микробный признак дисфункции эпителия.Curr Opin Microbiol. 2017; 39: 1–6.

CAS Google Scholar

33.

Милани С., Дуранти С., Боттачини Ф., Кейси Е., Туррони Ф., Махони Дж. И др. Первые микробные колонизаторы кишечника человека: состав, деятельность и последствия для здоровья микробиоты кишечника младенца. Microbiol Mol Biol Rev.2017; 81: e00036-17.

PubMed PubMed Central Google Scholar

34.

La Rosa PS, Warner BB, Zhou Y, Weinstock GM, Sodergren E, Hall-Moore CM и др. Структурированное развитие бактериальных популяций в кишечнике недоношенных детей. Proc Natl Acad Sci USA. 2014; 111: 12522–7.

Google Scholar

35.

Korpela K, Blakstad EW, Moltu SJ, Strommen K, Nakstad B, Ronnestad AE, et al. Развитие кишечной микробиоты и гестационный возраст у недоношенных новорожденных. Научный доклад 2018; 8: 2453.

PubMed PubMed Central Google Scholar

36.

Ватанен Т., Плихта Д.Р., Сомани Дж., Мунк П.К., Артур Т.Д., Холл А.Б. и др. Геномная изменчивость и штамм-специфическая функциональная адаптация микробиома кишечника человека в раннем возрасте. Nat Microbiol. 2019; 4: 470–9.

CAS Google Scholar

37.

Raman AS, Gehrig JL, Venkatesh S, Chang HW, Hibberd MC, Subramanian S, et al. Единица разреженного коваринга, которая описывает развитие здоровой и нарушенной микробиоты кишечника человека. Наука. 2019; 365: eaau4735.

PubMed PubMed Central Google Scholar

38.

Younge NE, Newgard CB, Cotten CM, Goldberg RN, Muehlbauer MJ, Bain JR, et al. Нарушение созревания микробиоты и метаболома у крайне недоношенных детей с послеродовой задержкой роста. Научный доклад 2019; 9: 8167.

PubMed PubMed Central Google Scholar

39.

Лю Дж, Ли Й, Фэн Й, Пан Л, Се З, Ян З, и др.Структурированное прогрессирование кишечной микробиоты, связанное с некротическим энтероколитом и поздним сепсисом у недоношенных детей: проспективное исследование в отделении интенсивной терапии новорожденных в Китае. PeerJ. 2019; 7: e7310.

PubMed PubMed Central Google Scholar

40.

Галаццо Дж., Ван Бест Н., Бервоетс Л., Дапаа И.О., Савелкул PH, Хорнеф М.В. и др. Развитие микробиоты и ассоциации с режимом рождения, диетой и атопическими расстройствами в продольном анализе образцов стула, собранных с младенчества до раннего детства.Гастроэнтерология. 2020; 158: 1584–96.

CAS Google Scholar

41.

Madan JC, Hoen AG, Lundgren SN, Farzan SF, Cottingham KL, Morrison HG, et al. Связь кесарева сечения и добавления смеси с кишечным микробиомом 6-недельных младенцев. JAMA Pediatr. 2016; 170: 212–9.

PubMed PubMed Central Google Scholar

42.

Стюарт С.Дж., Аджами, штат Нью-Джерси, О’Брайен Д.Л., Хатчинсон Д.С., Смит Д.П., Вонг М.К. и др.Временное развитие микробиома кишечника в раннем детстве по данным исследования TEDDY. Природа. 2018; 562: 583–8.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

43.

Combellick JL, Shin H, Shin D, Cai Y, Hagan H, Lacher C, et al. Различия в фекальной микробиоте новорожденных, рожденных дома или в больнице. Научный доклад 2018; 8: 15660.

PubMed PubMed Central Google Scholar

44.

Savage JH, Lee-Sarwar KA, Sordillo JE, Lange NE, Zhou Y, O’Connor GT и др. Диета во время беременности и младенчества и микробиом кишечника младенца. J Pediatr. 2018; 203: 47–54.e4.

PubMed PubMed Central Google Scholar

45.

Лундгрен С.Н., Мадан Дж.К., Эмонд Дж.А., Моррисон Х.Г., Кристенсен Б.К., Карагас М.Р. и др. Диета матери во время беременности связана с микробиомом детского стула в зависимости от способа родов.Микробиом. 2018; 6: 109.

PubMed PubMed Central Google Scholar

46.

Williams JE, Carrothers JM, Lackey KA, Beatty NF, Brooker SL, Peterson HK, et al. Между молочным, оральным и фекальным микробиомами в диадах мать-младенец существуют сильные многомерные отношения в течение первых шести месяцев после родов. J Nutr. 2019; 149: 902–14.

PubMed PubMed Central Google Scholar

47.

Азад М.Б., Конья Т., Персо Р.Р., Гутман Д.С., Чари Р.С., Филд С.Дж. и др. Влияние антибиотиков во время родов, методов родов и грудного вскармливания на микробиоту кишечника в течение первого года жизни: проспективное когортное исследование. Int J Obstet Gynaecol. 2016; 123: 983–93.

CAS Google Scholar

48.

Coker MO, Hoen AG, Dade E, Lundgren S, Li Z, Wong AD, et al. Конкретный класс антибиотиков во время родов связан с созреванием микробиоты кишечника младенца: проспективное когортное исследование.Int J Obstet Gynaecol. 2020; 127: 217–27.

CAS Google Scholar

49.

Eck A, Rutten N, Singendonk MMJ, Rijkers GT, Savelkoul PHM, Meijssen CB, et al. Развитие микробиоты новорожденных и действие антибиотиков в раннем возрасте определяется двумя разными типами поселенцев. PloS ONE. 2020; 15: e0228133.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

50.

Гупта Р.В., Тран Л., Норори Дж., Феррис М.Дж., Эрен А.М., Тейлор С.М. и др. Блокаторы рецепторов гистамина-2 изменяют фекальную микробиоту у недоношенных детей. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2013; 56: 397–400.

CAS Google Scholar

51.

Леви Э.И., Хоанг Д.М., Ванденплас Й. Влияние ингибиторов протонной помпы на микробиом у маленьких детей. Acta Paediatr. 2020; 109: 1531–8.

CAS Google Scholar

52.

Vich Vila A, Collij V, Sanna S, Sinha T, Imhann F, Bourgonje AR, et al. Влияние часто используемых лекарств на состав и метаболическую функцию микробиоты кишечника. Nat Commun. 2020; 11: 362.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

53.

Джексон М.А., Верди С., Максан М.Э., Шин С.М., Зирер Дж., Бойер Р.Ц.и др. Связь микробиоты кишечника с распространенными заболеваниями и лекарствами, отпускаемыми по рецепту, в популяционной когорте.Nat Commun. 2018; 9: 2655.

PubMed PubMed Central Google Scholar

54.

Iszatt N, Janssen S, Lenters V, Dahl C, Stigum H, Knight R, et al. Экологические токсиканты в грудном молоке норвежских матерей, а также состав и метаболиты кишечных бактерий у их младенцев в возрасте 1 месяца. Микробиом 2019; 7: 34.

PubMed PubMed Central Google Scholar

55.

Лауэ Х.Э., Моройши Ю., Джексон Б.П., Палис Т.Дж., Мадан Дж.К., Карагас МР.Смеси питательных и токсичных элементов и микробиом кишечника в раннем постнатальном периоде в когорте продольных рождений в США. Environ Int. 2020; 138: 105613.

CAS Google Scholar

56.

Маклин С., Джун С., Козырский А. Влияние курения матери на микробиоту кишечника младенца и его связь с избыточным весом ребенка: обзорный обзор. Мир J Pediatr. 2019; 15: 341–9.

Google Scholar

57.

Tun HM, Konya T, Takaro TK, Brook JR, Chari R, Field CJ и др. Контакт с домашними пушистыми домашними животными влияет на микробиоту кишечника младенца в возрасте 3-4 месяцев после различных сценариев рождения. Микробиом. 2017; 5: 40.

PubMed PubMed Central Google Scholar

58.

D’Agata AL, Wu J, Welandawe MKV, Dutra SVO, Kane B, Groer MW. Влияние стресса ОИТН в раннем возрасте на развивающийся микробиом кишечника. Dev Psychobiol. 2019; 61: 650–60.

PubMed PubMed Central Google Scholar

59.

Ho TTB, Groer MW, Kane B., Yee AL, Torres BA, Gilbert JA, et al. Дихотомическое развитие микробиома кишечника у недоношенных детей. Микробиом. 2018; 6: 157.

PubMed PubMed Central Google Scholar

60.

Parra-Llorca A, Gormaz M, Alcantara C, Cernada M, Nunez-Ramiro A, Vento M и др. Микробиом кишечника недоношенных в зависимости от типа кормления: значение донорского грудного молока.Front Microbiol. 2018; 9: 1376.

PubMed PubMed Central Google Scholar

61.

Тафт Д.Х., Салинеро Л.К., Вонгбхавит К., Каланетра К.М., Масарве К., Ю А. и др. Бактериальная колонизация и гены устойчивости к противомикробным препаратам в трубках для энтерального питания новорожденных. FEMS Microbiol Ecol. 2019; 95: физ039.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

62.

Ногацка А., Салазар Н., Суарес М., Милани С., Арболея С., Солис Г. и др.Влияние антимикробной профилактики во время родов на микробиоту кишечника и распространенность генов устойчивости к антибиотикам у доношенных новорожденных, родившихся через естественные родовые пути. Микробиом. 2017; 5: 93.

PubMed PubMed Central Google Scholar

63.

Гаспаррини А.Дж., Крофтс Т.С., Гибсон М.К., Тарр П.И., Уорнер Б.Б., Дантас Г. Нарушение антибиотиками микробиома кишечника недоношенных детей и резистома. Кишечные микробы. 2016; 7: 443–9.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

64.

Гибсон М.К., Ван Б., Ахмади С., Бернхэм Калифорния, Тарр П.И., Уорнер Б.Б. и др. Динамика развития микробиоты кишечника недоношенных детей и резистома к антибиотикам. Nat Microbiol. 2016; 1: 16024.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

65.

Rutayisire E, Huang K, Liu Y, Tao F. Способ родов влияет на разнообразие и характер колонизации кишечной микробиоты в течение первого года жизни младенцев: систематический обзор.BMC Gastroenterol. 2016; 16:86.

PubMed PubMed Central Google Scholar

66.

Dahl C, Stigum H, Valeur J, Iszatt N, Lenters V, Peddada S, et al. У недоношенных новорожденных есть различные микробиомы, которые не зависят от способа родов, продолжительности грудного вскармливания или воздействия антибиотиков. Int J Epidemiol. 2018; 47: 1658–69.

PubMed PubMed Central Google Scholar

67.

Tun MH, Tun HM, Mahoney JJ, Konya TB, Guttman DS, Becker AB. и другие. Послеродовое воздействие бытовых дезинфицирующих средств, микробиоты кишечника младенцев и последующий риск избыточного веса у детей. Can Med Assoc J. 2018; 190: E1097 – e107.

Google Scholar

68.

Шоу К.А., Берта М., Хофмеклер Т., Чопра П., Ватанен Т., Шриватса А. и др. Дисбактериоз, воспаление и реакция на лечение: продольное исследование педиатрических субъектов с недавно диагностированным воспалительным заболеванием кишечника.Genome Med. 2016; 8: 75.

PubMed PubMed Central Google Scholar

69.

Xia GH, You C, Gao XX, Zeng XL, Zhu JJ, Xu KY, et al. Индекс дисбактериоза инсульта (SDI) в микробиоме кишечника связан с травмой головного мозга и прогнозом инсульта. Фронт Neurol. 2019; 10: 397.

PubMed PubMed Central Google Scholar

70.

Го Й, Чжан И, Герхард М., Гао Дж. Дж., Мехиас-Луке Р., Чжан Л. и др.Влияние Helicobacter pylori на микробиоту желудочно-кишечного тракта: популяционное исследование в Linqu, зоне высокого риска рака желудка. Кишечник. 2019. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2019-319696.

71.

Casen C, Vebo HC, Sekelja M, Hegge FT, Karlsson MK, Ciemniejewska E, et al. Отклонения в микробиоте кишечника человека: новый диагностический тест для определения дисбактериоза у пациентов с СРК или ВЗК. Пищевая Pharmacol Therap. 2015; 42: 71–83.

CAS Google Scholar

72.

Мандл Т., Марсал Дж., Олссон П., Олссон Б., Андреассон К. Тяжелый кишечный дисбактериоз распространен при первичном синдроме Шегрена и связан с системной активностью заболевания. Arthritis Res Ther. 2017; 19: 237.

PubMed PubMed Central Google Scholar

73.

Ватанен Т., Костич А.Д., д’Хеннезель Э., Сильяндер Х., Франзоса Э.А., Яссур М. и др. Вариабельность иммуногенности LPS микробиома способствует развитию аутоиммунитета у людей.Клетка. 2016; 165: 842–53.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

74.

Ватанен Т., Франзоза Э.А., Швагер Р., Трипати С., Артур Т.Д., Вехик К. и др. Микробиом кишечника человека при диабете типа 1 с ранним началом из исследования TEDDY. Природа. 2018; 562: 589–94.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

75.

Chua HH, Chou HC, Tung YL, Chiang BL, Liao CC, Liu HH, et al.Дисбактериоз кишечника с обилием ruminococcus gnavus ассоциируется с аллергическими заболеваниями у младенцев. Гастроэнтерология. 2018; 154: 154–67.

PubMed PubMed Central Google Scholar

76.

Lee MJ, Kang MJ, Lee SY, Lee E, Kim K, Won S, et al. Нарушения генов микробиома кишечника у младенцев с атопическим дерматитом в зависимости от типа вскармливания. J Allergy Clin Immunol. 2018; 141: 1310–9.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

77.

Ламонт Р.Ф., Моллер Люф Б., Стенер Йоргенсен Дж. Воспалительные заболевания и нарушение обмена веществ у детей после воздействия антибиотиков во время беременности, антенатально, во время родов и новорожденных. F1000Res. 2020; 9: 144.

Google Scholar

78.

Доухауэр Карпа К., Пол И.М., Леки Дж. А., Шунг С., Каркачи-Салли Н., Врана К. Е. и др. Обзор ретроспективной карты для выявления перинатальных факторов, связанных с пищевой аллергией. Нутр Дж. 2012; 11: 87.

PubMed PubMed Central Google Scholar

79.

Metz TD, McKinney J, Allshouse AA, Knierim SD, Carey JC, Heyborne KD. Воздействие стрептококковой антибиотикопрофилактики группы B и индекс массы тела в раннем детстве в когорте вагинальных родов. J Matern Fetal Neonatal Med. 2020; 33: 3318–3323.

PubMed PubMed Central Google Scholar

80.

Wohl DL, Curry WJ, Mauger D, Miller J, Tyrie K. Антибиотики во время родов и детский атопический дерматит. J Am Board Fam Med. 2015; 28: 82–9.

PubMed PubMed Central Google Scholar

81.

Памми М., Коуп Дж., Тарр П.И., Уорнер Б.Б., Морроу А.Л., Май В. и др. Дисбактериоз кишечника у недоношенных детей, предшествующий некротическому энтероколиту: систематический обзор и метаанализ. Микробиом. 2017; 5:31.

PubMed PubMed Central Google Scholar

82.

Olm MR, Bhattacharya N, Crits-Christoph A, Firek BA, Baker R, Song YS, et al.Некротическому энтероколиту предшествует усиленная репликация кишечных бактерий, клебсиелл и бактерий, кодирующих фимбрии. Sci Adv. 2019; 5: eaax5727.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

83.

Esmaeilizand R, Shah PS, Seshia M, Yee W., Yoon EW, Dow K. Воздействие антибиотиков и развитие некротического энтероколита у очень недоношенных новорожденных. Педиатр детского здоровья. 2018; 23: e56 – e61.

PubMed PubMed Central Google Scholar

84.

Esaiassen E, Fjalstad JW, Juvet LK, van den Anker JN, Klingenberg C. Воздействие антибиотиков у новорожденных и ранние неблагоприятные исходы: систематический обзор и метаанализ. J Antimicrob. Chemother. 2017; 72: 1858–70.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

85.

Guillet R, Stoll BJ, Cotten CM, Gantz M, McDonald S, Poole WK, et al. Связь терапии блокаторами h3 и более высокой частоты некротического энтероколита у младенцев с очень низкой массой тела при рождении.Педиатрия. 2006; 117: e137–42.

PubMed Google Scholar

86.

Hewitt KM, Mannino FL, Gonzalez A, Chase JH, Caporaso JG, Knight R, et al. Бактериальное разнообразие в двух отделениях интенсивной терапии новорожденных (ОИТН). PloS ONE. 2013; 8: e54703.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

87.

Бокулич Н.А., Миллс Д.А., Андервуд М.А. Поверхностные микробы в отделении интенсивной терапии новорожденных: изменения в процессе регулярной очистки и со временем.J Clin Microbiol. 2013; 51: 2617–24.

PubMed PubMed Central Google Scholar

88.

Брукс Б., Олм М.Р., Файрек Б.А., Бейкер Р., Геллер-МакГрат Д., Реймер С.Р. и др. Развитие кишечного микробиома недоношенных детей является основным фактором, формирующим микробиом отделений интенсивной терапии новорожденных. Микробиом. 2018; 6: 112.

PubMed PubMed Central Google Scholar

89.

Стюарт С.Дж., Эмблтон Н.Д., Маррс Э.Л., Смит Д.П., Фофанова Т., Нельсон А. и др. Продольное развитие кишечного микробиома и метаболома у недоношенных новорожденных с поздним началом сепсиса и у здоровых людей. Микробиом. 2017; 5: 75.

PubMed PubMed Central Google Scholar

90.

Сингер JR, Blosser EG, Zindl CL, Silberger DJ, Conlan S, Laufer VA и др. Предотвращение дисбактериоза кишечного микробиома новорожденных мышей защищает от позднего сепсиса.Nat Med. 2019; 25: 1772–82.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

91.

Masi AC, Stewart CJ. Роль кишечного микробиома недоношенных при сепсисе и некротизирующем энтероколите. Early Hum Dev. 2019; 138: 104854.

PubMed PubMed Central Google Scholar

92.

Хемми М.Х., Вольке Д., Шнайдер С. Связь между проблемами с плачем, сном и / или кормлением в младенчестве и долгосрочными поведенческими результатами в детстве: метаанализ.Arch Dis Child. 2011; 96: 622–9.

PubMed PubMed Central Google Scholar

93.

Loughman A, Quinn T, Nation ML, Reichelt A, Moore RJ, Van TTH, et al. Детская микробиота при коликах: предиктивные ассоциации с проблемным плачем и последующим поведением ребенка. J Dev Orig Health Dis. 2020: 1–11. https://doi.org/10.1017/S2040174420000227.

94.

Huttenhower C, Kostic AD, Xavier RJ. Воспалительное заболевание кишечника как модель трансляции микробиома.Иммунитет. 2014; 40: 843–54.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

95.

Mayer EA, Tillisch K, Gupta A. Ось кишечника / мозга и микробиота. J Clin исследования. 2015; 125: 926–38.

PubMed PubMed Central Google Scholar

96.

Honda K, Littman DR. Микробиота в адаптивном иммунном гомеостазе и болезнях. Природа. 2016; 535: 75–84.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

97.

Schroeder BO, Bäckhed F. Сигналы от микробиоты кишечника к отдаленным органам в физиологии и болезнях. Nat Med. 2016; 22: 1079–89.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

98.

Леви М., Колодзейчик А.А., Тайс К.А., Элинав Э. Дисбактериоз и иммунная система. Nat Rev Immunol. 2017; 17: 219–32.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

99.

Марувада П., Леоне В., Каплан Л. М., Чанг Е.Б. Микробиом человека и ожирение: выход за рамки ассоциаций. Клетка. Хост-микроб. 2017; 22: 589–99.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

100.

Бах Дж.Ф. Гипотеза гигиены при аутоиммунных заболеваниях: роль патогенов и комменсалов. Nat Rev Immunol. 2018; 18: 105–20.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

101.

Браун JM, Хазен SL. Микробная модуляция сердечно-сосудистых заболеваний. Nat Rev.2018; 16: 171–81.

CAS Google Scholar

102.

Tilg H, Zmora N, Adolph TE, Elinav E. Кишечная микробиота, питающая метаболическое воспаление. Nat Rev Immunol. 2020; 20: 40–54.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

103.

Iacob S, Iacob DG. Инфекционные угрозы, кишечный барьер и его троянский конь: дисбактериоз.Front Microbiol. 2019; 10: 1676.

PubMed PubMed Central Google Scholar

104.

Fouhse JM, Yang K, More-Bayona J, Gao Y, Goruk S, Plastow G, et al. Воздействие амоксициллина на новорожденных изменяет долгосрочный иммунный ответ, несмотря на временное воздействие на кишечную микробиоту у поросят. Фронт Иммунол. 2019; 10: 2059.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

105.

Бомонт М., Паес С., Муссар Э., Кнудсен С., Каукиль Л., Эймард П. и др. Метаболиты кишечной микробиоты способствуют созреванию кишечного барьера при переходе от сосания к отъему. Кишечные микробы. 2020; 11: 1268–86.

PubMed PubMed Central Google Scholar

106.

Suh SH, Choe K, Hong SP, Jeong SH, Mäkinen T., Kim KS, et al. Микробиота кишечника регулирует целостность молочных желез, индуцируя VEGF-C в макрофагах ворсинок кишечника.EMBO Rep.2019; 20: e46927.

PubMed PubMed Central Google Scholar

107.

Kulkarni DH, McDonald KG, Knoop KA, Gustafsson JK, Kozlowski KM, Hunstad DA, et al. Пассажи антигена, связанные с бокаловидными клетками, ингибируются во время инфекции Salmonella typhimurium, чтобы предотвратить распространение патогена и ограничить реакцию на пищевые антигены. Mucosal Immunol. 2018; 11: 1103–13.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

108.

Abo ​​H, Chassaing B, Harusato A, Quiros M, Brazil JC, Ngo VL, et al. Регулятор-1 дифференцировки эритроидов, индуцированный микробиотой в раннем возрасте, управляет пролиферацией и регенерацией стволовых клеток кишечника. Nat Commun. 2020; 11: 513.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

109.

Fung TC, Vuong HE, Luna CDG, Проновост Г.Н., Александрова А.А., Райли Н.Г. и др. Воздействие кишечного серотонина и флуоксетина модулирует бактериальную колонизацию кишечника.Nat Microbiol. 2019; 4: 2064–73.

PubMed PubMed Central Google Scholar

110.

Canfora EE, Meex RCR, Venema K, Blaak EE. Метаболиты кишечных микробов при ожирении, НАЖБП и СД2. Обзоры природы. Эндокринология. 2019; 15: 261–73.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

111.

Lau WL, Vaziri ND. Микробные короткоцепочечные жирные кислоты кишечника и риск диабета.Нат Рев Нефрол. 2019; 15: 389–90.

PubMed PubMed Central Google Scholar

112.

Санна С., ван Зуйдам Н.Р., Махаджан А., Курильщиков А., Вич Вила А., Воса У и др. Причинно-следственные связи между микробиомом кишечника, короткоцепочечными жирными кислотами и метаболическими заболеваниями. Нат Жене. 2019; 51: 600–5.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

113.

Де Ваддер Ф, Ковачева-Датчари П., Гонсалвес Д., Винера Дж., Зитоун С., Дюшампт А. и др.Метаболиты, вырабатываемые микробиотой, улучшают метаболизм через нервные цепи кишечника и мозга. Клетка. 2014; 156: 84–96.

PubMed PubMed Central Google Scholar

114.

Далиле Б., Ван Ауденхове Л., Вервлиет Б., Вербеке К. Роль короткоцепочечных жирных кислот в коммуникации между микробиотой, кишечником и мозгом. Нат Рев Гастроэнтерол Гепатол. 2019; 16: 461–78.

PubMed PubMed Central Google Scholar

115.

Parada Venegas D, De la Fuente MK, Landskron G, Gonzalez MJ, Quera R, Dijkstra G и др. Короткоцепочечные жирные кислоты (SCFAs), опосредуемые эпителиальной и иммунной регуляцией кишечника, и ее значение при воспалительных заболеваниях кишечника. Фронт Иммунол. 2019; 10: 277.

PubMed PubMed Central Google Scholar

116.

Frese SA, Hutton AA, Contreras LN, Shaw CA, Palumbo MC, Casaburi G, et al. Устойчивость добавок Bifidobacterium longum subsp.Infantis EVC001 у младенцев на грудном вскармливании. мСфера. 2017; 2: e00501–17.

PubMed PubMed Central Google Scholar

117.

Zheng N, Gao Y, Zhu W., Meng D, Walker WA. Короткоцепочечные жирные кислоты, образующиеся при взаимодействии кишечных комменсальных бактерий с сцеженным грудным молоком, обладают противовоспалительным действием в незрелых энтероцитах человека. PloS ONE. 2020; 15: e0229283.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

118.

Waligora-Dupriet AJ, Dugay A, Auzeil N, Nicolis I, Rabot S, Huerre MR, et al. Короткоцепочечные жирные кислоты и полиамины в патогенезе некротического энтероколита: аспекты кинетики у гнотобиотических перепелов. Анаэроб. 2009; 15: 138–44.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

119.

Рой С.К., Менг К., Садовиц Б.Д., Коллиш-Сингул М., Епури Н., Саталин Дж. И др. Энтеральное введение смеси, ферментированной бактериями, новорожденным поросятам: высокоточная модель некротического энтероколита (NEC).PloS ONE. 2018; 13: e0201172.

PubMed PubMed Central Google Scholar

120.

Meng D, Sommella E, Salviati E, Campiglia P, Ganguli K, Djebali K, et al. Индол-3-молочная кислота, метаболит триптофана, секретируемый Bifidobacterium longum подвид Infantis, оказывает противовоспалительное действие в незрелом кишечнике. Pediatr Res. 2020. https://doi.org/10.1038/s41390-019-0740-x.

121.

Mukhopadhyay S, Wade KC, Puopolo KM.Препараты для профилактики и лечения сепсиса у новорожденных. Clin Perinatol. 2019; 46: 327–47.

PubMed PubMed Central Google Scholar

122.

Кабальеро-Флорес Г., Сакамото К., Зенг М.И., Ван Й., Хаким Дж., Матус-Акуна В. и др. Иммунизация матери обеспечивает защиту потомства от прикрепляющегося и удаляющегося патогена за счет доставки IgG с грудным молоком. Клетка. Хост-микроб. 2019; 25: 313–23.e4.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

123.

Mukhopadhyay S, Sengupta S, Puopolo KM. Проблемы и возможности рационального использования антибиотиков среди недоношенных детей. Arch Dis Child. 2019; 104: F327 – f32.

Google Scholar

124.

Шульман Дж., Диманд Р. Дж., Ли ХК, Дуэнас Г. В., Беннетт М. В., Гулд Дж. Б.. Использование антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных. Педиатрия. 2015; 135: 826–33.

PubMed PubMed Central Google Scholar

125.

Шульман Дж., Профит Дж., Ли ХК, Дуэнас Дж., Беннетт М.В., Паруча Дж. И др. Варианты использования антибиотиков в неонатальном периоде. Педиатрия. 2018; 142: e20180115.

PubMed PubMed Central Google Scholar

126.

Chi C, Buys N, Li C, Sun J, Yin C. Влияние пребиотиков на сепсис, некротический энтероколит, смертность, непереносимость кормления, время до полного энтерального питания, продолжительность пребывания в больнице и частоту стула в недоношенные дети: метаанализ.Eur J Clin Nutr. 2019; 73: 657–70.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

127.

Sun J, Marwah G, Westgarth M, Buys N, Ellwood D, Gray PH. Влияние пробиотиков на некротический энтероколит, сепсис, внутрижелудочковое кровотечение, смертность, продолжительность пребывания в больнице и прибавку в весе у очень недоношенных детей: метаанализ. Adv Nutr. 2017; 8: 749–63.

PubMed PubMed Central Google Scholar

128.

Deshpande G, Jape G, Rao S, Patole S. Преимущества пробиотиков у недоношенных новорожденных в странах с низким и средним доходом: систематический обзор рандомизированных контролируемых испытаний. BMJ Open. 2017; 7: e017638.

PubMed PubMed Central Google Scholar

129.

Dermyshi E, Wang Y, Yan C, Hong W, Qiu G, Gong X и др. «Золотой век» пробиотиков: систематический обзор и метаанализ рандомизированных и наблюдательных исследований недоношенных детей.Неонатология. 2017; 112: 9–23.

CAS PubMed PubMed Central Google Scholar

130.

Olsen R, Greisen G, Schroder M, Brok J. Профилактические пробиотики для недоношенных детей: систематический обзор и метаанализ обсервационных исследований. Неонатология. 2016; 109: 105–12.

PubMed PubMed Central Google Scholar

131.

Куанг Л., Цзян Ю. Эффект пробиотических добавок у беременных женщин: метаанализ рандомизированных контролируемых исследований.Br J Nutr. 2020; 123: 870–80.

CAS Google Scholar

132.

Skonieczna-Zydecka K, Janda K, Kaczmarczyk M, Marlicz W., Loniewski I, Loniewska B. Влияние пробиотиков на симптомы, микробиоту кишечника и маркеры воспаления при детской колике: систематический обзор, метаанализ и мета-регрессия рандомизированных контролируемых исследований. J Clin Med. 2020; 9: 999.

CAS Google Scholar

133.

van den Akker CHP, van Goudoever JB, Shamir R, Domellof M, Embleton ND, Hojsak I, et al. Пробиотики и недоношенные дети: позиционный документ Европейского общества педиатрической гастроэнтерологии, гепатологии и комитета по питанию по вопросам питания и рабочей группы Европейского общества детской гастроэнтерологии, гепатологии и питания по пробиотикам и пребиотикам. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2020; 70: 664–80.

Google Scholar

134.

van den Akker CHP, van Goudoever JB, Szajewska H, ​​Embleton ND, Hojsak I., Reid D., et al. Пробиотики для недоношенных детей: систематический обзор штаммов и сетевой метаанализ. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2018; 67: 103–22.

Google Scholar

135.

Su GL, Ko CW, Bercik P, Falck-Ytter Y, Sultan S, Weizman AV, et al. Руководство AGA по клинической практике о роли пробиотиков в лечении желудочно-кишечных расстройств.Гастроэнтерология. 2020. https://doi.org/10.1053/j.gastro.2020.05.059.

136.

Льюис З.Т., Шани Г., Масарве К.Ф., Попович М., Фрезе С.А., Села Д.А. и др. Подтверждение идентичности видов и подвидов бифидобактерий в коммерческих пробиотических продуктах. Pediatr Res. 2016; 79: 445–52.

CAS Google Scholar

137.

Chiang MC, Chen CL, Feng Y, Chen CC, Lien R, Chiu CH. Lactobacillus rhamnosus сепсис, связанный с терапией пробиотиками у крайне недоношенных новорожденных: патогенез и обзор для клиницистов.J Microbiol Immunol Infect. 2020. https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.03.029

138.

Pell LG, Loutet MG, Roth DE, Sherman PM. Аргументы против рутинного приема пробиотиков для профилактики НЭК. Curr Opin Pediatrics. 2019; 31: 195–201.

Google Scholar

Архив клинической микробиологии | инсайт медицинское издательство

Импакт-фактор журнала: 0,72 *; 1,37 * (5-летний импакт-фактор)
Индекс Copernicus Значение: 88.97
Индекс H: 3
Глобальный импакт-фактор: 0,564
Влияние журнала Research Gate: 0,16

Archives of Clinical Microbiology (ISSN: 1989-8436) – это рецензируемый международный журнал, в редакционной коллегии которого участвуют всемирно признанные ученые. С быстрой публикацией статей во всех областях микробиологии и инфекционных болезней. Архив клинической микробиологии существует уже восьмой год, и он был включен в каталог Национальной медицинской библиотеки (NLM) (первый шаг, который будет проиндексирован в PubMed).Кроме того, он проиндексирован в Index Copernicus (ICV: 88.97), DeepDyve, Open J Gate, JournalSeek, EBSCO A-Z.

https://www.imedpub.com/submissions/archives-clinical-microbiology.html или отправьте в виде вложения по электронной почте в редакцию по адресу [электронная почта защищена]

Патогенные бактерии

Патогенные бактерии – это бактерии, способные вызывать заболевание при попадании в организм и распространяться через воду, воздух, почву, а также при физическом контакте. В основном бактерии безвредны и полезны, но некоторые из них являются патогенными.

Связанные журналы патогенных бактерий

Журнал гепатита, Журнал иммунологических методов лечения инфекционных заболеваний, Журнал инфекционных заболеваний и терапии, Журнал инфекционных заболеваний и лечения, Журнал патологии и трансляционной медицины, Журнал патологии. Клинические исследования, отчеты о клинических случаях в клинической патологии, журнал Джейкобса по микробиологии и патологии, текущие отчеты по патобиологии, Международный журнал судебной медицины и патологии, Открытие патологии.

Вирусные болезни

Вирусные болезни – это инфекции, вызываемые вирусом или микроорганизмами. вирус, поражающий клетку, или формирование вирусной капсулы на поверхности клетки, которая может начать размножаться сама по себе и начинает распространяться, что приводит к вирусному заболеванию.

Связанные журналы вирусных заболеваний

Журнал вирусологии и противовирусных исследований, Достижения в области антибиотиков и антител, Журнал СПИДа и клинических исследований,
Журнал аллергии и терапии, Прикладная микробиология: открытый доступ, вирусное заболевание, Журнал болезней, передаваемых членистоногими, Всемирный журнал вирусологии, Текущее мнение в области вирусологии, Темы противовирусной медицины, Исследования и лечение гриппа, Достижения в вирусологии, Вирусология пищевых продуктов и окружающей среды, Исследования вирусов, Достижения в исследованиях вирусов, Адаптация и лечение вирусов.

Микобактериальные болезни

Микобактериальное заболевание – это инфекция одного типа, вызываемая скоплением микробов. Эти микобактериальные заболевания включают туберкулез, проказу, микобактерии язвы и Mycobacterium Para tuberculosis. Обычно их лечат такими лекарствами, как рифампицин, этамбутол и изониазид. Mycobacterium leprae лечится дапсоном.

Связанные журналы микобактериальных заболеваний

Журнал инфекционных заболеваний и лечения, Медицинская микология: открытый доступ, Журнал патологии и эпидемиологии, Исследования первичного и приобретенного иммунодефицита, Журнал вирусологии и противовирусных исследований, Текущие отчеты о грибковых инфекциях, Журнал инвазивных грибковых инфекций, Отчеты о случаях медицинской микологии, Медицинские журнал микологии, Микология, Микозы, Микопатология, Микробиология будущего, Клеточный хозяин и микроб, Журнал Общества педиатрических инфекционных болезней.

Бактериальная инфекция

Бактериальные инфекции – это инфекции, вызываемые бактериями. Инфекционная бактерия быстро размножается и выделяет токсичные химические вещества, которые повреждают ткани. Общие бактериальные инфекции включают пневмонию, ушные инфекции, диарею, инфекции мочевыводящих путей и кожные заболевания

Связанные журналы бактериальной инфекции

Журнал гепатита, Журнал иммунологических методов при инфекционных заболеваниях, Журнал инфекционных заболеваний и терапии, Журнал инфекционных заболеваний и лечения, Патогены и болезни, Текущие отчеты по клинической микробиологии, Международный журнал исследований микробиологии и иммунологии, Журнал прикладной микробиологии и микробиологии окружающей среды , Журнал глобальной устойчивости к противомикробным препаратам, Спектр микробиологии, микробиология JSM, микробиология OA, микробиология и инфекционные заболевания SOJ, Универсальный журнал исследований микробиологии.

Вирусная инфекция

Вирусные инфекции – это небольшой инфекционный организм, который меньше грибка или бактерии. Вирус прикрепляется к поверхности клетки и высвобождает свою вирусную ДНК или РНК внутри клеток, которые затем реплицируются сами по себе внутри клетки, чтобы сделать клетку более заразной и распространяться от одной клетки к другой, что приводит к вирусной инфекции.

Связанные журналы вирусной инфекции

Журнал ВИЧ и ретро-вирусов, Журнал инфекционных заболеваний и диагностики, Журнал медицинской микробиологии и диагностики, Микобактериальные заболевания, Детские инфекционные заболевания: открытый доступ, вирусология и микология, вирусные заболевания, Журнал болезней, передаваемых членистоногими, Всемирный вирусологический журнал, Текущее мнение в вирусологии, Темы противовирусной медицины, Исследования и лечение гриппа, Достижения в вирусологии, Пищевая вирусология и вирусология окружающей среды, Исследования вирусов, Достижения в исследованиях вирусов, Адаптация и лечение вирусов.

Грибковая инфекция

Грибковые инфекции – это инфекция, которая обычно начинается в легких или на коже, прогрессирует медленно и редко бывает серьезной, если иммунная система не работает на выходных. Когда иммунная система выходит на выходные, она может быть очень агрессивной и быстро распространяться, что приводит к смерти.

Связанные журналы грибковой инфекции

Медицинская микология: открытый доступ, журнал патологии и эпидемиологии, исследования первичных и приобретенных иммунодефицитов, журнал вирусологических и противовирусных исследований, достижения в области антибиотиков и антител, отчеты о текущих грибковых инфекциях, журнал инвазивных грибковых инфекций, отчеты о случаях медицинской микологии, медицинская микология журнал, Микология, Микозы, Микопатология, Микробиология будущего, Клеточный хозяин и микроб, Журнал Общества педиатрических инфекционных болезней.

Медицинская микробиология

Медицинская микробиология начинается с обзора иммунной системы, с помощью которой микроорганизмы или токсины проникают силой, чтобы победить клетки и встретиться с ними. Это исследование микроорганизмов или микробов, которые влияют на все аспекты нашей жизни, а также включают реакцию хозяина на микроорганизмы.

Родственные журналы медицинской микробиологии

Клиническая микробиология: Открытый доступ, Журнал новых инфекционных заболеваний, Журнал судебной патологии, Журнал ВИЧ и ретро-вирусов, Журнал инфекционных заболеваний и диагностики, Открытый журнал медицинской микробиологии, Журнал медицинской микробиологии, Международный журнал медицинской микробиологии, Медицина Микробиология и иммунология, Индийский журнал медицинской микробиологии, Канадский журнал инфекционных заболеваний и медицинской микробиологии, Обзоры по медицинской микробиологии, Международный журнал медицинской микробиологии, Приложение, Письма по медицинской микробиологии.

Вирус гепатита

Гепатит – это заболевание печени, при котором печень набухает и воспаляется из-за вирусной инфекции, которая приводит к гепатиту. Состояние может проходить самостоятельно или прогрессировать до фиброза, цирроза или рака печени. Вирусная инфекция гепатита бывает пяти типов: гепатит A, B, C, D и E, а также может возникать в результате употребления алкоголя.

Связанные журналы вируса гепатита

Журнал гепатита, Журнал иммунологических методов при инфекционных заболеваниях, Журнал инфекционных заболеваний и терапии, Журнал инфекционных заболеваний и лечения, Медицинская микология: открытый доступ, Текущие отчеты гепатологии, Исследование и лечение гепатита, Вирусный гепатит на практике, Ежемесячный гепатит, Текущие отчеты о гепатите, Еженедельный гепатит, Журнал вирусного гепатита, Обзоры вирусного гепатита, Ежегодник гепатита B, Горячие темы в вирусном гепатите

Microbial Genomics

Микробная геномика – это исследование микроорганизмов, генетический материал которых содержит микробы.Анализ всего микробного генома дает представление о микробной оценке и разнообразии микробов, помимо филогении отдельных белков или генов.

Связанные журналы микробной геномики

Микробная и сравнительная геномика, Наука и технологии генома, Новые микробы и инфекции, Микробная информатика и эксперименты, Микробная биотехнология, Фабрики микробных клеток, Микробные выбросы: вирусы, бактерии, грибы, Микробная экология в здоровье и болезнях.

Золотистый стафилококк

Золотистый стафилококк – это бактерия, вызывающая заболевания человека. Чаще всего абсцессы или целлюлит – это инфекции, вызванные золотистым стафилококком. Это происходит, когда кожа порезается или царапается, что позволяет бактериям проникнуть внутрь, а затем инфицировать. Это будет происходить в основном в ногах и руках.

Журналы, относящиеся к Staphylococcus aureus

Журнал инфекционных заболеваний и лечения, Медицинская микология: открытый доступ, Журнал патологии и эпидемиологии, Исследования первичного и приобретенного иммунодефицита, Журнал вирусологии и противовирусных исследований, Патогены и болезни, Текущие отчеты клинической микробиологии, Международный журнал исследований микробиологии и иммунологии, Журнал прикладной микробиологии и микробиологии окружающей среды, Журнал глобальной устойчивости к противомикробным препаратам, Спектр микробиологии, микробиология JSM, микробиология OA, микробиология и инфекционные заболевания SOJ, Универсальный журнал микробиологических исследований.

Вирус иммунодефицита человека

Вирус иммунодефицита человека – это вирус, который атакует иммунную систему, заражая лейкоциты. Лейкоциты – важная часть иммунной системы, которая будет разрушена определенным вирусом, называемым ВИЧ, что приводит к нехватке лейкоцитов, что снижает иммунную силу.

Связанные журналы вируса иммунодефицита человека

Журнал ВИЧ и ретро-вирусов, Журнал инфекционных заболеваний и диагностики, Журнал медицинской микробиологии и диагностики, Микобактериальные заболевания, Детские инфекционные заболевания: открытый доступ, вирусология и микология, The lancet HIV, Журнал клинических исследований в области ВИЧ, СПИДа и профилактики, Исследования и лечение СПИДа, ВИЧ / СПИД (Окленд, Н.Z.), Журнал исследований СПИДа и ВИЧ (онлайн), Журнал эпиднадзора за ВИЧ и эпидемиологией СПИДа, Будущее лечение ВИЧ, Журнал профилактики ВИЧ / СПИДа у детей и молодежи, Исследования СПИДа и ретровирусы человека, Обзор ВИЧ и СПИДа.

Холера

Холера – инфекционное заболевание, вызывающее диарею. Vibrio cholera – это бактерия, вызывающая холеру, которая может быть обнаружена в загрязненной воде или пище и приводит к обезвоживанию из-за потери жидкости организма во время диареи.

Связанные журналы холеры

Достижения в области антибиотиков и антител, Журнал СПИДа и клинических исследований, Журнал аллергии и терапии, Прикладная микробиология: открытый доступ, Архивы воспаления, Текущие отчеты об инфекционных заболеваниях, Медицина путешествий и инфекционные заболевания, Канадский журнал инфекционных заболеваний и медицинской микробиологии, Текущие клинические темы инфекционных заболеваний, Скандинавский журнал инфекционных заболеваний, Инфекционные добавки в клинической практике, Kansenshogaku zasshi.Журнал Японской ассоциации инфекционных заболеваний, Достижения в области детских инфекционных заболеваний, Междисциплинарные перспективы инфекционных заболеваний, Журнал глобальных инфекционных заболеваний, Американский журнал инфекционных заболеваний.

Болезнь, вызванная вирусом Эбола

Вирус Эбола – это вирус, вызывающий острое и серьезное заболевание, которое при отсутствии лечения часто заканчивается летальным исходом. Его иначе называют геморрагической лихорадкой Эбола, которая является смертельным вирусом, вызывающим внутреннее и внешнее кровотечение в организме.

Связанные журналы болезни, вызванной вирусом Эбола

Архив клинической микробиологии, Журнал вирусологии и противовирусных исследований, Достижения в области антибиотиков и антител, Журнал СПИДа и клинических исследований, Журнал аллергии и терапии, Прикладная микробиология: открытый доступ, Вирусные заболевания, Журнал болезней, передаваемых членистоногими, Всемирный журнал вирусология, Современные мнения в вирусологии, Темы противовирусной медицины, Исследования и лечение гриппа, Достижения в вирусологии, Пищевая и экологическая вирусология, Исследования вирусов, Достижения в исследованиях вирусов, Адаптация и лечение вирусов.

Ротавирусная инфекция

Инфекция, вызванная вирусом рота, является наиболее частой причиной тяжелой диареи, вызывающей обезвоживание. Она может распространяться через заражение рук, воды, пищи или любых предметов. Вирус попадает внутрь через пищевые продукты и распространяется через слизистые оболочки, что в конечном итоге приводит к диарее из-за инфекции.

Связанные журналы ротавирусной инфекции

Журнал вирусологии и противовирусных исследований, Достижения в области антибиотиков и антител, Журнал СПИДа и клинических исследований,
Журнал аллергии и терапии, Прикладная микробиология: открытый доступ, Архив воспаления, вирусных заболеваний, Журнал болезней, передаваемых членистоногими, Всемирный журнал вирусология, Современные мнения в вирусологии, Темы противовирусной медицины, Исследования и лечение гриппа, Достижения в вирусологии, Пищевая и экологическая вирусология, Исследования вирусов, Достижения в исследованиях вирусов, Адаптация и лечение вирусов.

Границы | Сравнение кишечного микробиома у умеренно-поздних недоношенных детей, получаемых матерями на грудном молоке и на искусственном вскармливании

Введение

Все чаще обнаруживается, что микробиом кишечника влияет на здоровье человека. Хотя индивидуальные различия существуют, основной микробиом, включающий Firmicutes и Bacteroidetes , считается решающим для поддержания здоровья взрослых (Eckburg et al., 2005; Turnbaugh and Gordon., 2009; Tap et al., 2009; Qin et al. ., 2010). По сравнению с кишечным микробиомом взрослых, младенцы, особенно недоношенные новорожденные, имеют относительно динамичный и нестабильный микробиом. Множественные факторы, включая генетические факторы (Stewart et al., 2005) и переменные окружающей среды, такие как источник питания, использование антибиотиков и способ доставки, могут потенциально повлиять на состав и богатство микробиома младенцев (Palmer et al., 2007; D’Argenio and Сальваторе, 2015; Лим и др., 2016). Временные изменения состава кишечного микробиома могут влиять на новорожденного иначе, чем на взрослого, поскольку кишечник новорожденного еще не полностью развит (Voreades et al., 2014; Гриц и Бхандари, 2015). В младенчестве, особенно у недоношенных новорожденных, основным источником энтерального питания является грудное молоко и / или смесь. Смесь – предпочтительная альтернатива, когда матери не могут производить достаточно грудного молока, что является общей проблемой для матерей недоношенных детей (Radtke, 2011). Смесь считается сбалансированным источником питательных веществ и может способствовать более быстрому росту недоношенных детей, чем только грудное молоко (Gross, 1983; Quigley and McGuire, 2014). Однако в последние годы наше понимание сложного состава грудного молока и диады мать-ребенок привело к усилению внимания к преимуществам грудного вскармливания (Hanson et al., 1978; Петерсон и др., 1998; Хамош, 2001; Oddy, 2002; Уолд и Адлерберт, 2002). Исследования демонстрируют роль грудного молока в укреплении здоровья младенцев, включая снижение риска некротического энтероколита (NEC) (Lucas and Cole, 1990; Boyd et al., 2007; Abrams et al., 2014; Quigley and McGuire, 2014). ), диабет I типа (Виртанен и др., 1992) и болезнь Крона (Бергстранд и Хеллерс, 1983) и способствующие развитию нервной системы (Лукас и др., 1992), а также снижение уровня ожирения в детстве (Армстронг и др., 2002).

Механизмы, с помощью которых грудное молоко способствует здоровью человека, до сих пор неясны. Исследования показывают, что как недоношенные дети с крайне низкой массой тела при рождении, так и очень недоношенные дети, вскармливаемые грудным молоком, демонстрируют повышенное альфа-разнообразие кишечных микробов по сравнению с аналогами, находящимися на искусственном вскармливании в течение 20–30 дней (Gewolb et al., 1999; Cong et al., 2016). ). Бифидобактерии , которые являются пробиотиками в кишечнике человека (Collins and Gibson, 1999; O’Callaghan and van Sinderen, 2016), могут колонизировать кишечник доношенных новорожденных, вскармливаемых грудным молоком, легче, чем кишечник младенцев, вскармливаемых смесью. (Bullen et al., 1976; Старк и Ли, 1982; Mevissen-Verhage et al., 1987; Балмер и Уортон, 1989; Хармсен и др., 2000; Безирцоглу и др., 2011; Ли и др., 2015). В частности, Bifidobacterium longum было больше в кишечнике доношенных детей, вскармливаемых грудным молоком, чем у детей, вскармливаемых смесью без пробиотических добавок (Lee et al., 2015), и Bifidobacterium spp. снизилась после перехода с грудного молока на молочную смесь (Davis et al., 2016). Другой род, Lactobacillus (Collins and Gibson, 1999), составляет около 3% популяции микробиома грудного молока (Urbaniak et al., 2016), было больше у доношенных детей, вскармливаемых грудным молоком, чем в образцах кала детей, вскармливаемых смесью (Madan et al., 2016), а также снизилось после изменения источника питания с грудного молока на смесь (Davis et al. др., 2016). Напротив, потенциально патогенные роды, такие как Clostridia , Klebsiella , Veillonella и Bacteroides , лучше колонизируются в кишечнике доношенных детей, вскармливаемых смесью, чем у детей, вскармливаемых грудным молоком (Benno et al. al., 1984; Mackie et al., 1999; Boyd et al., 2007; Адлерберт и Уолд, 2009; Безирцоглу и др., 2011; Ли и др., 2015). Разница, отмеченная между двумя группами, привела к интересу к манипулированию микробиомом младенца с помощью пробиотиков.

В последнее время особое внимание уделяется анализу микробиома для прогнозирования микробной функции в кишечнике. Метаболиты пробиотиков могут способствовать противовоспалительной функции, производя короткоцепочечные жирные кислоты (Fu et al., 2017; Xiong et al., 2017).Прогностический анализ функциональных путей микробиома, основанный на секвенировании ампликона гена 16S рРНК, показал, что младенцы, вскармливаемые исключительно грудным молоком, имели более высокий относительный уровень транспорта через микробную мембрану и более низкий энергетический метаболизм, чем младенцы, находящиеся на искусственном вскармливании (Thompson et al., 2015). Тем не менее, результаты метаанализа показали, что у младенцев, вскармливаемых не только грудным молоком, относительно больше микробных функций углеводного обмена, но снижен липидный обмен, метаболизм витаминов и детоксикация, чем у младенцев, вскармливаемых исключительно грудным молоком (Ho et al., 2018). Метатранскриптомика обеспечивает более четкую картину функциональности микробиома, чем функции, предсказанные на основе секвенирования ампликона гена 16S рРНК (Lavelle and Sokol, 2018). С помощью метатранскриптомного анализа функциональная микробиота кишечника человека может быть непосредственно описана без функциональных выводов на основе филогении (Booijink et al., 2010; Gosalbes et al., 2011; Franzosa et al., 2014; Hugenholtz et al., 2017).

Во многих предыдущих исследованиях изучали микробиом в первый месяц или первый год доношенных детей (Balmer and Wharton, 1989; Stark and Lee, 1982; Penders et al., 2006; Ли и др., 2014; Лим и др., 2015, 2016; McCann et al., 2018; Pannaraj et al., 2018). Тем не менее, 10% населения США в 2018 году родились недоношенными, при этом большинство недоношенных детей родились недоношенными в средней или поздней степени (Hamilton et al., 2019). Однако, насколько нам известно, только несколько исследований были посвящены этой группе (Forsgren et al., 2017; Chernikova et al., 2018; Zwittink et al., 2018). В частности, исследование здорового населения этой группы заложит основу для изучения заболеваний, связанных с дисбактериозом недоношенных детей, с использованием двойного когортного подхода, чтобы лучше выявить эффекты питания (Furse et al., 2018). Таким образом, цель настоящей работы состояла в том, чтобы сравнить состав и функцию микробиома кишечника в зависимости от источника питания, то есть собственного грудного молока матери (МВМ) и смеси, у умеренно-поздних недоношенных новорожденных. Подход, который мы использовали в этом исследовании, включает высокопроизводительное секвенирование ампликона гена 16S рРНК и сравнительную метатранскриптомику. Мы стремились определить потенциально пробиотические таксоны в группе MBM и выявить функциональные различия в микробиоме кишечника недоношенных новорожденных на умеренных и поздних сроках между двумя источниками питания.

Материалы и методы

Сбор проб

Sanford Health IRB, ID STUDY00000829IRA, одобрил все эксперименты с участием людей в этом исследовании. В исследование были включены двадцать здоровых младенцев без врожденных аномалий, родившихся умеренно-поздно недоношенными (срок беременности от 32 0/7 до 36 6/7 недель). Образцы кала собирали после того, как младенцы достигли полного энтерального кормления. После согласия родителей всем зарегистрированным младенцам был присвоен идентификационный номер.Описания и краткое изложение младенцев показаны в Таблице 1 и Дополнительной Таблице S1. Десять из двадцати младенцев были MBM (гестационный возраст: 33,7 ± 1,26 недели), а десять находились на искусственном вскармливании (гестационный возраст: 34 ± 1,5 недели). Все младенцы, включенные в группу исследования грудного молока, получали молоко собственной матери. Ни один из младенцев, включенных в группу MBM, не получал кормления смесью до сбора образцов; тем не менее, эти младенцы получали грудное молоко, обогащенное обогатителем грудного молока или детской смесью Neosure в соответствии со стандартной практикой.Младенцы, включенные в группу на искусственном вскармливании, не получали грудного молока до сбора образцов. Все матери младенцев, включенных в исследование, получали антибиотики перед родами либо в связи с опасениями по поводу инфекции, либо в качестве профилактики перед кесаревым сечением. Одиннадцать из двадцати младенцев получали антибиотики ампициллин / гентамицин во время наблюдения и оценки неонатального сепсиса. Ни у одного из этих младенцев не было положительного посева крови. Шесть из двадцати младенцев родились естественным путем, а четырнадцать родились посредством кесарева сечения (кесарево сечение).Шесть завербованных младенцев были коренными американцами, и четырнадцать младенцев были кавказскими, среди них было пять пар близнецов: младенцы № 7 и № 8; № 9 и № 10; № 18 и № 19; № 21 и № 22; и №23 и №24. Для каждого младенца образцы стула собирали в двух временных точках с интервалом минимум 24 часа. Первые образцы собирались в среднем через 15 дней после рождения, а второй сбор образцов проводился в среднем через 17 дней после рождения. Каждый собранный образец хранился в пробирках для защиты ДНК / РНК (Zymo Research), которые содержат защиту для ДНК / РНК для уменьшения деградации нуклеиновых кислот.Все образцы хранили при 4 ° C.

Таблица 1. Демографические и клинические данные младенцев, включенных в исследование.

Статистический анализ

Программное обеспечение

GraphPad Prism использовалось для выполнения непарных t -тестов с неравной дисперсией (Welch) для проверки статистической значимости гестационного возраста, веса при рождении и времени сбора первой и второй выборки между двумя группами включенных младенцев.

Экстракция ДНК / РНК

Суммарную ДНК и РНК одновременно экстрагировали из образцов фекалий, хранящихся в пробирках для ДНК / РНК Shield, поставляемых в комплекте ДНК / РНК Microbiome Mini Kit (ZRC188678, ZymoBIOMICS ^TM ) в соответствии с инструкциями производителя.Концентрации экстрагированной ДНК / РНК определяли количественно с помощью флуорометра Qubit 3.0 (Invitrogen ^TM ) и спектрофотометра NanoDrop ^TM (Thermo Scientific ^TM ).

Секвенирование ампликона гена 16S рРНК и биоинформатический анализ

Секвенирование ампликона гена 16S рРНК сегментов V3 – V4 было выполнено, как описано ранее, с использованием MiSeq Next Generation Sequencer в Центре геномики Университета Миннесоты (Gohl et al., 2016).

В среднем было получено 44 558 считываний парных концов на образец и загружено в Архив считывания последовательностей (SRA) Национального центра биотехнологической информации (NCBI) под регистрационным номером PRJNA515307.Последовательности фильтровали по Phred 33 и демультиплексировали с помощью Quantitative Insights Into Microbial Ecology 2 (QIIME2) (Bolyen et al., 2018). Варианты последовательности ампликона (ASV) были получены после учебника QIIME2 по базе данных NCBI nt, а таксономический анализ был выполнен с использованием GreenGenes (версия 13.8) (McDonald et al., 2012). Анализ альфа- и бета-разнообразия, анализ PERMANOVA, ANCOM (Mandal et al., 2015) и анализ дифференциальной численности гнейсов также были выполнены с помощью QIIME2.Алгоритм LEfSe (Segata et al., 2011) использовался после QIIME2 с параметрами по умолчанию для определения различий в биомаркерах. Кроме того, необработанные данные 16S также были проанализированы с помощью USEARCH (Эдгар, 2013). Вкратце, данные секвенирования были обрезаны и отфильтрованы с ожидаемыми ошибками <1 с помощью USEARCH. Девяносто семь процентов таблицы операционных таксономических единиц (OTU), альфа- и бета-разнообразия и таксономии с базой данных проекта базы данных рибосом (RDP) v16 (rdp_16s_v16.fa) (Cole et al., 2009) были выполнены с помощью конвейера UPARSE USEARCH.

Анализ РНК-Seq и биоинформатики

человеческих рРНК удаляли из общей РНК с использованием набора для истощения рРНК (человек / мышь / крыса) (E6310L, NEBNext ^® ) в соответствии с инструкциями производителя. Подготовка библиотеки выполнялась с использованием набора для подготовки библиотеки направленной РНК для набора Illumina (E7760S, NEBNext ^® ). HiSeq 4000 (на каждую дорожку с парным концом из 100 пар оснований) выполняли в Биотехнологическом центре Роя Дж. Карвера в Университете штата Иллинойс в Урбана-Шампейн.Общая РНК от 16 из 20 младенцев была секвенирована в двух сериях RNA-seq. В первом прогоне образцы от младенцев № 1, № 2, № 3, № 7, № 8, № 9, № 10, № 11 и № 13 включали по две временных точки каждая. Во втором прогоне RNA-seq образцы от младенцев № 18, № 19, № 20, № 21, № 22, № 23 и № 24 были собраны с двумя временными точками, объединенными вместе после того, как мы определили, что две временные точки ( С интервалом 8 ~ 12 ч) имели аналогичный микробный состав в первом опыте.

Данные метатранскриптома были обрезаны Trimmomatic (версия 0.39) (Bolger et al., 2014), а затем DIAMOND (версия 0.9.24) (Buchfink et al., 2015) был использован для выравнивания считываний ДНК с базой данных NCBI nr. Данные будут доступны после принятия. MEGAN6 (Huson et al., 2007) использовался для синтаксического анализа выровненных выходных данных DIAMOND для получения результатов бактериальной филогении и генной онтологии по базам данных InterPro. За конвейером SAMSA2 (версия 2.2.0) (Westreich et al., 2018) последовали шаги предварительной обработки, как показано в руководстве, с некоторыми незначительными изменениями. Изменения включали присоединение к библиотекам парного секвенирования с помощью Fastq-Join (версия 1.3.1) (Aronesty, 2013), обрезка адаптера с помощью Trimmomatic (версия 0.39), удаление рРНК бактерий с помощью SortMeRNA (версия 2.1) (Kopylova et al., 2012) по базе данных SILVA (версия 1.1.9) (Pruesse et al., 2007), сопоставление DIAMOND (версия 0.9.24) с базой данных NCBI RefSeq (Tatusova et al., 2013) и сопоставление с базой данных SEED Subsystems (Overbeek et al., 2013). Версии баз данных RefSeq и SEED Subsystems были получены через BioShare («Используемые базы данных» в README.md) и загружены путем запуска файла «full_database_download».bash »в составе SAMSA2. Выходные файлы DIAMOND были агрегированы с использованием сценариев R и Python для статистического анализа и дифференциального выражения DESeq2 как части конвейера SAMSA2.

Результаты

Демографические данные зачисленных младенцев

Двадцать младенцев были задействованы в этом исследовании. Десять младенцев получали MBM, а десять младенцев находились на искусственном вскармливании. Информированное согласие было получено от родителей всех участников. Характеристики младенцев приведены в таблице 1.Неравномерная дисперсия (Велча) непарный t -тест был использован для анализа различий в демографической информации между двумя группами. Между двумя группами не наблюдалось значительных различий в гестационном возрасте, массе тела при рождении, а также в возрасте первой и второй выборки (дополнительная таблица S1). Это исключает эти потенциальные смешивающие факторы между группами лечения, которые могут повлиять на интерпретацию результатов.

Влияние источника питания на альфа- и бета-разнообразие бактериального состава кишечника

Сначала мы сравнили альфа-разнообразие бактериального состава кишечника у младенцев, вскармливаемых MBM и искусственными смесями, через QIIME2 и UPARSE с данными секвенирования 16S рРНК.Не было обнаружено значительных различий в бактериальном альфа-разнообразии между двумя диетическими группами (рис. 1А и дополнительная таблица S2). Наблюдались относительно большие различия среди людей в группе, получавшей смесь, по сравнению с группой MBM.

Рисунок 1. Альфа- и бета-разнообразие. (A) Коробчатые диаграммы, показывающие бактериальное альфа-разнообразие между двумя диетическими группами. Нет существенной разницы в индексе альфа-разнообразия Шеннона между MBM и группами формул. (B) График Жаккорда бета-разнообразия, представленный EMPeror. Отчетливая кластеризация бета-разнообразия наблюдалась между MBM (красный) и формульной группой (синий).

Помимо альфа-разнообразия, бета-разнообразие является еще одним важным индикатором, позволяющим определить, могут ли различные источники питания влиять на микробный состав. Как показано на рисунке 1B, наблюдались отдельные кластеры для каждого источника питания. Кроме того, анализ кластеризации PERMANOVA был значимым при P <0.01, подтверждая, что микробные составы в группах MBM и рецептур значительно различались.

Различия в составе фекального микробиома между МБМ и группами формул

OTU, полученные с помощью USEARCH на уровне филума, показывают, что Firmicutes был наиболее распространенным бактериальным филумом у большинства недоношенных детей, вскармливаемых МВМ и смесью, в среднем 67 и 69% состава соответственно. Proteobacteria были вторыми по численности бактериями с составом 29 и 25% для групп MBM и формул соответственно (дополнительный рисунок S1).На круговых диаграммах таксономии синтаксиса из конвейера USEARCH показаны пропорции различных родов бактерий (рисунки 2A, B). Род Veillonella и род Escherichia / Shigella имеют наибольшее богатство среди недоношенных новорожденных с МБМ – 18,41% и 15,17% соответственно. За ними следовали Staphylococcus (10,58%), Clostridium (9,62%), Enterococcus (9,61%) и Streptococcus (9,32%). У недоношенных новорожденных, находящихся на искусственном вскармливании, Streptococcus (18.64%) и Klebsiella (17,41%) были наиболее распространенным бактериальным родом, за которым следовали Enterococcus (12,41%), Staphylococcus (10,67%) и Veillonella (10,4%). Akkermansia был уникальным для группы, получавшей смесь, а Lactococcus был уникальным для группы MBM.

Рисунок 2. Сравнение таксономии младенцев, вскармливаемых MBM и искусственными смесями, на основе результатов секвенирования ампликона гена 16S рРНК. (A) Таксономические круговые диаграммы доли в группе MBM на уровне родов из UPARSE.Число каждого сектора – это процент бактерий. (B) Таксономические круговые диаграммы доли в группе, получавшей смесь, на уровне родов из UPARSE. Число в каждом разделе относится к проценту этих бактерий. (C) Результат LEfSe по относительной численности, обнаруженной в Propionibacterium между младенцами, вскармливаемыми MBM и смесью. (D) Дифференциальная относительная численность таксонов у младенцев, вскармливаемых MBM и смесью, на основе Gneiss.

Затем мы выполнили алгоритм LEfSe для сравнительного метагеномического анализа, чтобы сравнить относительную численность между двумя группами.Результаты LEfSe показали, что Propionibacterium в группе MBM имели значительно большую относительную численность, чем группа формулы (рис. 2C), что также было подтверждено результатами анализа состава микробиомов (ANCOM) из конвейера QIIME2. Кроме того, результаты классификатора случайного леса и команды otu_select в конвейере UPARSE согласились с анализами ANCOM и LEfSe, что Propionibacterium является наиболее информативной OTU, которая может эффективно прогнозировать для разделения двух групп (дополнительные таблицы S3, S4).После использования сбалансированного подхода, Гнейса, более длинный список таксонов оказался дифференциально многочисленным (рис. 2D). В группе формулы более многочисленными были семейство Enterobacteriaceae , род Enterococcus , род Veillonella и класс Bacilli , тогда как отряд Clostridiales , род Streptococcus и род Propionibacterium были более многочисленными в группе. Группа МБМ. LefSe также использовался для анализа дифференциальной численности на основе других группировок, т.е.е., антибиотик, способ доставки, раса и двойные факторы (дополнительный рисунок S2). Никаких существенных различий в Propionibacterium не было обнаружено при использовании других группировок.

Чтобы подтвердить результаты секвенирования ампликона гена 16S рРНК, мы также выполнили метатранскриптомный анализ у 16 ​​из 20 младенцев. Сходные паттерны относительной численности Clostridium , Streptococcus , Veillonella , Bifidobacterium , Enterococcus , Escherichia и Staphylococcus были получены с помощью результатов метатранскриптома в обеих группах (Рисунки 3A, B).Помимо этих доминаторов, было обнаружено, что Pantoea , Vibrio и Paenibacillus имеют более высокую относительную численность, профилированную с помощью метатранскриптомного анализа, чем с помощью секвенирования ампликона гена 16S рРНК. Наблюдались высокие индивидуальные различия как в бактериальном составе, так и в богатстве (дополнительный рисунок S3). Streptococcus и Clostridium были самыми многочисленными родами бактерий в группе MBM, а также Escherichia , Veillonella и Bifidobacterium (рис. 3A).В группе формулы наиболее распространенными бактериальными родами были Enterococcus и Streptococcus , за которыми следовали Bifidobacterium , Clostridium , Pantoea и Staphylococcus (рис. 3B).

Рис. 3. Сравнение таксономии младенцев, вскармливаемых MBM и искусственными смесями, на основе метатранскриптомических результатов на уровне рода. (A) Относительная численность в группе МБМ. (B) Относительная численность в группе, получавшей смесь.

Микробные функции в образцах детского стула

Данные метатранскриптома впоследствии были проанализированы посредством анализа генной онтологии с помощью InterPro2GO в MEGAN6. Всего было получено 2 039 141 чтение. 1 647 709 прочтений были вовлечены в биологические процессы. 571 096 прочтений принадлежали клеточному компоненту. 1 486 812 считываний были связаны с молекулярной функцией. 225 729 прочтений были несекретными. Основываясь на результатах InterPro2GO, гены, связанные с каталитической активностью и метаболическим процессом, были чрезмерно представлены как у детей, вскармливаемых MBM, так и на искусственном вскармливании (дополнительные рисунки S4, S5).Между двумя группами было несколько заметных различий (дополнительная таблица S5). Группа формулы имела больше внутренних компонентов мембраны и транспортной функции, чем группа MBM. Гены связывания нуклеиновых кислот, связывания ионов и метаболического процесса ДНК были относительно более распространены в группе MBM, чем в группе формулы.

Чтобы найти дифференциальную экспрессию гена, данные метатранскриптома были проанализированы с помощью SAMSA2. На тепловой карте MBM и группы формул обычно группируются отдельно, за некоторыми исключениями, что группа формул была разделена на две части (дополнительный рисунок S6).На основании результата DESeq2 было выявлено 22 гена, дифференциально экспрессируемых ( P _прил <0,05) с абсолютным значением log2-кратного изменения более 2. Дифференциально экспрессируемые гены были дополнительно разделены на три уровня (Таблица 2), что показывает что механизмы кислотного стресса и кислотной устойчивости, а также утилизация L-фукозы увеличились в группе MBM, тогда как деградация валина и метионина увеличилась в группе формулы на уровне иерархии 2. На уровне иерархии 3 наибольшее повышение регуляции в группе MBM было в гамма-субъединице компонента B глицинредуктазы (20.327-log2-кратное увеличение), за которым следует вероятный глутамат / гамма-амино-бутиратный антипортер (9,128-log2-кратное увеличение) и шаперон HdeA (8802-log2-кратное увеличение). Заметная повышающая регуляция в группе, получавшей формулу, была у метионин-гамма-лиазы (увеличение в 7,648 log2 раз) и АТФ-зависимой РНК-геликазы YqfR (увеличение в 2,919 log2 раза) по сравнению с группой MBM.

Таблица 2. Сводка анализа аннотаций на основе иерархии базы данных подсистем SEED, показывающая три уровня для каждой аннотированной функции, которые имеют значительную разницу в выражении между группой грудного молока и группой смеси ( p _adj <0.05).

Обсуждение

Исследования микробиома кишечника недоношенных детей были относительно немногочисленными из-за трудностей с получением образцов. В нескольких исследованиях сообщалось о влиянии кормления на очень недоношенных (Cong et al., 2016) и крайне недоношенных детей (Gewolb et al., 1999), но когорта умеренно-поздних недоношенных составляет большую часть популяции недоношенных. Следовательно, исследования микробиома кишечника недоношенных новорожденных со средней и поздней стадией беременности, посвященные питательным эффектам, в целом отсутствовали.

Что касается альфа-разнообразия между различными источниками питания, нет значительных различий в альфа-разнообразии между недоношенными детьми, вскармливаемыми MBM и смесью. Однако было обнаружено, что бета-разнообразие на уровне родов различается, тогда как на уровне филюмов существенных различий не было. Основываясь на подходе ампликона 16S рРНК, на уровне филума преобладает Firmicutes , за которым следуют Proteobacteria в обеих группах. На уровне рода в образцах группы MBM в основном доминировали Veillonella и Escherichia / Shigella , за которыми следовали Staphylococcus , Enterococcus , Clostridium , Streptococcus и Klebsiella .Напротив, в группе, получавшей смесь, основными колонизаторами были Streptococcus и Klebsiella , а второстепенными колонизаторами были Enterococcus , Staphylococcus , Veillonella и Clostridium . В этом исследовании, используя как сбалансированные, так и несбалансированные методы для анализа дифференциально распространенных таксонов, мы обнаружили, что Propionibacterium постоянно более многочисленны в группе, получавшей MBM, чем в группе, получавшей смесь.Предыдущее исследование связывало присутствие Propionibacterium в кишечнике младенцев с кожной флорой матери, что может быть связано с колонизацией Propionibacterium во время кесарева сечения (Dominguez-Bello et al., 2010). Однако после того, как мы проанализировали данные на основе других группировок, включая способ доставки, мы не обнаружили существенной разницы в Propionibacterium , помимо группировки источников питания. Это говорит о том, что существенное различие Propionibacterium в этом исследовании в основном связано с источником питания. Propionibacterium обычно считается полезной бактерией (Holzapfel et al., 2001; Kechagia et al., 2013), хотя и не доминирует в микробиоме ядра кишечника. Более того, наши результаты машинного обучения UPARSE также подтвердили, что Propionibacterium был наиболее прогностическим индикатором для различения недоношенных детей, вскармливаемых MBM и искусственными смесями. В дополнение к Propionibacterium , результаты Gneiss также показали, что у младенцев MBM была значительно большая популяция из родов Streptococcus и Finegoldia , чем у представителей группы формулы, но меньше из семейства Enterobacteriaceae и рода Enterococcus , которые являются в основном соответствует метатранскриптомическим результатам.

В этом исследовании мы не обнаружили различий в относительной численности Bifidobacterium и Lactobacillus между группами, получавшими MBM и смесью. Bifidobacterium и Lactobacillus считаются полезными и обычно доминируют у доношенных здоровых младенцев (Stark and Lee, 1982; Benno et al., 1984; Balmer and Wharton, 1989; Bezirtzoglou et al., 2011) . Подобно предыдущим исследованиям на недоношенных новорожденных (Gewolb et al., 1999; Palmer et al., 2007; Конг и др., 2016; Wandro et al., 2018), мы обнаружили в целом низкую относительную численность Bifidobacterium и Lactobacillus на основе как секвенирования ампликона гена 16S рРНК, так и методов метатранскриптомики, за исключением одного образца в каждой группе. Хотя предполагалось, что методы экстракции ДНК и выбор праймеров для ПЦР приведут к артефакту недопредставленности Bifidobacteria (Gomez-Llorente et al., 2013; Walker et al., 2015) с помощью метатранскриптомного подхода, который должен устранили систематическую ошибку, мы обнаружили, что Bifidobacteria действительно имели относительно низкую популяцию.Возможное объяснение этого явления низкой относительной численности у Bifidobacterium связано с возрастом беременности (Butel et al., 2007; Arboleya et al., 2012; Черникова и др., 2018). Вполне вероятно, что кишечник умеренно-поздних недоношенных новорожденных еще не готов к такому типу колонизации. С другой стороны, длительное пребывание недоношенных детей в больнице приводит к дисбактериозу из-за различий в воздействии окружающей среды в домашних условиях (Schwiertz et al., 2003; Magne et al., 2006; Рудьер и др., 2009; Rougé et al., 2010; Jacquot et al., 2011), а использование антибиотиков во время родов или прямое использование для новорожденных (Zimmermann and Curtis, 2019) могло способствовать низкой численности, независимо от источника питания.

Разные уровни метаболических генов L-фукозы в двух группах могут быть одной из причин различий в бактериальном составе. Некоторые исследования показали, что олигосахариды грудного молока (HMO) в большом количестве присутствуют в грудном молоке человека, но не могут всасываться младенцами.Однако HMO служит метаболическим субстратом для определенных бактерий в кишечнике младенца (Engfer et al., 2000; Gnoth et al., 2000). L-фукоза является одним из мономеров HMO и очень распространена в кишечнике человека с несколькими распространенными кишечными бактериями человека, включая Bifidobacterium , E. coli и несколько видов Bacteroides , которые, как известно, используют L-фукозу ( Eagon, 1961; Pacheco et al., 2012; Bunesova et al., 2016; Westreich et al., 2019). Основываясь на наших результатах, мы предполагаем, что младенцы MBM имели доступ к большему количеству L-фукозы как олигосахарида, чем младенцы, получающие смеси, которые могли быть отобраны для определенных бактерий в кишечнике младенца (Bode, 2009).Кислотность кишечника, полученная из пищевых источников, также может влиять на микробиом кишечника новорожденных. Одно исследование показало, что pH образцов кала у младенцев MBM (5,49 ± 0,4) был значительно ниже, чем у младенцев, вскармливаемых смесью (6,91 ± 0,8), через 14 дней после рождения (Balmer and Wharton, 1989), что может служить одним из объяснения механизма повышенной кислотостойкости группы MBM мы наблюдали. Примечательно, что гамма-субъединица B глицинредуктазы увеличилась на 20-log ₂ раз в группе MBM.Глицин служит акцептором электронов и восстанавливается глицинредуктазой, продуцируемой анаэробными бактериями (Andreesen, 1994). Колонизация облигатных анаэробов, таких как Streptococcus anginosus , Clostridium butyricum и Veillonella dispar , имеет тенденцию к метаболизму, основанному на ферментации (Brown et al., 2013), что подтверждает наблюдение доминирующих Streptococcus , Clostridium и Veillonella в группе MBM данного исследования.Экспрессия гена устойчивости к кислоте, вероятно, была повышена в группе MBM, потому что Streptococcus , Clostridium и Veillonella продуцировали кислоту во время дыхания посредством ферментации. Связана ли повышенная экспрессия генов кислотостойкости и глицинредуктазы с использованием HMO, еще предстоит проверить в будущих исследованиях, в том числе, какие из бактерий более эффективны.

Соответствующее содержание аминокислот в молочных смесях может быть очень важным, особенно для недоношенных новорожденных (Jang et al., 2018). В этом исследовании мы обнаружили активацию пути, ответственного за деградацию двух незаменимых аминокислот, метионина и валина, в кишечнике новорожденных, вскармливаемых молочной смесью. Поэтому мы предполагаем, что содержание аминокислот в источниках питания может оказывать давление отбора на определенных членов микробиома. Поскольку источником белка большинства детских смесей является сыворотка коровьего молока, другие исследования, сравнивающие концентрацию аминокислот в плазме младенцев, также показали, что у младенцев, которых кормили смесью с преобладанием сыворотки, были повышенные уровни валина и метионина (Janas et al. ., 1985; Шанлер и Гарза, 1987). Гиперметионинемия – это нарушение обмена веществ, при котором у большинства пациентов симптомы не проявляются. Однако у немногих пациентов, у которых действительно проявляются симптомы, они показывают клиническое неврологическое заболевание (Chou, 2000; Chamberlin et al., 2000) и умеренный гепатит (Augoustides-Savvopoulou et al., 2003; Baric et al., 2004). Исследование показало, что 9 из 10 детей с гиперметионинемией были связаны с потреблением молочной смеси с избытком метионина (Mudd et al., 2003). Отек мозга у двух из этих пациентов наблюдался при МРТ головного мозга, и они нормализовались после уменьшения количества принятого метионина.Гиперметионинемия вызвана недостаточностью активности глицин-N-метилтрансферазы (GNMT) (Augoustides-Savvopoulou et al., 2003; Luka and Wagner, 2003; Luka et al., 2006) и / или мутациями гена MAT1A (Chou, 2000 ; Chamberlin et al., 2000), в результате чего концентрация метионина в плазме достигала 1870 мкМ (нормальный диапазон 5–35 мкМ). Следовательно, необходимы дополнительные исследования, чтобы понять влияние этих двух аминокислот на ось кишечник-мозг в отношении неврологических заболеваний.Снижение чрезмерного количества метионина и валина в смеси может потребоваться для смягчения возникновения заболевания.

Секвенирование ампликона гена 16S рРНК обычно используется для определения микробиома кишечника, но существуют ограничения, включая неравномерную амплификацию ПЦР, короткие последовательности (Quince et al., 2009; Poretsky et al., 2014) и низкую точность картирования OTU (Huse et al., 2010; Ranjan et al., 2018). В последние годы быстрое развитие технологии высокопроизводительного секвенирования и снижение затрат сделали метатранскриптом возможным в исследованиях микробиома.В отличие от секвенирования ампликона гена 16S рРНК, метатранскриптом напрямую сравнивает экспрессию функции гена и динамические изменения (Bashiardes et al., 2016; Shakya et al., 2019). В этом исследовании мы обнаружили, что большинство различий в бактериальном составе между группой MBM и группой, получавшей смесь, совпадают. Однако существует небольшая разница в доле бактерий между этими двумя методами. В результатах метатранскриптома доля Streptococcus в группе MBM была больше, чем в группе формулы, что было противоположным в соответствии с круговыми диаграммами синтаксиса 16S.Анализ дифференциальной численности, основанный на Gneiss для данных секвенирования 16S, действительно согласуется с результатами метатранскриптома о том, что Streptococcus был более распространенным в группе MBM, чем в группе формулы. Мы также обнаружили, что Veillonella и Klebsiella были мало представлены в результатах метатранскриптома, тогда как Bifidobacteria и Pantoea были широко представлены по сравнению с результатами секвенирования ампликона гена 16S рРНК. В этом исследовании мы одновременно извлекали ДНК и РНК для секвенирования ампликона гена 16S рРНК и анализа метатранскриптома, используя ту же стадию измельчения.На этом этапе было исключено, что некоторые бактерии, о которых известно, что они недостаточно представлены, вызваны недостаточным измельчением с использованием различных наборов на этапе экстракции нуклеиновых кислот. Поэтому мы предполагаем, что различия, наблюдаемые между двумя подходами, в основном связаны с избирательной амплификацией ПЦР, которая должна быть проверена параллельным сравнением предварительно определенного состава микробиомов в будущем исследовании.

Основным ограничением этого исследования было то, что сбор образцов кала у недоношенных новорожденных, находящихся в отделении интенсивной терапии новорожденных (ОИТН), был серьезным препятствием.Схема выборки в этом исследовании смогла устранить столько мешающих факторов, сколько мы можем легко понять. Например, нам известно, что кесарево сечение по сравнению с вагинальными родами – это фактор, который, как известно, влияет на микробиом у младенцев, поэтому не было статистической разницы между количеством младенцев, рожденных каждым методом в наших группах исследования. Однако одной из уникальных характеристик этого исследования является то, что в него было включено относительно большое количество младенцев из числа коренных американцев. Насколько нам известно, микробиом младенцев коренных американцев не получил должной оценки в других исследованиях.Младенцы, включенные в наше исследование, хорошо представляют общую демографию отделений интенсивной терапии в нашем регионе. Ранее мы не проводили оценку соотношения показателей грудного вскармливания и искусственного вскармливания между этническими демографическими группами в нашем отделении интенсивной терапии интенсивной терапии, поскольку грудное вскармливание распространяется на все группы населения, независимо от демографических. Таким образом, мы не ожидали различия расы между нашими группами во время набора. Наши результаты могут иметь последствия для здоровья населения, которые будут представлять интерес для будущих исследований. Кроме того, с практической точки зрения, близнецы не были исключены из исследования, поскольку пары близнецов распространены в отделениях интенсивной терапии интенсивной терапии, поскольку они с большей вероятностью будут рождены преждевременно, чем одиночные.Хотя экспозиции были схожими, мы не заметили идентичных микробиомов для двойных наборов.

Это исследование клинически актуально для недоношенных новорожденных во время их пребывания в отделениях интенсивной терапии, поскольку определенные заболевания, такие как NEC, имеют тенденцию возникать в отделениях интенсивной терапии с крайне и очень недоношенными группами населения с незрелым желудочно-кишечным трактом. В качестве первого комплексного исследования по сравнению влияния питания на раннюю микробную колонизацию кишечника недоношенных детей это исследование было сосредоточено не только на таксономии, но и на функционировании с помощью методов 16S рРНК и метатранскриптома.Мы обнаружили, что относительная численность Propionibacterium , Streptococcus и Finegoldia и порядка Clostridiales в группе MBM была значительно выше, чем в группе формулы, а относительная численность семейства Enterobacteriaceae , род Enterococcus и Veillonella , а также класс Bacilli в группе формулы был значительно выше, чем в группе MBM. Пробиотики, Bifidobacterium и Lactobacillus , не имели значительных различий между двумя группами.С помощью функционального анализа мы обнаружили, что бактериальные гены, относящиеся к глицинредуктазе, периплазматической кислотной стрессовой реакции у Enterobacteria , механизмам кислотной устойчивости и функциям утилизации L-фукозы в группе MBM были активированы, в то время как функции деградации метионина и валина были усилены. подавлено по сравнению с группой формулы. Эта статья дала более глубокое понимание формирования микробиома кишечника недоношенных детей в результате питания, что будет иметь большое значение для улучшения молочных смесей для этой группы населения.

Заявление о доступности данных

Наборы данных, созданные для этого исследования, можно найти в NCBI SRA PRJNA515307.

Заявление об этике

Исследования с участием людей были рассмотрены и одобрены Sanford Health. Письменное информированное согласие на участие в этом исследовании было предоставлено законным опекуном / ближайшими родственниками участников.

Авторские взносы

ZW, AN и S-YM проанализировали данные секвенирования. ZW сконструировал библиотеки метатранскриптомов.Авторы исследования – JW, XW и S-YM. ZW, S-YM и RV помогли составить рукопись. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.

Финансирование

Это исследование было частично поддержано запуском SDSU из фонда USDA Hatch SD00H606-16 с инвентарным номером 1009451 на S-YM, совместным семенным грантом Sanford Health / SDSU для XW, S-YM и JW, а также сельскохозяйственного эксперимента SDSU. Станция на XW и S-YM.

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Благодарности

Мы благодарим медсестер за помощь в сборе проб в Sanford Health, Sioux Falls, SD, США.

Дополнительные материалы

Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2020.00891/full#supplementary-material

Сноски

Список литературы

Абрамс, С.А., Шанлер, Р.Дж., Ли, М.Л., Рехтман, Д.J., and Group, P. S. (2014). Повышенная смертность и заболеваемость у крайне недоношенных детей, получающих диету, содержащую белковые продукты из коровьего молока. Грудное вскармливание. Med. 9, 281–285. DOI: 10.1089 / bfm.2014.0024

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Арболея С., Бинетти А., Салазар Н., Фернандес Н., Солис Г., Эрнандес-Барранко А. и др. (2012). Становление и развитие кишечной микробиоты у недоношенных новорожденных. FEMS Microbiol. Ecol. 79, 763–772. DOI: 10.1111 / j.1574-6941.2011.01261.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Армстронг, Дж., И Рейли, Дж. Дж., Информационная группа по вопросам здоровья детей (2002 г.). Грудное вскармливание и снижение риска детского ожирения. Ланцет 359, 2003–2004 гг. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (02) 08837-2

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Э. Аронести (2013). Сравнение служебных программ секвенирования. Открыть Биоинформ. J. 7

Google Scholar

Аугустидес-Саввопулу, П., Лука, З., Карида, С., Стейблер, С., Аллен, Р., Пациаура, К. и др. (2003). Дефицит глицин-N-метилтрансферазы: новый пациент с новой мутацией. J. Inherit. Метаб. Дис. 26, 745–759. DOI: 10.1023 / B: BOLI.0000009978.17777.33

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Барич, И., Фумич, К., Гленн, Б., Чук, М., Шульце, А., Финкельштейн, Дж. Д. и др. (2004). Дефицит S-аденозилгомоцистеингидролазы у человека: генетическое нарушение метаболизма метионина. Proc. Natl. Акад. Sci. США 101, 4234–4239. DOI: 10.1073 / pnas.0400658101

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бенно Ю., Савада К. и Мицуока Т. (1984). Микрофлора кишечника детей грудного возраста: состав фекальной флоры грудных детей и детей, находящихся на искусственном вскармливании. Microbiol. Иммунол. 28, 975–986. DOI: 10.1111 / j.1348-0421.1984.tb00754.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бергстранд О., Хеллерс Г.(1983). Кормление грудью в младенчестве у пациентов, у которых позже развивается болезнь Крона. Сканд. J. Gastroenterol. 18, 903–906. DOI: 10.3109 / 003655283013

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Безирцоглу Э., Циоциас А. и Веллинг Г. В. (2011). Профиль микробиоты в кале новорожденных на грудном вскармливании и на искусственном вскармливании с использованием флуоресцентной гибридизации in situ (FISH). Анаэроб 17, 478–482. DOI: 10.1016 / j.anaerobe.2011.03.009

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Больен, Э., Rideout, J. R., Dillon, M. R., Bokulich, N.A., Abnet, C., Al-Ghalith, G.A., et al. (2018). QIIME 2: воспроизводимая, интерактивная, масштабируемая и расширяемая наука о микробиомных данных. PeerJ 6: e27295v2. DOI: 10.1038 / s41587-019-0252-6

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Booijink, C.C., Boekhorst, J., Zoetendal, E.G., Smidt, H., Kleerebezem, M., and De Vos, W.M. (2010). Метатранскриптомный анализ фекальной микробиоты человека выявляет профили экспрессии, специфичные для каждого пациента, при этом преобладающе экспрессируются гены, кодирующие белки, участвующие в метаболизме углеводов. Заявл. Environ. Microbiol. 76, 5533–5540. DOI: 10.1128 / AEM.00502-10

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бойд, К. А., Куигли, М. А., и Броклхерст, П. (2007). Донорское грудное молоко по сравнению с детской смесью для недоношенных детей: систематический обзор и метаанализ. Arch. Дис. Чайлд Fetal Neonatal Edn. 92, F169 – F175. DOI: 10.1136 / adc.2005.089490

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Брейман, Л.(2001). Случайные леса. Мах. Учить. 45, 5–32.

Google Scholar

Браун, К. Т., Шарон, И., Томас, Б. К., Кастель, К. Дж., Моровиц, М. Дж., И Банфилд, Дж. Ф. (2013). Анализ с определением генома кишечного микробного сообщества недоношенных новорожденных выявил геном Varibaculum cambriense и сдвиг в сторону метаболизма, основанного на ферментации, в течение третьей недели жизни. Микробиом 1:30. DOI: 10.1186 / 2049-2618-1-30

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Бунесова, В., Лакруа, К., и Шваб, К. (2016). Утилизация фукозиллактозы и L-фукозы младенцами Bifidobacterium longum и Bifidobacterium kashiwanohense . BMC Microbiol. 16: 248. DOI: 10.1186 / s12866-016-0867-4

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Butel, M.-J., Suau, A., Campeotto, F., Magne, F., Aires, J., Ferraris, L., et al. (2007). Условия колонизации бифидобактериями у недоношенных детей: проспективный анализ. J. Pediatr. Гастроэнтерол. Nutr. 44, 577–582. DOI: 10.1097 / MPG.0b013e3180406b20

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чемберлин, М. Э., Убагай, Т., Мадд, С. Х., Томас, Дж., Пао, В. Ю., Нгуен, Т. К. и др. (2000). Дефицит метионин-аденозилтрансферазы I / III: новые мутации и клинические варианты. Am. J. Hum. Genet. 66, 347–355. DOI: 10.1086 / 302752

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Черникова, Д.А., Мадан, Дж. К., Хаусман, М. Л., Лундгрен, С. Н., Моррисон, Х. Г., Согин, М. Л. и др. (2018). Микробиом кишечника недоношенных детей в течение первых 6 недель жизни различается в зависимости от гестационной зрелости при рождении. Pediatr. Res. 84:71. DOI: 10.1038 / s41390-018-0022-z

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Чжоу, Дж. Я. (2000). Молекулярная генетика недостаточности метионинаденозилтрансферазы печени. Pharmacol. Ther. 85, 1–9. DOI: 10.1016 / s0163-7258 (99) 00047-9

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коул, Дж. Р., Ван, К., Карденас, Э., Фиш, Дж., Чай, Б., Фаррис, Р. Дж. И др. (2009). Проект базы данных рибосом: улучшенное выравнивание и новые инструменты для анализа рРНК. Nucleic Acids Res. 37 (Прилож ._1), D141 – D145. DOI: 10.1093 / nar / gkn879

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Коллинз М. Д. и Гибсон Г. Р. (1999). Пробиотики, пребиотики и синбиотики: подходы к регулированию микробной экологии кишечника. Am. J. Clin. Nutr. 69, 1052s – 1057s. DOI: 10.1093 / ajcn / 69.5.1052s

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Cong, X., Xu, W., Janton, S., Henderson, W. A., Matson, A., McGrath, J. M., et al. (2016). Модели развития кишечного микробиома в раннем периоде жизни недоношенных детей: влияние кормления и пола. PLoS One 11: e0152751. DOI: 10.1371 / journal.pone.0152751

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Дэвис, М.Ю., Чжан, Х., Браннан, Л. Э., Карман, Р. Дж., И Бун, Дж. Х. (2016). Быстрое изменение фекального микробиома и исчезновение Clostridium difficile у колонизированного младенца после перехода с грудного молока на коровье. Микробиом 4:53. DOI: 10.1186 / s40168-016-0198-6

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Домингес-Белло, М. Г., Костелло, Э. К., Контрерас, М., Магрис, М., Идальго, Г., Фирер, Н. и др. (2010). Способ доставки формирует приобретение и структуру исходной микробиоты в различных средах обитания новорожденных. Proc. Natl. Акад. Sci. США 107, 11971–11975. DOI: 10.1073 / pnas.1002601107

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Экбург, П. Б., Бик, Э. М., Бернштейн, К. Н., Пурдом, Э., Детлефсен, Л., Сарджент, М., и др. (2005). Разнообразие микробной флоры кишечника человека. Наука 308, 1635–1638. DOI: 10.1126 / science.1110591

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Энгфер, М.Б., Шталь, Б., Финке, Б., Савацки, Г., и Даниэль, Х. (2000). Олигосахариды грудного молока устойчивы к ферментативному гидролизу в верхних отделах желудочно-кишечного тракта. Am. J. Clin. Nutr. 71, 1589–1596. DOI: 10.1093 / ajcn / 71.6.1589

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Форсгрен, М., Изолаури, Э., Салминен, С., и Раутава, С. (2017). Поздние преждевременные роды прямо и косвенно влияют на развитие кишечной микробиоты младенца в течение первых шести месяцев жизни. Acta Paediatr. 106, 1103–1109. DOI: 10.1111 / apa.13837

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Franzosa, E. A., Morgan, X. C., Segata, N., Waldron, L., Reyes, J., Earl, A. M., et al. (2014). Связь метатранскриптома и метагенома кишечника человека. Proc. Natl. Акад. Sci. США 111, E2329 – E2338. DOI: 10.1073 / pnas.1319284111

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Fu, R.H., Wu, D.C., Yang, W., Scoffield, J., и Бенвенисте, Э. Н. (2017). Метаболиты пробиотиков способствуют противовоспалительным функциям иммунных клеток. FASEB J. 31: 1048.1041.

Google Scholar

Геволб И. Х., Швальбе Р. С., Тасиак В. Л., Харрисон Т. С. и Паниграхи П. (1999). Микрофлора стула у младенцев с крайне низкой массой тела при рождении. Arch. Дис. Ребенок. Фетальный новорожденный. Эд. 80, F167 – F173. DOI: 10.1136 / fn.80.3.f167

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Голь, Д.M., Vangay, P., Garbe, J., MacLean, A., Hauge, A., Becker, A., et al. (2016). Систематическое совершенствование методов генов-маркеров ампликонов для повышения точности исследований микробиома. Nat. Biotechnol. 34: 942. DOI: 10.1038 / NBT.3601

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гомес-Льоренте, К., Плаза-Диас, Дж., Агилера, М., Муньос-Кесада, С., Бермудес-Брито, М., Песо-Эчарри, П. и др. (2013). Три основных фактора определяют изменения в фекальной микробиоте, связанные с режимом кормления младенцев. J. Pediatr. Гастроэнтерол. Nutr. 57, 461–466. DOI: 10.1097 / MPG.0b013e31829d519a

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Госальбес, М. Дж., Дурбан, А., Пиньятелли, М., Абеллан, Дж. Дж., Хименес-Эрнандес, Н., Перес-Кобас, А. Э. и др. (2011). Метатранскриптомический подход к анализу функциональной микробиоты кишечника человека. PLoS One 6: e17447. DOI: 10.1371 / journal.pone.0017447

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гнот, М.J., Kunz, C., Kinne-Saffran, E., and Rudloff, S. (2000). Олигосахариды грудного молока минимально усваиваются in vitro. J. Nutr. 130, 3014–3020. DOI: 10.1093 / jn / 130.12.3014

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гросс, С. Дж. (1983). Рост и биохимическая реакция недоношенных детей, которых кормили грудным молоком или модифицированной детской смесью. N. Engl. J. Med. 308, 237–241. DOI: 10.1056 / NEJM198302033080501

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гамильтон, Б.Э., Мартин, Дж. А., Остерман, М. Дж., И Россен, Л. М. (2019). рождений: предварительные данные за 2018 год. Хяттсвилл, Массачусетс: Национальный центр статистики здравоохранения.

Google Scholar

Hanson, L., Ahlstedt, S., Carlsson, B., Fällström, S., Kaijser, B., Lindblad, B., et al. (1978). Новые знания об иммуноглобулинах грудного молока. Acta Paediatr. 67, 577–582.

Google Scholar

Хармсен, Х. Дж., Вильдебур-Велу, А. К., Раанг, Г. К., Вагендорп, А.A., Klijn, N., Bindels, J. G., et al. (2000). Анализ развития кишечной флоры у детей, находящихся на грудном вскармливании и на искусственном вскармливании, с использованием молекулярной идентификации и методов обнаружения. J. Pediatr. Гастроэнтерол. Nutr. 30, 61–67. DOI: 10.1097 / 00005176-200001000-00019

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хо, Н. Т., Ли, Ф., Ли-Сарвар, К. А., Тун, Х. М., Браун, Б. П., Паннарадж, П. С. и др. (2018). Мета-анализ воздействия исключительно грудного вскармливания на микробиоту кишечника младенцев в разных популяциях. Nat. Commun. 9: 4169. DOI: 10.1038 / s41467-018-06473-x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Holzapfel, W.H., Haberer, P., Geisen, R., Björkroth, J., and Schillinger, U. (2001). Таксономия и важные особенности пробиотических микроорганизмов в продуктах питания и питании. Am. J. Clin. Nutr. 73, 365s – 373s. DOI: 10.1093 / ajcn / 73.2.365s

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Гугенгольц, Ф., Ритари, Дж., Нюлунд, Л., Дэвидс, М., Сатокари, Р., и Де Вос, В. М. (2017). Возможность проведения метатранскриптомного анализа микробиоты кишечника младенцев: адаптация к твердой пище приводит к повышению активности фирмикутов в шесть месяцев. Внутр. J. Microbiol. 2017: 9547063. DOI: 10.1155 / 2017/9547063

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хьюз, С. М., Велч, Д. М., Моррисон, Х. Г. и Согин, М. Л. (2010). Разглаживание морщин в редкой биосфере за счет улучшенной кластеризации OTU. Environ. Microbiol. 12, 1889–1898. DOI: 10.1111 / j.1462-2920.2010.02193.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Huson, D.H., Auch, A.F., Qi, J., and Schuster, S.C. (2007). MEGAN анализ метагеномных данных. Genome Res. 17, 377–386.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Jacquot, A., Neveu, D., Aujoulat, F., Mercier, G., Marchandin, H., Jumas-Bilak, E., et al. (2011). Динамика и клиническая эволюция бактериальной микрофлоры кишечника у крайне недоношенных пациентов. J. Pediatr. 158, 390–396. DOI: 10.1016 / j.jpeds.2010.09.007

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Янас, Л. М., Пиччиано, М. Ф., и Хэтч, Т. Ф. (1985). Показатели белкового обмена у доношенных детей, получавших грудное молоко, смеси с преобладанием сыворотки или смеси коровьего молока. Педиатрия 75, 775–783.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Янг, Х.-Дж., Пак, Дж. Х., Ким, С. С., Ли, С. Л., и Ли, В. М. (2018). Смесь на основе аминокислот для недоношенных детей с непереносимостью кормления: сравнение уровня кальпротектина в кале. Pediatr. Гастроэнтерол. Гепатол. Nutr. 21, 189–195. DOI: 10.5223 / pghn.2018.21.3.189

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Кечагиа М., Басулис Д., Константопулу С., Димитриади Д., Гифтопулу К., Скармуцу Н. и др. (2013). Польза пробиотиков для здоровья: обзор. ISRN Nutr. 2013: 481651.

Google Scholar

Копылова Э., Ноэ Л., Тузе Х. (2012). SortMeRNA: быстрая и точная фильтрация рибосомных РНК в метатранскриптомических данных. Биоинформатика 28, 3211–3217. DOI: 10.1093 / биоинформатика / bts611

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лавель, А., Сокол, Х. (2018). Микробиота кишечника: помимо метагеномики, метатранскриптомика освещает функциональность микробиома при ВЗК. Nat. Преподобный Гастроэнтерол. Гепатол. 15: 193. DOI: 10.1038 / nrgastro.2018.15

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли, С. А., Лим, Дж. Й., Ким, Б.-С., Чо, С. Дж., Ким, Н.Ю., Ким, О. Б. и др. (2015). Сравнение профиля микробиоты кишечника у корейских младенцев, вскармливаемых грудью и вскармливаемыми смесями, с использованием пиросеквенирования. Nutri. Res. Практик. 9, 242–248. DOI: 10.4162 / nrp.2015.9.3.242

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ли М., Ван М. и Донован С. М. (2014). «Раннее развитие кишечного микробиома и иммуноопосредованные детские расстройства», в Семинарах по репродуктивной медицине , ред. Р. Легро и Дж. Х.Сегарс (Нью-Йорк, Нью-Йорк: издательство Thieme Medical Publishers), 074–086. DOI: 10.1055 / с-0033-1361825

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лим, Э. С., Чжоу, Ю., Чжао, Г., Бауэр, И. К., Дройт, Л., Ндао, И. М. и др. (2015). Динамика вирома кишечника человека и бактериального микробиома у младенцев в раннем возрасте. Nat. Med. 21: 1228. DOI: 10,1038 / нм. 3950

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лукас А. и Коул Т. Дж. (1990). Грудное молоко и некротический энтероколит новорожденных. Ланцет 336, 1519–1523. DOI: 10.1016 / 0140-6736 (90) 93304-8

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лукас А., Морли Р., Коул Т. Дж., Листер Г. и Лисон-Пейн К. (1992). Грудное молоко и последующий коэффициент интеллекта у недоношенных детей. Ланцет 339, 261–264.

Google Scholar

Лука, З., Капдевила, А., Мато, Дж. М., и Вагнер, К. (2006). Модель мыши с нокаутом глицин-N-метилтрансферазы для людей с дефицитом этого фермента. Transgenic Res. 15, 393–397. DOI: 10.1007 / s11248-006-0008-1

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Лука, З., и Вагнер, К. (2003). Влияние встречающихся в природе мутаций глицин-N-метилтрансферазы человека на активность и конформацию. Biochem. Биофиз. Res. Commun. 312, 1067–1072. DOI: 10.1016 / j.bbrc.2003.11.037

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Mackie, R.I., Sghir, A., and Gaskins, H.Р. (1999). Микробная экология развития желудочно-кишечного тракта новорожденных. Am. J. Clin. Nutr. 69, 1035S – 1045S. DOI: 10.1093 / ajcn / 69.5.1035s

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мадан, Дж. К., Хоэн, А. Г., Лундгрен, С. Н., Фарзан, С. Ф., Коттингем, К. Л., Моррисон, Х. Г. и др. (2016). Связь кесарева сечения и добавления смеси с кишечным микробиомом 6-недельных младенцев. JAMA Pediatr. 170, 212–219.DOI: 10.1001 / jamapediatrics.2015.3732

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Magne, F., Abély, M., Boyer, F., Morville, P., Pochart, P., and Suau, A. (2006). Низкое видовое разнообразие и высокая межличностная изменчивость в фекалиях недоношенных детей, что выявлено последовательностями генов 16S рРНК и профилями гель-электрофореза в ПЦР-временном градиенте температуры. FEMS Microbiol. Ecol. 57, 128–138. DOI: 10.1111 / j.1574-6941.2006.00097.x

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Мандал, С., Ван Треурен, В., Уайт, Р. А., Эггесбо, М., Найт, Р., и Педдада, С. Д. (2015). Анализ состава микробиомов: новый метод изучения микробного состава. Microbial. Ecol. Health Dis. 26: 27663. DOI: 10.3402 / mehd.v26.27663

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макканн А., Райан Ф. Дж., Стокдейл С. Р., Далмассо М., Блейк Т., Райан К. А. и др. (2018). Виромы годовалых младенцев показывают влияние способа рождения на разнообразие микробиома. PeerJ 6: e4694. DOI: 10.7717 / peerj.4694

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Макдональд Д., Прайс М. Н., Гудрич Дж., Навроцки Э. П., ДеСантис Т. З., Пробст А. и др. (2012). Улучшенная таксономия Greengenes с явными рангами для экологического и эволюционного анализа бактерий и архей. ISME J. 6: 610. DOI: 10.1038 / ismej.2011.139

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Mevissen-Verhage, E., Марселис, Дж., Де Вос, М., Хармсен-ван Амеронген, В., и Верхоф, Дж. (1987). Bifidobacterium, Bacteroides и Clostridium spp. в образцах фекалий младенцев, находящихся на грудном и искусственном вскармливании, с добавками железа и без них. J. Clin. Microbiol. 25, 285–289.

PubMed Аннотация | Google Scholar

Mudd, S.H., Braverman, N., Pomper, M., Tezcan, K., Kronick, J., Jayakar, P., et al. (2003). Детская гиперметионинемия и гипергомоцистеинемия из-за высокого потребления метионина: диагностическая ловушка. Мол. Genet. Метаб. 79, 6–16. DOI: 10.1016 / s1096-7192 (03) 00066-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Oddy, W.H. (2002). Влияние грудного молока на здоровье младенцев и детей. Грудное вскармливание. Откровение 10: 5.

Google Scholar

Овербек Р., Олсон Р., Пуш Г. Д., Олсен Г. Дж., Дэвис Дж. Дж., Дисз Т. и др. (2013). SEED и быстрое аннотирование микробных геномов с использованием технологии подсистем (RAST). Nucleic Acids Res. 42, D206 – D214. DOI: 10.1093 / nar / gkt1226

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пачеко А. Р., Кертис М. М., Ричи Дж. М., Мунера Д., Уолдор М. К., Морейра К. Г. и др. (2012). Чувствительность к фукозе регулирует бактериальную колонизацию кишечника. Природа 492: 113. DOI: 10.1038 / природа11623

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Палмер К., Бик Э. М., ДиДжиулио Д. Б., Релман Д. А. и Браун П.О. (2007). Развитие кишечной микробиоты младенца у человека. PLoS Biol. 5: 1556–1573. DOI: 10.1371 / journal.pbio.0050177

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Паннарадж, П., Ли, М., Серини, К., Сааведра, М., Альдрованди, Г. М., Сабори, А. и др. (2018). Общие и отличительные особенности виромов грудного молока и детского стула. Фронт. Microbiol. 9: 1162. DOI: 10.3389 / fmicb.2018.01162

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Пендерс, Дж., Thijs, C., Vink, C., Stelma, F. F., Snijders, B., Kummeling, I., et al. (2006). Факторы, влияющие на состав кишечной микробиоты в раннем детстве. Педиатрия 118, 511–521. DOI: 10.1542 / педс.2005-2824

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Петерсон, Дж. А., Паттон, С., и Хамош, М. (1998). Гликопротеины жировых шариков грудного молока для защиты грудного ребенка от инфекций. Неонатология 74, 143–162.DOI: 10.1159 / 000014020

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Порецкий Р., Родригес-Р. Л. М., Луо К., Цеменци Д. и Константинидис К. Т. (2014). Сильные и слабые стороны секвенирования ампликона гена 16S рРНК для выявления временной динамики микробного сообщества. PLoS One 9: e93827. DOI: 10.1371 / journal.pone.0093827

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Прюсс, Э., Кваст, К., Книттель, К., Fuchs, B.M., Ludwig, W., Peplies, J., et al. (2007). SILVA: всеобъемлющий онлайн-ресурс для проверенных и согласованных данных о последовательностях рибосомных РНК, совместимых с ARB. Nucleic Acids Res. 35, 7188–7196. DOI: 10.1093 / nar / gkm864

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Qin, J., Li, R., Raes, J., Arumugam, M., Burgdorf, K. S., Manichanh, C., et al. (2010). Каталог микробных генов кишечника человека, созданный путем метагеномного секвенирования. Природа 464: 59.DOI: 10.1038 / nature08821

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Куигли М. и Макгуайр У. Дж. С. Д. (2014). Смесь молочных смесей по сравнению с донорским грудным молоком для кормления недоношенных детей или детей с низкой массой тела при рождении. Кокрановская база данных Syst. Ред. 22: CD002971. DOI: 10.1002 / 14651858.CD002971.pub3

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Айвин, К., Лансен, А., Кертис, Т. П., Давенпорт, Р. Дж., Холл, Н., Хед, И. М. и др. (2009). Точное определение микробного разнообразия по 454 данным пиросеквенирования. Nat. Методы 6: 639. DOI: 10.1038 / nmeth.1361

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Радтке, Дж. В. (2011). Парадокс связанной с грудным вскармливанием заболеваемости среди недоношенных новорожденных. J. Obstetr. Гинеколь. Неонатальные медсестры. 40, 9–24. DOI: 10.1111 / j.1552-6909.2010.01211.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Ранджан Р., Рани А., Финн П. В. и Перкинс Д. Л. (2018). Оценка бактериального и функционального разнообразия микробиоты кишечника человека с помощью дополнительной метагеномики и метатранскриптомики. bioRxiv [Препринт] doi: 10.1101 / 363200v1

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Roudière, L., Jacquot, A., Marchandin, H., Aujoulat, F., Devine, R., Zorgniotti, I., et al. (2009). Оптимизированный гель-электрофорез при временной температуре с помощью ПЦР по сравнению с культивированием для оценки разнообразия кишечной микробиоты новорожденных. J. Microbiol. Методы 79, 156–165. DOI: 10.1016 / j.mimet.2009.08.005

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Rougé, C., Гольденберг, О., Феррарис, Л., Бергер, Б., Роша, Ф., Легран, А. и др. (2010). Исследование микробиоты кишечника недоношенных детей разными методами. Анаэроб 16, 362–370. DOI: 10.1016 / j.anaerobe.2010.06.002

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Шанлер Р. Дж. И Гарза К. (1987). Различия в аминокислотах в плазме у младенцев с очень низкой массой тела при рождении, которых кормили грудным молоком или смесью коровьего молока с преобладанием сыворотки. Pediatr.Res. 21: 301. DOI: 10.1203 / 00006450-198703000-00021

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Швирц, А., Грюль, Б., Лёбниц, М., Мишель, П., Радке, М., и Блаут, М. (2003). Развитие бактериального состава кишечника у госпитализированных недоношенных детей по сравнению с доношенными детьми, вскармливаемыми грудью. Pediatr. Res. 54, 393–399. DOI: 10.1203 / 01.PDR.0000078274.74607.7A

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Сегата, Н., Изард, Дж., Уолдрон, Л., Геверс, Д., Миропольский, Л., Гаррет, У. С. и др. (2011). Открытие и объяснение метагеномных биомаркеров. Genome Biol. 12: R60. DOI: 10.1186 / GB-2011-12-6-r60

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Старк П. Л. и Ли А. (1982). Микробная экология толстой кишки у детей, находящихся на грудном и искусственном вскармливании, в течение первого года жизни. J. Med. Microbiol. 15, 189–203. DOI: 10.1099 / 00222615-15-2-189

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Стюарт, Дж.А., Чедвик В. С., Мюррей А. (2005). Изучение влияния генетики хозяина на преобладающие эубактерии в фекальной микрофлоре детей. J. Med. Microbiol. 54, 1239–1242. DOI: 10.1099 / jmm.0.46189-0

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Tap, J., Mondot, S., Levenez, F., Pelletier, E., Caron, C., Furet, J.P., et al. (2009). К филогенетическому ядру кишечной микробиоты человека. Environ. Microbiol. 11, 2574–2584.DOI: 10.1111 / j.1462-2920.2009.01982.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Татусова, Т., Чиуфо, С., Федоров, Б., О’Нил, К., Толстой, И. (2013). База данных микробных геномов RefSeq: новая стратегия представления и аннотации. Nucleic Acids Res. 42, D553 – D559. DOI: 10.1093 / nar / gkt1274

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Томпсон, А. Л., Монтеагудо-Мера, А., Каденас, М. Б., Лампл, М. Л., и Азкарат-Перил, М.А. (2015). Практика кормления молоком и твердым кормом, а также посещение детских садов связаны с различиями в бактериальном разнообразии, преобладающих сообществах, а также метаболической и иммунной функции микробиома кишечника младенца. Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol. 5: 3. DOI: 10.3389 / fcimb.2015.00003

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Урбаниак, К., Анджелини, М., Глор, Г. Б., и Рид, Г. (2016). Профили микробиоты грудного молока в зависимости от метода родов, беременности и пола ребенка. Микробиом 4: 1. DOI: 10.1186 / s40168-015-0145-y

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Виртанен, С., Рясанен, Л., Аро, А., Юленен, К., Лунамаа, Р., Туомилехто, Дж. И др. (1992). Кормление в младенчестве и риск сахарного диабета 1 типа у финских детей. Диабет. Med. 9, 815–819. DOI: 10.1111 / j.1464-5491.1992.tb01899.x

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Уокер, А. В., Мартин, Дж.К., Скотт, П., Паркхилл, Дж., Флинт, Х. Дж., И Скотт, К. П. (2015). На профилирование микробиоты кишечника младенца человека на основе гена 16S рРНК сильно влияет обработка образцов и выбор праймера для ПЦР. Микробиом 3:26. DOI: 10.1186 / s40168-015-0087-4

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вандро С., Осборн С., Энрикес К., Биксби К., Арриета А. и Уайтсон К. (2018). Микробиом и метаболом стула недоношенных детей персонализированы и не зависят от последствий для здоровья, включая некротический энтероколит и поздний сепсис. мСфера 3: e00104-18. DOI: 10.1128 / mSphere.00104-18

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вестрейх, С. Т., Ардешир, А., Алкан, З., Кабл, М. Э., Корф, И., и Лемей, Д. Г. (2019). Метатранскриптомика фекалий макак с идиопатической хронической диареей выявляет измененную деградацию муцина и утилизацию фукозы. Микробиом 7:41. DOI: 10.1186 / s40168-019-0664-z

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Вестрейх, С.Т., Трейбер, М. Л., Миллс, Д. А., Корф, И., и Лемей, Д. Г. (2018). SAMSA2: автономный конвейер анализа метатранскриптомов. BMC Bioinformatics 19: 175. DOI: 10.1186 / s12859-018-2189-z

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Уолд А. и Адлерберт И. (2002). Грудное вскармливание и кишечная микрофлора младенцев – значение для защиты от инфекционных заболеваний, краткосрочные и долгосрочные последствия грудного вскармливания для здоровья ребенка. Берлин: Спрингер, 77–93.

Google Scholar

Xiong, W., Brown, C. T., Morowitz, M. J., Banfield, J. F., and Hettich, R. L. (2017). Метапротеомная характеристика развития кишечной микробиоты недоношенных новорожденных с определением генома выявляет видоспецифические метаболические сдвиги и вариабельность в раннем возрасте. Микробиом 5:72. DOI: 10.1186 / s40168-017-0290-6

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Циммерманн П. и Кертис Н.(2019). Влияние антибиотиков во время родов на микробиоту кишечника младенцев: систематический обзор. Arch. Дис. Чайлд Fetal Neonatal Edn. 2018: 316659. DOI: 10.1136 / archdischild-2018-316659

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

Цвиттинк, Р. Д., Ренес, И. Б., ван Линген, Р. А., ван Зоерен-Гроббен, Д., Константи, П., Норбруис, О. Ф. и др. (2018). Связь между продолжительностью внутривенного введения антибиотиков и развитием микробиоты в раннем возрасте у недоношенных новорожденных. Eur. J. Clin. Microbiol. Заразить. Дис. 37, 475–483. DOI: 10.1007 / s10096-018-3193-y

PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

пищевых аллергий, потенциально связанных с искусственным вскармливанием младенцев и кишечным микробиомом

Первый год жизни имеет решающее значение для развития микробиома кишечника человека. Изменения в относительной численности различных семейств и видов бактерий, колонизирующих кишечник в течение этого первого года, могут быть отсрочены или изменены в зависимости от факторов, в том числе от того, являются ли роды вагинальными или путем кесарева сечения, находятся ли младенцы на грудном или искусственном вскармливании, а также на раннем этапе заражения. к антибиотикам.Группа канадских исследователей использовала секвенирование бактериальных генов для анализа изменения численности различных кишечных бактерий у младенцев в возрасте от 3 месяцев до 1 года. Их результаты показали, что у младенцев, которых вскармливают из бутылочки, а не грудью, и в меньшей степени у детей, родившихся путем кесарева сечения, а не вагинально, развиваются особенности колонизации кишечника, которые были связаны с пищевой аллергией.

«Наша цель состояла в том, чтобы охарактеризовать комбинированное влияние кесарева сечения, лечения антибиотиками и искусственного вскармливания на развитие кишечной микробиоты у младенцев», – пояснила Анита Козырский, доктор философии.D., научный сотрудник Университета Альберты, Канада, который руководил исследованием. «Мы обнаружили, что по сравнению с младенцами, рожденными естественным путем и грудным вскармливанием, младенцы, вскармливаемые смесью или кесарево сечение, имели разные траектории бактериальной колонизации в более позднем младенчестве, что могло иметь последствия для их здоровья в будущем». Исследования опубликованы в Frontiers in Pediatrics , в статье под названием «Кесарево сечение, искусственное вскармливание и воздействие антибиотиков на младенцев: раздельное и комбинированное воздействие на микробные изменения кишечника в более позднем младенчестве».”

Авторы пишут, что наше понимание развития микробиома кишечника в значительной степени основано на описательных исследованиях численности различных бактериальных таксонов с увеличением младенческого возраста, будь то при наличии или отсутствии общих перинатальных воздействий. Методы секвенирования следующего поколения (NGS) позволили провести более полный анализ микробов в образцах детского стула. «Тем не менее, остается много вопросов», – признают они. Один из этих вопросов: «Насколько отклонения от микробной последовательности кишечника у новорожденного, рожденного естественным путем, не имеющего антибиотиков и вскармливаемого грудью, достаточно для прогнозирования такого результата, как пищевая сенсибилизация.”

Чтобы получить больше информации о развитии микробиома у младенцев, исследователи использовали метод, известный как анализ значимости микроматриц (SAM), для анализа бактериальной ДНК из более чем 1000 видов кишечных микробов в 166 парных образцах фекалий доношенных младенцев в возрасте 3 месяцев и в 1 год. Используя этот метод, команда смогла количественно оценить изменения в бактериальной колонизации кишечника в зависимости от способа рождения (вагинальные / кесарево сечение), статуса грудного вскармливания (да / нет) и использования антибиотиков (да / нет) к трем месяцам жизни.

Предыдущие исследования показали, что существуют типичные закономерности в типах бактерий, населяющих растущего младенца, но канадские исследования являются одними из первых, кто изучает скорость колонизации каждого типа бактерий в младенческом возрасте и подчеркивает, какие бактерии доминируют в кишечнике. микробиом со временем развивается. Результаты показали, что родившиеся через естественные родовые пути младенцы на грудном вскармливании, которые не подвергались воздействию антибиотиков в течение 3 месяцев после рождения, демонстрировали уникальную траекторию развития кишечных микробов в более позднем младенчестве.Напротив, кесарево сечение, воздействие антибиотиков и отсутствие грудного вскармливания – все это повлияло на развитие кишечного микробиома и относительную численность определенных бактериальных таксонов. По сравнению с нормальным развитием кишечных бактерий в младенческом возрасте, у детей, вскармливаемых смесью или кесарева сечения, наблюдались траектории колонизации среди семейств бактерий, которые ранее были связаны с пищевой аллергией и с быстрым набором веса.

Авторы признают, что потребуются более масштабные исследования, чтобы лучше понять, как изменения в микробиоме младенца влияют на здоровье.«В конечном итоге коллективная оценка этих микробных параметров будет способствовать нашему пониманию того, что является нормальным микробным развитием кишечника у младенцев и какие отклонения от нормального развития предсказывают будущее заболевание», – заключают они.

Грудное вскармливание микробиома | The New Yorker

Это отредактированный отрывок из книги « Я содержу множество: микробы внутри нас и более широкий взгляд на жизнь », которая будет опубликована 9 августа издательством Ecco, издательством HarperCollins Publishers.

Институт продуктов питания для здоровья при Калифорнийском университете в Дэвисе выглядит как тосканская вилла, его здания с терракотовыми стенами выходят на большой виноградник и сад, изобилующий летними овощами. Его возглавляет химик по имени Брюс Герман, и если бы существовал титул чемпиона мира по превознесению достоинств молока, он бы его, несомненно, удержал. На нашей первой встрече он потратил полчаса на монологи на эту тему, подпрыгивая на мяче для упражнений и месив лохмотья пузырчатой ​​пленки во время разговора.По его словам, молоко – идеальный источник питания, суперпродукт, достойный маркировки. Это не обычная точка зрения. Число научных публикаций о молоке ничтожно по сравнению с числом, посвященным другим жидкостям организма – крови, слюне, даже моче. Молочная промышленность потратила целое состояние на получение все большего и большего количества коровьего молока, но очень мало на понимание того, что это за белая жидкость и как она работает. По словам Германа, агентства, финансирующие медицину, в целом отклонили это предложение как несущественное, потому что «оно не имеет ничего общего с болезнями белых мужчин среднего возраста.«И диетологи смотрели на это как на простой коктейль из жиров и сахаров, который можно легко воспроизвести и заменить формулами. «Люди говорили, что это просто мешок с химикатами», – сказал мне Герман. “Это что угодно, только не это”.

Молоко – это инновация в области млекопитающих, обычная для утконосов и ящеров, людей и бегемотов, причем его ингредиенты различаются в зависимости от потребностей каждого вида. Грудное молоко – особое чудо. Каждая мать-млекопитающее производит сложные сахара, называемые олигосахаридами, но человеческие матери по какой-то причине производят исключительное разнообразие: к настоящему времени ученые идентифицировали более двухсот олигосахаридов грудного молока, или H.M.O.s. Они являются третьим по содержанию ингредиентом грудного молока после лактозы и жиров, и их структура должна сделать их богатым источником энергии для растущих младенцев, но младенцы не могут их переваривать. Когда Герман впервые узнал об этом, он был потрясен. Зачем матери тратить столько энергии на производство этих сложных химикатов, если они явно бесполезны для ее ребенка? Почему естественный отбор не отказался от такой расточительной практики? Вот подсказка: H.M.O. проходят через желудок и тонкий кишечник целыми и невредимыми, попадая в толстую кишку, где обитает большинство наших бактерий.Что, если они совсем не пища для младенцев? Что, если они являются пищей для микробов?

Эта идея восходит к началу двадцатого века, когда две очень разные группы ученых сделали открытия, которые, без их ведома, были тесно связаны. В одном лагере педиатры обнаружили, что микробы, названные Bifidobacteria («Bifs», как их друзья), чаще встречаются в стуле грудных детей, чем детей, вскармливаемых из бутылочки. Они утверждали, что грудное молоко должно содержать какое-то вещество, питающее бактерии, – то, что позже ученые назвали бифид-фактором.Тем временем химики обнаружили, что грудное молоко содержит углеводы, которых нет в коровьем, и постепенно сократили эту загадочную смесь до отдельных компонентов, включая несколько олигосахаридов. Параллельные пути встретились в 1954 году благодаря партнерству Ричарда Куна (химик, австриец, лауреат Нобелевской премии) и Пола Дьёрджи (педиатр, американец венгерского происхождения, защитник грудного молока). Вместе они подтвердили, что таинственный бифид-фактор и олигосахариды молока – это одно и то же, и что они питают кишечные микробы.

К девяностым годам ученые знали, что в молоке содержится более сотни HMO, но охарактеризовали лишь несколько. Никто не знал, как большинство из них выглядели или какими видами бактерий они кормились. Считалось, что все Бифы питались одинаково, но Герман не был удовлетворен. Он хотел точно знать, кто эти посетители и какие блюда они заказывают. Для этого он взял реплику из истории и собрал разнообразную команду химиков, микробиологов и ученых-диетологов.Вместе они идентифицировали всех H.M.O., вытащили их из молока и скармливали бактериям. И, к огорчению исследователей, ничего не росло.

Проблема вскоре стала ясна: H.M.O. не является универсальной пищей для Бифов. В 2006 году команда обнаружила, что сахара избирательно питают один подвид, Bifidobacterium longum infantis . Если вы предоставите B. Infantis H.M.O., он будет побеждать любую другую кишечную бактерию. Близкий подвид, B.longum longum слабо растет на тех же сахарах, а иронично названный B. lactis , распространенный продукт для йогуртов с пробиотиками, вообще не растет. Другой источник пробиотиков, B. bifidum , работает немного лучше, но он суетливый и беспорядочный едок. Он разбивает несколько H.M.O. и принимает те части, которые ему нравятся. Напротив, B. infantis пожирает все до последней крошки, используя кластер из тридцати генов – полный набор столовых приборов для поедания H.M.O.s. Ни один другой Bif не имеет этого генетического кластера; он уникален для B.Infantis . Грудное молоко эволюционировало, чтобы питать микроб, а оно, в свою очередь, превратилось в полноценный организм человека. Неудивительно, что часто это доминирующий микроб в кишечнике грудных детей.

B. infantis получает свое содержание. Переваривая H.M.O., он выделяет короткоцепочечные жирные кислоты, которые питают клетки кишечника младенца. Посредством прямого контакта B. infantis также побуждает клетки кишечника вырабатывать адгезивные белки, которые закрывают промежутки между ними, предотвращая попадание микробов в кровоток, и противовоспалительные молекулы, которые калибруют иммунную систему.Эти изменения происходят только тогда, когда B. infantis питается H.M.O.s; если вместо этого он получает лактозу, он выживает, но не вступает ни в какие отношения с клетками ребенка. Другими словами, весь полезный потенциал микроба раскрывается только тогда, когда он питается грудным молоком. Точно так же, чтобы ребенок мог в полной мере воспользоваться преимуществами молока, в кишечнике должно быть B. infantis . По этой причине Дэвид Миллс, микробиолог, работающий с немецким языком, на самом деле рассматривает B. infantis как часть молока, хотя и не вырабатывается в груди.

Непонятно, почему грудное молоко человека выделяется среди грудного молока других млекопитающих. В нем в пять раз больше видов ТМО, чем в коровьем молоке, и в несколько сотен раз больше. Даже шимпанзе гораздо беднее нашего. Миллс предлагает несколько возможных объяснений этой разницы. Первый связан с нашим мозгом, который, как известно, велик для приматов нашего размера и который невероятно быстро растет в течение первого года жизни. Этот быстрый рост частично зависит от питательного вещества, называемого сиаловой кислотой, которое также является одним из химических веществ, входящих в состав B.Infantis высвобождается, когда ест H.M.O.s. Возможно, что, если кормить эту бактерию, матери смогут вырастить более умных детей. Это может объяснить, почему среди обезьян и обезьян у социальных видов больше олигосахаридов в молоке, чем у одиночных, и к тому же более широкий их диапазон. Чтобы жить в больших группах, нужно помнить больше о социальных связях, поддерживать больше дружбы и манипулировать большим количеством соперников. Многие ученые считают, что эти требования привели к эволюции интеллекта приматов; возможно, они также способствовали разнообразию H.M.O.s.

Альтернативная идея связана с болезнями. В групповых условиях патогены могут легко передаваться от одного хозяина к другому, поэтому животным нужны более эффективные способы защиты. H.M.O. обеспечивают одну такую ​​защиту. Когда патоген поражает наш кишечник, он почти всегда начинается с захвата гликанов – молекул сахара – на поверхности наших кишечных клеток. Но H.M.O. поразительно похожи на эти гликаны, поэтому патогены иногда прилипают к ним. Они действуют как приманки, отводя огонь из собственных клеток ребенка.Они могут заблокировать перекличку злодеев, в том числе Salmonella ; Listeria ; Vibrio cholerae , возбудитель холеры; Campylobacter jejuni , наиболее частая причина бактериальной диареи; Entamoeba histolytica , прожорливая амеба, вызывающая дизентерию и ежегодно убивающая сотни тысяч человек; и многие вирулентные штаммы E. coli . H.M.O.s может даже быть в состоянии препятствовать заражению ВИЧ, что может объяснить, почему более половины младенцев, кормящих грудью от инфицированных матерей, не заражаются, несмотря на то, что в течение нескольких месяцев пьют молоко, зараженное вирусом.Каждый раз, когда ученые противопоставляют патоген культивированным клеткам в присутствии H.M.O., клетки выходят наружу с улыбкой.

Команда Института продуктов питания для здоровья построила впечатляющее предприятие по переработке молока в своем имитирующем тосканском здании. В основной лаборатории, которой Миллс руководит вместе с ученым-диетологом Даниэлой Бариле, есть две огромные стальные бочки, в которых хранится молоко, пастеризатор, похожий на кофемашину эспрессо, и множество другого оборудования для фильтрации жидкости и ее разрушения. на его компоненты.Когда я пришел, на соседней стеллаже стояли сотни пустых белых ведер. «Обычно они полны», – сказала мне Барил. Полные ведра хранятся в огромной морозильной камере, которая охлаждается до крайне неудобной температуры -25,6 градусов по Фаренгейту. На соседней скамейке есть ряд резиновых сапог («Когда мы обрабатываем молоко», – сказала Барил), молоток для измельчения льда («Дверь не закрывается должным образом») и, необъяснимым образом, нож для ветчины (я не спрашивал). Мы заглянули внутрь. На поддонах и полках стояли белые ведра, между которыми находилось около шестисот галлонов молока.Большая часть этого была коровьего молока, подаренного молочными заводами, но удивительное количество поступило от людей. «Многие женщины сцеживают молоко и хранят его, и, как только их ребенок отнимает грудь, они думают: что нам теперь с ним делать? Потом люди слышат о нас, и мы получаем пожертвования », – сказал Миллс. «Мы получили восемьдесят литров, собранные за два года от случайного сотрудника Стэнфордского университета, который сказал:« У меня есть все это молоко. Вы, ребята, этого хотите? »Да, хотели. Им нужно все молоко, которое они могут получить.

Гастроэзофагеальный рефлюкс и ребенок на грудном вскармливании

Что такое рефлюкс?

Многие младенцы приносят молоко обратно через пищевую трубку в разное время дня и ночи.Это называется рефлюксом (сокращенно от гастроэзофагеального рефлюкса или GOR). Проще говоря, клапан между желудком и пищевой трубкой (пищеводом) не удерживает молоко ребенка, и оно возвращается обратно по трубке в неправильном направлении. Тихий рефлюкс – это когда молоко возвращается из желудка, но его не рвет, а проглатывает.

Рефлюкс обычно начинается до 8-недельного возраста, часто уменьшается через 6 месяцев и исчезает сам по себе к годовалому возрасту. По крайней мере, 40% детей кормят примерно один раз в день, и около 5% детей будут рефлюксировать 6 или более раз в день без каких-либо других проблем.

Младенцы с рефлюксом также могут много плакать, чувствовать дискомфорт или раздражительность. У них может быть сильная икота или кашель, или им будет трудно справиться из-за рефлюкса.

Несмотря на то, что рефлюкс часто является нормальным явлением в младенчестве, он может быть очень тяжелым для родителей, чьи дети часто вскармливают молоко, поскольку они могут казаться обеспокоенными или испытывать дискомфорт. Рефлюкс, как правило, не требует медицинского обследования и часто лечится с помощью советов по кормлению и позиционирования, а также подбадривания.

Что может вызвать рефлюкс?

На протяжении большей части истории человечества младенцев не оставляли лежать, так как это подвергало бы их риску причинения вреда, поэтому их нужно было носить и держать на руках весь день.Теперь, когда мы обычно лежим младенцев гораздо чаще, чем наши предки, сила тяжести из-за постоянного вертикального положения не помогает удерживать младенческое молоко в желудке, и оно может снова подняться.

Младенцы, которые не могут эффективно прикладываться к груди, могут иметь рефлюкс. Это может быть связано с тем, что они вдыхают воздух во время кормления или плача. Иногда младенцам просто нужно занять немного другое положение, чтобы прикладывать грудь глубже. Иногда это может быть результатом физиологических проблем, таких как уздечка языка.

У младенцев, страдающих аллергией, может быть рефлюкс как симптом, или рефлюкс может быть симптомом микробного дисбактериоза – дисбаланса кишечных бактерий. Рефлюкс чаще встречается у детей с астмой, хотя астма не является причиной рефлюкса; Однако оба они могут быть симптомами аллергии.

Что может ухудшить рефлюкс?

• Находиться в семье с курильщиком.
• Пребывание в опущенном положении, например в автокресле.
• Плотная одежда вокруг живота.
• Лежа после кормления.
• Перекармливание или большие, нечастые кормления
• (что более вероятно при кормлении из бутылочки).
• Выбор продуктов питания матери, например избыток кофеина.
• Завязка для языка, если она мешает ребенку захватить грудь.
• Аллергия на белок коровьего молока.
• Рефлекс быстрого опускания (также известный как рефлекс выброса молока).

Когда мне следует беспокоиться?

Если вы беспокоитесь о своем ребенке, вы можете обратиться к медицинскому работнику, например, к врачу G.П., акушерка или патронажная сестра за поддержкой. Медицинский работник может провести дополнительное расследование, если у вашего ребенка есть другие симптомы, такие как необъяснимое отсутствие набора веса, тяжелое недомогание или очень сильная и частая срыгивание, срыгивание зеленой / желтой жидкости или что-то похожее на кофейную гущу, кровь в помете ребенка. или ребенок постоянно отказывается от еды. Если вашему ребенку не хватает молока или у него появляются признаки высокой температуры, обезвоживания или лихорадки, всегда немедленно обратитесь за медицинской помощью.

Как я могу помочь своему ребенку чувствовать себя более комфортно?

Как «млекопитающие-переносчики», мы созданы, чтобы держать наших малышей в вертикальном положении в течение большей части времени бодрствования и спать рядом с ними. Частое кормление грудью и реагирование на сигналы ребенка помогут свести к минимуму плач ребенка. Небольшое и частое кормление хорошо помогает многим младенцам, особенно детям с рефлюксом.

Получение квалифицированной поддержки для решения любых проблем с захватом и обеспечение эффективного кормления ребенка, возможно, с более вертикальным положением для кормления, поможет обеспечить наилучшее грудное вскармливание.В идеале после кормления держите ребенка в вертикальном положении рядом с его опекуном не менее 30 минут.

Похлопывание по ветру может усугубить рефлюкс, поэтому просто держите ребенка головой на правом плече, а живот – посередине груди. На этом этапе лучше избегать подпрыгивания или покачивания ребенка.

Надувные кресла и автокресла изгибают тело ребенка, что может сделать его более неудобным. Постарайтесь ограничить время пребывания в них и, по возможности, избегайте их после кормления.

Правила безопасного сна гласят, что младенцы спят на плоской поверхности. Если ваш врач рекомендует поднять один конец детской кроватки или колыбели, используйте кроватку, разработанную для этой цели в соответствии с рекомендациями производителя , вместо того, чтобы поднимать матрас внутри детской кроватки. Следите за тем, чтобы любой наклон был небольшим, чтобы ребенок не мог соскользнуть с кроватки; не используйте подушки или что-либо, что мешает спать на ровной поверхности, и всегда кладите их ногами на изножье кроватки.

Иногда исключение молочных продуктов из рациона матери может помочь уменьшить детский рефлюкс; ведение дневника питания может помочь выявить закономерности на тот случай, если возникнут какие-либо другие виды пищевой непереносимости. Элиминационные диеты лучше всего проводить при поддержке медицинского работника.

Что такое ГОРД?

Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь может быть диагностирована, когда одновременно происходит несколько из следующих событий: ребенок не набирает вес, частая и сильная рвота, беспокойное поведение и / или повторяющийся кашель, охриплость голоса или пневмония.Недоношенные дети, дети с грыжами или с неврологическими расстройствами более подвержены риску развития ГЭРБ.

Как можно вылечить моего ребенка с ГЭРБ?

Следует учитывать все предложения о том, как сделать ребенка более комфортным. В рекомендациях NICE говорится, что сначала следует изучить историю кормления, и могут быть уместны более частые кормления небольшими порциями. Оценка грудного вскармливания должна проводиться для детей, находящихся на грудном вскармливании – обученный консультант по грудному вскармливанию или сертифицированный консультант по грудному вскармливанию может предложить эту поддержку.Если ребенок также ест молочную смесь, необходимо проанализировать, как готовится кормление и как его кормить.

Около 25% детей с ГЭРБ также страдают аллергией на белок коровьего молока (АБКМ), с которой можно справиться путем изменения рациона матери для детей, находящихся на грудном вскармливании.

Если рекомендации по кормлению не уменьшают симптомы, можно назначить пробную альгинатную терапию. Это следует останавливать через определенные промежутки времени, чтобы увидеть, уменьшились ли симптомы. Следующим этапом лечения младенцев с рефлюксом в дополнение к необъяснимым трудностям с кормлением, нарушенному поведению или задержкам роста может быть испытание ингибиторов протонной помпы (ИПП) или антагонистов рецептора h3 (h3RA). Все лекарства могут иметь побочные эффекты, поэтому важно обсудить это с лечащим врачом.

Нужно ли моему ребенку с рефлюксом прекратить грудное вскармливание?

В идеале ребенок с рефлюксом должен продолжать кормить грудью. Если у вашего ребенка может быть аллергия на белок коровьего молока, то исключение всего коровьего молока из рациона матери может помочь улучшить симптомы (под наблюдением врача). Если обнаружена аллергия, можно предложить пересмотреть потребление материнского молока с помощью подхода «молочной лестницы».

Где я могу получить дополнительную поддержку?

Уход за ребенком, который часто срыгивает молоко или который чувствует себя неудобно и несчастно, является трудным для родителей. Важно убедиться, что вам есть с кем поговорить о том, что вы чувствуете. Это может быть личная встреча, будь то любимый человек или группа поддержки. Вы также можете найти онлайн-группу, полезную для практических советов, а также для эмоциональной поддержки.

Дисбактериоз кишечника – Педиатрия | Nutricia

По материалам Peterson and Round, 2014. ¹

Что вызывает дисбактериоз кишечной микробиоты у младенцев?

Ранняя жизнь – критическое время для развития микробиома кишечника, поэтому кишечник младенца особенно уязвим для дисбактериоза. Есть несколько факторов, которые влияют на состав микробиома кишечника у младенцев, в том числе: ^1,4-6

• Срок беременности
• Материнское окружение
• Способ родов (вагинальные или кесарево)
• Питание (грудное или искусственное вскармливание)
• Использование антибиотиков
• Диета
• Загрязнение воздуха
• Генетика

Генетические факторы и изменения в факторах окружающей среды могут изменить состав микробиома кишечника, что приведет к дисбактериозу. ¹

Какая связь между дисбактериозом кишечной микробиоты и аллергией?

Сообщалось о дисбиозе кишечной микробиоты у младенцев с аллергическими состояниями, такими как аллергия на белок коровьего молока (CMPA). У здоровых младенцев, находящихся на грудном вскармливании, в кишечнике обычно преобладает группа полезных бактерий, известных как бифидобактерии. Эти бактерии сначала передаются от матери во время родов и с грудным молоком. ^7–9

У младенцев с аллергическими заболеваниями факторы окружающей среды могут влиять на состав микробиоты кишечника.Младенцы с АБКМ часто имеют более низкие уровни бифидобактерий в микробиоте кишечника по сравнению со здоровыми младенцами, находящимися на грудном вскармливании. ⁹ В настоящее время считается, что дисбактериоз кишечника потенциально может привести к развитию аллергии и другим последствиям для здоровья в более позднем возрасте. ¹

Может ли дисбактериоз кишечной микробиоты влиять на развитие иммунной системы?

Ранняя жизнь – критическое время как для развития иммунной системы, так и для кишечной микробиоты.Иммунная система развивается быстро в течение первых 1000 дней жизни, и хорошо известно, что между иммунной системой и микробиотой кишечника возникает перекрестное взаимодействие.

Таким образом, дисбактериоз кишечной микробиоты может повлиять на развитие иммунной системы, что может привести к аллергии, такой как CMPA, и другим последствиям для здоровья, таким как астма, метаболический синдром, сердечно-сосудистые заболевания и ожирение. ^4,15–17

Может ли дисбактериоз кишечной микробиоты приводить к аллергическим заболеваниям, таким как аллергия на белок коровьего молока, у младенцев?

Считается, что дисбиоз кишечной микробиоты играет определенную роль в развитии пищевой аллергии, такой как аллергия на белок коровьего молока (АБКМ), в раннем возрасте.Несколько исследований показали, что дисбактериоз кишечника у младенцев может задерживать развитие оральной толерантности – процесса, при котором подавляется иммунный ответ на пищевой белок.

Нарушение пероральной толерантности может привести к развитию пищевой аллергии. ¹⁶ Дисбактериоз кишечника в молодом возрасте также был связан с развитием ряда заболеваний, включая астму, метаболический синдром, сердечно-сосудистые заболевания и ожирение. ¹⁷

Можем ли мы вернуть баланс к здоровой микробиоте кишечника?

Грудное молоко содержит как пребиотики природного происхождения, такие как олигосахариды грудного молока (HMO), так и полезные бактерии (пробиотики).Оба эти элемента помогают поддерживать здоровую микробиоту кишечника и поддерживать развитие иммунной системы. ^16,17

Если грудное вскармливание невозможно, добавление уникальной комбинации пребиотиков и пробиотиков, известных как синбиотики, к детской смеси, восстанавливает баланс кишечного микробиома и способствует пероральной переносимости, потенциально снижая риск аллергических заболеваний. ^20,23,24

Почему стоит рассмотреть уникальную смесь синбиотиков при аллергии на белок коровьего молока?

Растущее количество клинических данных свидетельствует о том, что уникальная смесь синбиотиков может иметь положительный эффект у младенцев с риском пищевой аллергии или живущих с ней, таких как АБКМ. ^12,23,24 Признавая потенциальные преимущества пре- и пробиотиков, Группа рекомендаций Всемирной организации по аллергии предлагает рассмотреть вопрос о добавлении пре- и пробиотиков для младенцев с риском аллергии, если они не находятся на исключительно грудном вскармливании. ^21,22

В настоящее время большинство смесей для младенцев, содержащих пробиотики, включают виды Bifidobacterium и / или молочнокислые бактерии, такие как Lactobacillus views, ²⁵ , которые обычно считаются безопасными и разрешенными для использования в пищевых продуктах в соответствии с Правилами Австралии и Новой Зеландии по пищевым стандартам.

В последнее десятилетие различные пребиотические смеси галактоолигосахаридов (GOS) и фруктоолигосахаридов (FOS) были изучены на предмет их положительного воздействия на младенцев с риском пищевой аллергии или живущих с ней. Клинические исследования пребиотических смесей для младенцев, состоящих из короткоцепочечной (sc) GOS и длинноцепочечной (lc) FOS, scGOS / lcFOS в соотношении 9: 1, напоминающих олигосахаридные компоненты грудного молока как по количеству, так и по разнообразию, показали преимущества, связанные с регулированием микробиоты кишечника и иммунной системы, снижением частоты инфекций и размягчением стула.